| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_002947 | 4,668,357 | A→C | 5.3% | E742D (GAA→GAC) | nuoG → | NADH‑quinone oxidoreductase subunit G |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 4,668,357 | 0 | A | C | 5.3% | 1010.9 / 2.8 | 351 | E742D (GAA→GAC) | nuoG | NADH‑quinone oxidoreductase subunit G |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (143/177); new base C (2/28); total (146/205) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.12e-05 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 356 total aligned reads displayed.
ATCAAGGGCATGAAGCTGGCCCGTGAGCCGCTGCGCTACTCCGGCCGTACCGCCATGCGTGCCAACATCAGTGTGCACGAGCCGCGCACCCCGCAAGACAAGGACACCGCGTTCGCCTTCTCCATGGAAGGCTACTCGGGTTCGGCCGAACCGCGCCAGCAGGTGCCATTCGCCTGGTCGCCGGGCTGGAACTCCCCACAAGCCTGGAACAAGTTTCAGGACGAGGTCGGTGGCCACCTGCGTGCCGGTGACCCAGGCGTACGCCTGATCGAATCGCAAGGCGACCGCCTGAACTGGTT > NC_002947/4668208‑4668506 | cAAGGGCATGAAGCTGGCCCGTGAGCCGCTGCGCTACTCCGGCCGTACCGCCATGCGTGCCAACATCAGTGTGCACGAGCCGCGCACCCCGCAAGACAAGGACACCGCGTTCGCCTTCTCCATGGAAGGCTACTCGGGTTCGGCCGAAcc < 1:5045910/150‑1 (MQ=255) gggCATGAAGCTGGCCCGTGAGCCGCTGCGCTACTCCGGCCGTACCGCCATGCGTGCCAACATCAGTGTGCACGAGCCGCGCACCCCGCAAGACAAGGACACCGCGTTCGCCTTCTCCATGGAAGGCTACTCGGGTTCGGCCGAAcccga < 1:2322662/150‑4 (MQ=255) cATGAAGCTGGCCCGTGAGCCGCTGCGCTACTCCGGCCGTACCGCCATGCGTGCCAACATCAGTGTGCACGAGCCGCGCACCCCGCAAGACAAGGACACCGCGTTCGCCTTCTCCATGGAAGGCTACTCGGGTTCGGCCGAACCGCGCca < 2:4154397/150‑1 (MQ=255) 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ggCTACTGGGGTTCGGCCGAACCGCGCCAGCAGGTGCCATTCGCCTGGTCGCCGGGCTGGAACTCCCCACAAGCCTGGAACAAGTTTCAGGACGAGGTCGGTGGCCACCTGCGTGCCGGTGACCCAGGCGTACGCCTGATCGAATCGCaa < 1:6534129/150‑1 (MQ=255) gCTACTCGGGTTCGGCCGAACCGCGCCAGCAGGTGCCATTCGCCTGGTCGCCGGGCTGGAACTCCCCACAAGCCTGGAACAAGTTTCAGGACGAGGTCGGTGGCCACCTGCGTGCCGGTGACCCAGGCGTACGCCTGATCGAATCGCAAg < 2:118221/150‑1 (MQ=255) aCTCGGGTTCGGCCGAACCGCGCCAGCAGGTGCCATTCGCCTGGTCGCCGGGCTGGAACTCCCCACAAGCCTGGAACAAGTTTCAGGACGAGGTCGGTGGCCACCTGCGTGCCGGTGACCCAGGCGTACGCCTGATCGAATCGCAAGGCg > 2:2455299/1‑150 (MQ=255) gggTTCGGCCGACCCGCGCCAGCAGGTGCCATTCGCCTGGTCGCCGGGCTGGAACTCCCCACAAGCCTGGAACAAGTTTCAGGACGAGGTCGGTGGCCACCTGCGTGCCGGTGACCCAGGCGTACGCCTGATCGAATCGCAAGGCGACCg < 1:5895112/150‑1 (MQ=255) gggTTCGGCCGAACCGCGCCAGCAGGTGCCATTCGCCTGGTCGCCGGGCTGGAACTCCCCACAAGCCTGGAACAAGTTTCAGGACGAGGTCGGTGGCCACCTGCGTGCCGGTGACCCAGGCGTACGCCTGATCGAATCGCAAGGCGACCg > 2:4059016/1‑150 (MQ=255) ttCGGCCGAACCGCGCCAGCAGGTGCCATTCGCCTGGTCGCCGGGCTGGAACTCCCCACAAGCCTGGAACAAGTTTCAGGACGAGGTCGGTGGCCACCTGCGTGCCGGTGACCCAGGCGTACGCCTGATCGAATCGCAAGGCGACCGCCt < 2:2922705/150‑1 (MQ=255) ggCCGAACCGCGCCAGCAGGTGCCATTCGCCTGGTCGCCGGGCTGGAACTCCCCACAAGCCTGGAACAAGTTTCAGGACGAGGTCGGTGGCCACCTGCGTGCCGGTGACCCAGGCGTACGCCTgg < 2:3027438/125‑2 (MQ=255) ggCCGAACCGCGCCAGCAGGTGCCATACGCCTGGTCGCCGGGCTGGAACTCCCCACAAGCCGGGAACAAGTTTCAGGACGAGGTCGGTGGCCACCTGCGTGCCGGTGACCCAGGCGTACGCCTGATCGAATCGCAAGGCGACCGCCTGaa > 1:2575259/1‑150 (MQ=255) gCCGAACCGCGCCAGCAGGTGCCATTCGCCTGGTCGCCGGGCTGGAACTCCCCACAAGCCTGGAACAAGTTTCAGGACGAGGTCGGTGGCCACCTGCGTGCCGGTGACCCAGGCGTACGCCTGATCGAATCGCAAGGCGACCGCCTGAAc > 1:6514428/1‑150 (MQ=255) gCCGAACCGCGCCAGAAGGTGCCATTCGCCTGGTCGCCGGGCTGGAACACCCCACAAGCCTGGAACAAGTTTCAGGACGAGGTCGGTGGCCACATGCGTGCCGGTGACCCAGCCGTACGCCTGATCGAATCGCAAGGCTACAGCCTGAAc > 2:1561144/1‑150 (MQ=255) ccGAACCGCGCCAGCAGGTGCCATTCGCCTGGTCGCCGGGCTGGAACTCCCCACAAGCCTGGAACAAGTTTCAGGACGAGGTCGGTGGCCACCTGCGTGCCGGTGACCCAGGCGTACGCCTGATCGAATCGCAAGGCGACCGCCTGAACt > 2:3436795/1‑150 (MQ=255) cGAACCGCGCCAGCAGGTGCCATTCGCCTGGTCGCCGGGCTGGAACTCCCCACAAGCCTGGAACAAGTTTCAGGACGAGGTCGGTGGCCACCTGCGTGCCGGTGACCCAGGCGTACGCCTGATCGAATCGCAAGGCGACCGCCTGAACTg < 2:1003646/150‑1 (MQ=255) cGAACCGCGCCAGCAGGTGCCATTCGCCTGGTCGCCGGGCTGGAACTCCCCACAAGCCTGGAACAAGTTTCAGGACGAGGTCGGTGGCCACCTGCGTGCCGGTGACCCAGGCGTACGCCTGATCGAATCGCAAGGCGACCGCCTGAACTg < 2:454582/150‑1 (MQ=255) gAACCGCGCCAGCAGGTGCCATTCGCCTGGTCGCCGGGCTGGAACTCCCCACAAGCCTGGAACAAGTTTCAGGACGAGGTCGGTGGCCACCTGCGTGCCGGTGACCCAGGCGTACGCCTGATCGAATCGCAAGGCGACCGCCTGAACTgg < 1:5544442/150‑1 (MQ=255) aaCCGCGCCAGCAGGTGCCATTCGCCTGGTCGCCGGGCTGGAACTCCCCACAAGCCTGGAACAAGTTTCAGGACGAGGTCGGTGGCCACCTGCGTGCCGGTGACCCAGGCGTACGCCTGATCGAATCGCAAGGCGACCGCCTGAACTGGt < 2:491468/150‑1 (MQ=255) aaCCGCGCCAGCAGGTGCCATTCGCCTGGTCGCCGGGCTGGAACTCCCCACAAGCCTGGAACAAGTTTCAGGACGAGGTCGGTGGCCACCTGCGTGCCGGTGACCCAGGCGTACGCCTGATCGAATCGCAAGGCGACCGCCTGAACTGGt > 2:2156956/1‑150 (MQ=255) aCCGCGCCAGCAGGTGCCATTCGCCTGGTCGCCGGGCTGGAACTCCCCACAAGCCTGGAACAAGTTTCAGGACGAGGTCGGTGGCCACCTGCGTGCCGGTGACCCAGGCGTACGCCTGATCGAATCGCAAGGCGACCGCCTGAACTGGtt < 1:4126543/150‑1 (MQ=255) | ATCAAGGGCATGAAGCTGGCCCGTGAGCCGCTGCGCTACTCCGGCCGTACCGCCATGCGTGCCAACATCAGTGTGCACGAGCCGCGCACCCCGCAAGACAAGGACACCGCGTTCGCCTTCTCCATGGAAGGCTACTCGGGTTCGGCCGAACCGCGCCAGCAGGTGCCATTCGCCTGGTCGCCGGGCTGGAACTCCCCACAAGCCTGGAACAAGTTTCAGGACGAGGTCGGTGGCCACCTGCGTGCCGGTGACCCAGGCGTACGCCTGATCGAATCGCAAGGCGACCGCCTGAACTGGTT > NC_002947/4668208‑4668506 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |