Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_002947 | 5,563,372 | C→A | 5.6% | R294L (CGT→CTT) | purA ← | adenylosuccinate synthetase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_002947 | 5,563,372 | 0 | C | A | 5.6% | 1032.4 / 32.8 | 304 | R294L (CGT→CTT) | purA | adenylosuccinate synthetase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (130/157); new base A (7/10); total (137/167) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.06e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
Only 100 of 309 total aligned reads displayed.
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2:4123784/3‑150 (MQ=255) gTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATaccacc > 2:4928275/1‑150 (MQ=255) gTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATaccacc > 2:4612968/1‑150 (MQ=255) tGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCg > 1:2153685/1‑150 (MQ=255) ccACGCTGGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGTATTTCCACCggtt < 2:5224111/150‑3 (MQ=255) aCGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGTATTTCCACCggttcc < 1:1919159/150‑5 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |