Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,310,204 | G→A | 5.8% | L449L (CTG→TTG) | PP_2028 ← | TPR repeat‑containing protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,310,204 | 0 | G | A | 5.8% | 975.4 / 30.2 | 308 | L449L (CTG→TTG) | PP_2028 | TPR repeat‑containing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (166/124); new base A (10/8); total (176/132) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 341 total aligned reads displayed.
TTCGGGGCTGGCCTGTTGGTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGGCTGCTGCAGTGTCGCCTT > NC_002947/2310055‑2310353 | ttCGGGGCTGGCCTGTTGGTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGcagcag > 2:4108344/1‑150 (MQ=255) gggCTGGCCTGTTGGTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGGTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTtgc < 2:48077/150‑1 (MQ=255) ggCTGGCCTGTTGGTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTtgct > 1:828617/1‑150 (MQ=255) cTGGCCTGTTGGTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTtgctgc < 2:2681094/150‑1 (MQ=255) ccTGTTGGTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCAccg > 2:2554642/1‑149 (MQ=255) ccTGTTGGTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCa < 2:3098699/150‑1 (MQ=255) tGTTGGTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCCGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGGTGCAGCAACTGCTGCAACaac < 1:4588588/150‑3 (MQ=255) ggTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCt < 1:1880152/150‑1 (MQ=255) gtcgtcGCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTg < 1:2372918/150‑1 (MQ=255) gtcgtcGCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGGTGCAGCAACTGCTGCAACAacgtgaa < 1:638300/150‑5 (MQ=255) cgtcgCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGt < 2:1671034/150‑1 (MQ=255) gtcgCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGtt < 2:1872113/150‑1 (MQ=255) cGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCa < 2:6166440/150‑1 (MQ=255) gtgtGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTGGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAgcg < 2:6839063/150‑1 (MQ=255) gCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTc > 1:6725130/1‑141 (MQ=255) gCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTc < 2:6725130/141‑1 (MQ=255) ccTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGcc < 2:4529080/150‑1 (MQ=255) cTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCt > 2:586106/1‑150 (MQ=255) ttGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTg > 1:2245380/1‑150 (MQ=255) tGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGc > 2:5477850/1‑150 (MQ=255) ggCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAg < 1:1648657/150‑1 (MQ=255) cGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTc > 2:4084510/1‑150 (MQ=255) ggCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGGTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCgg < 1:4811448/150‑1 (MQ=255) gctgctGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCTCCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCggg < 1:3393000/150‑1 (MQ=255) gctgctGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCggg < 1:3436270/150‑1 (MQ=255) ctgctgGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGc < 2:1471838/150‑1 (MQ=255) cGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTc > 2:3244263/1‑150 (MQ=255) cGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTc > 2:1194939/1‑150 (MQ=255) ctgctgTTTCCTTCGGTGTCGCGGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGGTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAgg < 2:6545350/150‑1 (MQ=255) tgctgTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCt < 1:425973/138‑1 (MQ=255) tgTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCtt > 1:445960/1‑150 (MQ=255) gCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTc > 2:3554528/1‑150 (MQ=255) ttCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGTGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTa > 1:1037379/1‑150 (MQ=255) ttCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGTCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTa < 2:6712343/150‑1 (MQ=255) ttCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTa < 1:3031804/150‑1 (MQ=255) ttCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTa > 1:2885188/1‑150 (MQ=255) ttCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTa > 2:4858638/1‑150 (MQ=255) ttCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTa < 1:944292/150‑1 (MQ=255) ttCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTa > 1:1088625/1‑150 (MQ=255) cGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAgg > 1:4282611/1‑150 (MQ=255) tttCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAggg < 2:3196936/135‑1 (MQ=255) ttCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATc > 2:57588/1‑150 (MQ=255) ttCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATc > 1:3578056/1‑150 (MQ=255) gCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGTCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAg > 1:667859/1‑150 (MQ=255) tGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTTTTCATCGGCCATGTCAACACGTTGTTGCAGCAGTAGCTGCAACACCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCTggg > 1:3110280/1‑150 (MQ=255) gCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGggc < 1:4998257/150‑1 (MQ=255) gggCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGggcggc < 1:5661832/150‑1 (MQ=255) gCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCtt > 2:2760680/1‑150 (MQ=255) tCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGc > 1:2924430/1‑150 (MQ=255) tCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGc > 1:1389277/1‑150 (MQ=255) ttGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTc > 1:6114186/1‑150 (MQ=255) gggCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGc > 1:3849878/1‑150 (MQ=255) aTCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACt > 1:1469343/1‑150 (MQ=255) cTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCAATGccc < 1:1755414/150‑3 (MQ=255) tGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCggg > 2:6357672/1‑150 (MQ=255) tGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCggg < 2:5309120/150‑1 (MQ=255) gggCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAg > 1:556833/1‑150 (MQ=255) gggCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAg < 2:3849878/150‑1 (MQ=255) gttgttCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCAt > 2:4199652/1‑150 (MQ=255) gttgttCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCAt > 1:11397/1‑150 (MQ=255) ttgttCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCAtt > 1:1964741/1‑150 (MQ=255) gttCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGc > 1:1426480/1‑150 (MQ=255) ttCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGcc > 2:826582/1‑150 (MQ=255) ccTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGGTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTc < 1:3711111/150‑1 (MQ=255) cTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCg > 2:4332855/1‑150 (MQ=255) tCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAggg < 1:5856474/88‑1 (MQ=255) ggCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGAtt > 1:2266783/1‑150 (MQ=255) ggCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGAtt < 1:374140/150‑1 (MQ=255) ccTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGa > 2:927763/1‑146 (MQ=255) ccTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGt > 1:5310078/1‑150 (MQ=255) cTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTa > 2:2217790/1‑150 (MQ=255) ttGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAg > 1:4035311/1‑150 (MQ=255) gCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTgg < 2:5701691/150‑1 (MQ=255) ttCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGgc > 2:5555526/1‑150 (MQ=255) ttCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGgc > 2:532203/1‑150 (MQ=255) ttCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGgc > 1:2974066/1‑150 (MQ=255) cACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGgctg > 2:2880785/1‑150 (MQ=255) cGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGgctgct < 1:691997/150‑1 (MQ=255) cGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGgctgct < 1:2554642/150‑1 (MQ=255) gttgttGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGGCGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGGctgctg > 1:4298920/1‑150 (MQ=255) gttgttGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCCTTGCCTCGATTGTAGTGGGctgctg > 1:3908161/1‑150 (MQ=255) gttgttGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGGctgctg < 1:2715302/150‑1 (MQ=255) gttgttGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGGctgctg > 2:100723/1‑150 (MQ=255) gttgttGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGGctgctg > 1:2405438/1‑150 (MQ=255) ggtgttgCAGCAGGTGCGGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGGctgctg < 2:189191/148‑1 (MQ=255) tggtgCAGCAACTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGGCTGCTGCa > 2:1274627/4‑150 (MQ=255) ggtgCAGCAACTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCAGTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGGCTGCTGCAg > 1:890062/3‑150 (MQ=255) ggtgCAGCAACTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGGCTGCTGCAg > 1:5891626/3‑150 (MQ=255) gcagcaGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGGCTGCTGCAgtgt > 1:5836108/1‑150 (MQ=255) gcagcaGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGGCTGCTGCAgtgt > 1:4924682/1‑150 (MQ=255) cagcagTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGGCTGCTGCAGTGTc < 2:2960588/150‑1 (MQ=255) cagcagTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGGCTGCTGCAGTGTc < 2:2388392/150‑1 (MQ=255) cagcaaCTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGGCTGCTGCAGTGTc > 1:5504946/1‑150 (MQ=255) agcagTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGGCTGCTGCAGTGTCg > 2:5126572/1‑150 (MQ=255) gcagTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGGCTGCTGCAGTGTCGc > 1:3954592/1‑150 (MQ=255) cagTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGGCTGCTGCAGTGTCGcc < 1:3223976/150‑1 (MQ=255) cagTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGGCTGCTGCAGTGTCGcc > 1:5795881/1‑150 (MQ=255) gTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGGCTGCTGCAGTGTCGCCtt > 2:5831924/1‑150 (MQ=255) gTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGGCTGCTGCAGTGTCGCCtt > 1:3969311/1‑150 (MQ=255) gTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGGCTGCTGCAGTGTCGCCtt > 2:2045950/1‑150 (MQ=255) | TTCGGGGCTGGCCTGTTGGTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGGCTGCTGCAGTGTCGCCTT > NC_002947/2310055‑2310353 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |