Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_002947 | 2,355,513 | G→A | 5.2% | G910S (GGC→AGC) ‡ | PP_2065 → | multidrug RND transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,355,513 | 0 | G | A | 5.2% | 919.8 / 24.0 | 287 | G910S (GGC→AGC) ‡ | PP_2065 | multidrug RND transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (156/116); new base A (9/6); total (165/122) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.90e-01 |
Only 100 of 298 total aligned reads displayed.
TGGTGCTGGCGGCGCAGTACGAAAGCCTGGTCGACCCCCTGATCATTCTGGTGACCGTGCCGCTGTCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGACTTTTGGC > NC_002947/2355364‑2355662 | tGGTGCTGGCGGCGCAGTACGAAAGCCTGGTCGACCCCCTGATCATTCTGGTGACCGTGCCGCTGTCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCg > 2:4111901/1‑150 (MQ=255) tGGTGCTGGCGGCGCAGTACGAAAGCCTGGTCGACCCCCTGATCATTCTGGTGACCGTGCCGCTGTCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCg > 2:6337088/1‑150 (MQ=255) ggTGCTGGCGGCGCAGTACGAAAGCCTGGTCGACCCCCTGATCATTCTGGTGACCGTGCCGCTGTCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCgg < 2:2940590/150‑1 (MQ=255) gTGCTGGCGGCGCAGTACGAAAGCCTGGTCGACCCCCTGATCATTCTGGTGACCGTGCCGCTGTCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGc < 1:1929858/150‑1 (MQ=255) tGCTGGCGGCGCAGTACGAAAGCCTGGTCGACCCCCTGATCATTCTGGTGACCGTGCCGCTGTCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGcc < 2:1895589/150‑1 (MQ=255) tGCTGGCGGCGCAGTACGAAAGCCTGGTCGACCCCCTGATCATTCTGGTGACCGTGCCGCTGTCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGcc < 1:4052993/150‑1 (MQ=255) gcggcgCAGTACGAAAGCCTGGTCGACCCCCTGATCATTCTGGTGACCGTGCCGCTGTCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATc < 2:2547355/150‑1 (MQ=255) gcggcgCAGTACGAAAGCCTGGTCGACCCCCTGATCATTCTGGTGACCGTGCCGCTGTCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATc > 1:5256743/1‑150 (MQ=255) 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tACGAAAGCCTGGTCGACCCCCTGATCATTCTGGTGACCGTGCCGCTGTCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCAc < 1:5928041/150‑1 (MQ=255) tACGAAAGCCTGGTCGACCCCCTGATCATTCTGGTGACCGTGCCGCTGTCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCAc > 1:4003783/1‑150 (MQ=255) aCGAAAGCCTGGTCGACCCCCTGATCATTCTGGTGACCGTGCCGCTGTCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCAGGCCGATCagcgtcacca < 2:5692750/150‑8 (MQ=255) cGAAAGCCTGGTCGACCCCCTGATCATTCTGGTGACCGTGCCGCTGTCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACgg < 1:5700987/150‑1 (MQ=255) gAAAGCCTGGTCGACCCCCTGATCATTCTGGTGACCGTGCCGCTGTCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGt > 2:4204428/1‑150 (MQ=255) 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acacaGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCtg > 2:5567719/1‑150 (MQ=255) cacaGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCtga > 2:1855599/1‑150 (MQ=255) acaGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCtgat > 2:2955226/1‑150 (MQ=255) acaGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCtgat < 1:5310008/150‑1 (MQ=255) caGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCtgatg < 1:4279568/150‑1 (MQ=255) aGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCtgatga > 2:3504152/1‑150 (MQ=255) aGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCtgatga < 2:1356361/150‑1 (MQ=255) gATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGAc < 2:2094934/150‑1 (MQ=255) gCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCAcgg > 1:1601971/1‑150 (MQ=255) tGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCAcggcgg > 2:2662878/1‑150 (MQ=255) ggTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACggcggc < 2:4003783/150‑1 (MQ=255) gACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGAt > 2:2386025/1‑150 (MQ=255) ttgCTGATCAGGCCGATCAGCGAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATg > 2:885512/3‑150 (MQ=255) ttgCTGATCAGGCCGATCAGCGAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATg > 2:1313589/3‑150 (MQ=255) ttgCTGATCAGGCCGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATg > 2:6112028/3‑150 (MQ=255) gCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGAc < 2:6036611/150‑1 (MQ=255) gCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGAc > 1:2985746/1‑150 (MQ=255) gCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGAc > 1:1004166/1‑150 (MQ=255) gCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCAATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGAc > 1:2771526/1‑150 (MQ=255) gCTGATCGGCCTGATCAGAAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGATATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGATGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATAAGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGTCGGCGATGAc > 1:1471458/1‑150 (MQ=255) gCTGATCAGGCCGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGAc > 1:331317/1‑150 (MQ=255) tGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGCTGACtg > 2:1738823/1‑149 (MQ=255) tGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGACtt > 1:804423/1‑150 (MQ=255) tGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGACtt > 1:3880404/1‑150 (MQ=255) tCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGACTTTTg < 1:2662878/150‑1 (MQ=255) ggCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGACTTTTGGc < 1:4791729/150‑1 (MQ=255) | TGGTGCTGGCGGCGCAGTACGAAAGCCTGGTCGACCCCCTGATCATTCTGGTGACCGTGCCGCTGTCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGACTTTTGGC > NC_002947/2355364‑2355662 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |