Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,591,075 | T→G | 13.4% | intergenic (+165/+52) | PP_4061 → / ← PP_4063 | hypothetical protein/long‑chain fatty acid‑‑CoA ligase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,591,075 | 0 | T | G | 13.4% | 424.5 / 34.6 | 160 | intergenic (+165/+52) | PP_4061/PP_4063 | hypothetical protein/long‑chain fatty acid‑‑CoA ligase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (54/81); new base G (8/15); total (64/96) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.18e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 161 total aligned reads displayed.
GGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAA > NC_002947/4590928‑4591224 | gaccggcaaggtgcagaagttccgcatgcgtgagatcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGc > 1:2356155‑M1/85‑150 (MQ=255) gCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCAACCAGGGACCGTGCCGGCCGTGAATG‑C‑GGCGCGGcc > 2:5139665/1‑150 (MQ=255) ccggcaaggtgcagaagttccgcatgcgtgagatcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGccc > 1:2593264‑M1/83‑150 (MQ=255) cGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGccc < 1:190366/150‑1 (MQ=255) tGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCt < 1:4272662/150‑1 (MQ=255) ggcaaggtgcagaagttccgcatgcgtgagatcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCt > 2:4792872‑M1/81‑150 (MQ=255) ggcaaggtgcagaagttccgcatgcgtgagatcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCt > 2:684056‑M1/81‑150 (MQ=255) ggcaaggtgcagaagttccgcatgcgtgagatcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCt > 1:4745710‑M1/81‑150 (MQ=255) gcaaggtgcagaagttccgcatgcgtgagatcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTg > 1:6679249‑M1/80‑150 (MQ=255) gcaaggtgcagaagttccgcatgcgtgagatcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTg > 2:6279465‑M1/80‑150 (MQ=255) gcaaggtgcagaagttccgcatgcgtgagatcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTg > 1:781918‑M1/80‑150 (MQ=255) gcaaggtgcagaagttccgcatgcgtgagatcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTg > 1:6615539‑M1/80‑150 (MQ=255) gcaaggtgcagaagttccgcatgcgtgagatcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTg > 1:6065462‑M1/80‑150 (MQ=255) gcaaggtgcagaagttccgcatgcgtgagatcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTg > 1:2616732‑M1/80‑150 (MQ=255) gcaaggtgcagaagttccgcatgcgtgagatcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTg > 1:1127437‑M1/80‑150 (MQ=255) gAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTACACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTg < 2:4036800/150‑1 (MQ=255) gAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTg < 1:4183095/150‑1 (MQ=255) gAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTg < 2:4009301/150‑1 (MQ=255) caaggtgcagaagttccgcatgcgtgagatcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTgg > 2:1621136‑M1/79‑150 (MQ=255) aaCAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTgg < 1:2922356/150‑1 (MQ=255) aaCAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTgg < 1:2553065/150‑1 (MQ=255) aaggtgcagaagttccgcatgcgtgagatcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGt > 2:1401045‑M1/78‑150 (MQ=255) aCAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGTTTGATTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGt < 2:6070459/150‑1 (MQ=255) aCAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGt < 1:235278/150‑1 (MQ=255) aggtgcagaagttccgcctgcgtgagatcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGTa > 2:4762167‑M1/77‑150 (MQ=255) aggtgcagaagttccgcatgcgtgagatcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGTa > 1:6116468‑M1/77‑150 (MQ=255) ggtgcagaagttccgcatgcgtgagatcagtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGTAg > 2:3982939‑M1/76‑150 (MQ=255) aGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGTAg < 1:5188090/150‑1 (MQ=255) aGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGTAg < 2:2539122/150‑1 (MQ=255) aGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGTAg < 1:4901019/150‑1 (MQ=255) aGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCATTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGTAg < 2:5472868/150‑1 (MQ=255) cTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTGGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGa < 1:6004362/150‑1 (MQ=255) tGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCGCGTCGCCGGGTAACCCGCGCCAACCCGGGCCCCGGGCGGCCCGGCATT‑C‑GGCGCGGCCCCCgggggggg > 2:825637/1‑144 (MQ=255) gATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGc < 1:2342770/150‑1 (MQ=255) tCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGGCAGCGCC‑GCATTCAAGGCC‑GGCACGGTCCCTGGTAGGAGC‑gg < 1:138305/150‑1 (MQ=17) tCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGGCAGCGCC‑GCATTCAAGGCC‑GGCACGGTCCCTGGTAGGAGC‑gg < 1:2031585/150‑1 (MQ=17) tCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGGCAGCGCC‑GCATTCAAGGCC‑GGCACGGTCCCTGGTAGGAGC‑gg < 1:4903711/150‑1 (MQ=17) tCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGC‑gg < 2:5193292/150‑1 (MQ=255) tCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGC‑gg < 1:1819902/150‑1 (MQ=255) cTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGGCAGCGCC‑GCATTCAAGGCC‑GGCACGGTCCCTGGTAGGAGC‑ggg < 1:1779461/150‑1 (MQ=17) tGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAATATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGGCAGCGCC‑GCATTCAAGGCC‑GGCACGGTCCCTGGTAGGAGC‑GGGt < 2:268696/150‑1 (MQ=17) ggtccgcctgcgtgagatctgtgtggcggagattgcggctgcatctgcgggttgatgtgctggcgcGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCGGCTCCTCCCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGC‑GGGtt > 2:6208961‑M1/67‑150 (MQ=255) gctgctCCATTGAAAGGTTGAGTAGGACCTGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGACTGACTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGC‑GGGTTTa < 1:5627039/150‑1 (MQ=38) 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GGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCg < 1:3057191‑M1/150‑1 (MQ=255) GTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCgg < 1:3648134‑M1/150‑1 (MQ=255) AACCCGCTCCTACCAGGGGCAGCGCCG‑CATTCAAGG‑CCGGCACGGTCCCTGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAAc < 2:5588525‑M1/150‑1 (MQ=255) AACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGcccc > 2:468394‑M1/1‑49 (MQ=255) ACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACt < 2:1345614‑M1/150‑1 (MQ=255) ACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACt < 2:2436566‑M1/150‑1 (MQ=255) 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CGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGATTG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCt > 1:5305159‑M1/1‑150 (MQ=255) GCTCCTACCAGGGGCAGCGCCG‑CATTCAAGG‑CCGGCACGGTCCCTGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTg < 2:5869609‑M1/150‑1 (MQ=255) GCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTg < 1:1920016‑M1/150‑1 (MQ=255) TCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACCTCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGACCTTCTGCa < 2:6757591‑M1/150‑1 (MQ=255) TCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCa < 2:6757562‑M1/150‑1 (MQ=255) CCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCAc < 2:260554‑M1/150‑1 (MQ=255) TACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCt < 2:4602206‑M1/150‑1 (MQ=255) CCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTg < 1:5811964‑M1/150‑1 (MQ=255) CCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTg < 2:3115797‑M1/150‑1 (MQ=255) CAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGc < 2:3518050‑M1/150‑1 (MQ=255) GGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCg < 2:976160‑M1/150‑1 (MQ=255) GGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGACACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCgg < 1:5028787‑M1/150‑1 (MQ=255) GACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCca < 1:3073399‑M1/110‑1 (MQ=255) ccGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCcggtca > 1:4824132/1‑150 (MQ=255) gCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCcggtcacggt > 2:4106787/1‑150 (MQ=255) ccGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCcggtcacggtc > 2:2710184/1‑150 (MQ=255) cGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCAAGCGGCACTTCTGCACCTTGCcggtcacggtca > 1:6307783/1‑150 (MQ=255) gCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATc < 2:2019965/150‑1 (MQ=255) cTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCgg > 2:3968248/1‑150 (MQ=255) ttGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCggg > 2:2382149/1‑150 (MQ=255) ttGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCggg > 1:5710089/1‑150 (MQ=255) tG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACtc > 2:3503711/1‑150 (MQ=255) tG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACtc < 2:5710089/150‑1 (MQ=255) tG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACtc > 2:4978220/1‑150 (MQ=255) tG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGC‑GGGTATACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACtc > 1:985214/1‑150 (MQ=255) ggcgCTGCCCCTGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACtcgtc > 2:6247399/1‑150 (MQ=255) ggcgCTGCCCCTGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACtcgtc > 1:898578/1‑150 (MQ=255) ggcgCTGCCCCTGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACtcgtc > 1:898595/1‑150 (MQ=255) ggcgCTGCCCCTGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACtcgtc > 2:2986831/1‑150 (MQ=255) cgcTGCCCCTGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGa > 1:743797/1‑150 (MQ=255) gcTGCCCCTGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGAc > 1:2606875/1‑150 (MQ=255) | GGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑C‑GGCGCTGCCCCTGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAA > NC_002947/4590928‑4591224 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |