Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,478,806 | T→A | 5.2% | N329I (AAC→ATC) ‡ | proA ← | gamma‑glutamyl phosphate reductase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,478,806 | 0 | T | A | 5.2% | 1126.8 / 32.9 | 328 | N329I (AAC→ATC) ‡ | proA | gamma‑glutamyl phosphate reductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (167/143); new base A (6/11); total (173/155) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.44e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.63e-01 |
Only 100 of 332 total aligned reads displayed.
GAAGCCATCGGCAAAGCAGGTCGGGGTGTTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACGCTCGCAACCGCGCAGCTCCACGCCCTTCTCCACGAAGCGGCGGGCCATT > NC_002947/5478658‑5478955 | gAAGCCATCGGCAAAGCAGGTCGGGGTGTTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGtt > 2:1329302/1‑150 (MQ=255) aGCCATCGGCAAAGCAGGTCGGGGTGTTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCa < 2:2082482/150‑1 (MQ=255) aGCCATCGGCAAAGCAGGTCGGGGTGTTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCa > 2:572571/1‑150 (MQ=255) gCCATCGGCAAAGCAGGTCGGGGTGTTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAg < 2:3284332/150‑1 (MQ=255) gCCATCGGCAAAGCAGGTCGGGGTGTTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAg < 2:6139550/150‑1 (MQ=255) gCCATCGGCAAAGCAGGTCGGGGTGTTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAg < 1:3007915/150‑1 (MQ=255) ccATCGGCAAAGCAGGTCGGGGTGTTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAgg < 1:3071040/150‑1 (MQ=255) aTCGGCAAAGCAGGTCGGGGTGTTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGcc > 1:6412754/1‑150 (MQ=255) aTCGGCAAAGCAGGTCGGGGTGTTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGcc > 2:3786531/1‑150 (MQ=255) aTCGGCAAAGCAGGTCGGGGTGTTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGcc > 2:6234903/1‑150 (MQ=255) aTCGGCAAAGCAGGTCGGGGTGTTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGCGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGcc > 2:102101/1‑150 (MQ=255) ggCAAAGCAGGTCGGGGTGTTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGAACCAGGCCATc < 2:4599755/150‑1 (MQ=255) ggCAAAGCAGGTCGGGGTGTTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGAACCAGGCCATc < 2:3607255/150‑1 (MQ=255) ggCAAAGCAGGTCGGGGTGTTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGAACCAGGCCATc < 2:2428934/150‑1 (MQ=255) gCAAAGCAGGTCGGGGTGTTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCATGGTTCAGGCCGTCg > 2:3663020/1‑150 (MQ=255) cAAAGCAGGTCGGGGTGTTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGa < 2:5061391/150‑1 (MQ=255) cAAAGCAGGTCGGGGTGTTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGa < 1:892260/150‑1 (MQ=255) cAAAGCAGGTCGGGGTGTTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGACGGCCTGAACCAGGCCATCGa < 1:4879083/150‑1 (MQ=255) aaaGCAGGTCGGGGTGTTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGAc > 1:2036734/1‑150 (MQ=255) aGCAGGTCGGGGTGTTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCa < 2:3147133/150‑1 (MQ=255) aGGTCGGGGTGTTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGGGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCAcgc < 2:883942/150‑1 (MQ=255) ggggTGTTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATc > 2:4522057/1‑150 (MQ=255) ggTGTTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGa < 2:2989479/150‑1 (MQ=255) tgtTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACa > 1:2056844/1‑150 (MQ=255) tgtTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACa < 2:5639237/150‑1 (MQ=255) tgtTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACa < 1:541092/150‑1 (MQ=255) gAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGAt > 2:1495825/1‑150 (MQ=255) gAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGAt < 2:5002931/150‑1 (MQ=255) ccGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGa < 2:1749507/150‑1 (MQ=255) cGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAg > 1:6775717/1‑150 (MQ=255) cGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAg < 1:6564835/150‑1 (MQ=255) cGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAg > 1:1554412/1‑150 (MQ=255) cGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGACGATCGACACGGTGTGGCGCGAGCCAGAGTCGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCCTCGACCACGCGCCACGACAGGATCGCAACGAg < 2:2924436/150‑1 (MQ=255) gAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTcc < 1:4074548/150‑1 (MQ=255) gAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTcc > 2:5396621/1‑150 (MQ=255) gAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTcc > 2:4224798/1‑150 (MQ=255) aaTCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCg > 2:1451581/1‑150 (MQ=255) tCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCTCCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCgtg < 1:3611445/150‑1 (MQ=255) cGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCgtgt < 1:6132422/150‑1 (MQ=255) aCCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGc < 1:2429793/150‑1 (MQ=255) aCCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGc < 1:1839938/150‑1 (MQ=255) cTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCa > 1:730983/1‑150 (MQ=255) ccATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCgg < 1:117739/150‑1 (MQ=255) aTGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCt > 1:58486/1‑150 (MQ=255) aTGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCt > 2:1958731/1‑150 (MQ=255) gAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTc < 1:1769522/150‑1 (MQ=255) cTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGt < 1:3445405/150‑1 (MQ=255) tGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTg < 1:3219818/150‑1 (MQ=255) tGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTg > 1:3517103/1‑150 (MQ=255) gACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTgg < 2:2568928/150‑1 (MQ=255) aCGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGc < 2:5242517/150‑1 (MQ=255) aCGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGc > 2:6274147/1‑150 (MQ=255) gggCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGa > 2:4693963/1‑90 (MQ=255) gggCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGa < 1:4693963/90‑1 (MQ=255) cTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGtt < 1:1457236/150‑1 (MQ=255) ttCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGttt > 2:3739401/1‑150 (MQ=255) ttCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGttt > 2:2612327/1‑150 (MQ=255) cACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTgg > 1:3311705/1‑150 (MQ=255) cccTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCgg < 1:3762725/136‑1 (MQ=255) ccTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGgcgc < 1:4437898/150‑1 (MQ=255) ccTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGGTTGgcgc > 2:6818375/1‑150 (MQ=255) tGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCtg > 1:4058804/1‑150 (MQ=255) ggTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCtga < 1:1964605/150‑1 (MQ=255) gtTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCtgatga < 2:3545918/150‑1 (MQ=255) ttCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTgatgat < 1:2837881/150‑1 (MQ=255) tCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATa < 2:4071439/150‑1 (MQ=255) tCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATa < 2:3334009/150‑1 (MQ=255) gCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGc < 1:1509972/150‑1 (MQ=255) tgatgaTCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCt > 2:5128039/1‑150 (MQ=255) tgatgaTCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCt > 1:2322390/1‑150 (MQ=255) gtgCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACGCTCGCAACcgcg > 1:520500/1‑150 (MQ=255) tgCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACGCTCGCAACCgcgc > 2:1569471/1‑150 (MQ=255) gCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACGCTCGCAACCGCGCa < 1:1002103/150‑1 (MQ=255) aTAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACGCTCGCAACCGCGCAGCTCCAc > 1:2651338/1‑150 (MQ=255) aGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTAc < 1:636897/126‑1 (MQ=255) aGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACGCTCGCAACCGCGCAGCTCCACGc > 2:6517152/1‑150 (MQ=255) tGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACGCTCGCAACCGCGCAGCTCCACGccc < 1:319942/150‑1 (MQ=255) tGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACGCTCGCAACCGCGCAGCTCCACGccc < 2:4733751/150‑1 (MQ=255) ggTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACGCTCGCAACCGCGCAGCTCCACGCCCt > 1:2544505/1‑150 (MQ=255) ttGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACGCTCGCAACCGCGCAGCTCCACGCCCTtc < 2:642128/150‑1 (MQ=255) ttGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACGCTCGCAACCGCGCAGCTCCACGCCCTtc < 1:572598/150‑1 (MQ=255) tGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACGCTCGCAACCGCGCAGCTCCACGCCCTtct < 2:3437674/150‑1 (MQ=255) gATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACGCTCGCAACCGCGCAGCTCCACGCCCTtctc > 1:4272019/1‑150 (MQ=255) tgtgCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACGCTCGCAACCGCGCAGCTCCACGCCCTTCTCCa > 2:5912104/1‑150 (MQ=255) cgtgGTCGACGGCCTGAACCAGGCCATCGAGCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACGCTCGCAACCGCGCAGCTCCACGCCCTTCTCCa > 1:6675453/2‑150 (MQ=255) tgCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGgcg < 1:3899481/96‑1 (MQ=255) tgCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACGCTCGCAACCGCGCAGCTCCACGCCCTTCTCCACg > 1:5139317/1‑150 (MQ=255) tgCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACGCTCGCAACCGCGCAGCTCCACGCCCTTCTCCACg > 1:5479885/1‑150 (MQ=255) gCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACGCTCGCAACCGCGCAGCTCCACGCCCTTCTCCACGa > 1:1924272/1‑150 (MQ=255) cTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACGCTCGCAACCGCGCAGCTCCACGCCCTTCTCCACGaa > 1:5656156/1‑150 (MQ=255) cTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACGCTCGCAACCGCGCAGCTCCACGCCCTTCTCCACGaa < 1:2305670/150‑1 (MQ=255) cGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACGCTCGCAACCGCGCAGCTCCACGCCCTTCTCCACGAAgc < 1:1709604/150‑1 (MQ=255) ccTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGATGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACGCTCGCAACCGCGCAGCTCCACGCCCTTCTCCACGAAGCGGCggg > 1:2668828/1‑150 (MQ=255) ccTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACGCTCGCAACCGCGCAGCTCCACGCCCTTCTCCACGAAGCGGCggg > 1:4979583/1‑150 (MQ=255) ccTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACGCTCGCAACCGCGCAGCTCCACGCCCTTCTCCACGAAGCGGCggg < 1:6067484/150‑1 (MQ=255) cTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACGCTCGCAACCGCGCAGCTCCACGCCCTTCTCCACGAAGCGGCGGGc > 1:4611879/1‑150 (MQ=255) cTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACGCTCGCAACCGCGCAGCTCCACGCCCTTCTCCACGAAGCGGCGGGc > 2:6644566/1‑150 (MQ=255) tGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACGCTCGCAACCGCGCAGCTCCACGCCCTTCTCCACGAAGCGGCGGGcc > 1:1619096/1‑150 (MQ=255) tGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACGCTCGCAACCGCGCAGCTCCACGCCCTTCTCCACGAAGCGGCGGGcc > 2:6785018/1‑150 (MQ=255) ttCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACGCTCGCAACCGCGCAGCTCCACGCCCTTCTCCACGAAGCGGCGGGCCAtt > 1:6206020/1‑150 (MQ=255) | GAAGCCATCGGCAAAGCAGGTCGGGGTGTTGAGCATGACCGACGCCGAATCGACCTCAGCCATGAACTGACGGGCTTCACCCTGGTGTTCGCTGATGATCGAGTCGGTGTGGTGCGAGCCATAGTGGTTGATGTGCTCGATGGCCTGGTTCAGGCCGTCGACCACGCGAATCGACAGGATCGCATCGAGGTATTCCGTGTGCCAGTCGGCTTCGGTGGCCGGTTTGGCGCTGATGATAGCCTGGGTACGCTCGCAACCGCGCAGCTCCACGCCCTTCTCCACGAAGCGGCGGGCCATT > NC_002947/5478658‑5478955 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |