Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,875,139 | A→C | 5.5% | D113A (GAC→GCC) | cobD → | Subunit of adenosylcobinamide‑phosphate synthase beta component |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,875,139 | 0 | A | C | 5.5% | 1286.2 / 39.6 | 379 | D113A (GAC→GCC) | cobD | Subunit of adenosylcobinamide‑phosphate synthase beta component |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (187/170); new base C (5/17); total (192/187) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.87e-03 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 381 total aligned reads displayed.
GTGGTGCCGCTGACCCTGGTGGCGCTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCCGCGTTGTTCTGGTTTGTGGTGG > NC_002947/1874991‑1875288 | gtggtgCCGCTGACCCTGGTGGCGCTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGAc < 1:3468965/150‑1 (MQ=255) ccGCTGACCCTGGTGGCGCTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCCGGGCGACCTGGCg > 1:2996286/1‑150 (MQ=255) gCTGACCCTGGTGGCGCTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGa < 2:6760847/150‑1 (MQ=255) gCTGACCCTGGTGGCGCTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGAGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGa < 1:6048862/150‑1 (MQ=255) cTGACCCTGGTGGCGCTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGTCGCCCTGGCgcaa < 1:3399267/150‑4 (MQ=255) cTGACCCTGGTGGCGCTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGTCGCCCTGGCgcaa < 2:571852/150‑4 (MQ=255) cTGACCCTGGTGGCGCTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGTCGCCCTGGCgcaa < 1:2119907/150‑4 (MQ=255) cTGACCCTGGTGGCGCTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTCCGCCAGGTCGCCCTGGCgcaa < 2:1149744/150‑4 (MQ=255) tGACCCTGGTGGCGCTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAgg < 2:3433653/150‑1 (MQ=255) gACCCTGGTGGCGCTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGAc > 2:3016692/1‑139 (MQ=255) cTGGTGGCGCTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAggcgcgg < 1:4648704/150‑1 (MQ=255) tggtggCGCTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAggcgcggc > 1:2823017/1‑150 (MQ=255) cTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCAGCGCCGGGtt < 1:2899973/150‑1 (MQ=255) tGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTg > 2:3530986/1‑150 (MQ=255) ggTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTgg > 2:216048/1‑150 (MQ=255) ggTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTgg < 2:6664894/150‑1 (MQ=255) gTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGc < 2:1015649/150‑1 (MQ=255) gTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGc < 1:2559567/150‑1 (MQ=255) gTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGc > 1:5893795/1‑150 (MQ=255) gTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGc > 2:121529/1‑150 (MQ=255) gTCCTTTCGTGCCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTCATGAGCTGGCGCTATACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGTCTTGCGCCAGGGAGACCAGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGc > 2:325179/1‑150 (MQ=255) cTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTAc > 2:315156/1‑150 (MQ=255) tttCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTAcc > 1:4326757/1‑150 (MQ=255) tCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTg > 1:4963092/1‑150 (MQ=255) cGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTgg > 1:1915733/1‑150 (MQ=255) tGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGcc > 1:6271800/1‑150 (MQ=255) tGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGcc > 1:2298496/1‑150 (MQ=255) tGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGACGGTGGCCAATGCCGTGCGGCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGcc < 2:4482062/150‑1 (MQ=255) ccGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCcgc > 1:5268752/1‑150 (MQ=255) ccGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCcgc > 1:6368197/1‑150 (MQ=255) tataTCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGaa > 2:290959/1‑150 (MQ=255) tataTCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCAGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGaa > 1:1130288/1‑150 (MQ=255) atatCGGCTGGCTGGGTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGaaa > 1:512823/1‑150 (MQ=255) atCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGtt < 2:6241050/126‑1 (MQ=255) atCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGtt > 1:6241018/1‑126 (MQ=255) tCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAAcgc < 2:2515274/150‑1 (MQ=255) ggctggctGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAAcgcgc < 1:5547369/150‑1 (MQ=255) ggctggctGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAAcgcgc > 1:6668584/1‑150 (MQ=255) ggctggctGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAAcgcgc > 2:5667096/1‑150 (MQ=255) gctggTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCt > 2:3328941/1‑150 (MQ=255) gTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGAc > 2:147725/1‑150 (MQ=255) gTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGAc < 2:3213074/150‑1 (MQ=255) gTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGAc > 1:6842062/1‑150 (MQ=255) gTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGAc < 1:176604/150‑1 (MQ=255) tGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGa < 1:1200045/150‑1 (MQ=255) ttgtgCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGc < 1:1000000/149‑1 (MQ=255) cTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCcgcg > 2:19576/1‑150 (MQ=255) tGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCgg > 1:3035788/1‑150 (MQ=255) tGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCgg > 1:2781875/1‑150 (MQ=255) tGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCgg > 1:2634096/1‑150 (MQ=255) tGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCgg > 2:4864213/1‑150 (MQ=255) gcgcTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTg < 2:880506/150‑1 (MQ=255) cgcTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTgg < 2:1319853/150‑1 (MQ=255) cgcTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTgg < 1:6479715/150‑1 (MQ=255) cgcTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTgg < 2:1818099/150‑1 (MQ=255) cgcTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTgg < 2:6486740/150‑1 (MQ=255) gcTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGc < 1:863953/150‑1 (MQ=255) ccagaCTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGcc > 1:470254/5‑150 (MQ=255) tttACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGccc > 1:2376867/1‑150 (MQ=255) tttACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGccc > 2:2374269/1‑150 (MQ=255) ttACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCg < 2:2877622/150‑1 (MQ=255) caagaccGGGGTGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAgc < 1:6444917/145‑1 (MQ=255) tGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAgcg > 1:4073553/1‑150 (MQ=255) gcgcCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAgcgg > 2:1384561/1‑150 (MQ=255) gTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGAcc < 2:6540922/150‑1 (MQ=255) ggggCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGa < 1:5357624/150‑1 (MQ=255) ggCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGt < 2:5365152/150‑1 (MQ=255) ggCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGt < 2:3831131/150‑1 (MQ=255) gcgcAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGt < 2:5890286/150‑1 (MQ=255) gcAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGc < 2:5945481/150‑1 (MQ=255) aGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTg < 2:3638379/150‑1 (MQ=255) aGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTg < 1:578902/150‑1 (MQ=255) gCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTgg < 1:6130512/150‑1 (MQ=255) gCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTgg < 1:3696423/150‑1 (MQ=255) gAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGc > 2:5063745/1‑150 (MQ=255) gAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGc > 1:1452449/1‑150 (MQ=255) aGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCa < 1:5602580/150‑1 (MQ=255) cATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGc > 2:1081839/1‑150 (MQ=255) tgctgcCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACg > 2:6190134/1‑150 (MQ=255) tgctgcCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACg > 2:1639304/1‑150 (MQ=255) cggcCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCa < 1:6326578/148‑1 (MQ=255) ccGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCTCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAgtg > 2:4690762/1‑150 (MQ=255) cGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAgtgt > 2:720000/1‑150 (MQ=255) gTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCGGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTc > 1:4218645/1‑150 (MQ=255) 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cTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCCGCgttgtt > 2:3801375/1‑150 (MQ=255) ttGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGACCGGCAGCGACGCAGTGTTCGCCGCGTTGTTc > 2:4896095/1‑150 (MQ=255) ttGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCCGCGTTGTTc > 2:4132651/1‑150 (MQ=255) cgcCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCCGCGTTGTTCTgg > 1:1981662/1‑150 (MQ=255) ccAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCCGCGTTGTTCTGGtt > 1:3319934/1‑150 (MQ=255) cAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCCGCGTTGTTCTGGttt < 1:4265739/150‑1 (MQ=255) cAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCCGCGTTGTTCTGGttt > 1:4824527/1‑150 (MQ=255) ggCGACCTGGCGGAGGCTCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGGGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCCGCGTTGTTCTGGTTtgtg < 1:1703042/150‑1 (MQ=255) ggCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCCGCGTTGTTCTGGTTtgtg < 1:5702251/150‑1 (MQ=255) ggCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCCGCGTTGTTCTGGTTtgtg < 1:1316110/150‑1 (MQ=255) gCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCCGCGTTGTTCTGGTTTgtgg < 2:2547058/150‑1 (MQ=255) | GTGGTGCCGCTGACCCTGGTGGCGCTGGTCCTTTCGTGGCTGCCGTATATCGGCTGGCTGGTTGATGTGCTGGCGCTTTACTGCGCCGTGGGGCTGCGCAGCCTGGGCGAGCATGTGCTGCCGGTGGCCAATGCCTTGCGCCAGGGCGACCTGGCGGAGGCGCGGCGCCGGGTTGGCTACCTGGTCAGCCGCGAAACGCGCGAGCTGGACGAGCCCGCGGTGGCCCGAGCGGCGACCGAGTCGGTGCTGGAGAACGGCAGCGACGCAGTGTTCGCCGCGTTGTTCTGGTTTGTGGTGG > NC_002947/1874991‑1875288 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |