| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,238,084 | G→T | 6.8% | intergenic (+52/+179) | PP_1971 → / ← PP_t63 | hypothetical protein/tRNA‑Asn |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,238,084 | 0 | G | T | 6.8% | 850.0 / 37.7 | 277 | intergenic (+52/+179) | PP_1971/PP_t63 | hypothetical protein/tRNA‑Asn |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (110/138); new base T (17/2); total (137/140) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.57e-04 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.65e-01 | |||||||||||
Only 100 of 286 total aligned reads displayed.
AACTGGTGGAGCTGGCGGTGCCGCATGTGATCGACGGGGAGGAATGGCTTGGGGTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCGCCCGCCGTTCACCGTTGCTGGCCAATAATTCCAGCGCAACGAAAAAGCCCCCGGTTG > NC_002947/2237935‑2238233 | aaCTGGTGGAGCTGGCGGTGCCGCATGTGATCGACGGGGAGGAATGGCTTGGGGTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCg > 1:4175249/1‑150 (MQ=255)aaCTGGTGGAGCTGGCGGTGCCGCATGTGATCGACGGGGAGGAATGGCTTGGGGTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCg > 2:4409621/1‑150 (MQ=255) aCTGGTGGAGCTGGCGGTGCCGCATGTGATCGACGGGGAGGAATGGCTTGGGGTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACACCgg > 1:1966268/1‑150 (MQ=255) cTGGTGGAGCTGGCGGTGCCGCATGTGATCGACGGGGAGGAATGGCTTGGGGTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGa < 1:1472891/150‑1 (MQ=255) cTGGTGGAGCTGGCGGTGCCGCATGTGATCGACGGGGAGGAATGGCTTGGGGTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGa < 2:5830130/150‑1 (MQ=255) tggtggAGCTGGCGGTGCCGCATGTGATCGACGGGGAGGAATGGCTTGGGGTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGAt > 2:3759261/1‑150 (MQ=255) tggAGCTGGCGGTGCCGCATGTGATCGACGGGGAGGAATGGCTTGGGGTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCgg > 1:6261273/1‑150 (MQ=255) tggAGCTGGCGGTGCCGCATGTGATCGACGGGGAGGAATGGCTTGGGGTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCgg > 1:2798079/1‑150 (MQ=255) ggAGCTGGCGGTGCCGCATGTGATCGACGGGGAGGAATGGCTTGGGGTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTGGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCggt < 2:4510039/150‑1 (MQ=255) gAGCTGGCGGTGCCGCATGTGATCGACGGGGAGGAATGGCTTGGGGTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCggtg > 2:806168/1‑150 (MQ=255) aGCTGGCGGTGCCGCATGTGATCGACGGGGAGGAATGGCTTGGGGTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCggtgg < 1:387551/150‑1 (MQ=255) gCTGGCGGTGCCGCATGTGATCGACGGGGAGGAATGGCTTGGGGTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCggtggt < 2:3937539/150‑1 (MQ=255) cTGGCGGTGCCGCATGTGATCGACGGGGAGGAATGGCTTGGGGTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGgtggtg < 1:3512161/150‑1 (MQ=255) cTGGCGGTGCCGCATGTGATCGACGGGGAGGAATGGCTTGGGGTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGgtggtg < 1:1060702/150‑1 (MQ=255) cTGGCGGTGCCGCATGTGATCGACGGGGAGGAATGGCTTGGGGTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGgtggtg < 1:1235352/150‑1 (MQ=255) ggCGGTGCCGCATGTGATCGACGGGGAGGAATGGCTTGGGGTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGa < 1:6869396/150‑1 (MQ=255) gCATGTGATCGACGGGGAGGAATGGCTTGGGGTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCg > 1:3286800/1‑150 (MQ=255) aTGTGATCGACGGGGAGGAATGGCTTGGGGTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCggt < 1:2284024/150‑1 (MQ=255) aTGTGATCGACGGGGAGGAATGGCTTGGGGTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCggt < 1:5890977/150‑1 (MQ=255) tgtgATCGACGGGGAGGAATGGCTTGGGGTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCggtg < 2:692949/150‑1 (MQ=255) tgtgATCGACGGGGAGGAATGGCTTGGGGTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCggtg > 2:88774/1‑150 (MQ=255) tgtgATCGACGGGGAGGAATGGCTTGGGGTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCggtg < 2:903385/150‑1 (MQ=255) tgATCGACGGGGAGGAATGGCTTGGGGTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCggtggt > 2:5416136/1‑150 (MQ=255) gATCGACGGGGAGGAATGGCTTGGGGTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGtt < 2:4904556/150‑1 (MQ=255) gATCGACGGGGAGGAATGGCTTGGGGTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGtt > 2:5971100/1‑150 (MQ=255) aTCGACGGGGAGGAATGGCTTGGGGTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCT‑‑ACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGaa < 1:5374143/150‑1 (MQ=255) tCGACGGGGAGGAATGGCTTGGGGTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGa < 2:2066947/150‑1 (MQ=255) cGACGGGGAGGAATGGCTTGGGGTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGaa < 1:840008/150‑1 (MQ=255) gACGGGGAGGAATGGCTTGGGGTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAac > 2:1511186/1‑150 (MQ=255) gACGGGGAGGAATGGCTTGGGGTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACACCGGATCGGGGGTGGACACACATCGGTGGTTGAac > 1:3304682/1‑150 (MQ=255) aCGGGGAGGAATGGCTTGGGGTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAaca > 2:3419442/1‑150 (MQ=255) gaggaATGGCTTGGGGTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGc < 1:2514100/150‑1 (MQ=255) aggaATGGCTTGGGGTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGcc < 1:641641/150‑1 (MQ=255) gaATGGCTTGGGGTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCcgt > 2:4255938/1‑150 (MQ=255) gaATGGCTTGGGGTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCcgg > 2:5634447/1‑149 (MQ=255) aaTGGCTTGGGGTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCcgtc < 1:1532264/150‑1 (MQ=255) ttGGGGTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGa < 2:2679169/150‑1 (MQ=255) ttGGGGTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGa > 2:1284902/1‑150 (MQ=255) ttGGGGTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGa < 2:4014126/150‑1 (MQ=255) ttGGGGTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTG‑ACACAGGCCGTCGTAGGAg > 2:1618663/1‑150 (MQ=255) ttGGGGTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCGACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGa > 1:4900516/1‑150 (MQ=255) gggTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGGTGAACACAGGCCGTCGTAGGAGCg > 2:1244355/1‑150 (MQ=255) ggTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGAGCgg < 1:1733279/150‑1 (MQ=255) ggTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGAGCgg < 1:5277202/150‑1 (MQ=255) ggTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGAGCgg < 2:605002/150‑1 (MQ=255) ccaaccgcgaagccttccatgatctggtcaatgcgctggagcggagctgatctatagcctgtgccggccTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATTGGGGGTGGACACACATTGGTGTTTGGGCGCAGGCCGTCGTAGGAGCgg > 2:652309‑M1/70‑150 (MQ=255) gtgtGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGAGCggg < 2:6100793/150‑1 (MQ=255) gtgtGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCAACACCCGATCGGTGGTGGGCACACATCGGTGGGTGTACACAGGCCGTCGTAGGGGCggg > 1:2274139/1‑150 (MQ=38) tgtgGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGGTTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGAGCGGGt > 1:5470366/1‑150 (MQ=255) ccgcgaagccttccatgatctggtcaatgcgctggagcggagctgatctacagcctgtgccggccTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCTGATTGGGGGTGGACACACATTGGTGTTTGGGCGCAGGCCGTCGTAGGAGCGGGttt > 1:380540‑M1/66‑150 (MQ=255) ggAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTTa > 2:2964781/1‑150 (MQ=255) gAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTTAc < 2:5166037/150‑1 (MQ=255) aGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTTAcc < 1:5745621/150‑1 (MQ=255) gCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTTAccc > 2:4708876/1‑150 (MQ=255) ccGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCcg < 1:4588559/150‑1 (MQ=255) ggggggCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGGCGTAGGAGCGGGTTTACCcgcg > 2:1788245/1‑150 (MQ=255) gggggCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTAAACCcgctc < 2:3513191/150‑3 (MQ=255) gggCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGTTGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACCCATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaaa < 1:4510728/150‑1 (MQ=255) ggCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAg < 2:5537013/150‑1 (MQ=255) ggCGTTTGACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGGGGGCGATGCCGGCTTCTACGCGGGTAACCCCGCTCCTCCCCCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAAg < 2:1001900/150‑1 (MQ=25) ttttACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACCACGGTGGGTGAACACACGCCGTCGGAGGCGCGGGTTTAACCGCGAAAcggcc > 1:3461865/1‑150 (MQ=37) ttttACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAgggcc > 2:367328/1‑150 (MQ=255) ttccccGTTGGGGCGCAGTGATTGCGGCCTGGGTGGGCGCGGCCGGCTGCGTCGCGGGTAACCCCGCGCCTACCCCGGAGCGGTGGTGGACCCCCCGCGGGGGTTGACCACCGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAAgggccgg < 2:5453307/147‑1 (MQ=255) tACCCTTTTGGGCGCTGTGTTTGAGGCCTCTGTGGGCGAGGCGGGCTTCTGCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGTTTTAACACCGGCGGTCGTAGGAGCGGTTTTACCCGCGAAAgggccggg < 2:2003598/150‑1 (MQ=21) cccGATTGGGCGCTGTTATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGTTAAACCCGCTCCTACCCCGGCTCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACCGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAgggccagcag < 1:2831844/150‑6 (MQ=25) cccGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAgggccgggcc > 2:3864754/1‑150 (MQ=255) cccGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAgggccgggcc > 2:3704365/1‑150 (MQ=255) ccGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCct > 2:326259/1‑150 (MQ=255) ccGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCAACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCct > 2:3047289/1‑150 (MQ=255) gcAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACAACGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCaaa > 1:469067/1‑149 (MQ=255) tGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACACGCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTcc > 2:2440569/1‑150 (MQ=255) gAGGCCTGTGTTGGCGTGGCCGGCTTCTTCGCGGGAAAACCCGCTCCTACCCCGGTGGGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACCCAGGCGGTCTTTGGCGGGGTTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTccgcccg < 1:2071264/150‑1 (MQ=25) gCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGtt > 1:895105/1‑79 (MQ=255) ctctGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCGCCCGCCGtt > 2:2151193/1‑150 (MQ=255) ctctGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCGCCCGCCGtt > 2:6268746/1‑150 (MQ=255) ctctGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGGAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCGCCCGCCGtt > 2:5377716/1‑150 (MQ=255) ctctGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAAACCCCAACGACACCCGATCCGTGGTGGACACACATAGGTGGGTGAACACAGGCCGTCGGAGGTGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCCGGCCTGCTGGCCAAACACCGCCCCCCCtt > 1:263936/1‑150 (MQ=25) tctGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGAACGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCCAAATCCGCCCGCCCTTc > 1:5533668/1‑150 (MQ=25) tctGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCTACACCGGATCGGTGGTGGAAACACATCGGTTGTTTTAAAAAGGCCCGGGGAGGAGCGGGGTTAACCGCGAAAGGGCCGGGCCGGCTGGCCAAACTACGCCCGCCGtta > 1:4020707/1‑149 (MQ=255) gCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTCCACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCGCCCGCCGTTCACCGTTg < 2:4639398/150‑1 (MQ=255) gcggcgggCTTCTGCGCGGGTACCCCCGCACCACCCCCGGCTGGGTGGTGGACACACAGCGGGGGTTGAACACCGGCCGTCGTCGGCGCGGGTTCCCCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCGCCCGCCGTTCACCGTTGCt < 1:3759252/144‑1 (MQ=18) tGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACCCATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCGCCCGCCGTTCACCGTTGCTgg < 2:4495024/150‑1 (MQ=255) gCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCGCCCGCCGTTCACCGTTGCTGGc < 2:2544348/150‑1 (MQ=255) gCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGCGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCGCCCGCCGTTCACCGTTGCTGGc < 2:2785321/150‑1 (MQ=255) cgTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCGCCCGCCGTTCACCGTTGCTGGCCAATAAtt > 2:1750770‑M1/3‑150 (MQ=255) CTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCGCCCGCCGTTCACCGTTGCTGGCCAATAAtt > 2:5991430‑M1/1‑150 (MQ=255) TCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCCCGTATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCGCCCGCCGTTCACCGTTGCTGGCCAATAATTcc > 2:1414466‑M1/1‑150 (MQ=255) cgggggTAAACCCGCTCCTACCCCGGATCGGTGGTGGAAACACATCGGTGGTTGACCACAGGCGGTCGTCGGAGCGGTTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCGCCCGCCGTTCACCGTTGCTGGCCAATAATTCCa < 2:633388/147‑1 (MQ=25) GGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCGCCCGCCGTTCACCGTTGCTGGCCAATAATTCCAgcg < 1:3066672‑M1/150‑1 (MQ=255) GGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCGCCCGCCGTTCACCGTTGCTGGCCAATAATTCCAgcg > 2:1954603‑M1/1‑150 (MQ=255) AAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCGCCCGCCGTTCACCGTTGCTGGCCAATAATTCCAGCGCAAc > 2:6130867‑M1/1‑150 (MQ=255) CCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCGCCCGCCGTTCACCGTTGCTGGCCAATAATTCCAGCGCAACGaa < 1:3560219‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCGCCCGCCGTTCACCGTTGCTGGCCAATAATTCCAGCGCAACGaaa < 1:6086702‑M1/150‑1 (MQ=255) GCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCGCCCGCCGTTCACCGTTGCTGGCCAATAATTCCAGCGCAACGaaaaa < 1:5024752‑M1/150‑1 (MQ=255) ctccacCGTATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTGGTTGGTGGGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCGCCCGCCGTTCACCGTTGCTGGCCAATAATTCCAGCGCAACGAAAAAGccc < 1:5984743/147‑1 (MQ=25) cacccccGGATCGGTGGTGGACACACATGGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCGCCCGCCGTTCACCGTTGCTGGCCAATAATTCCAGCGCAACGAAAAAGccc < 2:111849/145‑1 (MQ=255) CTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCGCCCGCCGTTCACCGTTGCTGGCCAATAATTCCAGCGCAACGAAAAAGccc > 2:6707337‑M1/1‑150 (MQ=255) TACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCGCCCGCCGTTCACCGTTGCTGGCCAATAATTCCAGCGCAACGAAAAAGcccc > 1:6283990‑M1/1‑150 (MQ=255) acCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCGCCCGCCGTTCACCGTTGCTGGCCAATAATTCCAGCGCAACGAAAAAGCCCCCgg > 1:3668946/1‑150 (MQ=255) cGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCGCCCGCCGTTCACCGTTGCTGGCCAATAATTCCAGCGCAACGAAAAAGCCCCCGGtt > 2:2202919/1‑150 (MQ=255) | AACTGGTGGAGCTGGCGGTGCCGCATGTGATCGACGGGGAGGAATGGCTTGGGGTGTGGAGCCGGGGGGCGTTTTACCCGATTGGGCGCAGTGATTGAGGCCTCTGTTGGCGATGCCGGCTTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATCGGTGGTGGACACACATCGGTGGTTGAACACAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCGCCCGCCGTTCACCGTTGCTGGCCAATAATTCCAGCGCAACGAAAAAGCCCCCGGTTG > NC_002947/2237935‑2238233 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |