Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,424,517 | A→G | 7.5% | intergenic (‑51/+86) | PP_1242 ← / ← PP_1244 | hypothetical protein/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,424,517 | 0 | A | G | 7.5% | 633.4 / 26.7 | 217 | intergenic (‑51/+86) | PP_1242/PP_1244 | hypothetical protein/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (89/104); new base G (10/6); total (104/113) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.98e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.38e-01 |
Only 100 of 220 total aligned reads displayed.
GCCGGGTTCGATGCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACC‑CTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCG > NC_002947/1424368‑1424664 | ccacagctcgatcgtgatgcaggccgtgatccatgaaatggaagcggtacaggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCa > 2:2296345‑M1/135‑150 (MQ=255) ccGGGTTCGATGCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCAc < 2:2828020/150‑1 (MQ=255) acagctcgatcgtgatgcaggccgtgatccatgaaatggaagcggtacaggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACg > 2:747054‑M1/133‑150 (MQ=255) gggTTCGATGCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGc < 2:5011058/150‑1 (MQ=255) ggTTCGATGCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGcc < 2:11837/150‑1 (MQ=255) tCGATGCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTGTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCGTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGGTGTCGGTGGGCATGGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGGTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGc < 2:6240315/150‑1 (MQ=255) cgatcgtgatgcaggccgtgatccatgaaatggaagcggtacaggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCt > 1:4455511‑M1/127‑150 (MQ=255) ggcatggcacgatgcatgaactggaggcgctgcggcctcttcttgagtcggcgctggttcaggtgcagatgtccgctgagcccaggaacttcgcactaaggctggttaacgtgccggaagggccGGCCTCTTCGCGGGCGAGCccgcgaa > 2:3801588‑M1/125‑147 (MQ=255) atcgtgatgcaggccgtgatccatgaaatggaagcggtacaggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTcc > 2:1791083‑M1/125‑150 (MQ=255) atcgtgatgcaggccgtgatccatgaaatggaagcggtacaggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCAAATAGCGGgcacgcccccgac < 1:2944931‑M1/26‑6 (MQ=255) aTGCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTcc < 1:3766779/150‑1 (MQ=255) gcatggcacgatgcatgaactggaggcgctgcggcctcttcttgagtcggcgctggttcaggtgcagatgtccgctgagcccaggaacttcgcactaaggctggttaacgtgccggaagggccGGCCTCTTCGCGGGCGAGcccgcgaag > 2:2793703‑M1/124‑146 (MQ=255) gCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGcgaaga < 2:6409042/150‑6 (MQ=255) gCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGcgaaga < 1:1432482/150‑6 (MQ=255) gCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCca < 1:2071578/150‑1 (MQ=255) gCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCca < 1:6832110/150‑1 (MQ=255) cgtgatgcaggccgtgatccatgaaatggaagcggtacaggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCGTgcccgcgaaga > 1:2846055‑M1/123‑145 (MQ=255) gtgatgcaggccgtgatccatgaaatggaagcggtacaggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCcac > 1:1005589‑M1/122‑150 (MQ=255) cGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGcgaagag < 2:1490050/150‑7 (MQ=255) cGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCcac < 1:3091006/150‑1 (MQ=255) tgatgcaggccgtgatccatgaaatggaagcggtacaggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCcaca > 2:4747505‑M1/121‑150 (MQ=255) gatgcaggccgtgatccatgaaatggaagcggtacaggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAg > 1:4357036‑M1/120‑150 (MQ=255) gAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAg < 1:5554312/150‑1 (MQ=255) atgcaggccgtgatccatgaaatggaagcggtacaggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAgg > 1:13707‑M1/119‑150 (MQ=255) aCAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAggg < 2:6862819/150‑2 (MQ=255) aGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAc < 1:6731811/150‑1 (MQ=255) gggTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACtgt < 2:307593/150‑1 (MQ=255) tGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCa < 2:791423/150‑1 (MQ=255) tGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCa < 1:6350760/150‑1 (MQ=255) tGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCa < 2:6300246/150‑1 (MQ=255) gAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGTGCAg > 1:1677946/1‑150 (MQ=255) tgttgtTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGc < 1:3116127/150‑1 (MQ=255) tgttgtTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGc < 1:6307662/150‑1 (MQ=255) ttgttTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCGCCCCCACGGACGTTGGAGTGCGt > 1:2043864/1‑150 (MQ=255) ttttCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGt < 1:3316797/147‑1 (MQ=255) ttCGCCTTTGTAGAAGCAGGTCTTGCCGTCTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCTTTGTTTTTTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGTCTGGCCTCTTCGCGTGCACGCCCGCTCACACAGGTACTGTGCAGTTCGTGACgg < 1:673765/150‑1 (MQ=255) ccTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCtgt < 2:2408184/150‑1 (MQ=255) ccTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCtgt < 2:4660521/150‑1 (MQ=255) cTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTa > 1:1595467/1‑127 (MQ=255) cTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTa < 2:1595467/127‑1 (MQ=255) cTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCtgtg < 1:4193838/150‑1 (MQ=255) cTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCACTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGcgggg > 2:3293788/1‑146 (MQ=255) ttGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTgtgg < 1:1946599/150‑1 (MQ=255) ttGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTgtgg < 2:1306702/150‑1 (MQ=255) ggTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCCGTGCGTGACGGCTgtggtg > 1:2722937/1‑150 (MQ=255) aaGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACC‑Ct < 1:2339670/150‑1 (MQ=255) ggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattcgcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACC‑Ctgt > 1:3648010‑M1/84‑150 (MQ=255) ggggctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACC‑Ctgt > 2:2596483‑M1/84‑150 (MQ=255) gCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACtgt > 2:4046067/1‑121 (MQ=255) gCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCCGTGCGTGACGGCTGTGGTGACC‑Ctgg > 1:6178122/1‑149 (MQ=255) gCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACC‑Ctgt < 1:104995/150‑1 (MQ=255) cAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACC‑Ctgtg < 1:5214774/150‑1 (MQ=255) aGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACC‑CTGTgg < 1:5029215/150‑1 (MQ=255) gTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACC‑CTGTGGGa < 1:1744414/150‑1 (MQ=255) ctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACC‑CTGTGGGa > 2:3397300‑M1/80‑150 (MQ=255) ctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACC‑CTGTGGGa > 1:1886574‑M1/80‑150 (MQ=255) ctggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACC‑CTGTGGGa > 2:6756343‑M1/80‑150 (MQ=255) tggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACC‑CTGTGGGAg > 1:3526864‑M1/79‑150 (MQ=255) gtcggcgctggttcaggtgcagatgtccgctgagcccaggaacttcgcactaaggctggttaacgtgccggaaggtccGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAAGTCTTGACTACTGTGGTGACCGCTGTGGGa > 1:2274785‑M1/79‑150 (MQ=255) gtcggcgctggttcaggtgcagatgtccgctgagcccaggaacttcgcactaaggctggttaacgtgccggaagggccGGCCTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAAGTCTTGACTACTGTGGTGACCGCTGTGGGa > 2:5091164‑M1/79‑150 (MQ=255) ggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACC‑CTGTGGGAGc > 1:3297154‑M1/78‑150 (MQ=255) ggtcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACC‑CTGTGGGAGc > 1:894562‑M1/78‑150 (MQ=255) cTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACC‑CTGTGGGAGc < 1:5920997/150‑1 (MQ=255) cTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACC‑CTGTGGGAGc < 1:3565782/150‑1 (MQ=255) tcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACC‑CTGTGGGAGCgg > 1:4803707‑M1/76‑150 (MQ=255) tcgagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACC‑CTGTGGGAGCgg > 2:4199888‑M1/76‑150 (MQ=255) tGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACC‑CTGTGGGAGCgg < 2:2494603/150‑1 (MQ=255) tGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACC‑CTGTGGGAGCgg < 1:5393985/150‑1 (MQ=255) gcgctggttcaggtgcagatgtccgctgagcccaggaacttcgcactaaggctggttaacgtgccggaagggccGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAAGTCTTGACTACTGTGGTGACCGCTGTGGGAGCgg > 1:1693049‑M1/75‑150 (MQ=255) gcgctggttcaggtgcagatgtccgctgagcccaggaacttcgcactaaggctggttaacgtgccggaagggccGGCCCTTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAAGTCTTGACTACTGTGGTGACCGCTGTGGGAGCgg > 2:4374326‑M1/75‑150 (MQ=255) gagtcggcgttgatgcagttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACC‑CTGTGGGAGCGGGc > 1:2600035‑M1/74‑150 (MQ=255) gACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACC‑CTGTGGGAGCGGGCGt < 2:5277532/150‑1 (MQ=255) cTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACC‑CTGTGGGAGCGGGCGTGc < 2:4910082/150‑1 (MQ=255) tgtgGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACC‑CTGTGGGAGCGGGCGTGcc > 2:3580692/1‑150 (MQ=255) tggtggGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACC‑CTGTGGGAGCGGGCGt > 1:6122260/1‑145 (MQ=255) aggtgcagatgtccgctgagcccaggaacttcgcactaaggctggttaacgtgccggaagggccGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAAGTCTTGACTACTGTGGTGACCGCTGTGGGAGCGGGCGAGCCcgc > 1:6451759‑M1/65‑150 (MQ=255) tggGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACGGTGCAGTGCGTGACGGCAGTGGTGACC‑CTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGa > 1:2212329/1‑150 (MQ=255) tggGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTTTTCAGTGCGTGACGGGGGTGGTGACC‑CTGTGGGAGCGGGCGTGCCcgcgc > 2:177619/1‑149 (MQ=39) gTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACC‑CTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAaga < 2:2676865/150‑1 (MQ=255) ttCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACC‑CTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAagag > 2:1076310/1‑150 (MQ=255) agttgcagatgcggtcgcatttacccacagagcctcacaccttgcattagcaggtcaGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACC‑CTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGc > 2:6106015‑M1/58‑150 (MQ=255) gtgttgtCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTGTGGGTGGCGTGGGGTGGCCTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACTGGTAGTGTGCTGTGCTTGACGGCTGTGGTGACC‑CTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGAc < 2:6150802/150‑1 (MQ=25) tgttgtCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACCCCCGCACCCACAGGTACGGTGCAGGGCGTGGCGGCGGTGGTGACC‑CAGTGGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCAGAcc > 1:1538979/1‑150 (MQ=255) ttgtCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCCCTCCCACAGGTACGGTGCAGTGCGTGACGGCGGTGGGGACC‑CTGTGGGAGCCGGCGTGCCCGCGCAGAGGCCAGACCTg > 2:3425832/1‑150 (MQ=255) tCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACCCCCCCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCGGTGGGGACC‑CGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGGAACTGCTa > 2:263151/1‑150 (MQ=38) gttttgtttCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACC‑CTGTGGGAGCgg < 1:4644520/109‑1 (MQ=255) ttttgtttCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACg > 2:3763683/1‑84 (MQ=255) ttttgtttCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACC‑CGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGa > 2:6294920/1‑150 (MQ=255) gtttCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCCGTGCGTGACGGCTGTGGTGACC‑CTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGct > 2:5417578/1‑150 (MQ=255) cccTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCGGCTCCCACAGGTACTGCGCTGTGCGTGACGGCTGTGGTGACC‑CTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCtgt < 2:4945637/150‑1 (MQ=255) ttCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCCCCGGGACTGTGCAGTGCGTGACCGCGGGGGTGCCC‑CGGGGGGAGCCGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCGCATGCCACGTGGGCGGCTCGGGGGGTcaa > 2:4360251/1‑150 (MQ=255) ttCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACC‑CGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTaaa > 2:2141001/1‑150 (MQ=255) tGGGTTGCCTGGGCTGGCCGCGTCGCGGGCACGCCCGCCCCCACTGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCGGTGGTCCCC‑CTTTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGc < 1:498148/150‑1 (MQ=38) ggTTGCCGGGGGGGGCCTCTTCGCGGGCAGGCCCGCCCCCAGGGGTACTGTGCAGGGGGTGCCGGCGGTGGGGACC‑GTGTGGGTGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGa < 1:3944325/150‑1 (MQ=255) ggCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACC‑CGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTg > 2:1046378/1‑150 (MQ=255) ggCTGGCCTCTTCGCGGGCACCCCCCCTACCAAACGTACAGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGAAC‑CAGTGGGAGCGGGCGTGCCCCCGAAGAGGCCGGACCAGCTAAAGCAAGGTGTGAGGCTCTGGGGGTAAATGAGACCGCATCTg > 2:5231966/1‑150 (MQ=255) tGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGTCGGCTGTGGTGACC‑CTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCaa > 2:3365485/1‑150 (MQ=255) GCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGGCC‑CTGTGGGCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCGGTCCTGCGAGTGCACGGTGTGAGGCTCGGGGGGTCCATGCGACCGCATCTGCCACt < 2:4509455‑M1/150‑1 (MQ=255) CTCTTCGCGGGCACCCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACC‑CGGGGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCGAATGCAAGGTGTGATGCTCTGTGGGTAAATTCGACCCCATcagcaaaggc < 2:589977‑M1/150‑5 (MQ=255) CGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACC‑CTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCAACAACg < 1:4900192‑M1/150‑1 (MQ=255) | GCCGGGTTCGATGCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCTGGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACC‑CTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTCTGTGGGTAAATGCGACCGCATCTGCAACTGCATCAACGCCG > NC_002947/1424368‑1424664 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |