Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,091,451 | G→A | 5.0% | intergenic (+28/+30) | tldD → / ← PP_0941 | microcin B17 maturation protease/ribosome associated protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,091,451 | 0 | G | A | 5.0% | 829.8 / 20.1 | 258 | intergenic (+28/+30) | tldD/PP_0941 | microcin B17 maturation protease/ribosome associated protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (117/128); new base A (4/9); total (121/137) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.67e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.33e-01 |
Only 100 of 272 total aligned reads displayed.
ACGACCTGGCACTGGACAGCGGGGTAGGAACGTGCGGAAAGGACGGGCAGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAG > NC_002947/1091302‑1091600 | aCGACCTGGCACTGGACAGCGGGGTAGGAACGTGCGGAAAGGACGGGCAGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCggg > 1:4394421/1‑150 (MQ=255) aCGACCTGGCACTGGACAGCGGGGTAGGAACGTGCGGAAAGGACGGGCAGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCggg < 1:4895743/150‑1 (MQ=255) gACCTGGCACTGGACAGCGGGGTAGGAACGTGCGGAAAGGACGGGCAGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCa > 2:3495664/1‑150 (MQ=255) cTGGCACTGGACAGCGGGGTAGGAACGTGCGGAAAGGACGGGCAGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGt < 2:4539671/150‑1 (MQ=255) gCACTGGACAGCGGGGTAGGAACGTGCGGAAAGGACGGGCAGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCg > 2:2680750/1‑150 (MQ=255) aCTGGACAGCGGGGTAGGAACGTGCGGAAAGGACGGGCAGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCt > 2:2021455/1‑150 (MQ=255) cTGGACAGCGGGGTAGGAACGTGCGGAAAGGACGGGCAGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTc < 2:6631972/150‑1 (MQ=255) tGGACATCGGGGTAGGAACGTGCGGAAAGGACGGGCAGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTcc < 2:3301089/150‑1 (MQ=255) tGGACAGCGGGGTAGGAACGTGCGGAAAGGACGGGCAGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTcc > 1:908382/1‑150 (MQ=255) ggACAGCGGGGTAGGAACGTGCGGAAAGGACGGGCAGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTccc < 1:6487336/150‑1 (MQ=255) aaGCGGGGTAGGAACGTTCGGAAAGGACGGTCAGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCTATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGTCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCcac‑a < 1:4329330/149‑1 (MQ=255) aGCGGGGTAGGAACGTGCGGAAAGGACGGGCAGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCGGGAGCGGACGTGCCCGCTcctgcaa < 2:697275/150‑6 (MQ=255) aGCGGGGTAGGAACGTGCGGAAAGGACGGGCAGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCGGGAGCGGACGTGCCCGCTcctgcaa < 2:6256102/150‑6 (MQ=255) gCGGGGTAGGAACGTGCGGAAAGGACGGGCAGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑Agg < 1:5129210/150‑1 (MQ=255) cGGGGTAGGAACGTGCGGAAAGGACGGGCAGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCGGGAGCGGACGTGCCCGCTcctgcaagg < 1:2433507/150‑8 (MQ=255) cGGGGTAGGAACGTGCGGAAAGGACGGGCAGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑Aggg < 2:4208488/150‑1 (MQ=255) gggTAGGAACGTGCGGAAAGGACGGGCAGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGcc < 1:5483499/150‑1 (MQ=255) ggTAGGAACGTGCGGAAAGGACGGGCAGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGccc < 2:4303055/150‑1 (MQ=255) ggTAGGAACGTGCGGAAAGGACGGGCAGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGccc < 2:6772090/150‑1 (MQ=255) ggAACGTGCGGAAAGGACGGGCAGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGt < 1:5689316/150‑1 (MQ=255) gAACGTGCGGAAAGGACGGGCAGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGcccccgaa < 2:344364/150‑5 (MQ=255) gAACGTGCGGAAAGGACGGGCAGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTc > 2:13858/1‑150 (MQ=255) aaCGTGCGGAAAGGACGGGCAGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTcc < 1:2866278/150‑1 (MQ=255) aaCGTGCGGAAAGGACGGGCAGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTcc > 2:2977390/1‑150 (MQ=255) tGCGGAAAGGACGGGCAGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCa < 1:3241675/150‑1 (MQ=255) gCGGAAAGGACGGGCAGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑CGGGCCCCAGTCCGTCAg > 2:5990284/1‑150 (MQ=255) cGGAAAGGACGGGCAGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAgc < 2:2644985/150‑1 (MQ=255) cGGAAAGGACGGGCAGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCGACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAgc < 1:2362459/150‑1 (MQ=255) gAAAGGACGGGCAGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAgcgc > 1:4913585/1‑150 (MQ=255) aGGACGGGCAGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAAc < 2:1356393/150‑1 (MQ=255) gACGGGCAGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAAccc > 2:3607322/1‑150 (MQ=255) ggCAGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCgcgc < 2:4998381/150‑1 (MQ=255) gCAGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCt > 1:2026319/1‑150 (MQ=255) gCAGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCt > 1:2758069/1‑150 (MQ=255) aGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGc < 2:5807299/150‑1 (MQ=255) tCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCaa < 1:2313925/150‑1 (MQ=255) cccagCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAAc < 1:4425264/146‑1 (MQ=255) ggTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACt > 1:1606592/1‑150 (MQ=255) gTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACtc > 2:2208776/1‑150 (MQ=255) gCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACtcgt > 1:5319682/1‑150 (MQ=255) ggTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGa > 1:6635939/1‑150 (MQ=255) tCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAgg > 2:2906038/1‑150 (MQ=255) tCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAgg > 1:5965159/1‑150 (MQ=255) ggggTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTc < 1:3277777/150‑1 (MQ=255) ggTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTcgc < 1:6289619/150‑1 (MQ=255) ggTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTcgc > 1:6842069/1‑150 (MQ=255) ggTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGAGTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTcgc < 2:4852613/150‑1 (MQ=255) ggggCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGa < 2:5065892/150‑1 (MQ=255) gggCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGAt < 1:4673224/150‑1 (MQ=255) ggCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATg < 1:4531861/150‑1 (MQ=255) ggCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATg > 2:1126502/1‑150 (MQ=255) ggCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATg > 2:6417673/1‑150 (MQ=255) gCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACAGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGt > 2:4840033/1‑150 (MQ=255) gCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACt < 2:84902/150‑1 (MQ=255) ccTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACtt < 2:923094/150‑1 (MQ=255) ccTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACtt < 1:1461145/150‑1 (MQ=255) ccTACCTTGAAACTGGATGCGATGACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACtt < 2:2407494/150‑1 (MQ=255) cTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTg > 2:4648875/1‑150 (MQ=255) tACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGa > 2:4486150/1‑150 (MQ=255) aCCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGaa > 1:4118264/1‑150 (MQ=255) aCCATGAAACTGGATGCGAATACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGTCTACGGGGACCCTTGCACGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAAAACGCGATGCAACTCGACGAGGTCGCGGATGTACTAGaa > 2:144338/1‑150 (MQ=255) ccTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAac < 2:3891888/150‑1 (MQ=255) cTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAaca > 1:5734571/1‑150 (MQ=255) cTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAaca > 2:1359166/1‑150 (MQ=255) ttGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAacac > 1:5210520/1‑150 (MQ=255) gAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGGTTCGGGGTCCCTTGCTGGAGCGGGCACGTCCGATCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCATCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCt < 1:1117177/150‑1 (MQ=255) aaaCTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCtt < 2:3773340/150‑1 (MQ=255) aCTGGATGCGATTACCGTGGGTGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTgc < 2:4149313/150‑1 (MQ=255) aCTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTgc < 2:4362401/150‑1 (MQ=255) tGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTgcgc > 1:309252/1‑150 (MQ=255) ttACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCa > 2:4730189/1‑150 (MQ=255) cGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAggcg < 1:3423488/150‑1 (MQ=255) tGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAggcggc < 2:6062122/150‑1 (MQ=255) tGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAggcggc > 2:1903008/1‑150 (MQ=255) tACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTc > 2:3232216/1‑150 (MQ=255) tACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTc > 1:6541644/1‑150 (MQ=255) ccGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTcgc < 2:124010/150‑1 (MQ=255) ccGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTcgc < 1:3182185/150‑1 (MQ=255) ggggCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTCgcgc > 1:1648202/1‑150 (MQ=255) ggggCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTCgcgc > 1:2822807/1‑150 (MQ=255) ggggCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTCgcgc < 2:5755422/150‑1 (MQ=255) ttCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTCGCGCCTTCACGTGCTgg > 1:3368850/1‑150 (MQ=255) gggACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCAt > 1:6416583/1‑150 (MQ=255) ggACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATg < 1:375693/150‑1 (MQ=255) ccTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGgcgc > 2:4508920/1‑150 (MQ=255) cTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCa > 1:6804653/1‑150 (MQ=255) ttGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCAc > 2:545904/1‑150 (MQ=255) ttGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCAc > 1:5628644/1‑150 (MQ=255) ttGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCAc > 1:2253563/1‑150 (MQ=255) ttGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCAc > 1:1918183/1‑150 (MQ=255) gtGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCAc < 2:2266270/149‑1 (MQ=255) ctgtgggAGCGGACGTGCCCGCTCCTGC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCAc > 2:5146580/6‑150 (MQ=255) tgtgggAGCGGACGTGCCCGCTCCTGCAAGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCAc > 1:3795314/5‑150 (MQ=255) tgtgggAGCGGACGTGCCCGCTCCTAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTCGCGCCTtctc > 1:1383377/5‑131 (MQ=255) gCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCa < 2:4394421/150‑1 (MQ=255) tgggAGCGGACGTGCCCGCTCCTAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCag > 2:4022011/3‑150 (MQ=255) gAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCagcga < 1:4765155/150‑1 (MQ=255) gggCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGt > 1:2116714/1‑150 (MQ=255) ggCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTa < 1:5120453/150‑1 (MQ=255) gCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAg > 2:6054181/1‑150 (MQ=255) | ACGACCTGGCACTGGACAGCGGGGTAGGAACGTGCGGAAAGGACGGGCAGTCGGTGCCGGTCGGGGTGGGGCAGCCTACCTTGAAACTGGATGCGATTACCGTGGGCGGTACCGGGGCTTGATGGCTTCGGGGACCCTTGCAGGAGCGGGCACGTCCGCTCCCAC‑AGGGCCCCAGTCCGTCAGCGCAACCCGCGCTGCAACTCGTCGAGGTCGCGGATGTACTTGAACACCTTGCGCGCGGCGGCAGGCGGCTTGTTTCGCGCCTTCTCGTGCTGGGCATGGCGCACCAGCGAGCGTAG > NC_002947/1091302‑1091600 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |