Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_002947 | 6,018,858 | 0 | C | A | 17.0% | 393.0 / 66.9 | 163 | intergenic (+58/+52) | xpt/PP_5266 | xanthine phosphoribosyltransferase/acetyl‑CoA hydrolase family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (46/87); new base A (14/14); total (60/103) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.37e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 163 total aligned reads displayed.
CGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGC‑GGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCT > NC_002947/6018711‑6019005 | gCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCtgt < 1:1253078/150‑1 (MQ=255) gCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCtgt < 2:1939550/150‑1 (MQ=255) ccGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCtgtg < 2:6527436/150‑1 (MQ=255) 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2:2504126/1‑79 (MQ=255) tCCCACAGGTACGGCACAGCGTTCGAGACCTGTGCTGCACCTGTGGGAGC‑GGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGcc > 2:504869/1‑150 (MQ=21) cccACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGC‑GGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGccc < 2:5550302/150‑1 (MQ=255) cccACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGC‑GGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGccc < 2:5550303/150‑1 (MQ=255) cccACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGC‑GGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGccc > 2:5775647/1‑150 (MQ=255) cccACAGGTACGGCACAGCGTTCGAGACCTGTGCTGCACCTGTGGGAGC‑GGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGccc > 1:4189929/1‑150 (MQ=21) 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aGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGC‑GGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACt > 2:4004003/1‑150 (MQ=255) gcagcaCAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGC‑GGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCAt > 2:4591340/1‑150 (MQ=255) aGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGC‑GGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGcccc > 2:3193240/1‑150 (MQ=255) aGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGC‑GGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGcccc > 1:1815272/1‑150 (MQ=255) gTCTCGAACGCTTGGCCGTACCTGTGGGCGC‑GGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAg < 1:5990792/150‑1 (MQ=255) 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1:2785912/1‑90 (MQ=255) gAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGC‑GGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAgc < 2:2785912/90‑1 (MQ=255) gAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGC‑GGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGc > 2:2178614/1‑150 (MQ=255) aaCGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGC‑GGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCt < 2:2421808/150‑1 (MQ=255) | CGTGCCGAACTGGACAGCCAGGGTTACCGCGTTGAATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGC‑GGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCT > NC_002947/6018711‑6019005 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |