Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,286,995 | G→T | 5.6% | L275L (CTG→CTT) | PP_2009 → | 1‑aminocyclopropane‑1‑carboxylate deaminase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,286,995 | 0 | G | T | 5.6% | 889.2 / 21.3 | 278 | L275L (CTG→CTT) | PP_2009 | 1‑aminocyclopropane‑1‑carboxylate deaminase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (133/126); new base T (2/17); total (135/143) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.33e-04 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 280 total aligned reads displayed.
ACGACGCCTGCCGTGGCGGTTTCGGAAAATTCGACGATGAGCTACTGACCTTCATCGCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTGCACATAGTGATGGTATAGCCCGGCCAGTGCATGCAAGCCGATCAGCCA > NC_002947/2286847‑2287144 | acgacgCCTGCCGTGGCGGTTTCGGAAAATTCGACGATGAGCTACTGACCTTCATCGCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGt > 2:1115873/1‑150 (MQ=255) acgacgCCTGCCGTGGCGGTTTCGGAAAATTCGACGATGAGCTACTGACCTTCATCGCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGt < 1:656250/150‑1 (MQ=255) cgacgCCTGCCGTGGCGGTTTCGGAAAATTCGACGATGAGCTACTGACCTTCATCGCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATCCCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGtt < 1:2878447/150‑1 (MQ=255) gCCTGCCGTGGCGGTTTCGGAAAATTCGACGATGAGCTACTGACCTTCATCGCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAg < 1:1610822/150‑1 (MQ=255) cTGCAGTGGCGGTTTCGGAAAATTCGACGATGAGCTACTGACCTTCATCGCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCaa > 2:5839433/1‑147 (MQ=255) gTGGCGGTTTCGGAAAATTCGACGATGAGCTACTGACCTTCATCGCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCa < 1:1072435/150‑1 (MQ=255) gTGGCGGTTTCGGAAAATTCGACGATGAGCTACTGACCTTCATCGCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCa < 1:1939183/150‑1 (MQ=255) gTGGCGGTTTCGGAAAATTCGACGATGAGCTACTGACCTTCATCGCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCa > 1:3893877/1‑150 (MQ=255) tGGCGGTTTCGGAAAATTCGACGATGAGCTACTGACCTTCATCGCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAg > 1:5223970/1‑150 (MQ=255) ggTTTCGGAAAATTCGACGATGAGCTACTGACCTTCATCGCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGCGGCTGCCGGGCTTGAACAGCCCGGCAgcaac < 2:6383481/150‑4 (MQ=38) tttCGTAAAATTCGACTATGAGCTACTGACCTTCATCGCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCt < 2:1397540/150‑1 (MQ=255) tttCGGAAAATTCGACGATGAGCTACTGACCTTCATCGCCGACTGCGAGCGGCGCACGGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTTGAACAGCCCGGCAgcaacct < 2:5204338/150‑6 (MQ=255) gAAAATTCGACGATGAGCTACTTACCTTCATCGCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGACCACTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGGGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGAAGCCGCCTGAtat > 1:2749378/1‑148 (MQ=255) aaaTTCGACGATGAGCTACTGACCTTCATCGCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTc < 2:1573898/150‑1 (MQ=255) ttCGACGATGAGCTACTGACCTTCATCGCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTa < 2:6267580/150‑1 (MQ=255) gacgaTGAGCTACTGACCTTCATCGCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTacac > 2:274912/1‑150 (MQ=255) ttGAGCTACTGACCTTCATCGCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATCCCGGCAAGGCTCTGTTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACgg < 2:1503154/149‑1 (MQ=255) aTGAGCTACGGACCGTCATCGCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTCGACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACgg < 2:6797228/150‑1 (MQ=255) aGCTACTGACCTTCATCGCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTg < 2:5059574/150‑1 (MQ=255) aCCTTCATCGCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAg > 2:5656484/1‑150 (MQ=255) cTTCATCGCCGACTGCGAGCGGCGCCCGGGCGTGCCGCTCGAAGCCCCCCATCCCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCCGGTGGCTGCCGGGCTGTCCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAggg < 1:5518478/150‑1 (MQ=255) cTTCATCGCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAggg > 2:1198290/1‑150 (MQ=255) ttCATCGCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAgggg > 2:6717886/1‑150 (MQ=255) tCGCCGACGGCGCGCGGCGCAGGGGCGTGCCGCCCTACGCCCTCTATCCCGGCACGGCTCTGGGGGCCTTGCTTGATCTGGTTGGGGCGGGGCTTTACACGCCGGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGAc < 1:4578623/150‑1 (MQ=255) gCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGAcgc > 2:4463559/1‑150 (MQ=255) ccGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGAcgcg < 2:2094514/150‑1 (MQ=255) cGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCgg > 1:5359168/1‑150 (MQ=255) gACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGt < 2:3773063/150‑1 (MQ=255) tGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTAc > 1:495718/1‑150 (MQ=255) gCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACt < 2:6667571/150‑1 (MQ=255) cGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACtt < 2:3544042/150‑1 (MQ=255) gggggcgCACGGCCGTGCCGCTCTACGCCCTCTATCCGGGCATGGCTCTGGGGGCGTGGCGTGTTCTGTTGGGGGCGGGGCTTTTCACGCCGGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGt < 1:2352646/147‑1 (MQ=255) aGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGt > 2:2454238/1‑150 (MQ=255) gcggcgCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTTGAACAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTa > 2:5367387/1‑150 (MQ=255) gcggcgCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTa < 2:3354816/150‑1 (MQ=255) gggcgCAGGGGGGTGCCGCTCTACGCCCTCTATCCGGGCACGGCTCTGCGGGCCTTGCGTTATCGGGTTGCTGCGGGGCTTTAAACGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTaa < 1:6360280/149‑1 (MQ=255) ggcgCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAg > 1:5618204/1‑150 (MQ=255) cACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGgcag > 1:2256935/1‑150 (MQ=255) aCTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACGGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGgcagc < 1:6206530/150‑1 (MQ=255) cTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGgcagca > 2:3093880/1‑150 (MQ=255) cTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGgcagca > 2:1082577/1‑150 (MQ=255) cTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGgcagca > 2:6740197/1‑150 (MQ=255) cTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCATGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGgcagca < 2:3975105/150‑1 (MQ=255) tGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCAt > 2:4123048/1‑150 (MQ=255) tGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCAt > 2:2583127/1‑150 (MQ=255) gCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATgc > 1:1195140/1‑150 (MQ=255) gCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGAAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATgc < 2:2957332/150‑1 (MQ=255) ggcccGCTCCACGCCCTCTACCCGGCCATGGCTGTGGGGGCCTTGCTTTATCTGTTGGGGGCGGGGCTGTACAACCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATgcgc < 1:314011/147‑1 (MQ=255) gCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCaa < 2:4729509/150‑1 (MQ=255) gCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAg > 1:79315/1‑150 (MQ=255) cTCGAAGCCCTCTATCCCGGAATGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCGGCGGGGTTGTTCACGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGc < 1:3020407/150‑1 (MQ=255) ctacgCCATCTATCCGGCCAAGGCTCTGCTGGCGTGGCGTTATCTGGTTGGTGCGGGGTTGTTCACGCCGGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCgt < 1:1958774/146‑1 (MQ=255) gAAGCCCTCTATCCCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCACGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCgtg < 2:4254490/150‑1 (MQ=255) aGCCCTCTATCCCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGtgtt < 2:4646414/150‑1 (MQ=255) aGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCATTGCGTGATAAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCGCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGtgtt < 2:1668895/150‑1 (MQ=255) gCCCTCTATACCGGCATGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGtgttg < 2:384918/150‑1 (MQ=255) ccTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTc < 2:969045/150‑1 (MQ=255) ctctATCCCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTcg < 1:6845645/150‑1 (MQ=255) tataCCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCACCAGCGTGTTGTCgcgc > 2:2202413/1‑150 (MQ=255) ataCCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCACGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCt < 2:5451704/150‑1 (MQ=255) taCCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTg < 2:5518860/150‑1 (MQ=255) aCCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGGGTTGTCGCGCTGc > 1:3581842/1‑150 (MQ=255) gCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTGCACAt > 1:2632107/1‑150 (MQ=255) aaGGCTCTGCTGGCCTCGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTGCACATAg > 1:5120123/1‑150 (MQ=255) ggCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTGCACATAGTg < 1:4328512/150‑1 (MQ=255) gCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTGCACATAGTGa > 2:5238663/1‑150 (MQ=255) ctctGGTGGCCTTGCGTGATCTGGTTGCTGCGGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTGCACATAGTGAt < 1:6053682/150‑1 (MQ=255) ctctGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTGCACATAGTGAt > 2:4085190/1‑150 (MQ=255) tctGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTGCACATAGTGATg > 1:1430151/1‑150 (MQ=255) tgctgGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTGCACATAGTGATGGt > 2:3671808/1‑150 (MQ=255) gctgGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTGCACATAGTGATGGta < 1:1537973/150‑1 (MQ=255) ctgGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTAAAGCCCGGCAGACGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCAAGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTGCACATAGTGATGGtat > 1:5875704/1‑150 (MQ=255) cTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGTAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTGCACATAGTGATGGTATAGccc > 2:1950128/1‑150 (MQ=255) ttGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTGCACATAGTGATGGTATAGCCCg > 1:272298/1‑150 (MQ=255) ttGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTGCACATAGTGATGGTATAGCCCg > 2:653580/1‑150 (MQ=255) ttGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTGCACATAGTGATGGTATAGCCCg > 2:5994922/1‑150 (MQ=255) ttGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTGCACATAGTGATGGTATAGCCCg < 2:4402209/150‑1 (MQ=255) gCGTGATCTGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTGCACATAGTGATGGTATAGCCCGGc < 1:4459935/150‑1 (MQ=255) gCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTGCACATAGTGATGGTATAGCCCGGc > 2:4068665/1‑150 (MQ=255) gCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACGTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTGCACATAGTGATGGTATAGCCCGGc > 2:4562289/1‑150 (MQ=255) aTCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATCCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTGCACATAGTGATGGTATAGCCCGGCCAGtg > 1:1875400/1‑150 (MQ=255) tCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTcg < 1:2227649/115‑1 (MQ=255) ctggTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTGCACATAGTGATGGTATAGCCCGGCCAGtgca < 1:415377/148‑1 (MQ=255) cAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTGCACATAGTGATGGTATAGCCCGGCCAGtgca < 2:6709542/150‑1 (MQ=255) cAGGTTGCGGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTGCACATAGTGATGGTATAGCCCGGCCAGtgca < 1:5956649/150‑1 (MQ=255) ggTTGCTGCGGGGCTGTACAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTGCACATAGTGATGGTATAGCCCGGCCAGtgcatg < 1:3770983/150‑1 (MQ=255) tgctgcCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTGCACATAGTGATGGTATAGCCCGGCCAGTGCATGCaa < 1:1028358/150‑1 (MQ=255) ctgcCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTGCACATAGTGATGGTATAGCCCGGCCAGTGCATGCAAGc < 2:788688/150‑1 (MQ=255) cggcCGGGCTGTTCAAGCCGGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTGCACATAGTGATGGTATAGCCCGGCCAGTGCATGCAAGc < 1:4010804/148‑1 (MQ=255) tgcCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTGCACATAGTGATGGTCTAGCCCGGCCCGTGCATGCAAGcc > 2:2024895/1‑150 (MQ=255) tgcCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTGCACATAGTGATGGTATAGCCCGGCCAGTGCATGCAAGcc > 1:6738120/1‑150 (MQ=255) tgcCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTGCACATAGTGATGGTATAGCCCGGCCAGTGCATGCAAGcc > 1:1690680/1‑150 (MQ=255) tgcCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTAAACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTGCACATAGTGATGGTATAGCCCGGCCAGTGCAGGCAAGcc > 1:3447324/1‑150 (MQ=255) gggCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTGCACATAGTGATGGTATAGCCCGGCCAGTGCATGCAAGCCGATc > 2:5314255/1‑150 (MQ=255) gCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTGCACATAGTGATGGTATAGCCCGGCCAGTGCATGCAAGGCGATCAg > 1:4736429/1‑150 (MQ=255) gCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTGCACATAGTGATGGTATAGCCCGGCCAGTGCATGCAAGGCGATCAg > 1:969862/1‑150 (MQ=255) cTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTGCACATAGTGATGGTATAGCCCGGCCAGTGCATGCAAGCCGATCAGc > 2:2231453/1‑150 (MQ=255) cTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTGCACATAGTGATGGTATAGCCCGGCCAGTGCATGCAAGCCGATCAGc < 2:6464582/150‑1 (MQ=255) cTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGAAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTGCACATAGTGATGGTATAGCCCGGCCAGTGCATGCAAGCCGATCAGc > 2:3632931/1‑150 (MQ=255) cTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGAAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTGCACATAGTGATGGTATAGCCCGGCCAGTGCATGCAAGCCGATCAGc > 2:1787193/1‑150 (MQ=255) | ACGACGCCTGCCGTGGCGGTTTCGGAAAATTCGACGATGAGCTACTGACCTTCATCGCCGACTGCGAGCGGCGCACTGGCGTGCCGCTCGAAGCCCTCTATACCGGCAAGGCTCTGCTGGCCTTGCGTGATCAGGTTGCTGCCGGGCTGTTCAAGCCCGGCAGCCGCCTGATCTTCGTACACACGGGTGGCCTGCAGGGGCGACGCGGTTACTTGTAAGGCAGCATGCGCAACAGCGTGTTGTCGCGCTGCACATAGTGATGGTATAGCCCGGCCAGTGCATGCAAGCCGATCAGCCA > NC_002947/2286847‑2287144 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |