| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,739,066 | A→T | 7.2% | intergenic (‑87/+70) | proY ← / ← hutH | proline (histidine) APC transporter/histidine ammonia‑lyase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,739,066 | 0 | A | T | 7.2% | 632.7 / 2.0 | 240 | intergenic (‑87/+70) | proY/hutH | proline (histidine) APC transporter/histidine ammonia‑lyase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (101/105); new base T (3/18); total (117/123) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.32e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 246 total aligned reads displayed.
GAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGACTACCCTTGGCCAACAGGTCCACGGCCTTTTCGATAT > NC_002947/5738917‑5739215 | gAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGa > 2:674911/1‑150 (MQ=255)gAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGa < 1:556589/150‑1 (MQ=255) aGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGAt < 1:5502078/150‑1 (MQ=255) aGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGAt < 1:3619368/150‑1 (MQ=255) ggCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATgg < 1:5386419/150‑1 (MQ=255) ggCCATCAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTCTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACGGGGGATgg > 2:5988739/1‑150 (MQ=255) ccATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGGGAGATTCAGGGGGCCGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGgt‑g > 2:1813810/1‑150 (MQ=255) aTGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑Gtt < 1:3586674/150‑1 (MQ=255) gAAACGGTTGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑Gtttt < 1:595264/150‑1 (MQ=255) aCGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCa > 2:5588765/1‑150 (MQ=255) aCGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCa < 2:378649/150‑1 (MQ=255) aCGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCGCCCACCGGGGCTGGT‑GTTTTGcc > 1:6630538/1‑149 (MQ=255) aCGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCCTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCa < 2:4930734/150‑1 (MQ=255) cGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCAc < 1:1280900/150‑1 (MQ=255) aTGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTa < 1:869847/150‑1 (MQ=255) gCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCt < 2:4307361/150‑1 (MQ=255) gggCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCtgt > 2:3799896/1‑150 (MQ=255) gggCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCtgt < 2:5451909/150‑1 (MQ=255) ggCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCtgtg < 1:6706037/150‑1 (MQ=255) gCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGGTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTgg < 1:1476891/150‑1 (MQ=255) aCTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTTAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCTGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGa < 1:3558780/150‑1 (MQ=255) aCTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGa < 2:1526952/150‑1 (MQ=255) aCTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGa < 1:3552033/150‑1 (MQ=255) ttAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGc < 1:3854041/150‑1 (MQ=255) ttAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCGCCCACACGGGGTGGT‑GTTTTTCACCGACGGGAGTGGGAGc > 1:2398635/1‑150 (MQ=255) tcgCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCg < 2:6016864/148‑1 (MQ=255) aGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCgg < 2:583251/150‑1 (MQ=255) aGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCgg < 1:1711679/150‑1 (MQ=255) aGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCGGTGGGAGCgg > 1:6166280/1‑150 (MQ=255) cccGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACGTCTGTGGGAGCGGgc > 2:506057/1‑150 (MQ=255) cgcgCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACCGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCGGTGGGTGCGGgcgc > 1:2712635/1‑150 (MQ=255) gttGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTGGTGTGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGTTGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGGGGGCGCGccc < 1:5036615/149‑1 (MQ=255) gagaCCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGATTTGTTTTTGTGGTGGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACCGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCcgcg < 2:4035682/150‑1 (MQ=255) agaCCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTTCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCcgcca > 2:2025000/1‑148 (MQ=255) gAGCTTGTTGCATGTCCCGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCAGCTCCCACAGGGTATGTT‑TTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGgccg < 1:4722092/150‑1 (MQ=255) gCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCCCCCCCCCACCCAAACGGGATGGT‑GTTTTTGACCAACATCGGTGGGAGCGGGGGCGCCCCCCAACGgccccc > 1:2962671/1‑150 (MQ=255) gCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTGTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGGACGCCCCCACCCCCCGGGGCTGGTGGTTTTGC‑CCTACGTCGGGGGGTGCGGGCGCGCCCGCGCAGGgccgcc > 1:2962688/1‑150 (MQ=255) aTGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGccc > 2:2246701/1‑150 (MQ=255) tCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAg > 2:5886133/1‑150 (MQ=255) gTCCTTGAATTGTTTTTGGGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCCCCGGGGTTGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGc < 1:6771439/150‑1 (MQ=255) ttGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCCCACCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTa > 2:1196045/1‑150 (MQ=255) taaTTTTTTTTGTGGTCGTGTGATTCTGGGGGCGGCTGCGCAGCCCCTTCGGGGGCACGCCCGCTCCCACTGGGTTTGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGGGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACa < 1:1034943/149‑1 (MQ=255) gatttGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACCGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACa < 2:6589503/147‑1 (MQ=255) gAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACa < 2:1055329/150‑1 (MQ=255) gAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACa < 2:1864213/150‑1 (MQ=255) aTTGTTTTTGTGGTCGTGAGTTTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAgg < 2:3585489/150‑1 (MQ=255) ttGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGc < 2:5263186/150‑1 (MQ=255) ttGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGc < 2:6237826/150‑1 (MQ=255) ttGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCACCCACAGGGGATTGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCCCCCGCGAAGGGCCCCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTAAAGGc > 1:3403510/1‑150 (MQ=255) gTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCCGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGTTGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCtt < 2:2056046/150‑1 (MQ=255) gTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCtt < 2:6823006/150‑1 (MQ=255) tttttGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGGTGGT‑GGTTTGCCCCTACTTCTGTGGGAGGGGGGGCGCCCCCGATGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTAAAGGCGTg > 1:1630046/1‑150 (MQ=38) tttttGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGG‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTg < 2:2722845/150‑1 (MQ=255) tttttGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCCCACCCACACGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCCGCGGCCCCCGGGGCGGTACACGCTTg > 2:6332619/1‑150 (MQ=255) ttttGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACCGGGGATGGT‑GTTTTGCCCCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTgg < 2:2639338/150‑1 (MQ=255) ttggtgGTCGTGAGCTTCCGGGGGCGGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCCCGCCCGCTCCCCCCGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGc < 2:5927414/147‑1 (MQ=255) ttGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCa < 2:4791575/150‑1 (MQ=255) tggtgGTCGGGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCCCCGGGGTTGGT‑GTTTTGCCCCTACTTCGGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCa < 1:3889394/148‑1 (MQ=255) ggggggtggtGAGTTTCTGGGGGGGGGGGCGCCGCCCGTGCGGGGGCCCGCCCGCGCCCCCGGGGGTTGGT‑GTTTGCCCCCTCCTGGGGGGGGCGGGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCa < 1:6428865/146‑1 (MQ=255) tgGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCCCTCCCACAGGGGGTGGT‑GTTTTTCACCAAATTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCCCCCCGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTa > 1:2689196/1‑150 (MQ=255) gagaTTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACccgc > 2:2224181/1‑150 (MQ=255) ccgcgaaggggCTGCGCAGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACCGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACccgccg > 2:3840081/8‑150 (MQ=39) ccgcgaaggggCTGCGCAGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACccgccg > 2:6075968/8‑150 (MQ=39) ccgcgaaggggCTGCGCAGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCGACGTCGGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGCAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCCGTACACccgccg > 1:5029865/8‑150 (MQ=255) aTTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCCCAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACGTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCACCGGCCCCAGGGGCGGTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCgg > 2:1442999/1‑150 (MQ=255) ttCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCGCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCAACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCCGCGGCCCCACGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGgc > 1:4988314/1‑150 (MQ=255) ggggCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATTGT‑GTTTTGCCCCTACGTGTGGGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCCGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGgcagcac > 2:3494753/1‑149 (MQ=39) ggggCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCCCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCACGGGCGTTACAGGCTTGGCAGGACACCCCCCGGCAGCaa > 2:3067563/1‑150 (MQ=255) gctgctGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCCCAGGGGGTGGT‑GGTTTGCACCGACTTCGGGGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCagccagcc > 1:5574801/1‑150 (MQ=255) gctgcGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCGGGGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGt > 2:4514328/1‑150 (MQ=255) tgcGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCGCCCACTGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACGTCGGTGGGCGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCCGTACACCCGCCGGCCGCAAGCCGGTcc > 2:3127830/1‑149 (MQ=255) cTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACGTGTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCCCCCGCAGCAAGCCGGTCAGACGAcccat > 1:2496961/1‑148 (MQ=255) ttCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGACTACCCTTg > 2:3218709/1‑150 (MQ=255) tgcgcgGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGTTGGT‑GTTTGGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGACTACCCTTg < 2:655705/148‑1 (MQ=255) tCGCGCGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTGGCACCTACTTCGGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGACTACCCTTgg < 2:1478417/150‑1 (MQ=255) gggCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTCCTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACCGGCTTGGCCGTCCACCCGCCGGCAGCACGCCGGTCAGACTACCC‑TGGCCacc > 2:5376554/1‑148 (MQ=39) gggCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCtgt > 2:4078286/1‑47 (MQ=255) gggCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAgg < 2:3273032/100‑1 (MQ=255) gggCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAgg > 1:3273032/1‑100 (MQ=255) ggCACGCCCGCTCCCACGGGGGATGGT‑GTTTGGCACCTACTTCTGTGGGCGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGACTACCCTTGGCCAAc < 2:1357238/150‑1 (MQ=255) gCACGCCCGCTCCCACGGGGGTTGGT‑GTTTTGCACCTACTGCGGGGGGAGGGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGACTACCCTTGGCCAACa < 1:960900/150‑1 (MQ=255) gCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGACTACCCTTGGCCAACa < 2:4772362/150‑1 (MQ=255) aCGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGACTACCCTTGGCCAACAgg < 2:5693788/150‑1 (MQ=255) cGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGACTACCCTTGGCCAACAGGt > 2:2465038/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACGTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCAGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGACAACCCGTGGCCAACAGGTcc > 1:5989927/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGACTACCCTTGGCCAACAGGTCCa > 1:5641356/1‑150 (MQ=255) tCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGACTACCCTTGGCCAACAGGTCCACGGc > 1:4544726/1‑150 (MQ=255) ccACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGACTACCCTTGGCCAACAGGTCCACGGCCt > 1:533922/1‑150 (MQ=255) cacaGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGACTACCCTTGGCCAACAGGTCCACGGCCtt > 1:1344526/1‑150 (MQ=255) cacaGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGACTACCCTTGGCCAACAGGTCCACGGCCtt > 2:3359263/1‑150 (MQ=255) cacaGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGACTACCCTTGGCCAACAGGTCCACGGCCtt > 1:1965750/1‑150 (MQ=255) cacaGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGACTACCCTTGGCCAACAGGTCCACGGCCtt > 2:86661/1‑150 (MQ=255) acaGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCATGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCCGACTACCCTTGGCCAACAGGTCCACGGCCttt > 1:3142187/1‑150 (MQ=255) acaGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGACTACCCTTGGCCAACAGGTCCACGGCCttt > 1:4417516/1‑150 (MQ=255) caGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGACTACCCTTGGCCAACAGGTCCACGGCCtttt < 2:6709263/150‑1 (MQ=255) aGGGGTTGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGACAGCAAGCCGGTCAGACTACCCTTGGCCAACAGGTCCACGGCCTTTTc < 2:5096422/150‑1 (MQ=255) aGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGACTACCCTTGGCCAACAGGTCCACGGCCTTTTc > 2:5765952/1‑150 (MQ=255) aGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGACTACCCTTGGCCAACAGGTCCACGGCCTTTTc > 2:3920024/1‑150 (MQ=255) aGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGACTACCCTTGGCCAACAGGTCCACGGCCTTTTc > 1:4823171/1‑150 (MQ=255) aTGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGACTACCCTTGGCCAACAGGTCCACGGCCTTTTCGatat > 2:5491101/1‑150 (MQ=255) | GAGGGCCATGAAACGGATGTGGCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGT‑GTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGACTACCCTTGGCCAACAGGTCCACGGCCTTTTCGATAT > NC_002947/5738917‑5739215 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |