Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_002947 | 5,739,087 | 0 | T | G | 8.4% | 526.3 / 4.5 | 218 | intergenic (‑108/+49) | proY/hutH | proline (histidine) APC transporter/histidine ammonia‑lyase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (103/86); new base G (15/10); total (121/97) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.72e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 234 total aligned reads displayed.
GCGGGCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAA‑GGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCAGTACACCCGCCGGCAGCAAGCCGGTCAGACTACCCTTGGCCAACAGGTCCACGGCCTTTTCGATATCCGGCGCGAAGAAACGGTCAC > NC_002947/5738938‑5739236 | gggCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCtgt < 1:691691/150‑1 (MQ=255) ggCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCtgtg < 1:6706037/150‑1 (MQ=255) ggCACTTAGCCCGCGCTTGAGACCTTGAGCTTGTTGCATGTCACGTCCTTGAATTGTTTTTGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCtgtg < 1:945450/150‑1 (MQ=255) 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tttttGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCCCACCCACACGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAA‑GGGCCGCCCCGCGGCCCCCGGGGCGGTACACGCTTg > 2:6332619/1‑150 (MQ=255) tttttGTGGTCGTGAGATGCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAA‑GGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTg < 2:2723270/150‑1 (MQ=255) tttgtGTGGTCGTGAGATTCTGGGGGCTGCTGCGCCGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCACCCACAGGGGAGGGTGTTTTGCACCTACTTCTGGGGGCGGGGGCGCGCCCGCGAA‑GGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTg < 1:4907294/150‑1 (MQ=255) ttGTGGTCGTGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACCGGGGATGGTGTTTTGCACCTACTTCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAA‑GGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCa < 2:4272129/150‑1 (MQ=255) tggtgGTCGGGAGATTCAGGGGGCTGCTGCGCAGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCCCCGGGGTTGGTGTTTTGCCCCTACTTCGGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAA‑GGGCCGCCCAGCGGCCCCAGGGGCGTTACAGGCTTGGCa < 1:3889394/148‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |