| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 6,015,034 | T→A | 5.3% | Q275L (CAA→CTA) ‡ | PP_5263 ← | GGDEF domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 6,015,034 | 0 | T | A | 5.3% | 1130.6 / 30.8 | 331 | Q275L (CAA→CTA) ‡ | PP_5263 | GGDEF domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (139/174); new base A (7/10); total (147/184) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.81e-01 | |||||||||||
Only 100 of 339 total aligned reads displayed.
CAATGCGCCCGTCAGCCAGGTTCAGGCGGGGCTGATAGTGCAGCTCCAGTTCGTCGCGGCGCAGGGCGCGGCGCAACTCGCTTTCCAGGTCAGCAAGGCTGCGGGCGTTGCGGTTGATGCGTTCGTTGAACACATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATCAGCGGATCGGCGCCGCTCTGCGCGCGAGCATGTGCAATGCCCAGGCTGCAGCCCAGCAGCAGGCTTTCGCCGTCGATCCAGTAGGGCTCTGCCAAGGCCTCGAC > NC_002947/6014885‑6015182 | aaTGCGCCCGTCAGCCAGGTTCAGGCGGGGCTGATAGTGCAGCTCCAGTTCGTCGCGGCGCAGGGCGCGGCGCAACTCGCTTTCCAGGTCAGCAAGGCTGCGGGCGTTGCGGTTGATGCGTTCGTTGAACACATGGAAGGTGCAGCCTTg > 2:3816790/1‑150 (MQ=255) cccGTCAGCCAGGTTCAGGCGGGGCTGATAGTGCAGCTCCAGTTCGTCGCGGCGCAGGGCGCGGCGCAACTCGCTTTCCAGGTCAGCAAGGCTGCGGGCGTTGCGGTTGATGCGTTCGTTGAACACATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGc‑c < 1:222764/150‑1 (MQ=255) ccGTCAGCCAGGTTCAGGCGGGGCTGATAGTGCAGCTCCAGTTCGTCGCGGCGCAGGGCGCGGCGCAACTCGCTTTCCAGGTCAGCAAGGCTGCGGGCGTTGCGGTTGATGCGTTCGTTGAACACATGGAAGGTGCAGCCAAGGCTGcac < 1:5734268/150‑3 (MQ=255) tCAGCCAGGTTCAGGCGGGGCTGATAGTGCAGCTCCAGTTCGTCGCGGCGCAGGGCGCGGCGCAACTCGCTTTCCAGGTCAGCAAGGCTGCGGGCGTTGCGGTTGATGCGTTCGTTGAACACATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTg < 1:2128301/150‑1 (MQ=255) aGCCAGGTTCAGGCGGGGCTGATAGTGCAGCTCCAGTTCGTCGCGGCGCAGGGCGCGGCGCAACTCGCTTTCCAGGTCAGCAAGGCTGCGGGCGTTGCGGTTGATGCGTTCGTTGAACACATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGc > 2:4429934/1‑150 (MQ=255) aGCCAGGTTCAGGCGGGGCTGATAGTGCAGCTCCAGTTCGTCGCGGCGCAGGGCGCGGCGCAACTCGCTTTCCAGGTCAGCAAGGCTGCGGGCGTTGCGGTTGATGCGTTCGTTGAACACATGGAAGGTGCAGCCAAGGCTGcaccttcc < 2:4326621/150‑8 (MQ=255) cAGGTTCAGGCGGGGCTGATAGTGCAGATCCAGTTCGTCGCGGCGCAGGGCGCGGCGCAACTCGCTTTCAAGGTCAGCAAGGCTGCGGGCGTTGCGGTTGATGCGGTCGTTGAACACATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTg > 2:6134973/1‑150 (MQ=255) aGGTTCAGGCGGGGCTGATAGTGCAGCTCCAGTTCGTCGCGGCGCAGGGCGCGGCGCAACTCGCTTTCCAGGTCAGCAAGGCTGCGGGCGTTGCGGTTGATGCGTTCGTTGAACAGATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGa > 2:2314873/1‑150 (MQ=255) aGGTTCAGGCGGGGCTGATAGTGCAGCTCCAGTTCGTCGCGGCGCAGGGCGCGGCGCAACTCGCTTTCCAGGTCAGCAAGGCTGCGGGCGTTGCGGTTGATGCGTTCGTTGAACACATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGa > 2:2279503/1‑150 (MQ=255) cAGGCGGGGCTGATAGTGCAGCTCCAGTTCGTCGCGGCGCAGGGCGCGGCGCAACTCGCTTTCCAGGTCAGCAAGGCTGCGGGCGTTGCGGTTGATGCGTTCGTTGAACACATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCAt < 2:2088933/150‑1 (MQ=255) gCGGGGCTGATAGTGCAGCTCCAGTTCGTCGCGGCGCAGGGCGCGGCGCAACTCGCTTTCCAGGTCAGCAAGGCTGCGGGCGTTGCGGTTGATGCGTTCGTTGAACACATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGc > 2:3291537/1‑150 (MQ=255) gggCTGATAGTGCAGCTCCAGTTCGTCGCGGCGCAGGGCGCGGCGCAACTCGCTTTCCAGGTCAGCAAGGCTGCGGGCGTTGCGGTTGATGCGTTCGTTGAACACATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGAt < 1:6334145/150‑1 (MQ=255) gCTGATAGTGCAGCTCCAGTTCGTCGCGGCGCAGGGCGCGGCGCAACTCGCTTTCCAGGTCAGCAAGGCTGCGGGCGTTGCGGTTGATGCGTTCGTTGAACACATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGAtgt < 2:4140159/150‑1 (MQ=255) gATAGTGCAGCTCCAGTTCGTCGCGGCGCAGGGCGCGGCGCAACTCGCTTTCCAGGTCAGCAAGGCTGCGGGCGTTGCGGTTGATGCGTTCGTTGAACACATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTgcg > 1:4782267/1‑150 (MQ=255) gTGCAGCTCCAGTTCGTCGCGGCGCAGGGCGCGGCGCAACTCGCTTTCCAGGTCAGCAAGGCTGCGGGCGTTGCGGTTGATGCGTTCGTTGAACACATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTg > 2:6743506/1‑150 (MQ=255) tGCAGCTCCAGTTCGTCGCGGCGCAGGGCGCGGCGCAACTCGCTTTCCAGGTCAGCAAGGCTGCGGGCGTTGCGGTTGATGCGTTCGTTGAACACATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGc < 1:5235830/150‑1 (MQ=255) tGCAGCTCCAGTTCGTCGCGGCGCAGGGCGCGGCGCAACTCGCTTTCCAGGTCAGCAAGGCTGCGGGCGTTGCGGTTGATGCGTTCGTTGAACACATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGc > 2:4890904/1‑150 (MQ=255) cAGCTCCAGTTCGTCGCGGCGCAGGGCGCGGCGCAACTCGCTTTCCAGGTCAGCAAGGCTGCGGGCGTTGCGGTTGATGCGTTCGTTGAACACATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATAGCGATGTGCGCGTGCca < 1:1753518/150‑1 (MQ=255) aGCTCCAGTTCGTCGCGGCGCAGGGCGCGGCGCAACTCGCTTTCCAGGTCAGCAAGGCTGCGGGCGTTGCGGTTGATGCGTTCGTTGAACACATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCcac > 1:3984720/1‑150 (MQ=255) tCCAGTTCGTCGCGGCGCAGGGCGCGGCGCAACTCGCTTTCCAGGTCAGCAAGGCTGCGGGCGTTGCGGTTGATGCGTTCGTTGAACACATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATc < 2:1610054/150‑1 (MQ=255) ccAGTTCGTCGCGGCGCAGGGCGCGGCGCAACTCGCTTTCCAGGTCAGCAAGGCTGCGGGCGTTGCGGTTGATGCGTTCGTTGAACACATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATCa < 2:5949034/150‑1 (MQ=255) cAGTTCGTCGCGGCGCAGGGCGCGGCGCAACTCGCTTTCCAGGTCAGCAAGGCTGCGGGCGTTGCGGTTGATGCGTTCGTTGAACACATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCAt < 2:6784713/126‑1 (MQ=255) gTTCGTCGCGGCGCAGGGCGCGGCGCAACTCGCTTTCCAGGTCAGCAAGGCTGCGGGCGTTGCGGTTGATGCGTTCGTTGAACACATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATCAGCg < 1:5875029/150‑1 (MQ=255) ttgcgcgGCGCAGGGCGCGGCGCAACTCGCTTTCCAGGTCAGCAAGGCTGCGGGCGTTGCGGTTGATGCGTTCGTTGAACACATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATCAGCGGAt > 2:3137993/4‑150 (MQ=255) gtcgCGGCGCAGGGCGCGGCGCAACTCGCTTTCCAGGTCAGCAAGGCTGCGGGCGTTGCGGTTGATGCGTTCGTTGAACACATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATCAGCGGATc < 1:2698493/150‑1 (MQ=255) gtcgCGGCGCAGGGCGCGGCGCAACTCGCTTTCCAGGTCAGCAAGGCTGCGGGCGTTGCGGTTGATGCGTTCGTTGAACACATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATCAGCGGATc > 1:1522497/1‑150 (MQ=255) tcgCGGCGCAGGGCGCGGCGCAACTCGCTTTCCAGGTCAGCAAGGCTGCGGGCGTTGCGGTTGATGCGTTCGTTGAACACATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATCAGCGGATCg > 1:145441/1‑150 (MQ=255) tcgCGGCGCAGGGCGCGGCGCAACTCGCTTTCCAGGTCAGCAAGGCTGCGGGCGTTGCGGTTGATGCGTTCGTTGAACACATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATCAGCGGATCg < 1:124785/150‑1 (MQ=255) gcggcgCAGGGCGCGGCGCAACTCGCTTTCCAGGTCAGCAAGGCTGCGGGCGTTGCGGTTGATGCGTTCGTTGAACACATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATCAGCGGATCGgc < 2:4051601/150‑1 (MQ=255) gcAGGGCGCGGCGCAACTCGCTTTCCAGGTCAGCAAGGCTGCGGGCGTTGCGGTTGATGCGTTCGTTGAACACATGGAAGGTGCAGCCTCGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATCAGCGGATCGGcgccgc > 2:2651068/1‑150 (MQ=255) gggCGCGGCGCAACTCGCTTTCCAGGTCAGCAAGGCTGCGGGCGTTGCGGTTGATGCGTTCGTTGAACACATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATCAGCGGATCGGCGCCGctct < 2:5386184/150‑1 (MQ=255) ggcgcggcgcAACTCGCTTTCCAGGTCAGCAAGGCTGCGGGCGTTGCGGTTGATGCGTTCGTTGAACACATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATCAGCGGATCGGCGCCGCTCTg > 1:2062916/1‑150 (MQ=255) gcgcggcgcAACTCGCTTTCCAGGTCAGCAAGGCTGCGGGCGTTGCGGTTGATGCGTTCGTTGAACACATGGAAGGTGCAGCCAAGGCTGcac < 2:587383/93‑3 (MQ=255) cgcAACTCGCTTTCCAGGTCAGCAAGGCTGCGGGCGTTGCGGTTGATGCGTTCGTTGAACACATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATCAGCGGATCGGCGCCGCTCTGCGCGCGa < 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tCGCTTTCCAGGTCAGCAAGGCTGCGGGCGTTGCGGTTGATGCGTTCGTTGAACACATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATCAGCGGATCGGCGCCGCTCTGCGCGCGAGCAtgt > 2:1115993/1‑150 (MQ=255) tCGCTTTCCAGGTCAGCAAGGCTGCGGGCGTTGCGGTTGATGCGTTCGTTGAACACATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATCAGCGGATCGGCGCCGCTCTGCGCGCGAGCAtgt < 1:1160570/150‑1 (MQ=255) tCGCTTTCCAGGTCAGCAAGGCTGCGGGCGTTGCGGTTGATGCGTTCGTTGAACACATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATCAGCGGATCGGCGCCGCTCTGCGCGCGAGCAtgt > 2:6824551/1‑150 (MQ=255) tCGCTTTCCAGGTCAGCAAGGCTGCGGGAGTTGCGGTTGATGCGTTCGTTGAACACATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATCAGCGGATCGGCGCCGCTCTGCGCGCGAGCAtgt > 1:51429/1‑150 (MQ=255) gCTTTCCAGGTCAGCAAGGCTGCGGGCGTTGCGGTTGATGCGTTCGTTGAACACATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATCAGCGGATCGGCGCCGCTCTGCGCGCGAGCATGTGc < 1:3804403/150‑1 (MQ=255) gCTTTCCAGGTCAGCAAGGCTGCGGGCGTTGCGGTTGATGCGTTCGATGAACACATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATCAGCGGATCGGCGCCGCTCTGCGCGCGAGCATGTGc > 2:1007842/1‑150 (MQ=255) cTTTCCAGGTCAGCAAGGCTGCGGGCGTTGCGGTTGATGCGTTCGTTGAACACATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATCAGCGGATCGGCGCCGCTCTGCGCGCGAGCATGTGCa > 1:6706602/1‑150 (MQ=255) ttgccAGGTCAGCACGGCTGCGGGCGTTGCGGTTGATGCGTTCGTTGAACACATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATCAGCGGATCGGCGCCGCTCTGCGCGCGAGCATGTGCaa < 1:1934545/147‑1 (MQ=255) ttCCAGGTCAGCAAGGCTGCGGGCGTTGCGGTTGATGCGTTCGTTGAACACATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATCAGCGGATCGGCGCCGCTCTGCGCGCGAGCATGTGCAAt < 1:5933394/150‑1 (MQ=255) aGGTCAGCAAGGCTGCGGGCGTTGCGGTTGATGCGTTCGTTGAACACATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATCAGCGGATCGGCGCCGCTCTGCGCGCGAGCATGTGCAATGccc > 1:6326840/1‑150 (MQ=255) 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ttcgttGAACACATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATCAGCGGATCGGCGCCGCTCTGCGCGCGAGCATGTGCAATGCCCAGGCTGCa > 2:3386274/1‑123 (MQ=255) ttcgttGAACACATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATCAGCGGATCGGCGCCGCTCTGCGCGCGAGCATGTGCAATGCCCAGGCTGCa < 1:3386274/123‑1 (MQ=255) tcgttGAACACATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATCAGCGGATCGGCGCCGCTCTGCGCGCGAGCATGTGCAATGCCCAGGCTGCAGCCCAGCAGCAGGCTTTCGCCGTCGATc < 1:4346422/150‑1 (MQ=255) gttGAACACATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATCAGCGGATCGGCGCCGCTCTGCGCGCGAGCATGTGCAATGCCCAGGCTGCAGCCCAGCAGCAGGCTTTCGCCGTCGATCCa < 2:1745774/150‑1 (MQ=255) gAACAGATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATCAGCGGATCGGCGCCGCTCTGCGCGCGAGCATGTGCAATGCCCAGGCTTCAGCCCAGCAGCAGGCTTTCGCCGTCGATCCAGTa < 2:665616/150‑1 (MQ=255) acacATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATCAGCGGATCGGCGCCGCTCTGCGCGCGAGCATGTGCAATGCCCAGGCTGCAGCCCAGCAGCAGGCTTTCGCCGTCGATCCAGTAgg < 2:244648/150‑1 (MQ=255) acaTGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATCAGCGGATCGGCGCCGCTCTGCGCGCGAGCATGTGCAATGCCCAGGCTGCAGCCCAGCAGCAGGCTTTCGCCGTCGATCCAGTAGGGc > 1:4291574/1‑150 (MQ=255) caTGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATCAGCGGATCGGCGCCGCTCTGCGCGCGAGCATGTGCAATGCCCAGGCTGCAGCCCAGCAGCAGGCTTTCGCCGTCGATCCAGTAGGGct < 2:812284/150‑1 (MQ=255) ggAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATCAGCGGATCGGCGCCGCTCTGCGCGCGAGCATGTGCAATGCCCAGGCTGCAGCCCAGCAGCAGGCTTTCGCCGTCGATCCAGTAGGGCTCTg > 1:3868643/1‑150 (MQ=255) ccaagggCAGCCAAGGCTGCACCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATCAGCGGATCGGCGCCGCTCTGCGCGCGAGCATGTGCAATGCCCAGGCTGCAGCCCAGCAGCAGGCTTTCGCCGTCGATCCAGTAGGGCTCTg > 1:3472957/7‑150 (MQ=255) caagggCAGCCAAGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATCAGCGGATCGGCGCCGCTCTGCGCGCGAGCATGTGCAATGCCCAGGCTGCAGCCCAGCAGCAGGCTTTCGCCGTCGATCCAGTa > 1:287178/6‑140 (MQ=255) caagggCAGCCAAGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATCAGCGGATCGGCGCCGCTCTGCGCGCGAGCATGTGCAATGCCCAGGCTGCAGCCCAGCAGCAGGCTTTCGCCGTCGATCCAGTa < 2:287178/135‑1 (MQ=255) aaGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATCAGCGGATCGGCGCCGCTCTGCGCGCGAGCATGTGCAATGCCCAGGCTGCAGCCCAGCAGCAGGCTTTCGCCGTCGATCCAGTAGGGCTCTGcc > 1:5892970/1‑150 (MQ=255) aagggCAGCCAAGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATCAGCGGATCGGCGCCGCTCTGCGCGCGAGCATGTGCAATGCCCAGGCTGCAGCCCAGCAGCAGGCTTTCGCCGTCGATCCAGTAGGGCTCTGCCa > 2:5076206/5‑150 (MQ=255) gTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATCAGCGGATCGGCGCCGCTCTGCGCGCGAGCATGTGCAATGCCCAGGCTGCAGCCCAGCAGCAGGCTTTCGCCGTCGATCCAGTAGGGCTCTGCCAAg < 2:6335088/150‑1 (MQ=255) cAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATCAGCGGATCGGCGCCGCTCTGCGCGCGAGCATGTGCAATGCCCAGGCTGCAGCCCAGCAGCAGGCTTTCGCCGTCGATCCAGTAGGGCTCTGCCAAGGcc > 1:2405590/1‑150 (MQ=255) cAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATCAGCGGATCGGCGCCGCTCTGCGCGCGAGCATGTGCAATGCCCAGGCTGCAGCCCAGCAGCAGGCTTTCGCCGTCGATCCAGTAGGGCTCTGCCAAGGcc > 1:800247/1‑150 (MQ=255) cAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATCAGCGGATCGGCGCCGCTCTGCGCGCGAGCATGTGCAATGCCCAGGCTGCAGCCCAGCAGCAGGCTTTCGCCGTCGATCCAGTAGGGCTCTGCCAAGGcc > 1:5028865/1‑150 (MQ=255) gCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATCAGCGGATCGGCGCCGCTCTGCGCGCGAGCATGTGCAATGCCCAGGCTGCAGCCCAGCAGCAGGCTTTCGCCGTCGATCCAGTAGGGCTCTGCCAAGGCCTc > 2:3589187/1‑150 (MQ=255) ccTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATCAGCGGATCGGCGCCGCTCTGCGCGCGAGCATGTGCAATGCCCAGGCTGCAGCCCAGCAGCAGGCTTTCGCCGTCGATCCAGTAGGGCTCTGCCAAGGCCTcg > 1:277440/1‑150 (MQ=255) ttGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATCAGCGGATCGGCGCCGCTCTGCGCGCGAGCATGTGCAATGCCCAGGCTGCAGCCCAGCAGCAGGCTTTCGCCGTCGATCCAGTAGGGCTCTGCCAAGGCCTcgac > 1:1084488/1‑150 (MQ=255) | CAATGCGCCCGTCAGCCAGGTTCAGGCGGGGCTGATAGTGCAGCTCCAGTTCGTCGCGGCGCAGGGCGCGGCGCAACTCGCTTTCCAGGTCAGCAAGGCTGCGGGCGTTGCGGTTGATGCGTTCGTTGAACACATGGAAGGTGCAGCCTTGGCTGC‑CCTTGGCCTGACGCATGGCGATGTGCGCGTGCCACATCAGCGGATCGGCGCCGCTCTGCGCGCGAGCATGTGCAATGCCCAGGCTGCAGCCCAGCAGCAGGCTTTCGCCGTCGATCCAGTAGGGCTCTGCCAAGGCCTCGAC > NC_002947/6014885‑6015182 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |