| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,687,926 | A→G | 5.9% | Q485R (CAG→CGG) | recJ → | ssDNA‑specific exonuclease RecJ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,687,926 | 0 | A | G | 5.9% | 1030.6 / 31.7 | 322 | Q485R (CAG→CGG) | recJ | ssDNA‑specific exonuclease RecJ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (152/151); new base G (6/13); total (158/164) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.56e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.26e-01 | |||||||||||
Only 100 of 325 total aligned reads displayed.
GGCGTTTGCCGAGGCGTTCGACGAAGAGGTGCGGCGTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGCATTGCCTTCGGCATTGACCGCGAAGTGTGGC > NC_002947/1687777‑1688075 | cGTTTGCCGAGGCGTTCGACGAAGAGGTGCGGCGTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGc < 1:326205/150‑1 (MQ=255) cGTTTGCCGAGGCGTTCGACGAAGAGGTGCGGCGTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGc < 1:2089315/150‑1 (MQ=255) tttGCCGAGGCGTTCGACGAAGAGGTGCGGCGTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCCATGGGCCGGCat < 1:5490431/150‑2 (MQ=255) tttGCCGAGGCGTTCGACGAAGAGGTGCGGCGTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGCAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCAc > 2:3913974/1‑150 (MQ=255) tGCCGAGGCGTTCGACGAAGAGGTGCGGCGTCAACTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCTGGCCCCATGGGCCGGCatgg < 1:3871045/150‑4 (MQ=255) ccGAGGCGTTCGACGAAGAGGTGCGGCGTCAGTTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCTGGCCCCATGGGCCGGCa > 1:4456346/1‑145 (MQ=255) ccGAGGCGTTCGACGAAGAGGTGCGGCGTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTcc > 2:2038515/1‑150 (MQ=255) ccGAGGCGTTCGACGAAGAGGTGCGGCGTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTcc < 2:2666090/150‑1 (MQ=255) ccGAGGCGTTCGACGAAGAGGTGCGGCGTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTcc > 2:1633924/1‑150 (MQ=255) ccGAGGCGTTCGACGAAGAGGTGCGGCGTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTcc > 1:2289859/1‑150 (MQ=255) gAGGCGTTCGACGAAGAGGTGCGGCGTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCt > 1:5062302/1‑150 (MQ=255) ggCGTTCGACGAAGAGGTGCGGCGTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGa < 2:6299568/150‑1 (MQ=255) ttCGACGAAGAGGTGCGGCGTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCg > 2:1071085/1‑150 (MQ=255) tCGACGAAGAGGTGCGGCGTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGc < 1:3714992/150‑1 (MQ=255) cgacgaAGAGGTGCGGCGTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCt < 1:2679574/150‑1 (MQ=255) gacgaAGAGGTGCGGCGTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTg > 2:1554977/1‑150 (MQ=255) gaAGAGGTGCGGCGTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTc > 2:339952/1‑150 (MQ=255) aaGAGGTGCGGCGTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTcc < 2:6752268/150‑1 (MQ=255) gagGTGCGGCGTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCAt > 2:5199265/1‑150 (MQ=255) gagGTGCGGCGTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCAt < 1:793460/150‑1 (MQ=255) ggTGCGGCGTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATgg < 1:18093/150‑1 (MQ=255) tGCGGCGTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCg > 2:801544/1‑150 (MQ=255) cggcgTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCgtg < 1:6352395/150‑1 (MQ=255) ggcgTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGACAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCgtgt > 1:3740722/1‑150 (MQ=255) tCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGGTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGGTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCa < 1:3582598/150‑1 (MQ=255) aGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGt > 1:6869494/1‑150 (MQ=255) cTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTtg < 2:3206509/150‑1 (MQ=255) tGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTtgg < 2:6146943/150‑1 (MQ=255) gcgcGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTtggt < 2:1705618/150‑1 (MQ=255) cgcgAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTtggtg < 1:5933210/150‑1 (MQ=255) gcgAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTtggtgg > 1:4072358/1‑150 (MQ=255) gaagaaGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGag > 2:6121128/1‑150 (MQ=255) gaagaaGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGag > 1:6424747/1‑150 (MQ=255) gaagaaGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGag < 2:2292741/150‑1 (MQ=255) aagaagACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGagc > 2:5734814/1‑150 (MQ=255) cTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGtgtg > 1:1568945/1‑150 (MQ=255) cTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGtgtg < 2:3055774/150‑1 (MQ=255) gACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGt > 2:5114161/1‑150 (MQ=255) gACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGt > 1:4619823/1‑150 (MQ=255) gACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGt > 2:4818423/1‑150 (MQ=255) tGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTgg > 2:2780829/1‑150 (MQ=255) tGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTgg > 1:2468206/1‑150 (MQ=255) tGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTgg > 2:134334/1‑150 (MQ=255) ggCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGc < 1:4142741/150‑1 (MQ=255) ggCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGc > 1:6575316/1‑150 (MQ=255) gccgccTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCg > 1:1645627/1‑150 (MQ=255) ccgccTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTGGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGa > 2:5602312/1‑150 (MQ=255) cgccTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGaa < 2:3508580/150‑1 (MQ=255) cTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACgg < 2:3310534/150‑1 (MQ=255) cTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACCTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACgg > 1:4244844/1‑150 (MQ=255) cTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACATGGCCAATGCCCTGCGCCATGCCGGCCAATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCAATGGCGTGTTACAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACgg > 1:257382/1‑150 (MQ=255) cTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTATACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGACGCTGTTCCATGGAGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGAGTGTGGTTGGCGAACgg > 2:271229/1‑150 (MQ=255) tgtCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCAcc > 1:1057905/1‑150 (MQ=255) tCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCAGGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCGGCGGGTGGTTGGCGAACGGCACCTg > 1:2278750/1‑150 (MQ=255) cGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGaa > 2:3138597/1‑150 (MQ=255) gACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGaaa < 2:3877470/150‑1 (MQ=255) gACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGaaa > 1:2712091/1‑150 (MQ=255) gACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGaaa > 1:1096957/1‑150 (MQ=255) 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tGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGGTGGTGGAGCAGCGGGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCa > 2:4152831/1‑150 (MQ=255) ggCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCaa > 1:4707898/1‑150 (MQ=255) cGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAaga < 1:6015531/150‑1 (MQ=255) gTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGc < 2:5971375/150‑1 (MQ=255) gTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGc < 1:4009142/150‑1 (MQ=255) 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cAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATgg > 1:4799305/1‑150 (MQ=255) aaGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGc > 2:343910/1‑150 (MQ=255) aaGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGc < 1:5199265/150‑1 (MQ=255) ggCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGCAt < 1:3154533/150‑1 (MQ=255) gCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGCAtt > 2:923082/1‑150 (MQ=255) ccTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGCATTGc > 1:4852544/1‑150 (MQ=255) cTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTGGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGCATTGcc > 1:2884999/1‑150 (MQ=255) cgcCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGCATTGCCTTc < 2:467803/150‑1 (MQ=255) gcCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGCATTGCCTTCg > 2:2263010/1‑150 (MQ=255) ccATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGCATTGCCTTCgg < 1:986214/150‑1 (MQ=255) tGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGCATTGCCTTCGGCAt > 1:1029014/1‑150 (MQ=255) tGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGCATTGCCTTCGGCAt > 1:4514462/1‑150 (MQ=255) ctggccccAT‑GGGCCGGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGCATTGCCTTCGGCATTg > 2:4465560/6‑150 (MQ=255) ccGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGCATTGCCTTCGGCATTg < 2:450792/150‑1 (MQ=255) tGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGCATTGCCTTCGGCATTGACCGCGaa > 1:6237219/1‑150 (MQ=255) gggCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGCATTGCCTTCGGCATTGACCGCGAAgt < 2:4898484/150‑1 (MQ=255) gCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGCATTGCCTTCGGCATTGACCGCGAAgtgt < 1:1710706/150‑1 (MQ=255) gCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGCATTGCCTTCGGCATTGACCGCGAAgtgt > 2:5383851/1‑150 (MQ=255) ccAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGCATTGCCTTCGGCATTGACCGCGAAGtgtg < 1:5945419/150‑1 (MQ=255) ccAGCACGTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGCATTGCCTTCGGCATTGACCGCGAAGtgtg < 1:4639723/150‑1 (MQ=255) cAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGCATTGCCTTCGGCATTGACCGCGAAGTGTgg > 2:5452924/1‑150 (MQ=255) aGCACTACCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGACTGTGACTCGGTGCGGCTGGATGGCATTGCCTTCGGCATTGACCGCGAAGTGTGGc > 1:5657966/1‑150 (MQ=255) | GGCGTTTGCCGAGGCGTTCGACGAAGAGGTGCGGCGTCAGCTGCGCGAAGAAGACCTGACTGGCCGCCTGTTGTCCGACGGCAGCCTGGCGGTAGAGGAGTTCCACCTCGACCTGGCCAAGGCCCTGCGCCATGCCGGCCCATGGGGCCAGCACTTCCCTGAGCCGCTGTTCCATGGCGTGTTCCAGTTGGTGGAGCAGCGTGTGGTTGGCGAACGGCACCTGAAAGTGGTGCTCAAGAGCGAATGTGGCTCGGTGCGGCTGGATGGCATTGCCTTCGGCATTGACCGCGAAGTGTGGC > NC_002947/1687777‑1688075 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |