| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 6,005,926 | C→A | 6.1% | intergenic (+28/+81) | PP_5256 → / ← amaA | cyclic nucleotide‑binding protein/L‑pipecolate oxidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 6,005,926 | 0 | C | A | 6.1% | 675.3 / 6.3 | 215 | intergenic (+28/+81) | PP_5256/amaA | cyclic nucleotide‑binding protein/L‑pipecolate oxidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (82/113); new base A (15/5); total (97/118) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.02e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 226 total aligned reads displayed.
GCGAAGTGCAGACGGCGTTGAGCAAATTGCAGCGGTTCCGGCGGCAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACTGCCCCGCGTGGTACAGCGAAAAACCGGACTCATAGAACGCTGTCCG > NC_002947/6005777‑6006075 | gcggacagcctgccgattccgttttcgccgatgagcggtgtgagcgcgccttcgctgcggacagcgttctatgagtccggtttttcgctgtaccacgcggggcagtgcctgagggttgtgttgtaagtactGGCCTCTTCGC‑GGGTAAAc < 1:6525328‑M1/19‑1 (MQ=255)gCGAAGTGCAGACGGCGTTGAGCAAATTGCAGCGGTTCCGGCGGCAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGCGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAAC < 2:3367319‑M1/150‑1 (MQ=255) ggacagcctgccgattccgttttcgccgatgagcggtgtgagcgcgccttcgctgcggacagcgttctatgagtccggtttttcgctgtaccacgcggggcagtgcctgagggttgtgttgtaagtactGGCCTCTTCGC‑GGGTAAAccc > 2:1052365‑M1/130‑150 (MQ=255) ggacagcctgccgattccgttgtcgccgatgagcggtgtgagcgcgccttcgctgcggacagcgttctatgagtccggtttttcgctgtaccacgcggggcagtgcctgagggttgtgttgtaagtactGGCCTCTTCGC‑GGGTAAAccc > 2:6594202‑M1/130‑150 (MQ=255) acagcctgccgattccgttttcgccgatgagcggtgtgagcgcgccttcgctgcggacagcgttctatgagtccggtttttcgctgtaccacgcggggcagtgcctgagggttgtgttgtaagtactGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGc > 2:1958441‑M1/128‑150 (MQ=255) tGCAGACGGCGTTGAGCAAATTGCAGCGGTTCCGGCGGCAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTC > 1:6243982‑M1/1‑150 (MQ=255) gCAGACGGCGTTGAGCAAATTGCAGCGGTTCCGGCGGCAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTTTACCCGCgaa < 2:6178933‑M1/150‑4 (MQ=255) gCAGACGGCGTTGAGCAAATTGCAGCGGTTCCGGCGGCAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCC < 2:892131‑M1/150‑1 (MQ=255) cctgccgattccgttttcgccgatgagcggtgtgagcgcgccttcgctgcggacagcgttctatgagtccggtttttcgctgtaccacgcggggcagtgcctgagggttgtgttgtaagtactGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCt > 1:5659756‑M1/124‑150 (MQ=255) tgccgattccgttttcgccgatgagcggtgtgagcgcgccttcgctgcggacagcgttctatgagtccggtttttcgctgtaccacgcggggcagtgcctgagggttgtgttgtaagtactGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTAc < 2:5037330‑M1/29‑1 (MQ=255) gACGGCGTTGAGCAAATTGCAGCGGTTCCGGCGGCAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGGGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GTGTAAACCCGCTCCTAC < 2:5311073‑M1/150‑1 (MQ=255) gACGGCGTTGAGCAAATTGCAGCGGTTCCGGCGGCAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTAC < 1:4844253‑M1/150‑1 (MQ=255) gACGGCGTTGAGCAAATTGCAGCGGTTCCGGCGGCAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTAC < 2:3286125‑M1/150‑1 (MQ=255) gccgattccgttttcgccgatgagcggtgtgagcgcgccttcgctgcggacagcgttctatgagtccggtttttcgctgtaccacgcggggcagtgcctgagggttgtgttgtaagtactGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACa > 1:713910‑M1/121‑150 (MQ=255) aCGGCGTTGAGCAAATTGCAGCGGTTCCGGCGGCAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA < 2:681886‑M1/150‑1 (MQ=255) cGGCGTTGAGCAAATTGCAGCGGTTCCGGCGGCAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACaa < 1:2391434/150‑1 (MQ=255) cGGCGTTGAGCAAATTGCAGCGGTTCCGGCGGCAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACaa < 1:2185565/150‑1 (MQ=255) cGGCGTTGAGCAAATTGCAGCGGTTCCGGCGGCAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACaa < 1:2270154/150‑1 (MQ=255) cGGCGTTGAGCAAATTGCAGCGGTTCCGGCGGCAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACaa < 1:748741/150‑1 (MQ=255) cGGCGTTGAGCAAATTGCAGCGGTTCCGGCGGCAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACaa < 1:1332992/150‑1 (MQ=255) ggCGTTGAGCAAATTGCAGCGGTTCCGGCGGCAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAag > 2:4485937/1‑150 (MQ=255) cGTTGAGCAAATTGCAGCGGTTCCGGCGGCAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAagta < 1:3391873/150‑1 (MQ=255) attccgttttcgccgatgagcggtgtgagcgcgccttcgctgcggacagcgttctatgagtccggtttttcgctgtaccacgcggggcagtgcctgagggttgtgttgtaagtactGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAagta < 1:2103803‑M1/34‑1 (MQ=255) gTTGAGCAAATTGCAGCGGTTCCGGCGGCAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAagtag < 1:333878/150‑1 (MQ=255) ttGAGCAAATTGCAGCGGTTCCGGCGGCAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAagtagt < 1:5801076/150‑1 (MQ=255) aGCAAATTGCAGCGGTTCCGGCGGCAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTACCGGCCTCGTCGC‑GGGGTAAACCGCTCCGACAAGTAGTGCa > 2:153565/1‑150 (MQ=255) aaaTTGCAGCGGTTCCGGCGGCAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCg < 1:4944265/150‑1 (MQ=255) aGCGGTTCCGGCGGCAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCGCCTACCAGAAATGCACCGCCGgaga > 2:6344977/1‑150 (MQ=39) ggTTCCGGCGGCAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAggg < 2:6045529/150‑1 (MQ=255) cggcggCAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCtgtg < 1:160406/150‑1 (MQ=255) gcggcAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTgtggt < 2:4382383/150‑1 (MQ=255) agcgcgccttcgctgcggacagcgttctatgagtccggtttttcgctgtaccacgcggggcagtgcctgagggttgtgttgtaagtactGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGa > 1:4057124‑M1/90‑150 (MQ=255) cAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAAc < 1:587211/150‑1 (MQ=255) gagCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCt > 1:252368‑M2/1‑149 (MQ=255) gCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgt > 1:3067249‑M2/1‑147 (MQ=255) ccGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgta > 2:3980552‑M2/1‑146 (MQ=255) ccGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgta > 2:1923671‑M2/1‑146 (MQ=255) ccGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgta > 1:1028085‑M2/1‑146 (MQ=255) tCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgtaggagcgg > 1:4698965‑M2/1‑139 (MQ=255) tCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgtaggagcgg > 1:1609866‑M2/1‑139 (MQ=255) tCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgtaggagcgg > 1:1154212‑M2/1‑139 (MQ=255) tCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgcaggagcgg > 2:1607719‑M2/1‑139 (MQ=255) tCGTTGTTGGTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCGTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgtaggagcgg > 2:4435682‑M2/1‑139 (MQ=255) gcggacagcgttctatgagtccggtttttcgctgtaccacgcggggcagtgcctgagggttgtgttgtaagtactGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCgg > 2:4798721‑M1/76‑150 (MQ=255) gcggacagcgttctatgagtccggtttttcgctgtaccacgcggggcagtgcctgagggttgtgttgtaagtactGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCgg > 2:1720928‑M1/76‑150 (MQ=255) gcggacagcggtctatgagtccggtttttcgctgtaccacgcggggcagtgcctgagggttgtgttgtaagtaccGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCgg > 1:5406249‑M1/76‑150 (MQ=255) cggacagcgttctatgagtccggtttttcgctgtaccacgcggggcagtgcctgagggttgtgttgtaagtactGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCggg > 2:2103803‑M1/75‑150 (MQ=255) cGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAggttcaccacagccctctcaggcggtgcactacttgtaggagcggg < 2:1097062‑M1/150‑47 (MQ=255) cGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgtaggagcggg > 2:4573535‑M2/1‑138 (MQ=255) gttgttgttGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCCCTCCTACCAGTAGTGCACCCCCGGAGAGGGCTGTGGTGAACCggtcggagcgggt < 2:178237‑M2/150‑14 (MQ=255) gttgttgttGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTACTGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAggttcaccacagccctctcaggcggtgcactacttgtaggagcgggt < 1:2102503‑M1/150‑48 (MQ=255) ttgttgttgCAGAAGCCGGCGTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGGTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgtaggagcgggtt > 2:1073805‑M2/1‑136 (MQ=255) ttgttgCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTAGC‑GGGTAAAACCCCTCCAACAACGTGTGGACCCCCGGAGAGGGGTGTTGTGTAACGGGAGGGGCGGGTTTaa > 2:2265286/1‑149 (MQ=255) tgCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTTCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgtaggagcgggtttacccgc > 2:1156180‑M2/1‑129 (MQ=255) gCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCggtaggagcgggtttacccgcg < 2:470251‑M2/150‑23 (MQ=255) aGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAAc < 1:3824386/125‑1 (MQ=255) aGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAAc > 2:3824386/1‑125 (MQ=255) aaGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgtaggagcgggttttaccgcgaaga < 2:4182547‑M2/150‑27 (MQ=255) aaGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAAACCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCGGAGAGGGCGGTGGTGAACCggtaggagcggggttacccgcgaaga < 2:4182712‑M2/150‑27 (MQ=255) ccGGCTTCAATCAAGACGGGGGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAGGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgtaggcgcgggtttacccgcgaagaggc > 2:4998135‑M2/1‑121 (MQ=255) ccGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCGGTGGTGAACCtgtaggagcgggtttacccgcggagaggc < 2:5089357‑M2/150‑30 (MQ=255) cGGATTCAATCAAGACGGGTGGCTTCCTGAGTTGTTTGCACATGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACCggttcaccaccgccctctcagggggtgcaatacttgtaggaggggttttacccgcgaagaggcc < 2:1874084‑M1/150‑65 (MQ=255) cTTCAATCACGATGGGTGGCTCCCTGAGTTGGTTGCACACGTGAGCCGGTGCGGGCCGCTTCGC‑GGGTAACCCCGCTCCTCCACTTCGGGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTTGGAGGGGTTTTACCCGCGAAGAGGCCAGt < 2:5851222/150‑1 (MQ=255) ttCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTAGC‑GGGTTAAACCCCTACAAAAAGAAGTGCACCCCCAGAGAGGGCTGTGGTGGAACGGGAGGAGCGGGTTTAACCCCGAAGAGGCCAgga > 1:2218948/1‑148 (MQ=255) tcaatccaGACGGGTGGCGTCCTGAGTTGGTTGCACACGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTGCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGCGGGCTGTGGTGAACCTGTCGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTAc < 2:5438105/150‑1 (MQ=37) aatcaaGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAAACCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCGGAGAGGGCGGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGCAGAGGCCCGTAcat > 2:6525328/1‑148 (MQ=38) atcaaGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAggttcaccacagccctctcaggcggtgcactacttgtaggagcgg > 1:6582721‑M1/1‑78 (MQ=255) accaaGACGGGGGGCTTCCGGCGTTGGTTCCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCCCCTACAAGTCGTGCACCGCCTGCGCGGGCTGTGGTTAACCTGTAGGTGCGGTTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTa < 2:6302767/148‑1 (MQ=37) agaagGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCCCTCCGACCAGTAGTGGACCCCCGGAGAGGGCGGTGGGGGAACGGTTGGGGCGGGTTTTCCCGCGCAGGGGCCCGTTCGTaaaac > 1:5626089/1‑150 (MQ=255) tGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGGTAAACCC‑CGGCGAACACTTGTGCACCCCCCGAGAGGGCGGTGGTGTAACCGTTGGTGCGGGGTTAACCCCGCACAGGCCCCGACGTAAAACACAAccc > 2:3088036/1‑150 (MQ=255) gCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTgaga < 2:3485683/84‑1 (MQ=255) gCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTgaga > 1:3485683/1‑84 (MQ=255) ttCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAggttcaccacagccctctcaggcggtgcactacttgtaggagcgg < 2:1118585‑M1/108‑46 (MQ=255) gCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAAACCCCACCGACAACTAGTGCACCCCCCGGGGGGGGGGTGGGGTACCGGTAGGAGCGGGGTTACCCCCCCAGAGGCCCCTAATGAAAAAACAAACCAAAAGCACAGcccccccg > 2:740288/1‑146 (MQ=255) acaAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAACCCCGCACCTACACGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACTGCCCCGCGTgg < 1:5074836/150‑1 (MQ=255) aaGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGTGAGGGCGGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACTGCCCCGCGTGGTa > 2:5541217/1‑150 (MQ=255) gAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACACGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACTGCCCCGCGTGGTACAGc < 2:5658675/150‑1 (MQ=255) gtgCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCGTACAAGTAGGGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACTGCCCCGCGTGGTACAGCGaaaaa < 2:2656345/150‑1 (MQ=255) ccGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCCCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgtaggagcggggttaaccgcgaagaggccggcacaggctcacttgtgcaaccaacacaggaagccccccgtcgtgattgaacc < 2:4988566‑M2/150‑85 (MQ=255) gCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAggttcaccacagccctctcaggcggtgcactacttgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctcacttgtgccaccaactcaggaagccacccttcttgattgaagccgg > 2:5587710‑M1/1‑29 (MQ=255) gCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAggttcaccacagccctctcaggcggtgcactacgtgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctcacttgtgcaaccaactcaggaagccacccttcgtgattgaagccgg > 2:6760742‑M1/1‑29 (MQ=255) gCCTCTTCGC‑GGGTAAAACCGCTCCTACAggttcaccacagccctctcaggcggtgcacgacttttaggagcgggtttaaccgcgaagaggccggcacaggctcacttgtgcaaccaactcaggaagccacccatcttgatttaagccgg > 2:5982031‑M1/1‑29 (MQ=255) ccTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAggttcaccaccgccctctcaggcggtgcactacttgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctcacttgtgcaaccaactcaggaagccacccttcttgattgaagccggc < 2:1042781‑M1/150‑123 (MQ=255) tctTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAggttcaccacagccctctcaggcggtgcactacttgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctcacttgtgcaaccaactcaggaagccacccttcttgattgaagccggctt < 2:6781327‑M1/150‑125 (MQ=255) tctTCGC‑GGGTAAAACCCCGCCTACAACTAGTGCACCCCCGGAGAGGGCTGTGGTGAACCGGTAGGAGCGGGTTTAACCGCGAAGAGGCCAGTACGTACAAAACAAACCTCACGCACAGCCCCGCGTGGTACAGCGAAAAACCGGCCTCa > 2:1207238/1‑150 (MQ=255) TCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACACGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACTGCCCCGCGTGGTACAGCGAAAAACCGGACTCa > 1:4550146‑M1/1‑150 (MQ=255) TTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCCCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCCGTACTTACAACACAACCCACAGGCACTGCCCCGCGTGGTACAGCGAAAAACCGGACTCATa < 1:2786513‑M1/150‑1 (MQ=255) gc‑gGGTAAACCCGCTCCTACAggttcaccacagccctctcaggcggtgcactacttgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctcacttgtgcaaccaactcaggaagccacccttcttgattgaagccggcttctgca > 1:1149365‑M1/1‑21 (MQ=255) gc‑gGGAAAACCCGCTCCTACCggttcaccacagccctctccggcggtgcagtacttgttggtggggttttacccgcgatgaggccggcacaggctcacttgtgcaaccaactcaggaagccacccttcttgattgaagccggcttctgca < 2:5255203‑M1/150‑130 (MQ=255) GC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACTGCCCCGCGTGGTACAGCGAAAAACCGGACTCATAGaa < 2:5718921‑M1/150‑1 (MQ=255) GC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCAGGAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACTGCCCCGCGTGGTACAGCGAAAAACCGGACTCATAgac < 2:4673354‑M1/150‑2 (MQ=255) c‑gGGTAAACCCGCTCCTACAggttcaccacagccctctcaggcggtgcactacttgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctcacttgtgcaaccaactcaggaagccacccgtcttgattgaagccggcttctgcaa > 1:2259974‑M1/1‑20 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACAggtaccccacagccctctccggcggtgcactagtttttggagcggttttacccgcgaagaggccggcacaggctcacttgtgcaaccaactcaggaagccacccttcttgattgaagccggcttctgcaac < 1:6871421‑M1/150‑132 (MQ=255) GTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACTGCCCCGCGTGGTACAGCGAAAAACCGGACTCATAGAACGCt < 1:799917‑M1/150‑1 (MQ=255) TAAACCCGCTCCTACACGTCGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACTGCCCCGCGTGGTACAGCGAAAAACCGGACTCATAGAACGCTg > 2:2052960‑M1/1‑150 (MQ=255) TAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACTGCCCCGCGTGGTACAGCGAAAAACCGGACTCATAGAACGCTg < 2:3782855‑M1/150‑1 (MQ=255) accccGCTCCTCCCCGTGGGGCCCCGCGTGCGGGGGGTGTGGTGACCGTGTCGGGGGGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACTGCCCCGCGTGGTACAGCGAAAAACCGGACTCATAGAACGCTGTc < 1:4210332/148‑1 (MQ=255) aaCCCGCTCCTACAggttcaccacagccctctcaggcggtgcactacttgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctcacttgtgcaaccaactcaggaagccacccttcttgattgaagccggcttctgcaacaacaa < 2:6780172‑M1/150‑137 (MQ=255) cccGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCtgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccggcacaggctcacttgtgcaaccaactcaggaagccacccttcttgattgaagccggcttctgcaacaacaacg < 1:2415259‑M2/150‑105 (MQ=255) CCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACTGCCCCGCGTGGTACAGCGAAAAACCGGACTCATAGAACGCTGTCCg < 2:4084906‑M1/150‑1 (MQ=255) | GCGAAGTGCAGACGGCGTTGAGCAAATTGCAGCGGTTCCGGCGGCAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAAGTAGTGCACCGCCTGAGAGGGCTGTGGTGAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCAGTACTTACAACACAACCCTCAGGCACTGCCCCGCGTGGTACAGCGAAAAACCGGACTCATAGAACGCTGTCCG > NC_002947/6005777‑6006075 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |