| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 5,989,441 | 0 | T | C | 20.6% | 362.6 / 90.9 | 205 | intergenic (+32/+57) | PP_5242/ycaC‑II | GAF domain‑containing sensor histidine kinase/putative hydrolase |
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Only 100 of 206 total aligned reads displayed.
GATGGGCTTGGCGATCTGTAGTTCGGTGGCTCAGGCCCACGGCGGGCAGCTGCAGGCGCTGGTGTCGCAGTTGGGTGGATGCCGGATTCGTGTCAGTCTGCCTTTGAATCACGCATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCA‑GGTTGCGGTAGTTGGGGATACGCTGCGACAGCAGGTTACCCAGCCCTTCGATGTCG > NC_002947/5989292‑5989588 | aTGGGCTTGGCGATCTGTAGTTCGGTGGCTCAGGCCCACGGCGGGCAGCTGCAGGCGCTGGTGTCGCAGTTGGGTGGATGCCGGATTCGTGTCAGTCTGCCTTTGAATCACGCATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTc < 1:482916/150‑1 (MQ=255) aTGGGCTTGGCGATCTGTAGTTCGGTGGCTCAGGCCCACGGCGGGCAGCTGCAGGCGCTGGTGTCGCAGTTGGGTGGATGCCGGATTCGTGTCAGTCTGCCTTTGAATCACGCATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTc < 1:5050279/150‑1 (MQ=255) tGGGCTTGGCGATCTGTAGTTCGGTGGCTCAGGCCCACGGCGGGCAGCTGCAGGCGCTGGTGTCGCAGTTGGGTGGATGCCGGATTCGTGTCAGTCTGCCTTTGAATCACGCATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTcc < 1:1695290/150‑1 (MQ=255) 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cgGGTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCA‑GGTTGCGGTAGTTGGGGATACGCTGCGACAGCAGGTTACCCAGcc > 2:2498286/1‑150 (MQ=255) tAAACCCGCCCCTACAGCCGACCGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCA‑GGTTGCGGTAGTTGGGGATACGCTGCGACAGCAGGTTACCCAGCCCTTc > 2:2630761/1‑150 (MQ=37) aaCCCGCCCCTACAGCCGACCGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCA‑GGTTGCGGTAGTTGGGGATACGCTGCGACAGCAGGTTACCCAGCCCTTCGa > 1:79612/1‑150 (MQ=38) aCCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCA‑GGTTGCGGTAGTTGGGGATACGCTGCGACAGCAGGTTACCCAGCCCTTCGAt > 2:6409841/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCA‑GGTTGCGGTAGTTGGGGATACGCTGCGACAGCAGGTTACCCAGCCCTTCGATg > 1:3480704/1‑150 (MQ=255) cccGCCCCTACAGCCGACCGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCA‑GGTTGCGGTAGTTGGGGATACGCTGCGACAGCAGGTTACCCAGCCCTTCGATg > 1:4461283/1‑150 (MQ=38) ccGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCA‑GGTTGCGGTAGTTGGGGATACGCTGCGACAGCAGGTTACCCAGCCCTTCGATGt > 1:6417350/1‑150 (MQ=255) ccGCCCCTACAGCCGACCGTAGGGGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCA‑GGTTGCGGTAGTTGGGGATACGCTGCGACAGCAGGTTACCCAGCCCTTCGATGt > 2:5354415/1‑150 (MQ=38) ccGCCCCTACAGCCGACCGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCA‑GGTTGCGGTAGTTGGGGATACGCTGCGACAGCAGGTTACCCAGCCCTTCGATGt > 1:4258082/1‑150 (MQ=37) ccGCCCCTACAGCCGACCGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCA‑GGTTGCGGTAGTTGGGGATACGCTGCGACAGCAGGTTACCCAGCCCTTCGATGt > 2:6081705/1‑150 (MQ=38) ccGCCCCTACAGCCGACCGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCA‑GGTTGCGGTAGTTGGGGATACGCTGCGACAGCAGGTTACCCAGCCCTTCGATGt > 2:253850/1‑150 (MQ=38) ccGCCCCTACAGCCGACCGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCA‑GGTTGCGGTAGTTGGGGATACGCTGCGACAGCAGGTTACCCAGCCCTTCGATGt > 1:1927644/1‑150 (MQ=38) ccGCCCCTACAGCCGACCGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCA‑GGTTGCGGTAGTTGGGGATACGCTGCGACAGCAGGTTACCCAGCCCTTCGATGt > 2:696543/1‑150 (MQ=38) cGCTCCTCGGGTGGGCTGTTGGGGC‑GGTTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCA‑GGTTGCGGTAGTTGGGGATACGCTGCGACAGCAGGTTACCCAGCCCTTCGATGTc < 1:1237812/150‑1 (MQ=39) gCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCA‑GGTTGCGGTAGTTGGGGATACGCTGCGACAGCAGGTTACCCAGCCCTTCGATGTCg > 1:1662025/1‑150 (MQ=255) gCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGGTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCA‑GGTTGCGGTAGTGGGGGATACGCTGCGACAGCAGGTTACCCAGCCCTTCGATGTCg > 2:1108597/1‑150 (MQ=255) gCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGGTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGGTCATCA‑GGTGGCGGGAGTTGGGGATACGCTGCGACAGCAGGTTACCCAGCCCTTCGATGTCg > 2:2080097/1‑150 (MQ=255) | GATGGGCTTGGCGATCTGTAGTTCGGTGGCTCAGGCCCACGGCGGGCAGCTGCAGGCGCTGGTGTCGCAGTTGGGTGGATGCCGGATTCGTGTCAGTCTGCCTTTGAATCACGCATAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGGTCGGCTGTAGGGGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACAGGTTTACATCAGCGCGAGGCCAGCGCTGCGTAGCTGTTCATCA‑GGTTGCGGTAGTTGGGGATACGCTGCGACAGCAGGTTACCCAGCCCTTCGATGTCG > NC_002947/5989292‑5989588 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |