| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,866,183 | C→T | 9.4% | intergenic (‑140/+97) | ligA ← / ← PP_4275 | DNA ligase/cell division protein ZipA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,866,183 | 0 | C | T | 9.4% | 675.2 / 42.0 | 243 | intergenic (‑140/+97) | ligA/PP_4275 | DNA ligase/cell division protein ZipA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (148/68); new base T (14/8); total (162/81) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.37e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.90e-01 | |||||||||||
Only 100 of 251 total aligned reads displayed.
GGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCTGGCGGT > NC_002947/4866035‑4866332 | ggcggTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATTCCCAAGGGC‑GGTGATGTACCt > 1:2154637/1‑150 (MQ=255)ggcggTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCt < 1:3508723/150‑1 (MQ=255) gTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑Ag < 1:5088811/150‑1 (MQ=255) cATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGa < 1:3129679/150‑1 (MQ=255) aTGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAAAACCCGACCCCCAAGGCGTCACAAGCCCGAGGGC‑GGGGATGTAACGgg‑aggat > 1:627185/1‑149 (MQ=255) tGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑atctca > 2:1672493/1‑145 (MQ=255) tGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGc > 2:6418779/1‑150 (MQ=255) gggATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCCACAAGGGCGTCACAATCCCAAGGGC‑GGGGATGTACCGGT‑AGGAGC‑g > 1:1586775/1‑150 (MQ=255) ggATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑gg < 2:1243417/150‑1 (MQ=255) gATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTACATCAC‑CGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGT‑GGGAGC‑ggg < 2:2427409/150‑1 (MQ=14) gATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑ggg < 1:5138576/150‑1 (MQ=255) gATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATCCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑ggg < 1:3774603/150‑1 (MQ=255) aTTTGTCTTCTCTTGCACAGCAACAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCGTCGCGGGTAAACCCGCTCCTCCAGGTACATCAC‑CGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGT‑GGGAGC‑GGGt < 2:6367665/150‑1 (MQ=9) aTTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTACATCAC‑CGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGT‑GGGAGC‑GGGt < 2:6672994/150‑1 (MQ=14) tctcTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTACATCAC‑CGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGT‑GGGAGC‑GGGTTTACCcgc < 1:3902942/150‑1 (MQ=14) tctcTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCcgc > 2:5014591/1‑150 (MQ=255) tctcTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCcgc < 2:1293933/150‑1 (MQ=255) ctctTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGGAAAACCCCGCCCCCAAGGGCGTCACAAGCCCAAGGGC‑GGGGATGTTCCTGT‑AGGGGC‑GGGTTTAACcccg > 1:6348725/1‑150 (MQ=255) tctTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCCCGCCCCCAAGGGCGGCACCTGGCCGAGGGC‑GGGGGTGTAGCTGT‑TTGTGC‑GGGTTTTACCGCGa > 1:3616102/1‑150 (MQ=255) tctTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCCACCAGGGCGTCACATTCCCGAGGGG‑GGGGGTGTACCGGG‑TGGAGC‑GGGTTTAACCGCGa > 1:148922/1‑150 (MQ=255) gtggcacagcaaaAGCGCCGGTTGGGGTGGTGGGTGGGGTTCCCGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACACGGGCGTCACAGGCCCTCGGGC‑GGTGTTGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGaa < 2:29249/147‑1 (MQ=37) ttGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGG‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGCag > 2:6207678/1‑150 (MQ=255) tGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAaga < 2:5625618/150‑1 (MQ=255) aaagcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTTAACCCGCTCCCCCAAGGGCGGCACAAGCCCGAGGGC‑GGGGGTGTACCGGT‑AGGGGCGGGGTTTACCC‑CGAAGAGGc > 1:5397811/1‑150 (MQ=255) aaagcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACCGGCCCGAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGc > 2:749784/1‑150 (MQ=255) aagcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGcc > 2:5530654/1‑150 (MQ=255) agcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGGGGTGTAGCTGT‑TGGGGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCg > 1:4161455/1‑150 (MQ=38) gaaaaaGAGCCGGTTGGGGTGGTGGTTGGGGTTCCTGTTGTCTGTTGACTGGCCCAGCCTCTTCGGGGGTAAACCCGCTCCCACATGGGCGTCAAATGCCCTTGGGG‑GGTGTTGTACGTGT‑AGGAGG‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCgg < 2:3222657/148‑1 (MQ=255) aaaaGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGca > 2:6212148/1‑150 (MQ=255) aaaaGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGG‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGca > 2:6757503/1‑150 (MQ=255) gagCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAgg > 2:5579277/1‑150 (MQ=255) gagCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCGGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAgg > 2:188198/1‑150 (MQ=255) gggTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGGTAACCCCCGCCCCCCCCGGCGGCCCCGTGCCGAGGGC‑GGGGGTGTTCCGGTGGGGGGG‑GGGTTTACCC‑CGAAGAGGGCCGCCCAGGCCAccacgaa > 1:4782030/1‑149 (MQ=255) gtggtgCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAAACCCCGCCCACCACGGCGGCACATGCCCGAGGGC‑GGGGAGGTACCGGG‑AGGAGC‑GGGTTTAACCGCCCAGAGGCCGGCCCAGGCCACCACGAAAc > 1:6039025/1‑150 (MQ=255) ggTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCCAACCGGcc > 2:5312667/1‑150 (MQ=255) tCCTGGTGTGTTTTGAGTGCCCCCCCCTCTGGGCGGTAAACCCCCCCCCCACCCGGGCGTCAATGGCCTTCGGGG‑GTTGTTGTACCTTT‑AGGCGG‑GTTTTAACCCGCTATGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGc < 2:3053278/150‑1 (MQ=255) ccAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGCTGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCa > 2:6416116/1‑150 (MQ=255) aGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTGGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACg > 2:2629883/1‑150 (MQ=255) gtgtCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGcc > 2:3275766/1‑150 (MQ=255) gggtgggTTCACGGTCCCCGCCGCTCCGGGGGAAACCCCGCCCCCACCCGGGCGCCACTGGCCCTCGGGC‑GGTGTTGAACGTGT‑CGGCGC‑GGTTTACCCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGcc < 2:4736026/144‑1 (MQ=255) gggtCTTTTTACTGGGCCCGCCGCTTCGGGGTAAAACCCGCCCCCAAACGGGCGTCACATGCCCTTGGGG‑GGTGTTGTACCGTT‑CGGCGG‑GGGTTAACCCGCGAAGTGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGcc < 2:4736199/148‑1 (MQ=255) cttgtgccTGGGCCCGCATCTCCGGGGGAAAACCCGCCCCCACATGGGCTACACTTGCCGTCGGGG‑GGTTTTTTCCCTTT‑CGTAGG‑GTTTTAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCa < 2:927890/143‑1 (MQ=255) gTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGGTAACCCGCGCCCACAAGGGCGGCCCATGCCCGCGGGC‑GGGGATGTTCCGGG‑GGGAGC‑GGGGTTACCCGCGGAGAGGCCGGCCCCGGCCACGACGATGCCCGAACCGGCCCGCACGCCCTCAgg > 1:4462613/1‑150 (MQ=255) cTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGGCACATGCCCGAGGGC‑GGGGATGTACCGGG‑TGGAGC‑GGGTTTACCCGCGGAGAGGCCGGCACAGGCAACGCCGATAACCGAACCCGCCAGCACGCCCTCAGgctgcg > 2:1424383/1‑149 (MQ=38) ccAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTATCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTc > 2:3145690/1‑150 (MQ=255) aGCCTCTTCGCGGGTAGACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGt > 2:1179631/1‑150 (MQ=255) aGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCCACCAGGGCGGCACATGCCCAAGGGC‑GGTGGTGTACCGGT‑TGGCGC‑GGGTTTTCCCGCGAAGAGGCCGGCACCGGCAACGACGATACCCCAAACGGCCAGCCCGCCCGCAGGCGGCTCgttggg > 2:852081/1‑147 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACACGGGCGTCACAGGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTc < 2:2711803/150‑1 (MQ=255) ctctTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGGCACATGCCCTAGGGC‑GGTGTTGTACCGGT‑AGGAGC‑GGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACCATACCCCAACCGGCCAGCACCCCCACACGCTGCTCGTTCGTcgg > 2:2030952/1‑148 (MQ=37) gggagcgGGTTTACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGa > 2:3358718/5‑150 (MQ=255) ctcggcgGGAAACCCCGCCCCCCCCCGGGCGCCACTGGCCCTGGGGG‑GTTGTTGAACCTGT‑AGGTGG‑GGTTTCCCCCGCGAAGCGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGa < 2:5186574/146‑1 (MQ=255) gagcgGGTTTACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCAAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATc > 1:2859675/3‑150 (MQ=255) cgGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGt > 2:5787395/1‑150 (MQ=255) aaaCCCGCTCCTACAGGTACATCAC‑CGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGT‑GGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTTGTCTGGATCTGTCAgcg > 2:2471898/1‑150 (MQ=14) aaaCCCGCTCCTACAGGTACATCAC‑CGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGT‑GGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAgcg > 2:2924938/1‑150 (MQ=14) aaCCCGCTCCTACAGGTACATCAC‑CGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGT‑GGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGAGCTGTCAgcgc > 2:4801985/1‑150 (MQ=14) aaCCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAgcgc > 1:757873/1‑150 (MQ=255) aaCCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAgcgc > 1:6798921/1‑150 (MQ=255) aCCCGCTCCTACAGGTACATCAC‑CGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGT‑GGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCACCGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCt > 2:2660498/1‑150 (MQ=14) aCCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCt > 1:1659031/1‑150 (MQ=255) aCCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCt > 2:4941112/1‑150 (MQ=255) aCCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCt > 2:4023496/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCtt > 1:2791137/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCtt > 1:1847092/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCtg > 2:5988762/1‑149 (MQ=255) ccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTc > 2:6342158/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTc > 1:2251608/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTc > 1:4354684/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTc > 1:1183142/1‑150 (MQ=255) gCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTg > 2:1133572/1‑150 (MQ=255) cTCCCACACGGGCGTCACATGCCCTTGGGC‑GGTTTTGTACCTGT‑AGGAGG‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTgg < 2:4109456/150‑1 (MQ=39) cTCCCACACGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTgg < 2:3848700/150‑1 (MQ=255) ccccACACGGGCGTCCCAGGCCCTCGGGG‑GGTGATGTCCCTGT‑AGGAGG‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTggg < 2:5402766/149‑1 (MQ=38) cccACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGt > 2:3336822/1‑150 (MQ=255) ccACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGtt > 2:4701930/1‑150 (MQ=255) ccACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGtt > 2:3674984/1‑150 (MQ=255) cacaAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTa > 2:6139540/1‑150 (MQ=255) acaAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATAccc > 1:6160648/1‑88 (MQ=255) acaAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAg > 2:3754501/1‑150 (MQ=255) aaGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAgcg > 2:3835236/1‑150 (MQ=255) gggTCACATGCCTTTGGGG‑GGTTTTGTACCTGT‑TGGAGG‑GGTTTAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACg < 2:1866877/148‑1 (MQ=255) cGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACgg < 1:4701930/150‑1 (MQ=255) gTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGgc > 1:3370557/1‑150 (MQ=255) caTGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACTACGATACCCGAACCTGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTACGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGAGCTc > 1:562986/1‑150 (MQ=255) accgCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGT‑GGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCTGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCt > 1:3723926/4‑150 (MQ=21) tGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGa > 1:6179352/1‑150 (MQ=255) cccTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTc > 2:3581252/1‑105 (MQ=255) cccTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAAc > 1:3063616/1‑150 (MQ=255) ccTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACt > 1:5292679/1‑150 (MQ=255) cTAGGGC‑GGTTATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTc < 2:1586775/150‑1 (MQ=255) tAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTcg > 1:1220078/1‑150 (MQ=255) tAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTcg > 2:2495624/1‑150 (MQ=255) tGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACg > 2:1398134/1‑150 (MQ=255) gTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCTgg > 1:5785233/1‑150 (MQ=255) gTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCTgg > 2:3547417/1‑150 (MQ=255) tACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCTGGc > 2:5756954/1‑150 (MQ=255) tACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCTGGc > 1:3969718/1‑150 (MQ=255) ccTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCTGGCgg > 1:4202732/1‑150 (MQ=255) cTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCTGGCGGt > 1:2689096/1‑150 (MQ=255) cTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCTGGCGGt > 1:5916949/1‑150 (MQ=255) | GGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGT‑AGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGACGATACGCTGGCGGT > NC_002947/4866035‑4866332 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |