| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,542,058 | A→C | 12.4% | intergenic (+38/+65) | nadE → / ← PP_4870 | NH(3)‑dependent NAD(+) synthetase/azurin |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,542,058 | 0 | A | C | 12.4% | 448.4 / 13.0 | 216 | intergenic (+38/+65) | nadE/PP_4870 | NH(3)‑dependent NAD(+) synthetase/azurin |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (94/72); new base C (4/24); total (102/114) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.64e-05 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 219 total aligned reads displayed.
GCAGATCGATGCCTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCA‑CCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAG > NC_002947/5541909‑5542206 | gcAGATCGATGCCTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGa < 1:1687446/150‑1 (MQ=255)gcAGATCGATGCCTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGa > 2:4497533/1‑150 (MQ=255) cAGATCGATGCCTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGGTGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAg < 2:4408044/150‑1 (MQ=255) cAGATCGATGCCTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAg < 2:5216116/150‑1 (MQ=255) aGATCGATGCCTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCCAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGAAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAgg < 1:862888/150‑1 (MQ=255) aGATCGATGCCTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAgg < 2:2383079/150‑1 (MQ=255) aGATCGATGCCTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAgg < 1:1045910/150‑1 (MQ=255) aGATCGATGCCTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAgg < 2:247707/150‑1 (MQ=255) aGATCGATGCCTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAgg < 2:5783640/150‑1 (MQ=255) gATGCCTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGaa < 1:3944563/150‑1 (MQ=255) aTGCCTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTGTCCCGCGAATAAGAGGGTGTAc > 2:5760022/1‑150 (MQ=255) aTGCCTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGAGAAGTGGCCTGCGGGAGCGGGGTCACCCGCCCAGACGCGGGTGAAc > 2:1209807/1‑150 (MQ=255) ccTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCa < 1:3103096/150‑1 (MQ=255) cTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTGACCCGCGCATTCGAGGGGGAACCCA‑c > 2:5150367/1‑150 (MQ=255) cTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCA‑c > 2:6857877/1‑150 (MQ=255) cTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGGTCACCCGCGACTACGAGGGTGCACCCA‑c > 2:2909859/1‑150 (MQ=255) ttCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGGGGACCCCCGCGCACGAGGGGGGAcccc‑cc > 1:4111217/1‑150 (MQ=255) ccTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCA‑CCGa < 2:2864713/150‑1 (MQ=255) gCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCA‑CCGACGc < 2:5938384/150‑1 (MQ=255) gCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTAACCCCCCAAAAAGATGGTGAACcca‑cccaccc > 1:1058858/1‑148 (MQ=255) gCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGGTCACCCGCGAATTCGAGGGTGAACCCC‑CCGAccc > 1:2251190/1‑148 (MQ=255) gCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCA‑CCGACGCATTcgc < 1:4341278/150‑1 (MQ=255) cAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTGACCCCCGAAAAAGAGGGTGAACCCA‑CCGACGCAATagcg > 1:3252265/1‑150 (MQ=255) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACCAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCA‑CCGACGCATTCGCgg < 2:5912657/150‑1 (MQ=255) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACACGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCA‑CCGACGCATTCGCgg < 1:4790609/150‑1 (MQ=255) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCA‑CCCTCGTATTCGCgg < 1:6649315/150‑1 (MQ=25) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGTCGGTGGGTTCA‑CCCTCGTATTCGCgg < 1:3518522/150‑1 (MQ=25) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCA‑CCGACGCATTCGCgg < 2:862933/150‑1 (MQ=255) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCA‑CCGACGCATTCGCgg < 1:5723419/150‑1 (MQ=255) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCA‑CCGACGCATTCGCgg < 1:6061267/150‑1 (MQ=255) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCA‑CCGACGCATTCGCgg < 2:4752113/150‑1 (MQ=255) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCA‑CCGACGCATTCGCgg < 1:3396594/150‑1 (MQ=255) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCA‑CCGACGCATTCGCgg < 1:2325143/150‑1 (MQ=255) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCA‑CCGACGCATTCGCgg < 1:4636974/150‑1 (MQ=255) aGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGGTGACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCA‑CCCACGCATTCGCgg > 2:3700287/1‑150 (MQ=255) aCCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAACGAGGGTGAACCCA‑CCGACGCATTCGCGGGTGAACCCg > 2:4151870/1‑150 (MQ=255) gACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGGGGACCCGCGCAAACGGGGGGGGACCCA‑CCGCCGCCATCGGGGGTGTACCCGCGCCCGGAggggtg > 1:5543942/1‑147 (MQ=255) aCATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCA‑ACGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCAGCAGGGTTCg > 2:5677271/1‑150 (MQ=255) atcatcGTCGCCACCTACCGCACGACCCAGCACACGCGCGAACTGCCTTTCGCTCCTTTATACGTGGCCTGCAGGAGGGGGTTCCCCCGCGAATACGCGGGTGACCCCA‑CCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGcc < 1:4455859/150‑1 (MQ=37) atcatcGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGGGGGCCCGCGAAAACGAGGGTGGTGCCC‑CCGACCCCATCGCCGGTGTAACCCCGCCTGCCGGGGTGGcc > 1:4065771/1‑150 (MQ=255) tcatcGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGATCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGGTCACCCGCGAATACGAGGGTGGACCCA‑CCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCg > 2:6571235/1‑150 (MQ=255) tcgtcgCCACCTACCGCAAGACCCAGCACACCCGCGAACTGCCGTGCGCTCCTTGATACGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCA‑CCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCa < 2:5572583/150‑1 (MQ=255) ccACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGGTGCCCCGCGAATACGAGGGTGGACCCA‑CCCACGCAATAGCGGGTGAACCCGCGCCAGCAGGGTTAGCCGGCCGCCgtt > 1:3909916/1‑150 (MQ=255) cTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAACGAGGGTGTAACCC‑CCGACGCAGTCGCGGGTGAACCCCCTCCGGCAGGGTTCGCCGTCAGccgatgttt > 2:2597329/1‑143 (MQ=255) aCCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACTAGGGTGAACCCA‑CCCACGCCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGGTCGCCGTCAGCCGTTGATTAc > 2:3806496/1‑150 (MQ=39) cgaaaGACCCAGCACACGCGCTAACGGCGGTTCGCTCCTTGATATGTGGCCTGCAGGAGGGGGTTCACCCGCTAATACGCGGGTGAACCCA‑CCGACGCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACtt < 1:5057749/147‑1 (MQ=38) cGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTGGATCAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCA‑CCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACtt < 2:5076838/150‑1 (MQ=255) cGCAACACCCCGCACATCCGCTACCTGCCTTTCGCTCCTTCAAAAGTGGCCTGCAGGAGCGGTTTCCCCCGCTAATACGAGGGTGAACCCA‑CCGACGCATTGGCGGGTGACCCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACtt < 2:1329743/150‑1 (MQ=255) gCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATTCGAGGGTGAACCCA‑CCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGGTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTg > 2:4445621/1‑150 (MQ=255) cAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCCCGAAAACGAGGGTGAACCCA‑CCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCACCTGCAGGGGTCGCCGGCAGCCGTTGATTAATTGa > 1:6863595/1‑150 (MQ=38) aaGACCCAGCACACGCGCGAACTGCGGTTCGATCCTTTATACGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCTAATCCGAGGGTGAACCAA‑CCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGAc < 2:5199587/150‑1 (MQ=38) aCCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGGTCACCCCCCAATACCCGGGTGTAACCA‑CCGCCGCCAGCGCGGGTGTAACCGCACCCGCACGGGTAGCCGGCCGCCGTTGAGTACGTGAccag > 2:5387257/1‑147 (MQ=255) cccgCACAAGCGCTACCTGCGGTTCGCCCCTTTATATGGGGCCTGCAGGCGCGGGTCCACCCGCTAATACGTGGTTTACCCCA‑CCGACGATTTCGGGGGTTAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGa < 1:4932555/147‑1 (MQ=255) ccAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTAACCCCCGAAAACGAGGGTGAACCCA‑CCCACGCATTCGCGGGTGAAACCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGGCAGCCGTTGATTAAGTGTCGATGa > 2:3558666/1‑150 (MQ=255) ccAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGGTCAACCCCGAAAACCAGGGTGAACCCACCCGAC‑CCTTCGCCGGTGAAACCGCGCCTGGCGGGTTCGCCGTCAGCCATTTGTTAATTGTCGAAGa > 2:3131087/1‑150 (MQ=255) aGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGGATACGAGGGTGAAACCA‑CCGACGCCTTCGCGGGTGTACCCGCGCCGGCAGGGTTAGCCGGCCGCCGTTGATTACTGGTAGATGAcc > 1:6284685/1‑150 (MQ=255) gCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCA‑CCGACGCATTAGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCGTTGATTACTTGACGATGACCt > 2:6225771/1‑150 (MQ=255) caAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAAACCA‑CCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCAGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGc > 2:2731504/1‑150 (MQ=255) gcgAACTGCGTTTCGCTCCTTTTTAAGTGGCCTGCTGGAGGGGTTTCACCCGCTATTAGGTGGTTTAACCCA‑CCGACGCTTTCGGGGTTTAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTtc < 2:1922493/150‑1 (MQ=255) cgAACGGCCGTTCGCTCATTGATATGTGGCCTGCTGGAGCGGTTTAACCCGCTAATCCGAGGGTGAACCCA‑CCGACGCTTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTtca < 1:2820015/150‑1 (MQ=255) tGCGGTGCGCTCCTTTATATGTGCCCTGCTGGTGGGGGTTCACCCGCTAATAGGCGGTTCACCCCA‑CCGCGGCTTTGGCGGGTCAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCatcatc < 1:3592145/150‑1 (MQ=255) ggCCGTGCGGTCCTTGATCCGGGGCCTGCTGGAGGGGGTTCACCGGCTAATACGCGGGTGAACCCA‑CCGACGCATTGGCGGGTTAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCatcatc < 1:6205152/149‑1 (MQ=255) ccGTTCGCTCATTGATACGTGGCCTGCTGGAGCGTGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCA‑CCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCga < 2:361726/150‑1 (MQ=255) gTTCGCTCCTTTATATGTGGCCTGCAGGAGGGGGTTCACCCGCTAATACGAGGTTGAACCCA‑CCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCgaga < 2:1779803/150‑1 (MQ=38) gTTCGCTCATTGATCTGTGGCCTGCTGGTGGGGTTACCCCCGGGAATTCTTGGGTGAACCAA‑CCTCCGAATTGGCGTGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCgaga < 1:1114295/150‑1 (MQ=255) tCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCA‑CCGACGCATTCGCGGGTGAACCCCCTCCTGCAGGGTTAGCCCTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTTCCGTTCATCATCGAGATGTGGc > 2:5028761/1‑150 (MQ=38) tCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGGTCACCCCCGCAAACGTGGGGGCACCCA‑CCCACGCAGTCGCGGGGGGCCCCCCACCAGCACGGGTGGCCGGCCGCCGTTGATTTCGTGAAGATGGCCCTGGCGTTCATCAGCGAGAAGTggg > 2:3648665/1‑149 (MQ=255) cTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCCCGAAAAAGACGGTGAACCCC‑CCCCCCCCATCGCGGGTGAACCCCCGCCTGCAGGGTTCGCCGGCCCCCGTTGATTACATGACGCTTACCATGCCGTTACTCAGAGAGATGTGGccc > 2:4912311/1‑150 (MQ=255) cTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCAACCCCCAATAAGAGGGTGAACCCA‑ACCACGCAATCGCCGGTGAAACCCCAACTTCAGGGTTCGCCCTCAGCCTATGATTTATTTACCATTAACGTTCCTTTCATCAAAGAGATGTGGccc > 2:2629478/1‑150 (MQ=255) ttGATAAGGGGCCTGCAGGCGCGGGTTCCCCCGCGAATACGAGGTTTAACCCA‑CCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCg < 1:4546386/150‑1 (MQ=38) cgtgccgtGCTGGCGCGGGTACACCCGCCAATCCGCGGTTCACCCCA‑CCGACGCCTTCGGGGGTCACCCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAgg < 1:659720/143‑1 (MQ=255) gggCCCGCTGGCGGGGGTCCACCGGCTAATACGCGGGTGACCCCA‑CCGACGCATGGGCGGGTCCCCCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTg < 1:5982236/149‑1 (MQ=255) ccTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAAGAGGGTGAAACCA‑CCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCGCCGGCCGGGTTCGCCGGCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCag > 2:2218915/1‑150 (MQ=38) tGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCA‑CCGACGCATTCGCGGGTGAAACCGCTCCTGCAGGGTTCGCCCTCAGCCGTTGATTACTTGGCGATGGCCTTGCCTTTCAACAACGTGTAGTGGCCCGGGCATGTGCagaa > 2:6210125/1‑150 (MQ=37) tGCAGGAGCGGGTTCACCCCCGCATACGAGGGTGAACCCA‑CCGACGCATTCGCGGGTGAAACCCCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCGTTTATTTCTTGTCGATGACCATGGCTTTCATCATACAGATGTGGCCCGGGCAGGTGCagaa > 2:6701849/1‑150 (MQ=255) tGCAGGAGCGGGTTAACCCGCGAATAAGAGGGTGAACCCA‑CCCACCCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCGGCAGGGTTCGCCGTCAGCCATTGATTACTTGACGATTACCATGCCGTTAAACATCGAGATGTGGCCCGGGCAGGTGCagaa > 2:433205/1‑150 (MQ=37) gCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGACCCCA‑CCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCagaag < 2:5665909/150‑1 (MQ=255) gCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCA‑CCGACGCATTCGCGGGTGAACCCCCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCCGCCGTTGATTACTTGACGGTGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCagaag > 2:6734059/1‑150 (MQ=255) aGGCGCGGGTCCACCCGCGAATCCGCGGGTGAACCCC‑CCGACGCATTCGCGGGTGACCCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAgaagaa < 2:110933/150‑1 (MQ=255) gAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCA‑CCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGc > 1:5637750/1‑150 (MQ=255) gggTTCACCCGCTATTACGAGGGATAACCCA‑CCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTa < 2:1282875/150‑1 (MQ=255) gggTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCA‑CCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCTAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTa < 2:1056419/150‑1 (MQ=255) gTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCA‑CCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGt > 1:1282370/1‑150 (MQ=255) gTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCA‑CCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGt > 1:5926506/1‑150 (MQ=255) gTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCA‑CCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGt > 1:5186005/1‑150 (MQ=255) ttCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCA‑CCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTc > 2:3987337/1‑150 (MQ=255) aCCCGCGAATACGAGGGTGAACCCA‑CCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTcacc > 1:679237/1‑150 (MQ=255) cccGCGAATGCGTCGGTGGGTTCA‑CCCTCGTATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCGGAAGAAGCTGTAGTcacca > 2:834048/1‑150 (MQ=25) ccGCGAATACGAGGGTGAACCCA‑CCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTg < 1:2601349/53‑1 (MQ=255) ccGCGAATACGAGGGTGAACCCA‑CCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTcaccac > 1:3433759/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATACGAGGGTGAACCCA‑CCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTcaccac > 2:4562518/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATACGAGGGTGAACCCA‑CCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTcaccac > 1:1928182/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATACGAGGGTGAACCCA‑CCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTcaccac > 2:3891478/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATACGAGGGTGAACCCA‑CCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTcaccac > 2:3890322/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATACGAGGGTGAACCCA‑CCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACGTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTcaccac > 2:6398441/1‑150 (MQ=255) cgcgAATACGAGGGTGAACCCA‑CCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCCTCGAGATGTGGCCCGGGACGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCaccacc > 2:6013363/1‑150 (MQ=255) gagAATACGAGGGTGAACCCA‑CCGACGCATTCGCGGTTGAACACGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCATTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGATGTAGTCACCACCg > 2:3744285/3‑150 (MQ=255) cgAATACGAGGGTGAACCCA‑CCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCgg > 1:813535/1‑150 (MQ=255) aCGAGGGTGAACCCA‑CCGACGCATTCGCGGGTGTACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCCTCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCttgc < 2:6220199/150‑3 (MQ=255) gAGGGTGAACCCA‑CCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAg > 1:5664188/1‑150 (MQ=255) | GCAGATCGATGCCTTCCTGCATGGGCAGCCGGTTGACCAGGCAGCGTTCGACATCATCGTCGCCACCTACCGCAAGACCCAGCACAAGCGCGAACTGCCGTTCGCTCCTTGATAAGTGGCCTGCAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGAGGGTGAACCCA‑CCGACGCATTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAGGGTTCGCCGTCAGCCTTTGATTACTTGACGATGACCTTGCCTTTCATCATCGAGATGTGGCCCGGGAAGGTGCAGAAGAAGCTGTAGTCACCACCGGCTTCCAG > NC_002947/5541909‑5542206 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |