| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 1,567,162 | 0 | C | A | 5.7% | 946.8 / 31.4 | 280 | intergenic (‑81/‑88) | pctA/PP_1372 | methyl‑accepting chemotaxis protein PctA/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (131/133); new base A (4/12); total (135/145) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.15e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 | |||||||||||
Only 100 of 287 total aligned reads displayed.
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GAAGGCGAGTATCACGATCAGTGATGCCGCCAAAAGAATCTTGTGGCTGAAACGAAGGCTTTTGTTCATGGCGTAATCGGTTCCGCTAAGGTTTTATATCAGGCGTTCGCACGAGTGGAGCCGTAGGTTGTGCAACATCCCGAAAAGTCCCTTTTCGGCTGTTCCTCTCTATTAAGGCGAATAACACCCACAGGTATCGGCCGAATTAAGCTAAAGCTTGAGCAGAGGATTAAAGAGATGTCGGAATTTTCGACCATCGTTGTAGGCGCGGGCCCGGATGGCCAGCCAGTCGGGCAAGC > NC_002947/1567013‑1567311 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |