| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_002947 | 119,735 | G→A | 5.4% | G31G (GGC→GGT) | metN ← | methionine ABC transporter ATP‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 119,735 | 0 | G | A | 5.4% | 937.8 / 26.0 | 294 | G31G (GGC→GGT) | metN | methionine ABC transporter ATP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (128/150); new base A (10/6); total (138/156) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.11e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 | |||||||||||
Only 100 of 299 total aligned reads displayed.
CGGAAGCCGCGCAACTGGCTGGCGTTGAACGCGGTGACGTCTTCGCCGTCGACGATGATCGTGCCGCCGGAAGGTTCTTCCAGGCGGTTGATCAGGCGCAGCATGGTGCTTTTGCCAGCGCCGGAATGGCCGATCAGGCCGAACACCTGGCCATCTTCGATGGTCAGGCTGGTCGGATTCAGTGCGGGGATTTCCCTACCGGCAACGCGGTAGGTTTTATGTACCTGTTGGAACTCGATCACGTAGCGAACCTTGTGGGGCGCATTGAAATTTGGGTCAGCGGTTAGCTGGGGTCGCGC > NC_002947/119586‑119884 | ggAAGCCGCGCAACTGGCTGGCGTTGAACGCGGTGACGTCTTCGCCGTCGACGATGATCGTGCCGCCGGAAGGTTCTTCCAGGCGGTTGATCAGGCGCAGCATGGTGCTTTTGCCAGCGCCGGACTGGCCGATCAGGCCGAACACCTGGc > 2:4152464/1‑150 (MQ=255) ggAAGCCGCGCAACTGGCTGGCGTTGAACGCGGTGACGTCTTCGCCGTCGACGATGATCGTGCCGCCGGAAGGTTCTTCCAGGCGGTTGATCAGGCGCAGCATGGTGCTTTTGCCAGCGCCGGAATGGCCGATCAGGCCGAACACCTGGc < 1:5974761/150‑1 (MQ=255) ggAAGCCCCGCAACTGGCTGGCGTTGAACGCGGTGACGTCTTCGCCGTCGACGATGATCGTGCCGCCGGAAGGTTCTTCCAGGCGGTTGATCAGGCGCAGCATGGTGCTTTTGCCAGCGCCGGACTGGCCGATCAGGCCGAACACCTGGc > 2:4465637/1‑150 (MQ=255) gAAGCCGCGCAACTGGCTGGCGTTGAACGCGGTGACGTCTTCGCCGTCGACGATGATCGTGCCGCCGGAAGGTTCTTCCAGGCGGTTGATCAGGCGCAGCATGGTGCTTTTGCCAGCGCCGGAATGGCCGATCAGGCCGAACACCTGGcc > 1:6843197/1‑150 (MQ=255) gCCGCGCAACTGGCTGGCGTTGAACGCGGTGACGTCTTCGCCGTCGACGATGATCGTGCCGCCGGAAGGTTCTTCCAGGCGGTTGATCAGGCGCAGCATGGTGCTTTTGCCAGCGCCGGAATGGCCGATCAGGCCGAACACCTGGCCATc > 1:1236580/1‑150 (MQ=255) cgcgCAACTGGCTGGCGTTGAACGCGGTGACGTCTTCGCCGTCGACGATGATCGTGCCGCCGGAAGGTTCTTCCAGGCGGTTGATCAGGCGCAGCATGGTGCTTTTGCCAGCGCCGGAATGGCCGATCAGGCCGAACACCTGGCCATCtt < 2:5436425/150‑1 (MQ=255) gcgcAACTGGCTGGCGTTGAACGCGGTGACGTCTTCGCCGTCGACGATGATCGTGCCGCCGGAAGGTTCTTCCAGGCGGTTGATCAGGCGCAGCATGGTGCTTTTGCCAGCGCCGGAATGGCCGATCAGGCCGAACACCTGGCCATCTTc < 2:6427552/150‑1 (MQ=255) cAACTGGCTGGCGTTGAACGCGGTGACGTCTTCGCCGTCGACGATGATCGTGCCGCCGGAAGGTTCTTCCAGGCGGTTGATCAGGCGCAGCATGGTGCTTTTGCCAGCGCCGGAATGGCCGATCAGGCCGAACACCTGGCCATCTTCGAt < 1:1063036/150‑1 (MQ=255) 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gctggcGTTGACCGCGGTGACGTCTTCGCCGTCGACGATGATCGTGCCGCCGGAAGGTTCTTCCAGGCGGTTGATCAGGCGCAGCATGGTGCTTTTGCCAGCGCCGGAATGGCCGATCAGGCCGAACACCTGACCATCGAAGATGGCCAg < 2:5929893/150‑1 (MQ=255) tggcGTTGAACGCGGTGACGTCTTCGCCGTCGACGATGATCGTGCCGCCGGAAGGTTCTTCCAGGCGGTTGATCAGGCGCAGCATGGTGCTTTTGCCAGCGCCGGAATGGCCGATCAGGCCGAACACCTGGCCATCTTCGATGGTCAGGc > 2:2759798/1‑150 (MQ=255) gggcGTTGAACGCGGTGACGTCTTCGCCGTCGACGATGATCGTGCCGCCGGAAGGTTCTTCCAGGCGGTTGATCAGGCGCAGCATGGTGCTTTTGCCAGCGCCGGAATGGCCGATCAGGCCGAACACCTGACCATCGAAGATGGCCAggt < 2:4697194/149‑2 (MQ=255) gcGTTGAACGCGGTGACGTCTTCGCCGTCGACGATGATCGTGCCGCCGGAAGGTTCTTCCAGGCGGTTGATCAGGCGCAGCATGGTGCTTTTGCCAGCGCCGGAATGGCCGATCAGGCCGAACACCTGGCCATCTTCGATGGTCAGGCTg < 2:5781384/150‑1 (MQ=255) gTTGAACGCGGTGACGTCTTCGCCGTCGACGATGATCGTGCCGCCGGAAGGTTCTTCCAGGCGGTTGATCAGGCGCAGCATGGTGCTTTTGCCAGCGCCGGAATGGCCGATCAGGCCGAACACCTGGCCATCTTCGATGGTCAGGCTGGt > 1:4017650/1‑150 (MQ=255) 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cgcgGTGACGTCTTCGCCGTCGACGATGATCGTGCCGCCGGAAGGTTCTTCCAGGCGGTTGATCAGGCGCAGCATGGTGCTTTTGCCAGCGCCGGAATGGCCGATCAGGCCGAACACCTGGCCATCTTCGATGGTCAGGCTGGTCGGAtt > 2:1726192/1‑150 (MQ=255) gcgGTGACGTCTTCGCCGTCGACGATGATCGTGCCGCCGGAAGGTTCTTCCAGGCGGTTGATCAGGCGCAGCATGGTGCTTTTGCCAGCGCCGGAATGGCCGATCAGGCCGAACACCTGGCCATCTTCGATGGTCAGGCTGGTCGGATTc < 1:4166112/150‑1 (MQ=255) cGTCTTCGCCGTCGACGATGATCGTGCCGCCGGAAGGTTCTTCCAGGCGGTTGATCAGGCGCAGCATGGTGCTTTTGCCAGCGCCGGAATGGCCGATCAGGCCGAACACCTGGCCATCTTCGATGGTCAGGCTGGTCGGATTCAGTGCgg < 2:637575/150‑1 (MQ=255) gTCTTCGCCGTCGACGATGATCGTGCCGCCGGAAGGTTCTTCCAGGCGGTTGATCAGGCGCCGCATGGTGCTTTTGCCAGCGCCGGAATGGCCGATCAGGCCGAACACCTGGCCATCTTCGATGGTCAGGCTGGTCGGATTCAGTGCggg > 1:3604238/1‑150 (MQ=255) gTCTTCGCCGTCGACGATGATCGTGCCGCCGGAAGGTTCTTCCAGGCGGTTGATCAGGCGCAGCATGGTGCTTTTGCCAGCGCCGGAATGGCCGATCAGGCCGAACACCTGGc < 2:6458101/113‑1 (MQ=255) 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acgaTGATCGTGCCGCCGGAAGGTTCTTCCAGGCGGTTGATCAGGCGCAGCATGGTGCTTTTGCCAGCGCCGGAATGGCCGATCAGGCCGAACACCTGGCCATCTTCGATGGTCAGGCTGGTCGGATTCAGTGCGGGGATTTCCCTACCg > 2:5797458/1‑150 (MQ=255) gatgatCGTGCCGCCGGAAGGTTCTTCCAGGCGGTTGATCAGGCGCAGCATGGTGCTTTTGCCAGCGCCGGAATGGCCGATCAGGCCGAACACCTGGCCATCTTCGATGGTCAGGCTGGTCGGATTCAGTGCGGGGATTTCCCTACCGGc > 2:2207144/1‑150 (MQ=255) gatgatCGTGCCCCCGGAAGGTTCTTCCAGGCGGTTCATCAGGCGCAGCATGGTGCTAAAGCCAGCGCCGGAATGGCCCATCAGGCCGAACACCTGGCCATCTTCGATGGTCACGCTGGTCGGATTCAGTGCGGGCATTTCTCTACCGGc > 1:1461372/1‑150 (MQ=255) tCGTGCCGCCGGAAGGTTCTTCCAGGCGGTTGATCAGGCGCAGCATGGTGCTTTTGCCAGCGCCGGAATGGCCGATCAGGCCGAACACCTGGCCATCTTCGATGGTCAGGCTGGTCGGATTCAGTGCGGGGATTTCCCTACCGGCAAcgc > 1:3577583/1‑150 (MQ=255) gTGCCGCCGGAAGGTTCTTCCAGGCGGTTGATCAGGCGCAGCATGGTGCTTTTGCCAGCGCCGGAATGGCCGATCAGGCCGAACACCTGGCCATCTTCGATGGTCAGGCTGGTCGGATTCAGTGCGGGGATTTCCCTACCGGCAACGCgg > 2:6198510/1‑150 (MQ=255) 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CGGAAGCCGCGCAACTGGCTGGCGTTGAACGCGGTGACGTCTTCGCCGTCGACGATGATCGTGCCGCCGGAAGGTTCTTCCAGGCGGTTGATCAGGCGCAGCATGGTGCTTTTGCCAGCGCCGGAATGGCCGATCAGGCCGAACACCTGGCCATCTTCGATGGTCAGGCTGGTCGGATTCAGTGCGGGGATTTCCCTACCGGCAACGCGGTAGGTTTTATGTACCTGTTGGAACTCGATCACGTAGCGAACCTTGTGGGGCGCATTGAAATTTGGGTCAGCGGTTAGCTGGGGTCGCGC > NC_002947/119586‑119884 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |