Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_002947 | 5,000,519 | C→G | 7.9% | R396G (CGC→GGC) ‡ | bkdB → | branched‑chain alpha‑keto acid dehydrogenase complex lipoamide acyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_002947 | 5,000,519 | 0 | C | G | 7.9% | 747.5 / 41.8 | 227 | R396G (CGC→GGC) ‡ | bkdB | branched‑chain alpha‑keto acid dehydrogenase complex lipoamide acyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (107/102); new base G (10/8); total (117/110) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.08e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.62e-01 |
Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
GCGCCCTGGGTGGCATTGTCAGCACGCCGGTGGTCAACACCCCGGAAGTGGCAATCGTCGGGGTCAACCGCATGGTCGAACGGCCAGTGGTGATCGACGGCCAGATCGTCGTGCGCAAGATGATGAACCTGTCCAGCTCGTTCGACCACCGCGTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGTTCATCCAGGCCGTACGTGGCCTGCTCGAACAACCCGCCTGCCTGTTCGTGGAGTGAGCATGCAACAGATTATCCAGACTACCCTGTTGATCATCGGCGGCGGCCCTGGCGGCTATGTAG > NC_002947/5000370‑5000668 | gcgcCCTGGGTGGCATTGTCAGCACGCCGGTGGTCAACACCCCGGAAGTGGCAATCGTCGGGGTCAACCGCATGGTCGAACGGCCAGTGGTGATCGACGGCCAGATCGTCGTGCGCAAGATGATGAACCTGTCCAGCTCGTTCGaccacc > 1:2296621/1‑150 (MQ=255) gcCCTGGGTGGCATTGTCAGCACGCCGGTGGTCAACACCCCGGAAGTGGCAATCGTCGGGGTCAACCGCATGGTCGAACGGCCAGTGGTGATCGACGGCCAGATCGTCGTGCGCAAGATGATGAACCTGTCCAGCTCGTTCGACCACcgc > 2:2854221/1‑150 (MQ=255) cccTGGGTGGCATTGTCAGCACGCCGGTGGTCAACACCCCGGAAGTGGCAATCGTCGGGGTCAACCGCATGGTCGAACGGCCAGTGGTGATCGACGGCCAGATCGTCGTGCGCAAGATGATGAACCTGTCCAGCTCGTTCGACCACcgcg > 1:1047242/1‑150 (MQ=255) cTGGGTGGCATTGTCAGCACGCCGGTGGTCAACACCCCGGAAGTGGCAATCGTCGGGGTCAACCGCATGGTCGAACGGCCAGTGGTGATCGACGGCCAGATCGTCGTGCGCAAGATGATGAACCTGTCCAGCTCGTTCGACCACCGCGTg > 2:765582/1‑150 (MQ=255) tGGCATTGTCAGCACGCCGGTGGTCAACACCCCGGAAGTGGCAATCGTCGGGGTCAACCGCATGGTCGAACGGCCAGTGGTGATCGACGGCCAGATCGTCGTGCGCAAGATGATGAACCTGTCCAGCTCGTTCGACCACCGCGTGGTCGa < 2:2059338/150‑1 (MQ=255) tGGCATTGTCAGCACGCCGGTGGTCAACACCCCGGAAGTGGCAATCGTCGGGGTCAACCGCATGGTCGAACGGCCAGTGGTGATCGACGGCCAGATCGTCGTGCGCAAGATGATGAACCTGTCCAGCTCGTTCGACCACCGCGTGGTCGa > 2:5256801/1‑150 (MQ=255) tGGCATTGTCAGCACGCCGGTGGTCAACACCCCGGAAGTGGCAATCGTCGGGGTCAACCGCATGGTCGAACGGCCAGTGGTGATCGACGGCCAGATCGTCGTGCGCAAGATGATGAACCTGTCCAGCTCGTTCGACCACCGCGTGGTCGa > 2:2497914/1‑150 (MQ=255) tGGCATTGTCAGCACGCCGGTGGTCAACACCCCGGAAGTGGCAATCGTCGGGGTCAACCGCATGGTCGAACGGCCAGTGGTGATCGACGGCCAGATCGTCATGCGCAAGATGATGAACCTGTCCAGCTCGTTCGACCACCGCGTGGTCGa < 1:6586758/150‑1 (MQ=255) ggCATTGTCAGCACGCCGGTGGTCAACACCCCGGAAGTGGCAATCGTCGGGGTCAACCGCATGGTCGAACGGCCAGTGGTGATCGACGGCCAGATCGTCGTGCGCAAGATGATGAACCTGTCCAGCTCGTTCGACCACGCGGTGGTCGaa < 1:5246520/150‑2 (MQ=255) ggCATTGTCAGCACGCCGGTGGTCAACACCCCGGAAGTGGCAATCGTCGGGGTCAACCGCATGGTCGAACGGCCAGTGGTGATCGACGGCCAGATCGTCGTGCGCAAGATGATGAACCTGTCCAGCTCGTTCGACCACGCGGTGGTCGaa < 1:365168/150‑2 (MQ=255) ggCATTGTCAGCACGCCGGTGGTCAACACCCCGGAAGTGGCAATCGTCGGGGTCAACCGCATGGTCGAACGGCCAGTGGTGATCGACGGCCAGATCGTCGTGCGCAAGATGATGAACCTGTCCAGCTCGTTCGACCACGCGGTGGTCGaa < 2:5189860/150‑2 (MQ=255) cATTGTCAGCACGCCGGTGGTCAACACCCCGGAAGTGGCAATCGTCGGGGTCAACCGCATGGTCGAACGGCCAGTGGTGATCGACGGCCAGATCGTCGTGCGCAAGATGATGAACCTGTCCAGCTCGTTCGACCACCGCGTGGTCGATgg > 2:6039148/1‑150 (MQ=255) cATTGTCAGCACGCCGGTGGTCAACACCCCGGAAGTGGCAATCGTCGGGGTCAACCGCATGGTCGAACGGCCAGTGGTGATCGACGGCCAGATCGTCGTGCGCAAGATGATGAACCTGTCCAGCTCGTTCGACCACCGCGTGGTCGATgg < 1:1211799/150‑1 (MQ=255) cATTGTCAGCACGCCGGTGGTCAACACCCCGGAAGTGGCAATCGTCGGGGTCAACCGCATGGTCGAACGGCCAGTGGTGATCGACGGCCAGATCGTCGTGCGCAAGATGATGAACCTGTCCAGCTCGTTCGACCACCGCGTGGTCGATgg > 2:5628788/1‑150 (MQ=255) tGTCAGCACGCCGGTGGTCAACACCCCGGAAGTGGCAATCGTCGGGGTCAACCGCATGGTCGAACGGCCAGTGGTGATCGACGGCCAGATCGTCGTGCGCAAGATGATGAACCTGTCCAGCTCGTTCGACCACCGCGTGGTCGATGGCAt < 1:5091575/150‑1 (MQ=255) tCAGCACGCCGGTGGTCAACACCCCGGAAGTGGCAATCGTCGGGGTCAACCGCATGGTCGAACGGCCAGTGGTGATCGACGGCCAGATCGTCGTGCGCAAGATGATGAACCTGTCCAGCTCGTTCGACCACCGCGTGGTCGATGGCATgg < 1:2896148/150‑1 (MQ=255) aGCACGCCGGTGGTCAACACCCCGGAAGTGGCAATCGTCGGGGTCAACCGCATGGTCGAACGGCCAGTGGTGATCGACGGCCAGATCGTCGTGCGCAAGATGATGAACCTGTCCAGCTCGTTCGACCACCGCGTGGTCGATGGCATGGAt > 2:1328852/1‑150 (MQ=255) aGCACGCCGGTGGTCAACACCCCGGAAGTGGCAATCGTCGGGGTCAACCGCATGGTCGAACGGCCAGTGGTGATCGACGGCCAGATCGTCGTGCGCAAGATGATGAACCTGTCCAGCTCGTTCGACCACCGCGTGGTCGATGGCATGGAt > 2:5740133/1‑150 (MQ=255) 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aaCACCCCGGAAGTGGCAATCGTCGGGGTCAACCGCATGGTCGAACGGCCAGTGGTGATCGACGGCCAGATCGTCGTGCGCAAGATGATGAACCTGTCCAGCTCGTTCGACCACCGCGTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGTTCATc > 2:3006196/1‑150 (MQ=255) aaCACCCCGGAAGTGGCAATCGTCGGGGTCAACCGCATGGTCGAACGGCCAGTGGTGATCGACGGCCAGATCGTCGTGCGCAAGATGATGAACCTGTCCAGCTCGTTCGACCACCGCGTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGTTCATc < 2:6829850/150‑1 (MQ=255) aaCACCCCGGAAGTGGCAATCGTCGGGGTCAACCGCATGGTCGAACGGCCAGTGGTGATCGACGGCCAGATCGTCGTGCGCAAGATGATGAACCTGTCCAGCTCGTTCGACCACCGCGTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGTTCATc < 1:1894614/150‑1 (MQ=255) aaCACCCCGGAAGTGGCAATCGTCGGGGTCAACCGCATGGTCGAACGGCCAGTGGTGATCGACGGCCAGATCGTCGTGCGCAAGATGATGAACCTGTCCAGCTCGTTCGACCACCGCGTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGTTCATc > 2:6768901/1‑150 (MQ=255) aaCACCCCGGAAGTGGCAATCGTCGGGGTCAACCGCATGGTCGAACGGCCAGTGGTGATCGACGGCCAGATCGTCGTGCGCAAGATGATGAACCTGTCCAGCTCGTTCGACCACCGCGTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGTTCATc < 1:4600098/150‑1 (MQ=255) 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cAATCGTCGGGGTCAACCGCATGGTCGAACGGCCAGTGGTGATCGACGGCCAGATCGTCGTGCGCAAGATGATGAACCTGTCCAGCTCGTTCGACCACCGCGTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGTTCATCCAGGCCGTACGTGGcc > 1:6541511/1‑150 (MQ=255) aaTCGTCGGGGTCAACCGCATGGTCGAACGGCCAGTGGTGATCGACGGCCAGATCGTCGTGCGCAAGATGATGAACCTGTCCAGCTCGTTCGACCACCGCGTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGTTCATCCAGGCCGTACGTGGCCt < 2:3058503/150‑1 (MQ=255) ggggTCAACCGCATGGTCGAACGGCCAGTGGTGATCGACGGCCAGATCGTCGTGCGCAAGATGATGAACCTGTCCAGCTCGTTCGACCACCGCGTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGTTCATCCAGGCCGTACGTGGCCTGCTCGaa > 1:2629053/1‑150 (MQ=255) ggTCAACCGCATGGTCGAACGGCCAGTGGTGATCGACGGCCAGATCGTCGTGCGCAAGATGATGAACCTGTCCAGCTCGTTCGACCACCGCGTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGTTCATCCAGGCCGTACGTGGCCTGCTCGaaca > 1:1060719/1‑150 (MQ=255) gTCAACCGCATGGTCGAACGGCCAGTGGTGATCGACGGCCAGATCGTCGTGCGCAAGATGATGAACCTGTCCAGCTCGTTCGACCACCGCGTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGTTCATCCAGGCCGTACGTGGCCTGCTCGaacaa > 2:2422161/1‑150 (MQ=255) 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atCGACCACGCGGTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGTTCATCCAGGCCGTACGTGGCCTGCTCGAACAACCCGCCTGCCTGTTCGTGGAGTGAGCATGCAACAGATTATCCAGACTACCCTGTTGATCATCGGCGGCGGCCCTggcg > 1:4836191/2‑150 (MQ=255) atCGACCACGCGGTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGTTCATCCAGGCCGTACGTGGCCTGCTCGAACAACCCGCCTGCCTGTTCGTGGAGTGAGCATGCAACAGATTATCCAGACAACCCTGGTGATCATCGGCGGCGGCCCTggcg > 1:6154708/2‑150 (MQ=255) tCGACCACGCGGTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGTTCATCCAGGCCGTACGTGGCCTGCTCGAACAACCCGCCTGCCTGTTCGTGGAGTGAGCATGCAACAGATTATCCAGACTACCCTGTTGATCATCGGCGGCGGCCCTggcgg > 2:3246438/1‑150 (MQ=255) tCGACCACCGCGTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGTTCATCCAGGCCGTACGTGGCCTGCTCGAACAACCCGCCTGCCTGTTCGTGGAGTGAGCATGCAACAGATTATCCAGACTACCCTGTTGATCATCGGCGGCGGCCCTggcgg < 2:3380939/150‑1 (MQ=255) gACCACCGCGTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGTTCATCCAGGCCGTACGTGGCCTGCTCGAACAACCCGCCTGCCTGTTCGTGGAGTGAGCATGCAACAGATTATCCAGACTACCCTGTTGATCATCGGCGGTGGCCCTGGCGGCt > 2:4561567/1‑150 (MQ=255) gACCACCGCGTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGTTCATCCAGGCCGTACGTGGCCTGCTCGAACAACCCGCCTGCCTGTTCGTGGAGTGAGCATGCAACAGATTATCCAGACTACCCTGTTGATCATCGGCGGCGGCCCTGGCGGCt > 1:3096253/1‑150 (MQ=255) gACCACCGCGTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGTTCATCCAGGCCGTACGTGGCCTGCTCGAACAACCCGCCTGCCTGTTCGTGGAGTGAGCATGCAACAGATTATCCAGACTACCCTGTTGATCATCGGCGGCGGCCCTGGCGGCt > 2:3103438/1‑150 (MQ=255) accaccGCGTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGTTCATCCAGGCCGTACGTGGCCTGCTCGAACAACCCGCCTGCCTGTTCGTGGAGTGAGCATGCAACAGATTATCCAGACTACCCTGTTGATCATCGGCGGCGGCCCTGGCGGCTa < 2:1120204/150‑1 (MQ=255) ccaccGCGTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGTTCATCCAGGCCGTACGTGGCCTGCTCGAACAACCCGCCTGCCTGTTCGTGGAGTGAGCATGCAACAGATTATCCAGACTACCCTGTTGATCATCGGCGGCGGCCCTGGCGGCTAt > 1:3335148/1‑150 (MQ=255) ccaccGCGTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGTTCATCCAGGCCGTACGTGGCCTGCTCGAACAACCCGCCTGCCTGTTCGTGGAGTGAGCATGCAACAGATTATCCAGACTACCCTGTTGATCATCGGCGGCGGCCCTGGCGGCTAt > 2:1050446/1‑150 (MQ=255) ccaccGCGTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGTTCATCCAGGCCGTACGTGGCCTGCTCGAACAACCCGCCTGCCTGTTCGTGGAGTGAGCATGCAACAGATTATCCAGACTACCCTGTTGATCATCGGCGGCGGCCCTGGCGGCTAt > 1:4679888/1‑150 (MQ=255) accGCGTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGTTCATCCAGGCCGTACGTGGCCTGCTCGAACAACCCGCCTGCCTGTTCGTGGAGTGAGCATGCAACAGATTATCCAGACTACCCTGTTGATCATCGGCGGCGGCCCTGGCGGCTATGt < 2:6572373/150‑1 (MQ=255) ccGCGTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGTTCATCCAGGCCGTACGTGGCCTGCTCGAACAACCCGCCTGCCTGTTCGTGGAGTGAGCATGCAACAGATTATCCAGACTACCCTGTTGATCATCGGCGGCGGCCCTGGCGGCTATGTa > 1:6309283/1‑150 (MQ=255) cgcgTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGTTCATCCAGGCCGTACGTGGCCTGCTCGAACAACCCGCCTGCCTGTTCGTGGAGTGAGCATGCAACAGATTATCCAGACTACCCTGTTGATCATCGGCGGCGGCCCTGGCGGCTATGTag > 2:3226520/1‑150 (MQ=255) cgcgTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGTTCATCCAGGCCGTACGTGGCCTGCTCGAACAACCCGCCTGCCTGTTCGTGGAGTGAGCATGCAACAGATTATCCAGACTACCCTGTTGATCATCGGCGGCGGCCCTGGCGGCTATGTag < 2:5430012/150‑1 (MQ=255) | GCGCCCTGGGTGGCATTGTCAGCACGCCGGTGGTCAACACCCCGGAAGTGGCAATCGTCGGGGTCAACCGCATGGTCGAACGGCCAGTGGTGATCGACGGCCAGATCGTCGTGCGCAAGATGATGAACCTGTCCAGCTCGTTCGACCACCGCGTGGTCGATGGCATGGATGCCGCCCTGTTCATCCAGGCCGTACGTGGCCTGCTCGAACAACCCGCCTGCCTGTTCGTGGAGTGAGCATGCAACAGATTATCCAGACTACCCTGTTGATCATCGGCGGCGGCCCTGGCGGCTATGTAG > NC_002947/5000370‑5000668 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |