Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_002947 | 479,505 | 0 | C | T | 5.2% | 977.4 / 25.9 | 304 | intergenic (‑34/+22) | cca/ycgB | multifunctional tRNA nucleotidyltransferase/2',3'‑cyclic phosphodiesterase/2' nucleotidase/phosphatase/type IV piliation protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (149/139); new base T (8/8); total (157/147) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 320 total aligned reads displayed.
CCATTTGCTAGCATTTCTTCGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCGGCATGTGGTGAGTACTCATCACTTGCTCGCCTTGCACGGTCTCCAGGTGGATATCGA > NC_002947/479359‑479654 | ccATTTGCTAGCATTTCTTCGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTc > 1:4125980/1‑150 (MQ=255) ccATTTGCTAGCATTTCTTCGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTc > 1:5702688/1‑150 (MQ=255) ttGCTAGCATTTCTTCGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTcggcg < 1:355317/150‑1 (MQ=255) ttGCTAGCATTTCTTCGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACCGCCGACGGGTTATCCTGTcggca < 2:2009631/150‑2 (MQ=255) gCTAGCATTTCTTCGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGt > 2:5530711/1‑150 (MQ=255) cTAGCATTTCTTCGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTc > 1:5001000/1‑150 (MQ=255) cTAGCATTTCTTCGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTc > 1:3117320/1‑150 (MQ=255) tAGCATTTCTTCGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCa > 2:6272023/1‑150 (MQ=255) 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cGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCGGCATGTGGTGAGTACTCATCACTTGCTCGCCTTGCACGGTCTCCAGGTGGATATCGa > 1:6138139/1‑150 (MQ=255) | CCATTTGCTAGCATTTCTTCGACGGTGGCGCCCACCACCAGCCAGTCGATATCGCTGACAGGGCGGCCGAGCAAACGGTCGCGCACGGCGCCGCCAACTTTGTAGATGTGCATGTGCAGCTCTCCATAACTGCCGACAGGATAACCCGTCGGCGGTCATGGGGTTGCATCAGAGGTGGTGGATAACAGCCAGGTCCATGCGGCCATAGTCGGCGCTTTCGCTATGCTCGCCGCGCGGCGGCATGTGGTGAGTACTCATCACTTGCTCGCCTTGCACGGTCTCCAGGTGGATATCGA > NC_002947/479359‑479654 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |