| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 4,472,648 | 0 | A | C | 8.5% | 657.6 / 2.3 | 246 | intergenic (+36/‑101) | nhaA‑II/PP_3959 | Na(+)/H(+) antiporter NhaA/voltage‑gated chloride channel family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (139/72); new base C (2/28); total (141/105) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.09e-10 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 252 total aligned reads displayed.
GCGAAACTCGGTGTGCTATCCGCGTCGTTGATCGCAGCCGTGCTGGGGTTGACCTGGGGGGTGTGGAGCATGCGCAGCGCAGCGTCTGCTACCAAAGCCGGTTCGCCCACCTAGCCAATTCCGGACTGGCGATCCCTTGCAGTTGGGCAAGCGGATCGCCACTCCCGGTGCGGCTACAACCTGTGTCGGGTAGGCCTGTGCGGGAAAACACGCCATACTCACGGCTTTCCAAGTCAGCCATGTGTGGACAATGTCCGACCCTACCCGACCTGCACCTTCACTCCCCCGCCGTTCACGCT > NC_002947/4472499‑4472797 | cgAAACTCGGTGTGCTATCCGCGTCGTTGATCGCAGCCGTGCTGGGGTTGACCTGGGGGGTGTGGAGCATGCGCAGCGCAGCGTCTGCTACCAAAGCCGGTTCGCCCACCTAGCCAATTCCGGACTGGCGATCCCTTGCAGTTGGGCAAg < 2:6283909/150‑1 (MQ=255) cgAAACTCGGTGTGCTATCCGCGTCGTTGATCGCAGCCGAGCTGGGGTTGACCTGGGGGGTGTGGAGCATGCGCAGCGCAGCGTCTGCTACCAAAGCCGGTTCGCCCACCTAGCCAATTCCGGACTGGCGATCCCTTGCAGTTGGGCAAg > 2:4945607/1‑150 (MQ=255) gAAACTCGGTGTGCTATCCGCGTCGTTGATCGCAGCCGTGCTGGGGTTGACCTGGGGGGTGTGGAGCATGCGCAGCGCAGCGTCTGCTACCAAAGCCGGTTCGCCCACCTAGCCAATTCCGGACTGGCGATCCCTTGCAGTTGGGCAAGc < 1:3493113/150‑1 (MQ=255) 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aGCGGATCGCCACTCCCGGTGCGGCTACAACCTGTGTCGGGTAGGCCTGTGCGGGAAAACACGCCATACTCACGGCTTTCCAAGTCAGCCATGTGTGGACAATGTCCGACCCTACCCGACCTGCACCTTCACTCCCCCGCCGTTCACGCt > 2:3776072/1‑150 (MQ=255) | GCGAAACTCGGTGTGCTATCCGCGTCGTTGATCGCAGCCGTGCTGGGGTTGACCTGGGGGGTGTGGAGCATGCGCAGCGCAGCGTCTGCTACCAAAGCCGGTTCGCCCACCTAGCCAATTCCGGACTGGCGATCCCTTGCAGTTGGGCAAGCGGATCGCCACTCCCGGTGCGGCTACAACCTGTGTCGGGTAGGCCTGTGCGGGAAAACACGCCATACTCACGGCTTTCCAAGTCAGCCATGTGTGGACAATGTCCGACCCTACCCGACCTGCACCTTCACTCCCCCGCCGTTCACGCT > NC_002947/4472499‑4472797 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |