| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,663,123 | A→G | 5.7% | K60E (AAG→GAG) | sahR → | methionine metabolism transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,663,123 | 0 | A | G | 5.7% | 993.6 / 30.5 | 313 | K60E (AAG→GAG) | sahR | methionine metabolism transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (151/143); new base G (7/11); total (158/155) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.40e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.75e-01 | |||||||||||
Only 100 of 324 total aligned reads displayed.
GCAACGCGAAACATTGGCAGCCCTGTGCAAAGCCAGTGGCGATGCGCTGCGCCTGAACGTATTGCGCGCCTTGGCCAATGACTCGTTCGGCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCGGCTGCACGCGGCGCTGCTCGAAGAAGTCGACGACCTGGCCCTACCGCCCGAT > NC_002947/5662975‑5663272 | cAACGCGAAACATTGGCAGCCCTGTGCAAAGCCAGTGGCGATGCGCTGCGCCTGAACGTATTGCGCGCCTTGGCCAATGACTCGTTCGGCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAg < 2:4336779/150‑1 (MQ=255) aCGCGAAACATTGGCAGCCCTGTGCAAAGCCAGTGGCGATGCGCTGCGCCTGAACGTATTGCGCGCCTTGGCCAATGACTCGTTCGGCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCAGCACCTTGAGGt < 2:2689659/150‑1 (MQ=255) cgAAACATTGGCAGCCCTGTGCAAAGCCAGTGGCGATGCGCTGCGCCTGAACGTATTGCGCGCCTTGGCCAATGACTCGTTCGGCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCCTGAGCCAGCACCTTGAGGTgat < 1:1134820/150‑3 (MQ=255) gAAACATTGGCAGCCCTGTGCAAAGCCAGTGGCGATGCGCTGCGCCTGAACGTATTGCGCGCCTTGGCCAATGACTCGTTCGGCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTg < 1:4672748/150‑1 (MQ=255) aCATTGGCAGCCCTGTGCAAAGCCAGTGGCGATGCGCTGCGCCTGAACGTATTGCGCGCCTTGGCCAATGACTCGTTCGGCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCt > 1:756183/1‑150 (MQ=255) aCATTGGCAGCCCTGTGCAAAGACAGAGGCGATGCGATGCGCCTGAAAGTATTGCGCGCCTTGGCCAAAGACTCGTTCGTCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCt > 1:5960910/1‑150 (MQ=255) cATTGGCAGCCCTGTGCAAAGCCAGTGGCGATGCGCTGCGCCTGAACGTATTGCGCGCCTTGGCCAATGACTCGTTCGGCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCAGCACCTTGAGGTGATGGCTc < 1:3410561/150‑1 (MQ=255) aTTGGCAGCCCTGTGCAAAGCCAGTGGCGATGCGCTGCGCCTGAACGTATTGCGCGCCTTGGCCAATGACTCGTTCGGCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCa > 1:4564947/1‑150 (MQ=255) tGGCAGCCCTGTGCAAAGCCAGTGGCGATGCGCTGCGCCTGAACGTATTGCGCGCCTTGGCCAATGACTCGTTCGGCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑gg < 1:5479295/150‑1 (MQ=255) tGGCAGCCCTGTGCAAAGCCAGTGGCGATGCGCTGCGCCTGAACGTATTGCGCGCCTTGGCCAATGACTCGTTCGGCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑gg > 1:938745/1‑150 (MQ=255) ccTGTGCAAAGCCAGTGGCGATGCGCTGCGCCTGAACGTATTGCGCGCCTTGGCCAATGACTCGTTCGGCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCt > 1:5329762/1‑150 (MQ=255) cTGTGCAAAGCCAGTGGCGATGCGCTGCGCCTGACCGTATTGCGCGCCTTGGCCAATGACTCGTTCGGCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTc < 2:3190302/150‑1 (MQ=255) cTGTGCAAAGCCAGTGGCGATGCGCTGCGCCTGAACGTATTGCGCGCCTTGGCCAATGACTCGTTCGGCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTc < 1:6207075/150‑1 (MQ=255) tgtgCAAAGCCAGTGGCGATGCGCTGCGCCTGAACGTATTGCGCGCCTTGGCCAATGACTCGTTCGGCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCg > 2:6566262/1‑150 (MQ=255) tgtgCAAAGCCAGTGGCGATGCGCTGCGCCTGAACGTATTGCGCGCCTTGGCCAATGACTCGTTCGGCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCg > 2:2548267/1‑150 (MQ=255) gtgCAAAGCCAGTGGCGATGCGCTGCGCCTGAACGTATTGCGCGCCTTGGCCAATGACTCGTTCGGCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGt < 1:5086751/150‑1 (MQ=255) tgCAAAGCCAGTGGCGATGCGCTGCGCCTTAACGTATTGCGCGCCTTGGCCAATGACTCGTTCGGCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTg < 1:3714077/150‑1 (MQ=255) aaGCCAGTGGCGATGCGCTGCGCCTGAACGTATTGCGCGCCTTGGCCAATGACTCGTTCGGCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCaa < 2:1726702/150‑1 (MQ=255) aaGCCAGTGGCGATGCGCTGCGCCTGAACGTATTGCGCGCCTTGGCCAATGACTCGTTCGGCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCaa < 1:569388/150‑1 (MQ=255) aaGCCAGTGGCGATGCGCTGCGCCTGAACGTATTGCGCGCCTTGGCCAAGGACTCGTTCGGCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCaa < 1:2369111/150‑1 (MQ=255) tGGCGATGCGCTGCGCCTGAACGTATTGCGCGCCTTGGCCAATGACTCGTTCGGCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACccgccg < 1:3316353/150‑1 (MQ=255) tGGCGATGCGCTGCGCCTGAACGTATTGCGCGCCTTGGCCAATGACTCGTTCGGCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACccgccg > 1:2974374/1‑150 (MQ=255) aTGCGCTGCGCCTGAACGTATTGCGCGCCTTGGCCAATGACTCGTTCGGCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAg > 2:5586889/1‑150 (MQ=255) aTGCGCTGCGCCTGAACGTATTGCGCGCCTTGGCCAATGACTCGTTCGGCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAg < 1:1297332/150‑1 (MQ=255) ccgAACGTAGGGCGCGCCTTGGCCAAGGACGCGGTCGGCGTGCGGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCAtc < 2:5293895/148‑1 (MQ=255) cTGAACGTATTGCGCGCCTTGGCCAATGACTCGTTCGGCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCAtc > 2:3154881/1‑150 (MQ=255) cTGAACGTATTGCGCGCCTTGGCCAATGACTCGTTCGGCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCAtc > 2:4409347/1‑150 (MQ=255) gAACGTATTGCGCGCCTTGGCCAATGACTCGTTCGGCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCAtctt > 2:2119138/1‑150 (MQ=255) aaCGTATTGCGCGCCTTGGCCAATGACTCGTTCGGCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCAtcttc < 1:6097900/150‑1 (MQ=255) gTATTGCGCGCCTTGGCCAATGACTCGTTCGGCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTAc > 1:6065194/1‑150 (MQ=255) ttGCGCGCCTTGGCCAATGACTCGTTCGGCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTAccgc > 1:3825561/1‑150 (MQ=255) tGCGCGCCTTGGCCAATGACTCGTTCGGCGTGCTGTAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGACAGTCGGGCATGATCAATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGACGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTAccgcc > 2:5621087/1‑150 (MQ=255) ttGGCCAATGACTCGTTCGGCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGtgccctg > 2:1446570/1‑150 (MQ=255) ttGGCCAATGACTCGTTCGGCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGtgccctg > 1:4278060/1‑150 (MQ=255) cAATGACTCGTTCGGCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGa > 1:2249057/1‑150 (MQ=255) cAATGACTCGTTCGGCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGa < 1:5586889/150‑1 (MQ=255) aaTGACTCGTTCGGCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGAt > 2:1962298/1‑150 (MQ=255) aaTGACTCGTTCGGCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGAt > 1:5217970/1‑150 (MQ=255) aaTGACTCGTTCGGCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGAt > 1:3523233/1‑150 (MQ=255) aTGACTCGTTCGGCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATg < 1:841352/150‑1 (MQ=255) aTGACTCGTTCGGCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATg < 1:1830008/150‑1 (MQ=255) gACTCGTTCGGCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGc < 1:2342535/150‑1 (MQ=255) tCGTTCGGCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCACCCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTg > 2:4659661/1‑150 (MQ=255) tCGTTCGGCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTg > 2:3936257/1‑150 (MQ=255) cGGCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCt < 2:5183826/150‑1 (MQ=255) gCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTgg < 2:6348546/150‑1 (MQ=255) gCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTgg < 1:2284335/150‑1 (MQ=255) cGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTggg < 1:2716818/150‑1 (MQ=255) gCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTgg > 2:5418471/1‑150 (MQ=255) cTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGc < 2:4367515/150‑1 (MQ=255) cTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGc > 1:2468572/1‑150 (MQ=255) tGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGcc > 2:5845976/1‑150 (MQ=255) tGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGcc < 1:4788965/150‑1 (MQ=255) gAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCgg > 2:2253944/1‑150 (MQ=255) gAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCgg > 1:6627341/1‑150 (MQ=255) aaCTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCGGc < 1:3245552/150‑1 (MQ=255) aCTGGCGCAGCTCTTCGCCCTCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCCAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGGGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCGGCt < 2:796200/150‑1 (MQ=255) aCTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCGGCt < 1:1021204/150‑1 (MQ=255) aCTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCGGCt < 1:3576237/150‑1 (MQ=255) aCTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCGGCt > 1:5789063/1‑150 (MQ=255) gcgcAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTa > 1:6708847/1‑104 (MQ=255) gcgcAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCGGCTGCAc > 1:1966265/1‑150 (MQ=255) tCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCGGCTGCACGCGgcgc < 1:1525234/150‑1 (MQ=255) gACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCGGCTGCACGCGGCGCTGCTc > 2:1260162/1‑150 (MQ=255) gACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCGGCTGCACGCGGCGCTGCTc < 1:4873472/150‑1 (MQ=255) gACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCGGCTGCACGCGGCGCTGCTc < 1:6566262/150‑1 (MQ=255) aTCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCACGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCGGCTGCACGCGGCGCTGCTCgaa < 2:401732/150‑1 (MQ=255) aTCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCGGCTGCACGCGGCGCTGCTCgaa < 2:4897473/150‑1 (MQ=255) aTCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCGGCTGCACGCGGCGCTGCTCgaa < 2:5120352/150‑1 (MQ=255) aTCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCGGCTGCACGCGGCGCTGCTCgaa > 2:4244100/1‑150 (MQ=255) aTCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCGGCTGCACGCGGCGCTGCTCgaa < 2:3739788/150‑1 (MQ=255) aTCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCGGCTGCACGCGGCGCTGCTCgaa < 2:3610431/150‑1 (MQ=255) ggCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCGGCTGCACGCGGCGCTGCTCgaagaa < 1:4431105/150‑1 (MQ=255) aGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGa > 2:6665886/1‑100 (MQ=255) tCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCGGCTGCACGCGGCGCTGCTCGAAGAAGTcgac > 1:2885322/1‑150 (MQ=255) tcggCCTGAGCCAGCACCTTGAGGTGATGGCTCATGCCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCGGCTGCACGCGGCGCTGCTCGAAGAAGTcgac > 2:3800485/3‑150 (MQ=38) tcggCCTGAGCCAGCACCTTGAGGTGATGGCTCATGCCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCGGCTGCACGCGGCGCTGCTCGAAGAAGTcgac > 1:1713351/3‑150 (MQ=38) gCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCGGCTGCACGCGGCGCTGCTCGAAGAAGTCGACGAcc < 2:6411910/150‑1 (MQ=255) cATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCGGCTGAACGCGGCGCTGCTCGAAGAAGTCGACGACCt < 1:5300822/150‑1 (MQ=255) aTGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCGGCTGCACGCGGCGCTGCTCGAAGAAGTCGACGACCTg > 2:3087289/1‑150 (MQ=255) tGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCGGCTGCACGCGGCGCTGCTCGAAGAAGTCGACGACCTgg < 2:4176725/150‑1 (MQ=255) aTCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCGGCTGCACGCGGCGCTGCTCGAAGAAGTCGACGACCTGGCCCTAc > 2:2804805/1‑150 (MQ=255) aTCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCGGCTGCACGCGGCGCTGCTCGAAGAAGTCGACGACCTGGCCCTAc > 2:6819233/1‑150 (MQ=255) tCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCGGCTGCACGCGGCGCTGCTCGAAGAAGTCGACGACCTGGCCCTAcc > 1:3981278/1‑150 (MQ=255) tCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCGGCTGCACGCGGCGCTGCTCGAAGAAGTCGACGACCTGGCCCTAcc > 2:1208772/1‑150 (MQ=255) tCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCGGCTGCACGCGGCGCTGCTCGAAGAAGTCGACGACCTGGCCCTAcc > 1:5708259/1‑150 (MQ=255) tCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCGGCTGCACGCGGCGCTGCTCGAAGAAGTCGACGACCTGGCCCTAcc > 1:6288785/1‑150 (MQ=255) tCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCGGCTGCACGCGGCGCTGCTCGAAGAAGTCGACGACCTGGCCCTAcc > 1:827699/1‑150 (MQ=255) cACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCGGCTGCACGCGGCGCTGCTCGAAGAAGTCGACGACCTGGCCCTACCg > 1:2151816/1‑150 (MQ=255) aCCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCGGCTGCACGCGGCGCTGCTCGAAGAAGTCGACGACCTGGCCCTACCGc < 2:6870735/150‑1 (MQ=255) aCCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCGGCTGCACGCGGCGCTGCTCGAAGAAGTCGACGACCTGGCCCTACCGc < 2:939446/150‑1 (MQ=255) cTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCGGCTGCACGCGGCGCTGCTCGAAGAAGTCGACGACCTGGCCCTACCGccc < 1:4745502/150‑1 (MQ=255) cTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCGGCTGCACGCGGCGCTGCTCGAAGAAGTCGACGACCTGGCCCTACCGccc > 1:2633733/1‑150 (MQ=255) cTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCGGCTGCACGCGGCGCTGCTCGAAGAAGTCGACGACCTGGCCCTACCGccc < 2:1118244/150‑1 (MQ=255) tCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCGGCTGCACGCGGCGCTGCTCGAAGAAGTCGACGACCTGGCCCTACCGCCCg > 1:1855169/1‑150 (MQ=255) tCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCGGCTGCACGCGGCGCTGCTCGAAGAAGTCGACGACCTGGCCCTACCGCCCg > 2:3373124/1‑150 (MQ=255) aaGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCGGCTGCACGCGGCGCTGCTCGAAGAAGTCGACGACCTGGCCCTACCGCCCGAt < 2:4756905/150‑1 (MQ=255) aaGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCGGCTGCACGCGGCGCTGCTCGAAGAAGTCGACGACCTGGCCCTACCGCCCGAt > 2:4085895/1‑150 (MQ=255) aaGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCGGCTGCACGCGGCGCTGCTCGAAGAAGTCGACGACCTGGCCCTACCGCCCGAt < 1:6489151/150‑1 (MQ=255) aaGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCGGCTGCACGCGGCGCTGCTCGAAGAAGTCGACGACCTGGCCCTACCGCCCGAt < 2:2974374/150‑1 (MQ=255) | GCAACGCGAAACATTGGCAGCCCTGTGCAAAGCCAGTGGCGATGCGCTGCGCCTGAACGTATTGCGCGCCTTGGCCAATGACTCGTTCGGCGTGCTGGAACTGGCGCAGATCTTCGACATCGGCCAGTCGGGCATGAGCCATCACCTCAAGGTGCTGGCTCA‑GGCCGACCTCGTGGCAACCCGCCGCGAAGGCAACGCCATCTTCTACCGCCGTGCCCTGCCCGATGGCCTGCGCCTGGGTGGCCGGCTGCACGCGGCGCTGCTCGAAGAAGTCGACGACCTGGCCCTACCGCCCGAT > NC_002947/5662975‑5663272 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |