Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,709,545 | G→C | 6.5% | intergenic (+65/+47) | PP_5006 → / ← PP_5007 | TetR family transcriptional regulator/polyhydroxyalkanoate granule‑associated protein GA2 |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,709,545 | 0 | G | C | 6.5% | 950.7 / 40.9 | 289 | intergenic (+65/+47) | PP_5006/PP_5007 | TetR family transcriptional regulator/polyhydroxyalkanoate granule‑associated protein GA2 |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (129/139); new base C (10/9); total (141/148) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.14e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.54e-01 |
Only 100 of 311 total aligned reads displayed.
GGTGATGATGCTGGTGGCGCCGCATCTGCAGGCCCAGGCCCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCTGTGGTCGCTGCAGGCGCAGCGCTGGCAGC > NC_002947/5709396‑5709693 | ggTGATGATGCTGGTGGCGCCGCATCTGCAGGCCCAGGCCCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTgg > 2:6746276/1‑150 (MQ=255) ggTGATGATGCTGGTGGCGCCGCATCTGCAGGCCCAGGCCCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTgg < 1:3401341/150‑1 (MQ=255) ggTGATGATGCTGGTGGCGCCGCATCTGCAGGCCCAGGCCCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTgg > 2:6698362/1‑150 (MQ=255) gTGATGATGCTGGTGGCGCCGCATCTGCAGGCCCAGGCCCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGgc < 1:672489/150‑1 (MQ=255) gTGATGATGCTGGTGGCGCCGCATCTGCAGGCCCAGGCCCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGgc < 2:148552/150‑1 (MQ=255) gTGATGATGCTGGTGGCGCCGCATCTGCAGGCCCAGGCCCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGgc < 1:2411025/150‑1 (MQ=255) gatgatGCTGGTGGCGCCGCATCTGCAGGCCCAGGCCCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGgcgc < 2:2330796/150‑1 (MQ=255) gatgatGCTGGTGGCGCCGCATCTGCAGGCCCAGGCCCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGgcgc > 1:2234095/1‑150 (MQ=255) gatgCTGGTGGCGCCGCATCTGCAGGCCCAGGCCCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCTCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATc < 1:6336017/150‑1 (MQ=255) gatgCTGGTGGCGCCGCATCTGCAGGCCCAGGCCCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATc > 2:3775260/1‑150 (MQ=255) gatgCTGGTGGCGCCGCATCTGCAGGCCCAGGCCCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATc > 1:2205781/1‑150 (MQ=255) gCTGGTGGCGCCGCATCTGCAGGCCCAGGCCCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTg < 1:615124/150‑1 (MQ=255) tggtggCGCCGCATCTGCAGGCCCAGGCCCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTa < 2:6437069/150‑1 (MQ=255) tggtggCGCCGCATCTGCAGGCCCAGGCCCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTa < 2:5911232/150‑1 (MQ=255) tggtggCGCCGCATCTGCAGGCCCAGGCCCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTa < 1:1236868/150‑1 (MQ=255) tggtggCGCCGCATCTGCAGGCCCAGGCCCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTa > 2:4343090/1‑150 (MQ=255) gcgcCGCATCTGCAGGCCCAGGCCCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGc < 1:2694549/150‑1 (MQ=255) gcgcCGCATCTGCAGGCCCAGGCCCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGc < 1:3819268/150‑1 (MQ=255) ccgcATCTGCAGGCCCAGGCCCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGGGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCggg > 1:1721073/1‑150 (MQ=255) ccgcATCTGCAGGCCCAGGCCCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCggg < 1:5752614/150‑1 (MQ=255) ccgcATCTGCAGGCCCAGGCCCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCggg < 2:6805976/150‑1 (MQ=255) tGCAGGCCCAGGCCCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTAccc < 2:4566190/150‑1 (MQ=255) tGCAGGCCCAGGCCCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTAccc < 1:6620338/150‑1 (MQ=255) tGCAGGCCCAGGCCCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTAccc > 2:3123291/1‑150 (MQ=255) gCAGGCCCAGGCCCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCCCACCGACAACGTTTGGCGCCTCTTGTAGGAGCGGGTTTAcccc > 1:4132854/1‑149 (MQ=255) ggccgcggcccGGGCGGGGGGGGAGCTGCGGGCTGTGAAGTACCTGGTGGGGTTGGCCTGCTGGAGATGTCGGGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCGTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGTGGGGGTTTACCCGCga < 1:6634351/144‑1 (MQ=255) cccaggccc‑GGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCgaaga > 2:1607754/1‑150 (MQ=255) caggcccGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCgaagaa < 1:5644067/150‑1 (MQ=255) caggcccGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCgaagaa > 1:4484379/1‑150 (MQ=255) ggcggcggAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGt < 2:137816/150‑1 (MQ=255) ggAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTatcaga > 2:3213016/1‑150 (MQ=255) agcagcTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGGGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTatcagatc < 1:5990948/150‑1 (MQ=255) gcagcTGGCAGTGAAGTACAGGGAGGGTTAGGCCTGATGTAGATGTAGTGTTGCAGCCTACGCATTCGCGGGAAAACCCTCACCTACAAGTTTTGCCTCAACTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTatcagatca < 1:158431/150‑1 (MQ=37) ggCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTAc < 1:3256728/150‑1 (MQ=255) gCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCGGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCCCGCCTACAAGGTTTGGCGCAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCCCCAAAAAGGCGACCCGGTATCAGATAAGGGTAcc > 1:4198546/1‑150 (MQ=255) cAGTTACGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGTTGTAGTTTTGCAGCCGACGAATTCGCGGTTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATATTGTCGGTGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCg < 1:5892092/150‑1 (MQ=255) cAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACACCCAACAAAAACGTTTGGCGCCAAATTTATGAGCCGGTTTAACCCCGAAGAAGGCGACCCCGGAAAAAATCAGGGTaacc > 1:3000657/1‑147 (MQ=255) aGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCgg > 2:4923875/1‑150 (MQ=255) gTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGt < 2:3693812/150‑1 (MQ=255) gTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGt < 1:6197570/150‑1 (MQ=255) tGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCCCTCCTACCAGGTTTGGCGCCTCTTGGAGTAGCGGGTTTTACCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTg > 1:3654697/1‑150 (MQ=255) aGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGATATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCa < 1:6465536/150‑1 (MQ=255) ccTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCg < 1:6820622/150‑1 (MQ=255) gTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTAACGGTGCCAGTCGGTGCCGACg > 2:4894634/1‑150 (MQ=255) gTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATAAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACg > 2:728676/1‑150 (MQ=255) gTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAACAAGGTTTGGCGCATCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGACGAAGGCGACGCGGGATCAGATCAGGGTACCGGTGCCCGTCGGTGCCCACg > 2:4695214/1‑150 (MQ=255) tAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCAACTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTAACAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACgg > 1:2761092/1‑150 (MQ=255) ggCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCg < 2:1167032/150‑1 (MQ=255) gCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGt > 2:423250/1‑150 (MQ=255) ctgctgGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGtgc < 2:6265870/150‑1 (MQ=255) tgctgGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCCCACCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGATCCGGTTTACCCCCGAAAAAGGCGACCCCGTATCAGAACAGGGTACAGGTGCCACACGGTGCCGACGGCGtgct > 1:4932399/1‑150 (MQ=255) tgGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCCCACCAACAACGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCCCCAAGAAGGCGACCCGGTATAAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCCACGGCGTgctgct > 1:688867/1‑150 (MQ=255) ggAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAAACCCCACCTAAAATGTTTTGCGCATATTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCCGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGctgctg > 1:479327/1‑150 (MQ=38) 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aGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGt < 2:3401204/150‑1 (MQ=255) gtTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAACCCCGCTCCTACACGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTggc < 1:5681754/150‑1 (MQ=255) ttGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGTTTGGCGCCTCGTGGAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTggcg > 2:2781440/1‑150 (MQ=255) ttGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTggcg < 1:1307726/150‑1 (MQ=255) ttGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCGGGTAGGAGCGGGGTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGGggcg > 1:6851866/1‑150 (MQ=255) 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ccGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGtt < 1:3081550/150‑1 (MQ=255) ccGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGtt > 1:3939688/1‑150 (MQ=255) cGACGCATT‑GCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGc < 1:6310811/150‑1 (MQ=255) aTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTg > 1:6250766/1‑150 (MQ=255) aTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTg < 1:996120/150‑1 (MQ=255) tCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCt > 1:430043/1‑150 (MQ=255) gTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGCAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCTGTGGTc > 2:6157832/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCTGTGGTCGCTGc > 2:1286301/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCTGTGGTCGCTGc > 2:2477942/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACTAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCTGTGGTCGCTGCa < 2:5330578/150‑1 (MQ=255) ccGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTTTAGGAGCGCGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTAGGAGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTAGCCGGAGCTGTGGTCGCTCCa > 1:5404703/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCTGTGGTCGCTGCa > 1:40049/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCTGTGGTCGCTGCa < 2:4086857/150‑1 (MQ=255) ccGCTCCTACAAGATGCGCCAAACCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGctgctg < 2:4991022/111‑1 (MQ=21) ccGCTCCTACAAGATGCGCCAAACCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCTGTGGTCGCTGCa > 2:1721258/1‑150 (MQ=37) cGCTCCTACAAGATGCGCCAAACCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGc > 2:5053099/1‑84 (MQ=17) 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tACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCTGTGGTCGCTGCAGGCGCAg > 1:6744439/1‑150 (MQ=255) cAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCTGTGGTCGCTGCAGGCGCAgcg > 2:1539907/1‑150 (MQ=255) cAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCTGTGGTCGCTGCAGGCGCAgcg > 2:1959282/1‑150 (MQ=255) cAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCTGTGGTCGCTGCAGGCGCAgcg > 1:2294357/1‑150 (MQ=255) aaGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCTGTGGTCGCTGCAGGCGCAgcgc < 2:4026857/150‑1 (MQ=255) aaGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCTGTGGTCGCTGCAGGCGCAgcgc > 1:4617284/1‑150 (MQ=255) aGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCTGTGGTCGCTGCAGGCGCAGCGCt < 1:5015071/150‑1 (MQ=255) ggTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCTGTGGTCGCTGCAGGCGCAGCGCTg < 1:3505689/150‑1 (MQ=255) ggTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCTGTGGTCGCTGCAGGCGCAGCGCTg < 1:4034991/150‑1 (MQ=255) gTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGGTGCCGGTGCTGTGGTCGCTGCAGGCGCAGCGCTgg < 2:5509838/150‑1 (MQ=255) ggCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCTGTGGTCGCTGCAGGCGCAGCGCTGGCAGc < 2:2979234/150‑1 (MQ=255) | GGTGATGATGCTGGTGGCGCCGCATCTGCAGGCCCAGGCCCGGGCGGCGGCGGAGCAGCTGGCAGTGAAGTACCTGGAGGGGTAGGCCTGCTGGAGATGTAGTGTTGCAGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTTGGCGCATCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAAGGCGACGCGGTATCAGATCAGGGTACCGGTGCCAGTCGGTGCCGACGGCGTGCTGCTGGCCGGGGTGGCGGCAGTTGCCGGTGCTGTGGTCGCTGCAGGCGCAGCGCTGGCAGC > NC_002947/5709396‑5709693 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |