Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,866,154 | G→A | 7.0% | intergenic (‑111/+126) | ligA ← / ← PP_4275 | DNA ligase/cell division protein ZipA |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,866,154 | 0 | G | A | 7.0% | 856.7 / 33.8 | 272 | intergenic (‑111/+126) | ligA/PP_4275 | DNA ligase/cell division protein ZipA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (152/101); new base A (11/8); total (163/109) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.31e-01 |
Only 100 of 275 total aligned reads displayed.
TCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACG > NC_002947/4866006‑4866303 | tCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGc < 2:5160710/150‑1 (MQ=255) tCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGACTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGc < 1:1544376/150‑1 (MQ=255) ggCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGt > 2:5138576/1‑150 (MQ=255) ggCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGt < 1:787358/150‑1 (MQ=255) ggCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGt < 2:1037805/150‑1 (MQ=255) ggCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGt > 2:2152568/1‑150 (MQ=255) ggCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCCACCAGGGCgg > 2:4624119/1‑149 (MQ=255) cACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTca < 1:4322710/150‑1 (MQ=255) aCGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTcac < 2:2780159/150‑1 (MQ=255) aCGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCCACAAGGGCGTcac > 2:2365731/1‑150 (MQ=255) cAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATg < 2:3058645/150‑1 (MQ=255) tCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCt < 1:713608/150‑1 (MQ=255) tCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCt < 2:506447/150‑1 (MQ=255) ggATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAATGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTTAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCGAggg > 1:482781/1‑150 (MQ=255) gATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGc > 2:4859237/1‑150 (MQ=255) gATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGc > 1:6721126/1‑150 (MQ=255) tACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑gg < 1:1149740/150‑1 (MQ=255) tACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGGAAACCCCCGCCCCCAACGGCGGCCCAAGCCCAAGGGC‑gg > 1:712602/1‑150 (MQ=255) aCGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGt > 2:6035325/1‑150 (MQ=255) aCGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGt < 2:299600/150‑1 (MQ=255) aCGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGt < 2:1543937/150‑1 (MQ=255) aCGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCCCTCCCACAACGGCGTCACAAGCCCTAcggc‑ggg > 1:3668530/1‑149 (MQ=255) gggTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGa > 2:4214709/1‑150 (MQ=255) gggTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGa < 1:6124321/150‑1 (MQ=255) gggTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCGAGGGC‑GGTGa > 2:5569649/1‑150 (MQ=255) gggTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAAACCCCTCCCACAAGGGCGGCACAATCCCAAGGGC‑GGTgt > 1:1651997/1‑149 (MQ=255) tttCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAAACCCCACCCACAAGGGCGTCACAAGCCCAAGGGC‑GGTGaatt > 1:148549/1‑147 (MQ=255) tttCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAAACCCCACCCACAAAGGCGTCACAAGCCCAAGGGC‑GGTGAttt > 1:1866978/1‑148 (MQ=255) tCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTAc < 1:1298002/150‑1 (MQ=255) ggcggTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATTCCCAAGGGC‑GGTGATGTACCt > 1:2154637/1‑150 (MQ=255) ggcggTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTAccg > 2:1188480/1‑149 (MQ=255) ggcggTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCt < 1:6362032/150‑1 (MQ=255) gcggTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAgg > 2:1473850/1‑135 (MQ=255) ggTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTa < 2:3560490/150‑1 (MQ=255) tGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTatctca > 2:1672493/1‑145 (MQ=255) gggATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCg > 2:5422449/1‑150 (MQ=255) ggATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCgg < 2:1243360/150‑1 (MQ=255) ggATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCgg < 2:2491214/150‑1 (MQ=255) ggATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCgg < 2:5608289/150‑1 (MQ=255) ggATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCgg < 1:4358259/150‑1 (MQ=255) gATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCggg < 1:5138527/150‑1 (MQ=255) gATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATCCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCggg < 1:3774603/150‑1 (MQ=255) aTTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTACATCAC‑CGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGCGGGt < 2:6672994/150‑1 (MQ=14) aTTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTACATCAC‑CGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGCGGGt < 1:4137784/150‑1 (MQ=14) tttGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGGAAAACCCCACCCCCAACGGCGGCACAATCCCAAGGGG‑GGGGTTGTACCGGTAGGAGCggggt > 1:255304/1‑148 (MQ=255) ttGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGttt < 1:4285549/150‑1 (MQ=255) gTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTACATCAC‑CGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGCGGGTTTAc < 1:5205944/150‑1 (MQ=14) gTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTAc > 2:4040347/1‑150 (MQ=255) gTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTAc < 1:5765264/150‑1 (MQ=255) tcttctCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTAcc < 1:3128315/150‑1 (MQ=255) cttctCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTAccc < 2:2851346/150‑1 (MQ=255) cttctCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTAccc > 2:3899175/1‑150 (MQ=255) ttctCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTTAACCCCCGCCCCCAACGGGGGCCCCTGGCCGAGGGG‑GGGGGTGTGCCGGTAGGCGCGGGGTTAcccc > 1:2924375/1‑149 (MQ=255) tctcTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTACATCAC‑CGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGCGGGTTTACCcgc < 1:3902942/150‑1 (MQ=14) tctTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCCCGCCCCCAAGGGCGGCACCTGGCCGAGGGC‑GGGGGTGTAGCTGTTTGTGCGGGTTTTACCGCGa > 1:3616102/1‑150 (MQ=255) gtggcacagcaaaAGCGCCGGTTGGGGTGGTGGGTGGGGTTCCCGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACACGGGCGTCACAGGCCCTCGGGC‑GGTGTTGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaa < 2:29249/147‑1 (MQ=37) ctTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGTGGGTTTACCCGCGaa < 2:644960/150‑1 (MQ=255) ttGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAAACCCCGCCCACAAAGGCGGCACATGCCCGAGGGC‑GGTGGTGTACCGGTAGGAGCGGGTTTAGCCGCGAag > 1:5410426/1‑150 (MQ=255) tGCAAAGCAAAAGAGCTGGTTGGGGTGGTGGGTGGGGTTCCTGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAaga < 1:6266186/150‑1 (MQ=255) aaagcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGGGATGTACCGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGc > 1:3383580/1‑150 (MQ=255) aaagcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACCGGCCCGAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGc > 2:749784/1‑150 (MQ=255) aaagcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGc > 2:5363424/1‑150 (MQ=255) gcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAAGGC‑GGTGTTGTACCGGTAGGAGCGGGTTTAACCGCGAAGAGGCCgg > 1:4699957/1‑150 (MQ=255) gaaaaaGAGCCGGTTGGGGTGGTGGTTGGGGTTCCTGTTGTCTGTTGACTGGCCCAGCCTCTTCGGGGGTAAACCCGCTCCCACATGGGCGTCAAATGCCCTTGGGG‑GGTGTTGTACGTGTAGGAGGGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCgg < 2:3222657/148‑1 (MQ=255) aaaaGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGca > 2:6212148/1‑150 (MQ=255) aaaaGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGGAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGca > 2:6757503/1‑150 (MQ=255) aaaGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCCCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGcac > 2:350038/1‑150 (MQ=255) aaaGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGGAAAACACCAACCACAAGGGCGTAACAAGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCAGGAGGCGCGGGTTTAACCGCGAAGAGGCCGGcac > 1:6162085/1‑150 (MQ=255) gtggtgCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCCACAAGGGCGTCACATGCCCCAGGGC‑GGGGATGTACCGGGAGGGTCGGGGTTACCCGCCGAGAGGCCGGCACAGGCAACCACGAAAc > 1:6039016/1‑150 (MQ=255) ccAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGCTGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCa > 2:6416116/1‑150 (MQ=255) cAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCAc > 2:5893553/1‑150 (MQ=255) gggtgggTTCACGGTCCCCGCCGCTCCGGGGGAAACCCCGCCCCCACCCGGGCGCCACTGGCCCTCGGGC‑GGTGTTGAACGTGTCGGCGCGGTTTACCCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGcc < 2:4736026/144‑1 (MQ=255) gggtCTTTTTACTGGGCCCGCCGCTTCGGGGTAAAACCCGCCCCCAAACGGGCGTCACATGCCCTTGGGG‑GGTGTTGTACCGTTCGGCGGGGGTTAACCCGCGAAGTGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGcc < 2:4736199/148‑1 (MQ=255) gtCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCGAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGccca > 2:5667488/1‑149 (MQ=255) gACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCCCCTGCCCGAGGGC‑GGTGCTGTACCGGGCGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATCCCCGAACCGGCCAGCACGCCCGCAGgctg > 2:3349865/1‑150 (MQ=37) gACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCGACCACAAGGGCGGCACATGCCCGAGGGC‑GGGGGTGTACCGGTAGGAGCGGGTTTACCCCCGGAGAGGCCGGCACAGGCCACCACGATACCCCAACCGGCCACCACGCCCGCAGgctg > 2:1161381/1‑150 (MQ=37) cTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGGCACATGCCCGAGGGC‑GGGGATGTACCGGGTGGAGCGGGTTTACCCGCGGAGAGGCCGGCACAGGCAACGCCGATAACCGAACCCGCCAGCACGCCCTCAGgctgcg > 2:1424383/1‑149 (MQ=38) cccgCCTCTTCGCGGGAAAACCGCCGCCCACTGGGGCGACACAGGCCCTTGGGG‑GGTGATGTACGTGTAGGCGGGGTTTTCCCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTc < 1:5003744/147‑1 (MQ=255) cAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCCCGCCCACAAGGGCGTCCCAAGCCCGAGGGC‑GGTGATGTACCTGGAGGAGCGGGTTTACCCCCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACGACGATACCCGCACCGGCCAGCACGCCCACAGGCTGCTCTTTCg > 2:3162485/1‑150 (MQ=38) aGCCTCTTCGCGGGTAAAACCCCTACCACAATGGCGTCACATTCCCAAGGGC‑GGTGATGTAACAGTAGGAGCGGGTTTAACCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGt > 2:852131/1‑150 (MQ=38) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGAt > 2:3762891/1‑150 (MQ=255) gagcgGGTTTACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCAAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATc > 1:2859675/3‑150 (MQ=255) cgGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGt > 2:5786529/1‑150 (MQ=255) aaaCCCGCTCCTACAGGTACATCAC‑CGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTTGTCTGGATCTGTCAgcg > 2:2471898/1‑150 (MQ=14) aaCCCGCTCCTACAGGTACATCAC‑CGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGAGCTGTCAgcgc > 2:4801985/1‑150 (MQ=14) aCCCGCTCCTACAGGTACATCAC‑CGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCTGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCt > 2:1308870/1‑150 (MQ=14) aCCCGCTCCTACAGGTACATCAC‑CGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACCGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCt > 2:2660498/1‑150 (MQ=14) aCCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCt > 1:1659031/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCtt > 2:1978477/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTc > 1:1183158/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTc > 2:6355121/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTc > 2:6342135/1‑150 (MQ=255) cccccACATGGGCGTCACATGCCCTTGGGG‑GGTTTTGTACCTGTTGGAGGGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTgg < 2:4694070/148‑1 (MQ=38) cTCCCACATGGGCGTCACATGCCCTTGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTgg < 2:3848474/150‑1 (MQ=255) tCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTggg > 1:1813709/1‑150 (MQ=255) ccACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGtt > 2:3674984/1‑150 (MQ=255) cccacgggCGTCACAGGCCCTCGGGC‑GGTGATGTACCTGTTGGCGGGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTa < 2:498758/145‑1 (MQ=39) cacaCGGGCGTCACTTGCCCTTGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTa < 2:3308604/150‑1 (MQ=255) acaAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATAccc < 2:6160648/88‑1 (MQ=255) gCGTCACTTGCCCTCGGGG‑GGTTTTGTACCTTTTGGTGGGGGTTACCCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACg < 2:1866978/150‑1 (MQ=255) | TCGGCACGCAGTTCGAGGATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACG > NC_002947/4866006‑4866303 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |