| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 4,866,181 | 0 | A | C | 9.9% | 686.6 / 51.4 | 246 | intergenic (‑138/+99) | ligA/PP_4275 | DNA ligase/cell division protein ZipA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (144/71); new base C (14/11); total (164/82) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.75e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.04e-01 | |||||||||||
Only 100 of 247 total aligned reads displayed.
TCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTG‑T‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCTGGCG > NC_002947/4866033‑4866330 | tCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTAc < 1:1298002/150‑1 (MQ=255) ggcggTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTAccg > 2:1188480/1‑149 (MQ=255) ggcggTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCt < 1:6362032/150‑1 (MQ=255) 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ggATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTG‑T‑AGGAGC‑gg < 2:1243417/150‑1 (MQ=255) gATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTG‑T‑AGGAGC‑ggg < 1:5138576/150‑1 (MQ=255) aTTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTACATCAC‑CGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTG‑T‑GGGAGC‑GGGt < 2:6672994/150‑1 (MQ=14) aTTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTACATCAC‑CGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTG‑T‑GGGAGC‑GGGt < 1:4137784/150‑1 (MQ=14) aTTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTG‑T‑AGGAGC‑GGGt < 1:6070115/150‑1 (MQ=255) 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cccACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTG‑T‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGt > 2:3336680/1‑150 (MQ=255) ccACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTG‑T‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGtt > 2:4701930/1‑150 (MQ=255) ccACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTG‑T‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGtt > 1:199/1‑150 (MQ=255) acaAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTG‑T‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATAccc > 1:6160648/1‑88 (MQ=255) acaAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTG‑T‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATAccc < 2:6160648/88‑1 (MQ=255) acaAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTG‑T‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAg > 2:323676/1‑150 (MQ=255) caAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTG‑T‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAgc > 1:622355/1‑150 (MQ=255) gggTCACATGCCTTTGGGG‑GGTTTTGTACCTG‑T‑TGGAGG‑GGTTTAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACg < 2:1866877/148‑1 (MQ=255) cGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTG‑T‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACgg < 1:4701930/150‑1 (MQ=255) gTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTG‑T‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGgc > 1:3370557/1‑150 (MQ=255) atcaccgCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTG‑T‑GGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCTGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGgc > 1:2853862/7‑150 (MQ=21) caTGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTG‑T‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTACGATACCCGAACCTGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTACGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGAGCTc > 1:562986/1‑150 (MQ=255) accgCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTG‑T‑GGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCTGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCt > 1:3724013/4‑150 (MQ=21) cccTAGGGC‑GGTGATGTACCTG‑T‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAAc > 1:3063616/1‑150 (MQ=255) ccTAGGGC‑GGTGATGTACCTG‑T‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACt > 1:5292679/1‑150 (MQ=255) cTAGGGC‑GGTTATGTACCTG‑T‑AGGAGC‑GGTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTc < 2:1586775/150‑1 (MQ=255) tAGGGC‑GGTGATGTACCTG‑T‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTcg > 1:1220078/1‑150 (MQ=255) aGGGC‑GGTGATGTACCTG‑T‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTcga > 1:3815223/1‑150 (MQ=255) c‑GGTGATGTACCTG‑T‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGACCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGAt > 2:5554375/1‑150 (MQ=255) tGATGTACCTG‑T‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACg > 2:1398134/1‑150 (MQ=255) gTACCTG‑T‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCTgg > 1:5785233/1‑150 (MQ=255) tACCTG‑T‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCTGGc > 2:5756954/1‑150 (MQ=255) | TCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTG‑T‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCTGGCG > NC_002947/4866033‑4866330 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |