| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 1,567,160 | 0 | T | G | 5.4% | 985.5 / 30.7 | 286 | intergenic (‑79/‑90) | pctA/PP_1372 | methyl‑accepting chemotaxis protein PctA/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (133/137); new base G (4/12); total (137/149) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.28e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 290 total aligned reads displayed.
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(MQ=255) cATCCCGAAAAGTCCCTTTTC‑GGCTGTTCCTCTCTATTAAGGCGAATAACACCCACAGGTCTCGGCCGAATTAAGCTAAAGCTTGAGCAGAGGATTAAAGAGATGTCGGAATTTTCGACCATCGTTGTAGGCGCGGGCCCGGATGgccag > 1:6520993/1‑150 (MQ=255) cATCCCGAAAAGTCCCTTTTC‑GGCTGTTCCTCTCTATTAAGGCGAATAACACCCACAGGTATCGGCCGAATTAAGCTAAAGCTTGAGCAGAGGATTAAAGAGATGTCGGAATTTTCGACCATCGTTGTAGGCGCGGGCCCGGATGgccag > 1:3132325/1‑150 (MQ=255) cATCCCGAAAAGTCCCTTTTC‑GGCTGTTCCTCTCTATTAAGGCGAATAACACCCACAGGTATCGGCCGAATTAAGCTAAAGCTTGAGCAGAGGATTAAAGAGATGTCGGAATTTTCGACCATCGTTGTAGGCGCGGGCCCGGATGgccag < 1:3573005/150‑1 (MQ=255) aTCCCGAAAAGTCCCTTTTC‑GGCTGTTCCTCTCTATTAAGGCGAATAACACCCACAGGTATCGGCCGAATTAAGCTAAAGCTTGAGCAGAGGATTAAAGAGATGTCGGAATTTTCGACCATCGTTGt > 1:1510259/1‑127 (MQ=255) agccGAAAAGGGACTTTTC‑GGCTGTTCCTCTCTATTAAGGCGAATAACACCCACAGGTATCGGCCGAATTAAGCTAAAGCTTGAGCAGAGGATTAAAGAGATGTCGGAATTTTCGACCATc < 1:3726401/119‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |