| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,450,343 | G→C | 5.5% | G337G (GGG→GGC) ‡ | PP_1263 → | fusaric acid resistance protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,450,343 | 0 | G | C | 5.5% | 1248.4 / 43.2 | 366 | G337G (GGG→GGC) ‡ | PP_1263 | fusaric acid resistance protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (183/163); new base C (7/13); total (190/176) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.66e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 384 total aligned reads displayed.
AACCTGCCCGCCGAACTGGTCGGCCAGCGGCCTGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTCGGCGGGGTATGACGTGGCGGTGGCCCGCTACAACCA > NC_002947/1450194‑1450492 | aCCTGCCCGCCGAACTGGTCGGCCAGCGGCCTGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCgggg < 2:5478579/150‑1 (MQ=255) aCCTGCCCGCCGAACTGGTCGGCCAGCGGCCTGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCgggg > 1:2738985/1‑150 (MQ=255) taccccGCCGAACTGGTCGGCCAGCGGCCGGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGt > 2:3929515/4‑150 (MQ=255) cTGCCCGCCGAACTGGTCGGCCAGCGGCCTGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGt < 2:2134280/150‑1 (MQ=255) tGCCCGCCGAACTGGTCGGCCAGCGGCCTGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTg < 1:2262133/150‑1 (MQ=255) cccGCCGAACTGGTCGGCCAGCGGCCTGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGc > 1:2951274/1‑150 (MQ=255) cccGCCGAACTGGTCGGCCAGCGGCCTGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGc < 1:6376123/150‑1 (MQ=255) cccGCCGAACTGGTCGGCCAGCGGCCTGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCCCCGGTGGc < 1:3834077/150‑1 (MQ=255) cgccgAACTGGTCGGCCCGCGGCCTGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCGGGGCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCCCCGGGGGTGGccc > 1:3755869/1‑150 (MQ=255) cgccgAACTGGTCGGCCAGCGGCCTGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCCCCGGTGGcca < 1:4914150/150‑2 (MQ=255) gccgAACTGGTCGGCCAGCGGCCTGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCGGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGccat < 1:5387964/150‑3 (MQ=255) ccgAACTGGTCGGCCAGCGGCCTGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCGGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCCCCGGTGGccatg < 1:6477221/150‑4 (MQ=255) cgAACTGGTCGGCCAGCGGCCTGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCt > 2:5157598/1‑150 (MQ=255) gAACTGGTCGGCCAGCGGCCTGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCCTCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTg > 2:4125067/1‑150 (MQ=255) gAACTGGTCGGCCAGCGGCCTGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCCACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCCCCGGTGGccatgaa < 1:6318006/150‑6 (MQ=255) gAACTGGTCGGCCAGCGGCCTGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGccatgaa < 1:3152894/150‑6 (MQ=255) gAACTGGTCGGCCAGCGGCCTGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTg < 1:4463143/150‑1 (MQ=255) aaCTGGTCGGCCAGCGGCCTGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTgg > 2:2548401/1‑150 (MQ=255) cTGGTCGGCCAGCGGCCTGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGaa > 1:4675235/1‑150 (MQ=255) gTCGGCCAGCGGCCTGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTc > 2:6365152/1‑150 (MQ=255) tCGGCCAGCGGCCTGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTcc < 2:5371038/150‑1 (MQ=255) tCGGCCAGCGGCCTGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTcc > 1:5743959/1‑150 (MQ=255) ccAGCGGCCTGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGAc > 1:1992624/1‑150 (MQ=255) aGCGGCCTGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTg > 2:4682859/1‑137 (MQ=255) gCCTGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGgcg < 1:1001450/150‑1 (MQ=255) tGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCaa > 2:5843504/1‑150 (MQ=255) tGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCaa > 2:4875246/1‑150 (MQ=255) gATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAg < 2:1905708/150‑1 (MQ=255) ggTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCaa < 1:1244163/150‑1 (MQ=255) ggTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCACTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCaa < 2:6190873/150‑1 (MQ=255) cAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGTCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACaa > 2:6707979/1‑150 (MQ=255) cAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACaa > 2:651238/1‑150 (MQ=255) cAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCGGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACaa > 1:6575054/1‑150 (MQ=255) ccGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGt > 2:3075729/1‑150 (MQ=255) aGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTcggcccgg > 2:2850296/1‑150 (MQ=255) ggCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCAt > 1:5604822/1‑150 (MQ=255) gCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATc > 2:2922730/1‑150 (MQ=255) tGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAATGTCGGCCCGGCCATCAg > 2:6010621/1‑150 (MQ=255) tGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAg > 1:5006780/1‑150 (MQ=255) tGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAg > 2:4282290/1‑150 (MQ=255) tGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAg > 2:737720/1‑150 (MQ=255) ccAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCtt > 2:6264072/1‑150 (MQ=255) cAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTg > 2:3533178/1‑150 (MQ=255) 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ggCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCttt < 1:4880838/150‑1 (MQ=255) gCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTg > 2:3764078/1‑150 (MQ=255) aTCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGAc > 2:3284546/1‑150 (MQ=255) tCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACg > 1:6252945/1‑150 (MQ=255) aCGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTg > 2:3792535/1‑150 (MQ=255) aCGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTg > 2:804587/1‑150 (MQ=255) cGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTgg < 1:1718083/150‑1 (MQ=255) tCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCt > 2:4186360/1‑150 (MQ=255) tCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCt > 1:4759129/1‑150 (MQ=255) gCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTgcgc > 2:332316/1‑150 (MQ=255) ccGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCt > 2:3254260/1‑150 (MQ=255) ggCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCa < 1:6135434/150‑1 (MQ=255) cttcCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACt < 1:1917923/150‑1 (MQ=255) cttcCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACt < 2:4009808/150‑1 (MQ=255) tcCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTgg < 2:3704840/150‑1 (MQ=255) tcCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTgg > 1:2809924/1‑150 (MQ=255) tcCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTgg > 1:344449/1‑150 (MQ=255) ccccAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTggg > 2:2659798/1‑150 (MQ=255) cccAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGc > 2:3562894/1‑150 (MQ=255) cccAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGc > 1:6856432/1‑150 (MQ=255) cccAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGc > 1:5650830/1‑150 (MQ=255) cAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGt > 1:1069543/1‑150 (MQ=255) cAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGt < 1:2531917/150‑1 (MQ=255) aaCGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTg < 1:1859717/150‑1 (MQ=255) aaCGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTg < 1:2388627/150‑1 (MQ=255) aCGTCGACCTGGTCGGCAGGCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGATTTCCTGACCGGGCGCTAGTTCAACTACATCGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTgg < 2:4491381/150‑1 (MQ=255) cGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTc < 2:2386849/150‑1 (MQ=255) ccTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTcggc > 1:3599771/1‑150 (MQ=255) tGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTcggcgg > 1:1640479/1‑150 (MQ=255) ggTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTCGGCggg < 2:1960030/150‑1 (MQ=255) ggTCGGCAGCCAGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTCGGCggg < 1:6787907/150‑1 (MQ=255) gCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTCGGCGGGGTATGACg < 1:1813493/150‑1 (MQ=255) cTGGGCCTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTCGGCGGGGTATGACGTg < 2:281455/150‑1 (MQ=255) gggCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCGGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTCGGCGGGGTATGACGTGGc < 1:3912829/150‑1 (MQ=255) gCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTCGGCGGGGTATGACGTGGCgg < 1:5979523/150‑1 (MQ=255) cTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTCGGCGGGGTATGACGTGGCGGt > 1:3650368/1‑150 (MQ=255) ttCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTCGGCGGGGTATGACGTGGCGGTg > 1:4283603/1‑150 (MQ=255) ttCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTCGGCGGGGTATGACGTGGCGGTg > 1:30643/1‑150 (MQ=255) gcgggCCACCCCCGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTCGGCGGGGTATGACGTGGCGGTGGc > 1:629687/4‑150 (MQ=255) cATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTCGGCGGGGTATGACGTGGCGGTGGc > 1:4066909/1‑150 (MQ=255) tGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTCGGCGGGGTATGACGTGGCGGTGGccc < 2:1086150/150‑1 (MQ=255) tGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTCGGCGGGGTATGACGTGGCGGTGGccc < 1:5843504/150‑1 (MQ=255) ggCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTCGGCGGGGTATGACGTGGCGGTGGCCCg > 1:2126057/1‑150 (MQ=255) ggCCACCCCCGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTCGGCGGGGTATGACGTGGCGGTGGCCCg > 2:5778719/1‑150 (MQ=255) cACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTCGGCGGGGTATGACGTGGCGGTGGCCCGCTa > 1:873197/1‑150 (MQ=255) cACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTCGGCGGGGTATGACGTGGCGGTGGCCCGCTa > 2:1576369/1‑150 (MQ=255) aCCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTCGGCGGGGTATGACGTGGCg < 1:753175/138‑1 (MQ=255) aCCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTCGGCGGGGTATGACGTGGCGGTGGCCCGCTAc > 1:5489772/1‑150 (MQ=255) aCCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTCGGCGGGGTATGACGTGGCGGTGGCCCGCTAc < 2:1368241/150‑1 (MQ=255) aCCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTCGGCGGGGTATGACGTGGCGGTGGCCCGCTAc > 2:1847116/1‑150 (MQ=255) ccGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTCGGCGGGGTATGACGTGGCGGTGGCCCGCTACa < 2:5662570/150‑1 (MQ=255) | AACCTGCCCGCCGAACTGGTCGGCCAGCGGCCTGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTCGGCGGGGTATGACGTGGCGGTGGCCCGCTACAACCA > NC_002947/1450194‑1450492 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |