| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 5,703,797 | 0 | G | A | 8.6% | 546.7 / 30.1 | 185 | intergenic (+82/‑85) | hslU/PP_5002 | protease HslVU ATPase subunit/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (78/91); new base A (4/12); total (82/103) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.21e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.37e-01 | |||||||||||
Only 100 of 195 total aligned reads displayed.
CGGCGTATGTGAACAGCCACCTGGGTGAGCTGGCACAGAACGAAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTTCGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACA‑ACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGC‑TTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAGCCTCCAAGACCCTCAGCCTCACCTAC > NC_002947/5703648‑5703944 | ggcgTATGTGAACAGCCACCTGGGTGAGCTGGCACAGAACGAAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTTCGACAGTTTCGCGGGGCACCCCGCGCCAGCCCGCGCCACCCCACCCCCGTGGGCC‑GTGGGGGTACGTGCggggg > 2:5478084/1‑150 (MQ=255) gcgTATGTGAACAGCCACCTGGGTGAGCTGGCACAGAACGAAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTTCGACAGTTTCGCGGGGCAACCCCCACCAGCACCCCCCCCCACA‑ACCCCAGGGCCCGTGGTGGTACCTGCGGgggc > 1:1676519/1‑150 (MQ=255) gTATGTGAACAGCCACCTGGGTGAGCTGGCACAGAACGAAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTTCGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACA‑ACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGgcgg > 2:3801914‑M2/1‑146 (MQ=255) 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gcCACCACA‑ACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCAGGAgcgggcttgcccgcgaaactgtcgaaaccggtcttacagaatgtaacgcgaccggtcttcgttctgtgccagctcacccaggtggctgttcacatacgccgcgtcgatctg < 2:6797766‑M2/150‑112 (MQ=255) caccacA‑ACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGC‑TTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCt > 2:255417/1‑150 (MQ=255) accacA‑ACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGC‑TTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTg > 2:3499151/1‑150 (MQ=255) accacA‑ACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGC‑TTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTg > 2:4584895/1‑150 (MQ=255) ccacA‑ACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGC‑TTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGc > 2:698342/1‑150 (MQ=255) ccca‑ACCCTTGGGCCTTTGGTGATCCGTGGGGGGGCGGGC‑TTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGca < 2:775494/148‑1 (MQ=255) caca‑CCCCTTGGGCGTGTGGTGATCGGTGGGGGGGGGGGC‑TGGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGca < 1:207275/150‑1 (MQ=255) caca‑ACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGC‑TTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGca > 2:1035060/1‑150 (MQ=255) aca‑ACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGC‑TTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGcac > 1:6201430/1‑150 (MQ=255) a‑aCCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGC‑TTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACaa > 1:491478/1‑150 (MQ=255) a‑aCCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGC‑TTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACaa > 2:5079942/1‑150 (MQ=255) a‑aCCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGC‑TTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACaa > 2:6091508/1‑150 (MQ=255) ccccTTGGGCCTGTGGTGATCGGGGGGGGGGGGGGC‑TGGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACaaa < 1:5478084/149‑1 (MQ=255) cccTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGgcgggcttgcccgcgaaactgtcgaaaccggtcttacagaatgtaacgcgacaggtcttcgttctgtgccagctcacccaggtggctgttcacatacgccgcgtcgatctggatcggcgct < 1:5167016‑M2/150‑122 (MQ=255) cccTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGC‑TTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAg > 2:5570323/1‑150 (MQ=255) ccTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGC‑TTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAGc > 2:401150/1‑150 (MQ=255) ttGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGgcgggcttgcccgcgaaactgtcgaaaccggtcttacagaatgtaacgcgacaggtcttcgttctgtgccagctcacccaggtggctgttcacatacgccgcgtcgatctggatcggcgcttcg < 1:1060270‑M2/150‑125 (MQ=255) gggggCGTGTGGGGATCGGTGGGGGGGGGGGC‑TTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAGCCt < 1:6399294/148‑1 (MQ=255) gggCGTGTGGTGATCGGTGGGGGGGCGGGC‑TTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAGCCTcc < 1:6667237/150‑1 (MQ=255) gggCCTGTGGTGATCCGTGGGGGGGCGGGC‑TTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAGCCTcc < 2:742822/150‑1 (MQ=255) gCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGC‑TTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAGCCTCCaa < 2:6186196/150‑1 (MQ=255) gtggtgATCCGTGCGGGGGCGGGC‑TTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTATGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAGCCTCCAAGAcc < 2:5220658/150‑1 (MQ=255) tggtgATCCGGGGGGGGGCGGGG‑TTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAGCCTCCAAGAccc < 1:6569129/150‑1 (MQ=255) gtgATCCGTGCGGGGGCGGGC‑TTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAGCCTCCAAGACCCTc > 1:3737510/1‑150 (MQ=255) gcgcGTGCAGGAGCGGGC‑TTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAGCCTCCAAGACCCTCAGc > 2:6413280/4‑150 (MQ=255) gTGCGGGGGCGGGC‑TTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAGCCTCCAAGACCCTCAGCCTCa > 2:4902536/1‑150 (MQ=255) ggggCGGGC‑TTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGc < 2:2452806/92‑1 (MQ=255) | CGGCGTATGTGAACAGCCACCTGGGTGAGCTGGCACAGAACGAAGACCTGTCGCGTTACATTCTGTAAGACCGGTTTCGACAGTTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCTGCACGCGCCACCACA‑ACCCTTGGGCCTGTGGTGATCCGTGCGGGGGCGGGC‑TTGCCCGCGAAGAGGCCCTTGAATCCCTCCCCCATAAGCTGGAAGCTGTGCTTCATCAGCTCCCGAGAGATTCTGCCCATGGCCCGCCTGCCTACCGCCATCAACCTGCACAAAGCCTCCAAGACCCTCAGCCTCACCTAC > NC_002947/5703648‑5703944 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |