Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,875,136 | G→T | 5.2% | G112V (GGC→GTC) | cobD → | Subunit of adenosylcobinamide‑phosphate synthase beta component |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,875,136 | 0 | G | T | 5.2% | 1262.6 / 36.7 | 371 | G112V (GGC→GTC) | cobD | Subunit of adenosylcobinamide‑phosphate synthase beta component |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (189/162); new base T (5/15); total (194/177) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.92e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 390 total aligned reads displayed.
GGCGGTGGTGCCGCTGACCCTGGTGGCGCTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCCGCGTTGTTCTGGTTTGTGG > NC_002947/1874987‑1875285 | ggCGGTGGTGCCGCTGACCCTGGTGGCGCTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAggg > 2:526877/1‑150 (MQ=255) gCGGTGGTGCCGCTGACCCTGGTGGCGCTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGc < 1:3841279/150‑1 (MQ=255) gCGGTGGTGCCGCTGACCCTGGTGGCGCTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGc < 2:5405075/150‑1 (MQ=255) cGCTGACCCTGGTGGCGCTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCgg > 2:3447699/1‑150 (MQ=255) gCTGACCCTGGTGGCGCTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGa < 2:6760847/150‑1 (MQ=255) gCTGACCCTGGTGGCGCTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGa < 1:2303168/150‑1 (MQ=255) gCTGACCCTGGTGGCGCTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGa < 1:5861996/150‑1 (MQ=255) gCTGACCCTGGTGGCGCTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGa < 1:2742882/150‑1 (MQ=255) cTGACCCTGGTGGCGCTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTCCGCCAGGTCGCCCTGGCgcaa < 2:113937/150‑4 (MQ=255) tGACCCTGGTGGCGCTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTCCGCCAGGTCGCCCTGGCgcaag < 2:6068778/150‑5 (MQ=255) ccTGGTGGCGCTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAggcgcg > 2:5702003/1‑150 (MQ=255) gcgcTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCgg < 1:2027409/150‑1 (MQ=255) gcTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGt > 2:4886683/1‑150 (MQ=255) cgggTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACGGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGtt < 1:4942435/148‑1 (MQ=255) cgggTCCGTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTGTACGGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGCGCCGGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCggggt < 2:2292318/148‑3 (MQ=255) cTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGATGCGCAGCCTGGGCGATCATGTGCTGCCGGTGGCCATTGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCAGCGCCGGttt < 1:6359726/150‑1 (MQ=255) tGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTg > 2:3531246/1‑150 (MQ=255) ggTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTgg < 1:2952509/150‑1 (MQ=255) ggTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTgg < 2:6664894/150‑1 (MQ=255) gTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGc < 2:4209725/150‑1 (MQ=255) gTCCTTTCGTGCCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTCATGAGCTGGCGCTATACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGTCTTGCGCCAGGGAGACCAGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGc > 2:325179/1‑150 (MQ=255) tCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCt > 1:6059770/1‑150 (MQ=255) cTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTAc > 2:315156/1‑150 (MQ=255) tttCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTAcc > 2:4302863/1‑150 (MQ=255) tttCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCC‑TCCGCCAGGTCGCCCTGGCgcaa > 2:3343705/1‑124 (MQ=255) gTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGt < 2:3650313/150‑1 (MQ=255) tGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGcc > 1:5298396/1‑150 (MQ=255) tGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGcc > 1:6271593/1‑150 (MQ=255) tGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGACGGTGGCCAATGCCGTGCGGCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGcc < 2:4482062/150‑1 (MQ=255) ccGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCcgc < 1:3022209/150‑1 (MQ=255) tataTCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGaa > 2:290977/1‑150 (MQ=255) tataTCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCAGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGaa > 1:1130288/1‑150 (MQ=255) atCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGtt > 1:6240951/1‑126 (MQ=255) atCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGtt < 2:6241050/126‑1 (MQ=255) atCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAAcg > 2:1020763/1‑150 (MQ=255) atCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAAcg > 1:947070/1‑150 (MQ=255) tCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAAcgc < 2:2515274/150‑1 (MQ=255) tCGGCTGGCTGGGTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAAcgc > 1:5185031/1‑150 (MQ=255) cGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAAcgcg < 1:3579136/150‑1 (MQ=255) ggctggctGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAAcgcgc < 2:1190042/150‑1 (MQ=255) ggctggctGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAAcgcgc > 1:3100981/1‑150 (MQ=255) ggctggctGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAAcgcgc > 1:6668584/1‑150 (MQ=255) gctggctgGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAAcgcgcg > 1:1784666/1‑150 (MQ=255) gctggTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCt < 1:2401026/150‑1 (MQ=255) gTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGAc < 2:3213074/150‑1 (MQ=255) gTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGAc > 2:147725/1‑150 (MQ=255) gTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGAc > 1:6842062/1‑150 (MQ=255) tGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGa < 1:1200045/150‑1 (MQ=255) ttgtgCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGc < 1:1000000/149‑1 (MQ=255) tGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGGGCTCGTCCAGCTcgcgc < 1:4997513/150‑2 (MQ=255) tGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCgg > 2:4053624/1‑150 (MQ=255) tGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCgg > 1:5526802/1‑150 (MQ=255) gcgcTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTg < 2:880506/150‑1 (MQ=255) cgcTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTgg < 1:6479715/150‑1 (MQ=255) cgcTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTgg < 2:6486740/150‑1 (MQ=255) cgcTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTgg < 2:1818099/150‑1 (MQ=255) cTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGcc < 2:5902733/150‑1 (MQ=255) tttACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGccc > 1:2564981/1‑150 (MQ=255) tttACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGccc > 2:2374269/1‑150 (MQ=255) ttACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCg < 2:2877622/150‑1 (MQ=255) caagaccGGGGTGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAgc < 1:6444604/145‑1 (MQ=255) cgcCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAgcggc < 1:4668841/150‑1 (MQ=255) gTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGAcc < 2:6540922/150‑1 (MQ=255) tGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCgg < 1:5916927/150‑1 (MQ=255) gcAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGc < 2:1314681/150‑1 (MQ=255) gcAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGc < 1:4090282/150‑1 (MQ=255) aGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTg < 1:578741/150‑1 (MQ=255) gCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTgg < 1:4423327/150‑1 (MQ=255) ccTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGga > 1:2435529/1‑150 (MQ=255) ccTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGga > 1:6288229/1‑150 (MQ=255) gggCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGaa < 1:1921502/150‑1 (MQ=255) ggCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAAc > 1:4559686/1‑150 (MQ=255) ggCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAAc < 1:4772312/150‑1 (MQ=255) gAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGc > 1:1452449/1‑150 (MQ=255) aGCATGTGCTGCCGGTGGCCACTGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCa < 1:5602528/150‑1 (MQ=255) tgctgcCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACg > 2:6190134/1‑150 (MQ=255) tgctgcCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACg > 2:1639304/1‑150 (MQ=255) tgcCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAg > 2:5780598/1‑150 (MQ=255) ccGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCTCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAgtg > 2:4690901/1‑150 (MQ=255) cGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAgtgt > 2:720000/1‑150 (MQ=255) ggggCCAATGGCTGGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTc < 1:325179/148‑1 (MQ=255) gTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTc > 1:2190462/1‑150 (MQ=255) gTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCGGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTc > 1:4218645/1‑150 (MQ=255) ggCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTcgc > 2:2796092/1‑150 (MQ=255) gCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTcgcc < 2:1947504/150‑1 (MQ=255) cAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTcgccgc > 2:3808175/1‑150 (MQ=255) cAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTcgccgc < 1:2797122/150‑1 (MQ=255) aaTGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTc > 1:4295265/1‑144 (MQ=255) aaTGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCcgcg > 2:3019335/1‑150 (MQ=255) gCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCCGCgttg > 2:1366887/1‑150 (MQ=255) ccTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCCGCgttgt > 1:3447868/1‑150 (MQ=255) cTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCCGCgttgtt > 2:2116295/1‑150 (MQ=255) gcCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCCGCGTTGTTCTGGt > 1:731648/1‑150 (MQ=255) ccAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCCGCGTTGTTCTGGtt > 1:3334758/1‑150 (MQ=255) ggCGACCTGGCGGAGGCTCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGGGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCCGCGTTGTTCTGGTTtgtg < 1:1703042/150‑1 (MQ=255) ggCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCCGCGTTGTTCTGGTTtgtg > 2:498258/1‑150 (MQ=255) ggCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCCGCGTTGTTCTGGTTtgtg < 1:1316110/150‑1 (MQ=255) ggCGACCGGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCCGCGTTGTTCTGGTTtgtg < 1:2861415/150‑1 (MQ=255) ggCGACCGGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCCGCGTTGTTCTGGTTtgtg < 1:5702003/150‑1 (MQ=255) gCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCCGCGTTGTTCTGGTTTgtgg < 2:2547058/150‑1 (MQ=255) | GGCGGTGGTGCCGCTGACCCTGGTGGCGCTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCCGCGTTGTTCTGGTTTGTGG > NC_002947/1874987‑1875285 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |