Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 514,014 | G→T | 6.4% | intergenic (+45/+32) | yhfA → / ← PP_0426 | hypothetical protein/membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 514,014 | 0 | G | T | 6.4% | 892.6 / 35.6 | 266 | intergenic (+45/+32) | yhfA/PP_0426 | hypothetical protein/membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (132/117); new base T (7/10); total (139/127) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.53e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.77e-01 |
Only 100 of 266 total aligned reads displayed.
GGGCGGTGGAGCTGTCGGCGGAAAAGTATTGCTCGGCTTCGATCATGCTCGAGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTGGTAAACCAGGCCAAGCCAGATAACCCCCAG > NC_002947/513866‑514162 | ggcggTGGAGCTGTCGGCGGAAAAGTATTGCTCGACTTCGATCATGCTCGAGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGaa > 1:4784089/1‑150 (MQ=255) ggTGGAGCTGTCGGCGGAAAAGTATTGCTCGGCTTCGATCATGCTCGAGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAAccc < 2:4558805/150‑1 (MQ=255) tGGAGCTGTCGGCGGAAAAGTATTGCTCGGCTTCGATCATGCTCGAGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGc > 2:5816604/1‑150 (MQ=255) gAGCTGTCGGCGGAAAAGTATTGCTCGGCTTCGATCATGCTCGAGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCGTGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTc > 1:5042871/1‑150 (MQ=255) aGCTGTCGGCGGAAAAGTATTGCTCGGCTTCGATCATGCTCGAGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGGAGCGGGTTCACCCGCttc < 1:3983189/150‑3 (MQ=255) cTGTCGGCGGAAAAGTATTGCTCGGCTTCGATCATGCTCGAGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCa > 2:2277908/1‑150 (MQ=255) cggcggAAAAGTATTGCTCGGCTTCGATCATGCTCGAGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGG‑AGCGGGTTCACCCGCTTCCAcaagg < 2:3631518/150‑5 (MQ=255) gcggAAAAGTATTGCTCGGCTTCGATCATGCTCGAGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGGAGCGGGTTCACCCGCTTCCAcaaggg < 2:5313956/150‑6 (MQ=255) ggAAAAGTATTGCTCGGCTTCGATCATGCTCGAGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGGAGCGGGTTCACCCGCTTCCAcaagggct < 2:3051789/150‑8 (MQ=255) ggAAAAGTATTGCTCGGCTTCGATCATGCTCGAGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGc > 2:3781481/1‑150 (MQ=255) aaGTATTGCTCGGCTTCGATCATGCTCGAGCGTGCCGGGGTTGAGATGACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGAGTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCgg < 2:3347555/150‑1 (MQ=255) gCTCGGCTTCGATCATGCTCGAGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGtt < 1:5643094/150‑1 (MQ=255) cTCGGCTTCGATCATGCTCGAGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGttt < 1:1856480/150‑1 (MQ=255) 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ttCGATCATGCTCGAGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGATg > 2:4379374/1‑150 (MQ=255) tCGATCATGCTCGAGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTgc < 1:524938/150‑1 (MQ=255) tCGATCAGGCTCGAGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGACAGCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTGTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTgc < 2:6273816/150‑1 (MQ=255) tCATGCTCGAGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAg < 1:939415/150‑1 (MQ=255) tCATGCTCGAGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAg > 2:2651987/1‑150 (MQ=255) cATGCTCGAGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAgg < 2:486381/150‑1 (MQ=255) cATGCTCGAGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTGTCAGTTGCGCAgg > 1:2268030/1‑150 (MQ=255) gCTCGAGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGcc < 1:3781481/150‑1 (MQ=255) gCTCGAGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGcc < 1:254206/150‑1 (MQ=255) tCGAGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCgg > 1:3183239/1‑150 (MQ=255) gAGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCa > 1:1590646/1‑133 (MQ=255) gAGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGaa > 1:753537/1‑150 (MQ=255) gCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGCGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAgg > 2:6496652/1‑150 (MQ=255) tGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGcc > 1:5550174/1‑150 (MQ=255) cGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATc > 2:4992845/1‑150 (MQ=255) 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cTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGc < 1:1306930/150‑1 (MQ=255) gggTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTc > 2:1627210/1‑150 (MQ=255) gggTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTc < 1:6418060/150‑1 (MQ=255) gTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGTCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCaa < 1:516899/150‑1 (MQ=255) gTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCaa < 2:3645021/150‑1 (MQ=255) 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ttCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGgcgc < 1:2216820/150‑1 (MQ=255) ccgatctcTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCtttt < 1:1188391/143‑1 (MQ=255) gggCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGTCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTg < 2:2457968/150‑1 (MQ=255) gggCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTg < 1:5935636/150‑1 (MQ=255) ggCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTgg < 1:2921173/150‑1 (MQ=255) gCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTGGt < 2:4018798/150‑1 (MQ=255) gCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTGGTaaa > 1:871868/1‑150 (MQ=255) gCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTGGTaaa > 1:3504492/1‑150 (MQ=255) tttGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTGGTAAAcc > 2:3557419/1‑150 (MQ=255) tttGCAGCACTTGTTTAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCAGCGGCACGGGCGAGTTTCATTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCAATGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGACTCGCTCAACCGCTCCCGGCCCATTTGATatcgg > 2:1188391/1‑146 (MQ=255) ttGCGGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTGGTAAACCa < 1:1095766/150‑1 (MQ=255) gCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTGGTAAACCAgg > 2:6284739/1‑150 (MQ=255) cAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTGGTAAACCAGGc > 2:2990913/1‑150 (MQ=255) cgcgggtgGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTGGTAAACCAGGCCaa > 1:1572290/6‑150 (MQ=255) cTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTGGTAAACCAGGCCAAGc > 1:1438203/1‑150 (MQ=255) cTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTGGTAAACCAGGCCAAGc < 1:5703267/150‑1 (MQ=255) cTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTGGTAAACCAGGCCAAGc > 2:6783163/1‑150 (MQ=255) ttGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTGGTAAACCAGGCCAAGcc > 2:1684688/1‑150 (MQ=255) gtgGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTGGTAAACCAGGCCAAGCCAg < 2:2690366/150‑1 (MQ=255) tgGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTGGTAAACCAGGCCAAGCCAGa < 1:2873173/150‑1 (MQ=255) gggaGCGGGTTCACCCGCTTCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTGGTAAACCAGGCCAAGCCAGAt > 1:470208/4‑150 (MQ=255) gggaGCGGGTTCACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTGGTAAACCAGGCCAAGCCAGAt > 1:2884351/4‑150 (MQ=255) gAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTGGTAAACCAGGCCAAGCCAGATa > 2:2333553/1‑150 (MQ=255) gaGCGGGTTCACCCGCTTCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTGGTAAACCAGGCCAAGCCAGATac > 2:584904/2‑149 (MQ=255) gaGCGGGTTCACCCGCTTCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTGGTAAACCAGGCCAAGCCAGATaa > 2:1442355/2‑150 (MQ=255) aGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTGGTAAACCAGGCCAAGCCAGATAAc < 1:2137551/150‑1 (MQ=255) gCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTGGTAAACCAGGCCAAGCCAGATAAcc < 1:1931675/150‑1 (MQ=255) gggTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTGGTAAACCAGGCCAAGCCAGATAAcccc > 1:242327/1‑150 (MQ=255) gggTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTGGTAAACCAGGCCAAGCCAGATAAcccc < 1:2652445/150‑1 (MQ=255) ggTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTGGTAAACCAGGCCAAGCCAGATAAccccc > 2:5487612/1‑150 (MQ=255) | GGGCGGTGGAGCTGTCGGCGGAAAAGTATTGCTCGGCTTCGATCATGCTCGAGCGTGCCGGGGTTGAGATTACCCATGGGTATGAAATCGTAGAGCTGGGTTAAGGCTGAGATTCCGGGGCCGCTTTGCAGCCCTTGTGGAAGCGGGTGAACCCGCTCCCACCCGCGGCCCGGGCGAGTTTCAGTTGCGCAGGGCCGGAAGGGCCATCCGCAACCATTGCGGAAGACGGCTTCTTAGCGCCTGGCTCAACCGCTCCCGGCGCTTTTGGTAAACCAGGCCAAGCCAGATAACCCCCAG > NC_002947/513866‑514162 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |