| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,595,528 | C→G | 7.1% | V66L (GTG→CTG) | pde ← | 3',5'‑cyclic‑nucleotide phosphodiesterase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,595,528 | 0 | C | G | 7.1% | 986.1 / 48.3 | 295 | V66L (GTG→CTG) | pde | 3',5'‑cyclic‑nucleotide phosphodiesterase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (124/150); new base G (12/9); total (136/159) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.65e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
Only 100 of 308 total aligned reads displayed.
CACCCGCCACGCGCCGATATCAGTCACCGCCTGCACCAGTTCAGGCGCCACCTGCGCCATCACCTGAGCCTCGTCATGGTTGCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGCCAACACGTGGCGCAGGCTGTCTCGGGTCTTGAGGCCCAGCATGCTGCCAGCCGGGTCGGCGAACAGGTGGGCATCGG > NC_002947/5595379‑5595677 | caccCGCCACGCGCCGATATCAGTCACCGCCTGCACCAGTTCAGGCGCCACCTGCGCCATCACCTGAGCCTCGTCATGGTTGCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCAc > 1:22371/1‑150 (MQ=255) ccACGCGCCGATATCAGTCACCGCCTGCACCAGTTCAGGCGCCACCTGCGCCATCACCTGAGCCTCGTCATGGTTGCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGc < 1:6322757/150‑1 (MQ=255) ccACGCGCCGATATCAGTCACCGCCTGCACCAGTTCAGGCGCCACCTGCGCCATCACCTGAGCCTCGTCATGGTTGCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGc > 1:716732/1‑150 (MQ=255) gcCGATATCAGTCACCGCCTGCACCAGTTCAGGCGCCACCTGCGCCATCACCTGAGCCTCGTCATGGTTGCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCAGCGTGGCATCCta < 1:1335249/150‑2 (MQ=255) ccGATATCAGTCACCGCCTGCACCAGTTCAGGCGCCACCTGCGCCATCACCTGAGCCTCGTCATGGTTGCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTgg < 2:3730311/150‑1 (MQ=255) gATATCAGTCACCGCCTGCACCAGTTCAGGCGCCACCTGCGCCATCACCTGAGCCTCGTCATGGTTGCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCAGCGTGGCATCCtatga < 1:6790875/150‑5 (MQ=255) tatCAGTCACCGCCTGCACCAGTTCAGGCGCCACCTGCGCCATCACCTGAGCCTCGTCATGGTTGCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACa < 1:2507202/150‑1 (MQ=255) tCAGTCACCGCCTGCACCAGTTCAGGCGCCACCTGCGCCATCACCTGAGCCTCGTCATGGTTGCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAgg > 1:6769067/1‑150 (MQ=255) cAGTCACCGCCTGCACCAGTTCAGGCGCCACCTGCGCCATCACCTGAGCCTCGTCATGGTTGCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGt > 1:4276490/1‑150 (MQ=255) aGTCACCGCCTGCACCAGTTCAGGCGCCACCTGCGCCATCACCTGAGCCTCGTCATGGTTGCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTc < 2:6083246/150‑1 (MQ=255) tCACCGCCTGCACCAGTTCAGGCGCCACCTGCGCCATCACCTGAGCCTCGTCATGGTTGCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGc > 1:16262/1‑150 (MQ=255) tCACCGCCTGCACCAGTTCAGGCGCCACCTGCGCCATCACCTGAGCCTCGTCATGGTTGCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGc > 1:2169867/1‑150 (MQ=255) tCACCGCCTGCACCAGTTCAGGCGCCACCTGCGCCATCACCTGAGCCTCGTCATGGTTGCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGc > 2:5068124/1‑150 (MQ=255) aCCGCCTGCACCAGTTCAGGCGCCACCTGCGCCATCACCTGAGCCTCGTCATGGTTGCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGccc > 1:4413220/1‑150 (MQ=255) ccGCCTGCACCAGTTCAGGCGCCACCTGCGCCATCACCTGAGCCTCGTCATGGTTGCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCg > 1:3389550/1‑150 (MQ=255) cGCCTGCACCAGTTCAGGCGCCACCTGCGCCATCACCTGAGCCTCGTCATGGTTGCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGt < 1:4038408/150‑1 (MQ=255) gCCTGCACCAGTTCAGGCGCCACCTGCGCCATCACCTGAGCCTCGTCATGGTTGCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTg < 2:5327259/150‑1 (MQ=255) gCCTGAACTGGTGCAGGCGCCACCTGCGCCATCACCTGAGCCTCGTCAGGGTTGCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTg > 1:4804150/1‑150 (MQ=255) ccTGCACCAGTTCAGGCGCCACCTGCGCCATCACCTGAGCCTCGTCATGGTTGCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGc > 1:5938589/1‑150 (MQ=255) ccTGCACCAGTTCAGGCGCCACCTGCGCCATCACCTGAGCCTCGTCATGGTTGCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGc < 2:1235068/150‑1 (MQ=255) cTGCACCAGTTCAGGCGCCACCTGCGCCATCACCTGAGCCTCGTCATGGTTGCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTg < 1:288795/132‑1 (MQ=255) cTGCACCAGTTCAGGCGCCACCTGCGCCATCACCTGAGCCTCGTCATGGTTGCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTg > 2:288795/1‑132 (MQ=255) gCACCAGTTCAGGCGCCACCTGCGCCATCACCTGAGCCTCGTCATGGTTGCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGcaca > 2:4552121/1‑150 (MQ=255) cACCAGTTCAGGCGCCACCTGCGCCATCACCTGAGCCTCGTCATGGTTGCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCAcag > 1:2537728/1‑150 (MQ=255) aCCAGTTCAGGCGCCACCTGCGCCATCACCTGAGCCTCGTCATGGTTGCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCAcagc > 1:5705210/1‑150 (MQ=255) aCCAGTTCAGGCGCCACCTGCGCCATCACCTGAGCCTCGTCATGGTTGCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCAcagc < 1:6864019/150‑1 (MQ=255) aCCAGTTCAGGCGCCACCTGCGCCATCACCTGAGCCTCGTCATGGTTGCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCAcagc < 1:5124317/150‑1 (MQ=255) aCCAGTTCAGGCGCCACCTGCGCCATCACCTGAGCCTCGTCATGGTTGCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCAcagc > 2:3622168/1‑150 (MQ=255) ccAGTTCAGGCGCCACCTGCGCCATCACCTGAGCCTCGTCATGGTTGCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCAcagca < 1:5865068/150‑1 (MQ=255) ccAGTTCAGGCGCCACCTGCGCCATCACCTGAGCCTCGTCATGGTTGCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCAcagca < 2:2017557/150‑1 (MQ=255) cAGTTCAGGCGCCACCTGCGCCATCACCTGAGCCTCGTCATGGTTGCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCAcagcag > 2:5670239/1‑150 (MQ=255) aGTTCAGGCGCCACCTGCGCCATCACCTGAGCCTCGTCATGGTTGCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACagcagc < 2:554613/150‑1 (MQ=255) gTTCAGGCGCCACCTGCGCCATCACCTGAGCCTCGTCATGGTTGCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTg > 1:1772539/1‑116 (MQ=255) gTTCAGGCGCCACCTGCGCCATCACCTGAGCCTCGTCATGGTTGCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAgcagca > 1:2313016/1‑150 (MQ=255) ttCAGGCGCCACCTGCGCCATCACCTGAGCCTCGTCATGGTTGCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCaa < 1:2843143/150‑1 (MQ=255) tCAGGCGCCACCTGCGCCATCACCTGAGCCTCGTCATGGTTGCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAg < 2:3071679/150‑1 (MQ=255) aGGCGCCACCTGCGCCATCACCTGAGCCTCGTCATGGTTGCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTc < 2:3389550/150‑1 (MQ=255) gcgcCACCTGCACCATCACCTGAGCCTCGTCATGGTTGCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGa > 1:2062700/1‑150 (MQ=255) 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tCATGGTTGCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGcc > 2:4121697/1‑150 (MQ=255) aTGGTTGCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGCCaa < 1:332098/150‑1 (MQ=255) aTGGTTGCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGCCaa < 1:5314482/150‑1 (MQ=255) gCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGCCAACACGTg < 1:614328/150‑1 (MQ=255) gCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGCCAACACGTg < 1:308150/150‑1 (MQ=255) 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aaaCGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTTCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGCCAACACGTGGCGCAGGCTGTCTCGGGTCTTGAGGcc < 2:4384023/150‑1 (MQ=255) aaaCGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGCCAACACGTGGCGCAGGCTGTCTCGGGTCTTGAGGcc > 2:1588197/1‑150 (MQ=255) aCGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGCCAACACGTGGCGCAGGCTGTCTCGGGTCTTGAGGCCCa > 1:101680/1‑150 (MQ=255) cGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGCCAACACGTGGCGCAGGCTGTCTCGGGTCTTGAGGCCCAg > 2:1295669/1‑150 (MQ=255) gTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGCCAACACGTGGCGCAGGCTGTCTCGGGTCTTGAGGCCCAGCa < 1:84569/150‑1 (MQ=255) cGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGCCAACACGTGGCGCAGGCTGTCTCGGGTCTTGAGGCCCAGCAtgc > 2:6717794/1‑150 (MQ=255) ggTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGCCAACACGTGGCGCAGGCTGTCTCGGGTCTTGAGGCCCAGCAtgct < 2:1437280/150‑1 (MQ=255) tCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGCCAACACGTGGCGCAGGCTGTCTCGGGTCTTGAGGCCCAGCATGCTGCCAGcc > 1:4111121/1‑150 (MQ=255) tCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGCCAACACGTGGCGCAGGCTGTCTCGGGTCTTGAGGCCCAGCATGCTGCCAGcc > 1:1874999/1‑150 (MQ=255) cccGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGCCAACACGTGGCGCAGGCTGTCTCGGGTCTTGAGGCCCAGCATGCTGCCAGCCg > 2:1691681/1‑150 (MQ=255) 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ccaGGATGCCAGCGTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGCCAACACGTGGCGCAGGCTGTCTCGGGTCTTGAGGCCCAGCATGCTGCCAGCCGGGTCGGCGAACAg > 1:4936285/3‑150 (MQ=255) caGGATGCCAGCGTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGCCAACACGTGGCGCAGGCTGTCTCGGGTCTTGAGGCCCAGCATGCTGCCAGCCGGGTCGGCGAACAgg > 2:487390/2‑150 (MQ=255) aGGATGCCAGCGTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGCCAACACGTGGCGCAGGCTGTCTCGGGTCTTGAGGCCCAGCATGCTGCCAGCCGGGTCGGCGAACAGGt > 2:6744677/1‑150 (MQ=255) aGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGCCAACACGTGGCGCAGGCTGTCTCGGGTCTTGAGGCCCAGCATGCTGCCAGCCGGGTCGGCGAACAGGt < 2:3922315/150‑1 (MQ=255) ggATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGCCAACACGTGGCGCAGGCTGTCTCGGGTCTTGAGGCCCAGCATGCTGCCAGCCGGGTCGGCGAACAGGTg < 1:2196647/150‑1 (MQ=255) ggATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGCCAACACGTGGCGCAGGCTGTCTCGGGTCTTGAGGCCCAGCATGCTGCCAGCCGGGTCGGCGAACAGGTg > 1:290730/1‑150 (MQ=255) gATGCCAGCGTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGCCAACACGTGGCGCAGGCTGTCTCGGGTCTTGAGGCCCAGCATGCTGCCAGCCGGGTCGGCGAACAGGTgg < 2:4936285/150‑1 (MQ=255) gATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGCCAACACGTGGCGCAGGCTGTCTCGGGTCTTGAGGCCCAGCATGCTGCCAGCCGGGTCGGCGAACAGGTgg < 1:5248152/150‑1 (MQ=255) gATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGCCAACACGTGGCGCAGGCTGTCTCGGGTCTTGAGGCCCAGCATGCTGCCAGCCGGGTCGGCGAACAGGTgg < 1:6630529/150‑1 (MQ=255) aCGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGCCAACACGTGGCGCAGGCTGTCTCGGGTCTTGAGGCCCAGCATGCTGCCAGCCGGGTCGGCGAACAGGTGGGCATCg < 2:5175107/150‑1 (MQ=255) aCGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGCCAACACGTGGCGCAGGCTGTCTCGGGTCTTGAGGCCCAGCATGCTGCCAGCCGGGTCGGCGAACAGGTGGGCATCg > 1:518169/1‑150 (MQ=255) | CACCCGCCACGCGCCGATATCAGTCACCGCCTGCACCAGTTCAGGCGCCACCTGCGCCATCACCTGAGCCTCGTCATGGTTGCCCGGCAGCCAGCGAGTGGGTACGGCAAACGGTGCGGTCAGCTCCCGAAACGCTTCATAGGATGCCACGCTGGCATCCTGGGACAGGTCGCCCGTGCACAGCAGCAAGTCGACAAGCGGCTGCTCGCGCCGCACCTGGGCCAACACGTGGCGCAGGCTGTCTCGGGTCTTGAGGCCCAGCATGCTGCCAGCCGGGTCGGCGAACAGGTGGGCATCGG > NC_002947/5595379‑5595677 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |