| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 149,649 | G→C | 5.1% | R57R (CGC→CGG) ‡ | PP_0141 ← | ABC transporter ATP‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 149,649 | 0 | G | C | 5.1% | 1009.5 / 30.8 | 296 | R57R (CGC→CGG) ‡ | PP_0141 | ABC transporter ATP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (119/162); new base C (6/9); total (125/171) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.32e-01 | |||||||||||
Only 100 of 305 total aligned reads displayed.
AGGCCACGTTTTCGGTCACCGTCAGCGAAGAGAACAGCGCCCCCTTCTGGAACAGCACGCCAAAGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACAGGTCAAGGTCAAGGTTTTCATGCACCACCTGGCGGCCGAAGCGGTTGCAGATGCCGCGGGCTTCGAT > NC_002947/149501‑149798 | aGGCCACGTTTTCGGTCACCGTCAGCGAAGAGAACAGCGCCCCCTTCTGGAACAGCACGCCAAAGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGgc < 1:416967/150‑1 (MQ=255) ggCCACGTTTTCGGTCACCGTCAGCGAAGAGAACAGCGCCCCCTTCTGGAACAGCACGCCAAAGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGgcg > 2:1762787/1‑150 (MQ=255) ccACGTTTTCGGTCACCGTCAGCGAAGAGAACAGCGCCCCCTTCTGGAACAGCACGCCAAAGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCa > 2:5068984/1‑150 (MQ=255) ccACGTTTTCGGTCACCGTCAGCGAAGAGAACAGCGCCCCCTTCTGGAACAGCACGCCAAAGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCa < 1:4705757/150‑1 (MQ=255) cACGTTTTCGGTCACCGTCAGCGAAGAGAACAGCGCCCCCTTCTGGAACAGCACGCCAAAGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAg > 2:5479480/1‑150 (MQ=255) cACGTTTTCGGTCACCGTCAGCGAAGAGAACAGCGCCCCCTTCTGGAACAGCACGCCAAAGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAg < 1:50502/150‑1 (MQ=255) aCGTTTTCGGTCACCGTCAGCGAAGAGAACAGCGCCCCCTTCTGGAACAGCACGCCAAAGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGc < 1:2632383/150‑1 (MQ=255) gTTTTCGGTCACCGTCAGCGAAGAGAACAGCGCCCCCTTCTGGAACAGCACGCCAAAGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGccc > 1:1398022/1‑150 (MQ=255) tttCGGTCACCGTCAGCGAAGAGAACAGCGCCCCCTTCTGGAACAGCACGCCAAAGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCaa < 1:3215925/150‑1 (MQ=255) tttCGGTCACCGTCAGCGAAGAGAACAGCGCCCCCTTCTGGAACAGCACGCCAAAGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCaa > 1:3783934/1‑150 (MQ=255) ttCGGTCACCGTCAGCGAAGAGAACAGCGCCCCCTTCTGGAACAGCACGCCAAAGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAat < 1:3696172/150‑1 (MQ=255) ttCGGTCACCGTCAGCGAAGAGAACAGCGCCCCCTTCTGGAACAGCACGCCAAAGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAat < 2:2650767/150‑1 (MQ=255) tCGGTCACCGTCAGCGAAGAGAACAGCGCCCCCTTCTGGAACAGCACGCCAAAGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAatg < 2:5598101/150‑1 (MQ=255) cGGTCACCGTCAGCGAAGAGAACAGCGCCCCCTTCTGGAACAGCACGCCAAAGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAatga < 2:1413646/150‑1 (MQ=255) cGGTCACCGTCAGCGAAGAGAACAGCGCCCCCTTCTGGAACAGCACGCCAAAGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAatga < 1:6793949/150‑1 (MQ=255) cGGTCACCGTCAGCGAAGAGAACAGCGCCCCCTTCTGGAACAGCACGCCAAAGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAatga < 1:756502/150‑1 (MQ=255) ggTCACCGTCAGCGAAGAGAACAGCGCCCCCTTCTGGAACAGCACGCCAAAGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAatgat > 1:1008358/1‑150 (MQ=255) gTCACCGTCAGCGAAGAGAACAGCGCCCCCTTCTGGAACAGCACGCCAAAGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAatgatg > 2:4696307/1‑150 (MQ=255) tCACCGTCAGCGAAGAGAACAGCGCCCCCTTCTGGAACAGCACGCCAAAGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGAtgc > 1:6629850/1‑150 (MQ=255) tCACCGTCAGCGAAGAGAACAGCGCCCCCTTCTGGAACAGCACGCCAAAGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGGTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCTAATGAtgc > 2:2620841/1‑150 (MQ=255) cACCGTCAGCGAAGAGAACAGCGCCCCCTTCTGGAACAGCACGCCAAAGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCATCATTGGGCTGCGCCGGCCCAatgaaggg < 2:4583541/150‑5 (MQ=255) aGCGAAGAGAACAGCGCCCCCTTCTGGAACAGCACGCCAAAGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGa > 2:6592629/1‑150 (MQ=255) gCGAAGAGAACAGCGCCCCCTTCTGGAACAGCACGCCAAAGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGaa > 2:5211636/1‑150 (MQ=255) gCGAAGAGAACAGCGCCCCCTTCTGGAACAGCACGCCAAAGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGaa < 1:252504/150‑1 (MQ=255) gAAGAGAACAGCGCCCCCTTCTGGAACAGCACGCCAAAGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGc > 2:3804343/1‑150 (MQ=255) gAAGAGAACAGCGCCCCCTTCTGGAACAGCACGCCAAAGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGc > 2:4804552/1‑150 (MQ=255) gaACAGCGCCCCCTTCTGGAACAGCACGCCAAAGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGa < 2:4206102/150‑1 (MQ=255) gaACAGCGCCCCCTTCTGGAACAGCACGCCAAAGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCACAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGa < 1:1735283/150‑1 (MQ=255) aaCAGCGCCCCCTTCTGGAACAGCACGCCAAAGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGAt < 2:5891172/150‑1 (MQ=255) gcgcCCCCTTCTGGAACAGCACGCCAAAGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGc < 2:6165198/150‑1 (MQ=255) cccccTTCTGGAACAGCACGCCAAAGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGc > 1:918965/1‑150 (MQ=255) ccccTTCTGGAACTGCACGCCATAGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCTTTGGGCCGGCGCAGCCCAATGTTGCTGCGCAGAAGCACCGTTTTTCAGCt < 2:1508405/150‑1 (MQ=255) ccTTCTGGAACAGCACGCCAAAGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGc < 1:3059129/150‑1 (MQ=255) ttCTGGAACAGCACGCCAAAGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCt > 2:2285626/1‑150 (MQ=255) tGGAACAGCACGCCAAAGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGaa > 2:2774960/1‑150 (MQ=255) ggAACAGCACGCCAAAGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAAc > 1:4488666/1‑150 (MQ=255) ggAACAGCACGCCAAAGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAAc > 1:6339762/1‑150 (MQ=255) aCGCCAAAGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTAcc < 2:5986286/150‑1 (MQ=255) cGCCAAAGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCa < 1:5534170/150‑1 (MQ=255) gCCAAAGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCTGCGCCGGCCCAatgaa < 1:209258/105‑2 (MQ=255) gCCAAAGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCAc > 2:2979410/1‑150 (MQ=255) gCCAAAGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCAc > 1:5648226/1‑150 (MQ=255) gCCAAAGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCAc > 1:1505724/1‑150 (MQ=255) aaaGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGc < 1:495065/150‑1 (MQ=255) aGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGa < 1:5444593/150‑1 (MQ=255) aGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGa < 1:6017749/150‑1 (MQ=255) gccgcTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTa < 2:1535819/138‑1 (MQ=255) gccgcTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTa > 1:1535819/1‑138 (MQ=255) cTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTc < 2:724512/150‑1 (MQ=255) tCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTcg < 2:4273447/150‑1 (MQ=255) gACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTcgcc > 1:1128677/1‑150 (MQ=255) gACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTcgcc < 1:2863086/150‑1 (MQ=255) cAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTcgccgtg < 1:2285626/150‑3 (MQ=255) aaCGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACa > 1:4867128/1‑150 (MQ=255) aaCGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACa < 2:214396/150‑1 (MQ=255) gCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACcggt > 1:5076258/1‑150 (MQ=255) cTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACaggtc < 2:327356/150‑1 (MQ=255) ttcttcGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACaggtcaag < 2:2502516/150‑1 (MQ=255) cgtcGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACaggtcaaggt < 2:4232583/148‑1 (MQ=255) ttcGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACaggtcaaggtc > 2:3613860/1‑150 (MQ=255) cgcgCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACAggtcaaggtcaa < 1:3272495/150‑1 (MQ=255) cgcgCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACAggtcaaggtcaa < 1:5133551/150‑1 (MQ=255) gcgcAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACAGgtcaaggtcaag < 2:3966000/150‑1 (MQ=255) gcgcAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACAGgtcaaggtcaag < 2:4065031/150‑1 (MQ=255) aGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCCCGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACAGGTCAAGGTCAAGGttt < 1:5610257/150‑1 (MQ=255) aGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACAGGTCAAGGTCAAGGttt < 2:4335387/150‑1 (MQ=255) gCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACAGGTCAAGGTCAAGGTTTTc < 1:4027146/150‑1 (MQ=255) ccGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACAGGTCAAGGTCAAGGTTTTCa < 1:3485066/150‑1 (MQ=255) ccGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACAGGTCAAGGTCAAGGTTTTCa < 1:6512587/150‑1 (MQ=255) gTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACAGGTCAAGGTCAAGGTTTTCATGc < 2:2536848/150‑1 (MQ=255) cAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACAGGTCAAGGTCAAGGTTTTCATGcac < 1:3434710/150‑1 (MQ=255) gTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACAGGTCAAGGTCAAGGTTTTCATGcaccac > 2:3380427/1‑150 (MQ=255) gTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACAGGTCAAGGTCAAGGTTTTCATGcaccac > 2:861145/1‑150 (MQ=255) gTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACAGGTCAAGGTCAAGGTTTTCATGcaccac < 1:3674193/150‑1 (MQ=255) tCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACAGGTCAAGGTCAAGGTTTTCATGcaccaca > 2:5675292/1‑149 (MQ=255) ccTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACAGGTCAAGGTCAAGGTTTTCATGCACCACCt < 2:5395630/150‑1 (MQ=255) gCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACAGGTCAAGGTCAAGGTTTTCATGCACCACCTggcg < 2:1125942/150‑1 (MQ=255) ccTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACAGGTCAAGGTCAAGGTTTTCATGCACCACCTGGCGGCCGAAGc > 1:1866827/1‑150 (MQ=255) ccTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACAGGTCAAGGTCAAGGTTTTCATGCACCACCTGGCGGCCGAAGc < 2:1262872/150‑1 (MQ=255) gATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACAGGTCAAGGTCAAGGTTTTCATGCACCACCTGGCGGCCGAAGCGGtt < 1:4613826/150‑1 (MQ=255) aTCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACAGGTCAAGGTCAAGGTTTTCATGCACCACCTGGCGGCCGAAGCGGTTg < 2:2838784/150‑1 (MQ=255) tCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACAGGTCAAGGTCAAGGTTTTCATGCACCACCTGGCGGCCGAAGCGGTTGc > 2:3026823/1‑150 (MQ=255) cTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACAGGTCAAGGTCAAGGTTTTCATGCACCACCTGGCGGCCGAAGCGGTTGCa < 2:6747362/150‑1 (MQ=255) cTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACAGGTCAAGGTCAAGGTTTTCATGCACCACCTGGCGGCCGAAGCGGTTGCa < 2:4483775/150‑1 (MQ=255) tGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACAGGTCAAGGTCAAGGTTTTCATGCACCACCTGGCGGCCGAAGCGGTTGCAg > 1:575959/1‑150 (MQ=255) catCATTGGGCTGCGCCGGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACAGGTCAAGGTCAAGGTTTTCATGCACCACCTGGCGGCCGAAGCGGTTGCAGATGc > 1:1978626/3‑150 (MQ=255) tCATTGGGCTGCGCCGGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCgg < 2:1689987/90‑1 (MQ=38) tCATTGGGCTGCGCCGGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACAGGTCAAGGTCAAGGTTTTCATGCACCACCTGGCGGCCGAAGCGGTTGCAGATGCcg > 1:3048144/1‑150 (MQ=255) cATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACAGGTCAAGGTCAAGGTTTTCATGCACCACCTGGCGGCCGAAGCGGTTGCAGATGCcgc < 1:4331706/150‑1 (MQ=255) aTTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACAGGTCAAGGTCAAGGTTTTCATGCACCACCTGGCGGCCGAAGCGGTTGCAGATGCcgcg < 2:5831813/150‑1 (MQ=255) ttGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACAGGTCAAGGTCAAGGTTTTCATGCACCACCTGGCGGCCGAAGCGGTTGCAGATGCCGCgg < 2:1907966/150‑1 (MQ=255) ttGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACAGGTCAAGGTCAAGGTTTTCATGCACCACCTGGCGGCCGAAGCGGTTGCAGATGCCGCgg < 1:3511648/150‑1 (MQ=255) ggCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACAGGTCAAGGTCAAGGTTTTCATGCACCACCTGGCGGCCGAAGCGGTTGCAGATGCCGCGGGCt > 1:2692208/1‑150 (MQ=255) gCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACAGGTCAAGGTCAAGGTTTTCATGCACCACCTGGCGGCCGAAGCGGTTGCAGATGCCGCGGGCtt < 1:523558/150‑1 (MQ=255) gCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACAGGTCAAGGTCAAGGTTTTCATGCACCACCTGGCGGCCGAAGCGGTTGCAGATGCCGCGGGCtt > 2:6320137/1‑150 (MQ=255) gCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACAGGTCAAGGTCAAGGTTTTCATGCACCACCTGGCGGCCGAAGCGGTTGCAGATGCCGCGGGCtt < 1:6162101/150‑1 (MQ=255) gCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACAGGTCAAGGTCAAGGTTTTCATGCACCACCTGGCGGCCGAAGCGGTTGCAGATGCCGCGGGCtt < 2:2034388/150‑1 (MQ=255) ccGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACAGGTCAAGGTCAAGGTTTTCATGCACCACCTGGCGGCCGAAGCGGTTGCAGATGCCGCGGGCTTc > 1:5316696/1‑150 (MQ=255) ccGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACAGGTCAAGGTCAAGGTTTTCATGCACCACCTGGCGGCCGAAGCGGTTGCAGATGCCGCGGGCTTc < 2:4848571/150‑1 (MQ=255) ccGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACAGGTCAAGGTCAAGGTTTTCATGCACCACCTGGCGGCCGAAGCGGTTGCAGATGCCGCGGGCTTc < 2:918965/150‑1 (MQ=255) | AGGCCACGTTTTCGGTCACCGTCAGCGAAGAGAACAGCGCCCCCTTCTGGAACAGCACGCCAAAGCGCCGCTCGACCAGTGAACGCTGTTCTTCGCGCAGGCCGGTCAGGTCCTGGCCGAGCACCTTGATCTGCCCTTCATTGGGCCGGCGCAGCCCAATGATGCTGCGCAGAAGCACCGATTTGCCGCTGCCTGAACCGCCTACCACGGCGAGGATTTCGCCGCGGTACAGGTCAAGGTCAAGGTTTTCATGCACCACCTGGCGGCCGAAGCGGTTGCAGATGCCGCGGGCTTCGAT > NC_002947/149501‑149798 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |