| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,430,858 | C→A | 5.3% | E33* (GAA→TAA) ‡ | PP_2126 ← | LuxR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,430,858 | 0 | C | A | 5.3% | 707.2 / 8.6 | 255 | E33* (GAA→TAA) ‡ | PP_2126 | LuxR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (112/121); new base A (19/2); total (132/123) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.43e-04 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 255 total aligned reads displayed.
AGGATCAGCACTTTGCAGGTACTGCCGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACA > NC_002947/2430710‑2431005 | aGGATCAGCACTTTGCAGGTACTGCCGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCg < 1:4251564/150‑1 (MQ=255)aGGATCAGCACTTTGCAGGTACTGCCGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCg < 1:1598158/150‑1 (MQ=255)aGGATCAGCACTTTGCAGGTACTGCCGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCg < 1:1025942/150‑1 (MQ=255)aGGATCAGCACTTTGCAGGTACTGCCGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCg < 2:5725289/150‑1 (MQ=255)aGGATCAGCACTTTGCAGGTACTGCCGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGCGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCGTCg > 1:1521447/1‑150 (MQ=255) ggATCAGCACTTTGCAGGTACTGCCGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGc < 2:595233/150‑1 (MQ=255) gATCAGCACTTTGCAGGTACTGCCGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGcc > 2:1557693/1‑150 (MQ=255) gATCAGCACTTTGCAGGTACTGCCGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGcc > 2:6239512/1‑150 (MQ=255) tCAGCACTTTGCAGGTACTGCCGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGa < 1:1993099/150‑1 (MQ=255) gCACTTTGCAGGTACTGCCGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCTAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCGAAGCCGAcga < 2:1943553/150‑3 (MQ=255) cTTTGCAGGTACTGCCGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGt < 2:5216280/150‑1 (MQ=255) tttGCAGGTACTGCCGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTc > 2:603139/1‑150 (MQ=255) tttGCAGGTACTGCCGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCGTCGCCGACCAccgc > 1:1363199/1‑147 (MQ=255) ttGCAGGTACTGCCGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCa < 2:5523351/150‑1 (MQ=255) cAGGTACTGCCGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCGTCGCCcaccaccgccaac > 1:3888595/1‑143 (MQ=255) aGGTACTGCCGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGc > 2:1022459/1‑150 (MQ=255) aGGTACTGCCGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGc > 2:5764107/1‑150 (MQ=255) gTACTGCCGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCg > 2:6573412/1‑150 (MQ=255) gTACTGCCGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCg > 2:5105842/1‑150 (MQ=255) tACTGCCGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCgg < 2:3840214/150‑1 (MQ=255) aCTGCCGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCggg < 1:734162/150‑1 (MQ=255) cTGCCGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCCACCACCTCAAAGCCcggg > 1:1066368/1‑150 (MQ=255) tGCCGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGa > 1:2119260/1‑150 (MQ=255) tGCCGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGa > 1:5592919/1‑150 (MQ=255) tGCCGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTAGCCCACCACCTCAAAACCCGGGa > 1:6439990/1‑150 (MQ=255) gCCGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCg < 1:4803991/127‑1 (MQ=255) gCCGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCg > 2:4803991/1‑127 (MQ=255) gCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCCGGGATATc > 2:2635738/1‑150 (MQ=255) gtGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGTGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCTCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCg < 1:590198/149‑1 (MQ=255) tGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGc < 1:2801190/150‑1 (MQ=255) gccccGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCa < 2:5506846/148‑1 (MQ=255) gCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACCTCATAGCCGGGGCTATCGccc > 2:4892658/1‑148 (MQ=255) ccGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGAc > 2:452379/1‑150 (MQ=255) ccGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATAGCAGAc > 2:2079917/1‑150 (MQ=255) acGCAGTTGGGTAAGGGCGACCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATCTCCAGCAAGATGATCTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGAAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTAGCCGACCACCTCATAGCCGGGGATATCGCAAAc > 2:5104398/2‑150 (MQ=255) cGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGAcc > 2:6513506/1‑150 (MQ=255) gCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCa < 1:837943/150‑1 (MQ=255) aGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGt < 1:5904770/150‑1 (MQ=255) aGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGt < 1:3401815/150‑1 (MQ=255) tAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGc < 2:5249320/108‑1 (MQ=255) tAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCa < 1:3256520/150‑1 (MQ=255) gggCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCAccc < 2:6332312/150‑1 (MQ=255) gCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCg > 2:2561911/1‑150 (MQ=255) gCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCg < 1:526787/150‑1 (MQ=255) ccAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGCTGCTGTCGGGCGCCAGTGTGCGGACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGgcgc < 2:3887916/150‑1 (MQ=255) cAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGcgcg < 1:5683297/150‑1 (MQ=255) cAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGcgcg < 2:123161/150‑1 (MQ=255) ggCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCa < 1:3734699/129‑1 (MQ=255) cGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCGTCGCCGACCACGTAAAATACCGGGATATAGCAGAAAACTTCCCGCACCCCCGCGCCGATCa > 2:5820772/1‑150 (MQ=255) gCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAg > 2:1605833/1‑150 (MQ=255) cTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGc < 1:238406/150‑1 (MQ=255) ggTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGa < 1:4973078/150‑1 (MQ=255) gTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAg > 2:2158954/1‑150 (MQ=255) gTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGGCATAGCCCGGGATATCGCCGACCAGTGCCCCCACCCCCCCGCCGATCAGCGAg > 1:4710386/1‑150 (MQ=255) tCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGt < 1:5033868/150‑1 (MQ=255) gAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTgg > 2:5823248/1‑150 (MQ=255) aTGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGGTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCt < 2:4622636/150‑1 (MQ=255) tGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACcagca < 2:4352353/150‑1 (MQ=255) gTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACcagcag > 2:3978574/1‑150 (MQ=255) cAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCGTAGCCGACCACCGCATAGCCGGGGATAAAGCGGACAACTGCCCGCAACCCGGCGCGGATCACCGAGTGGTCATCGACcaggcggag > 1:2653788/1‑144 (MQ=255) gCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTc < 1:6198713/150‑1 (MQ=255) cAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCg > 2:443911/1‑105 (MQ=255) aaGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTa < 2:5201161/150‑1 (MQ=255) aGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCCACCACCTAATAGCCCGGGATATCCCAGACCCCTGCCCCCACCCCCGCGCGGATAAGCCAGTGGTCAACTAACAGCAGTAGTCTAc > 1:3344498/1‑150 (MQ=255) gatgctGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACa < 2:5667825/150‑1 (MQ=255) atgatgTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTAGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAg > 2:3681192/1‑150 (MQ=255) gTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCGTCGCCGACCACGTCAAAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGCTCAGCGAGGGGTCCTCTACCAGCCGTAGTCTACCGGTCAt > 1:6801020/1‑150 (MQ=255) cGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCGTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATAGCAGACCAGTGCCCGCACCCCCGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCAtgg > 2:1363401/1‑150 (MQ=255) gggCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCAtggt < 2:3238512/150‑1 (MQ=255) gggCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGGCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCCGCGCGGCTCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCAtggt > 2:3092736/1‑150 (MQ=255) gcgcCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCAtggttg < 1:1413844/150‑1 (MQ=255) gcgcCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCAtggttg < 2:5162434/150‑1 (MQ=255) cgcCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCAtggttgg < 1:5859159/150‑1 (MQ=255) cgcCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCAtggttgg < 2:3404811/150‑1 (MQ=255) gtgtGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATa < 2:2964263/150‑1 (MQ=255) tgCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTc < 1:6164130/150‑1 (MQ=255) gCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTcc < 1:5426700/150‑1 (MQ=255) ccTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCGTCGCCCACCACCTCATAGCCCGGGATATCCCAGACCAGTGCCCCCCCCCCCGCGCGGATCACCGAGGGGGCAACTAACACCACTAGTCTACAGGTCAGGGGTGGTAATAATCCGGgcg > 2:2315747/1‑150 (MQ=255) ccTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCATCGCCGACCACGTCATAGCCCGGGATATCGCAGACCACTGCCCCCACCCCCGCCCGGATCAGCGAGTGGTCAGATACCACCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACAACTGgcg > 2:6420885/1‑150 (MQ=255) ggTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCGTCGCCGACCACGGCCTAGCCGGGGAGATCGCACACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCACCAGTAGTCTACAGGGCATGGTTGGTAAAACACCGGGCGCGt > 2:3227265/1‑150 (MQ=255) gTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGtt < 1:3019650/150‑1 (MQ=255) gAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCt < 1:6618630/150‑1 (MQ=255) gTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATATCCGGGGATATCGCAGAACAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGGTGGTAATACTCCGGGCGCGTTGCTgg > 2:3491912/1‑150 (MQ=255) gTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTgg < 2:1066368/150‑1 (MQ=255) gTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTgg < 2:5592919/150‑1 (MQ=255) gTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCCCCCCCCACCTCATAGCCCGGGATATCGCCCACCACTGCCCGCACCCCCGCGCGGCTCACCGAGTGGTCAACTACCAGCAGGAGTCGACCCGGCAAGGGTGGTAAAACACCAGGCGCGTTGCggg > 2:3744942/1‑150 (MQ=255) aGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCAAAGCCCGGGATATAGCAGACCACTGCCCGCACCCCCGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGGTGGTAATACTCCGGGCGCGGTGCTGGGt > 2:4201546/1‑150 (MQ=255) cTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTTCCCGCACCCCCGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCCGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGGAAAACTCCTGGCGCGTTGGTGGGTgc > 1:4548736/1‑150 (MQ=255) tGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTgcg < 2:5364209/150‑1 (MQ=255) ctatgacgtggtCGGCGAAGCCGACGACGGCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTgcgc > 1:6065756/7‑150 (MQ=255) tatgacgtggtCGGCGCAGCCGACGACGGCATAGCCGGGGATAGCGCAGGCCCGGGCCCGCACCCCGGCGCGGATCCGCGAGTGGTCAGCTCCCAGCCGGCGTCTACCGGTCCGGGGGGGTAATACTCCTGGCGCGGTGCTGGGTGcgcg > 2:1834794/6‑150 (MQ=255) acgtcgtCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCGGGGTGCGCGGGGa > 2:6821341/2‑150 (MQ=255) cgtcgGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCAc < 1:5764107/150‑1 (MQ=255) gtcgGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACg < 2:3350725/150‑1 (MQ=255) gtcgGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACg < 1:4987898/150‑1 (MQ=255) tcgGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACgg < 1:322513/150‑1 (MQ=255) tcgGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGAGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACgg < 2:2813522/150‑1 (MQ=255) cgGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACggg < 1:2528262/150‑1 (MQ=255) gCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGaa > 1:4431344/1‑150 (MQ=255) ttCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACa > 1:4359550/1‑150 (MQ=255) | AGGATCAGCACTTTGCAGGTACTGCCGCTGGCCCGCAGTTGGGTAAGGGCGTCCAGGCCGCTGGTCGAACGCATGGAGATGTCCAGCAAGATGATGTCGGGCGCCAGTGTGCGTACCTGGTCGAGTAGCTGGTTGCCGTCGTCGGCTTCGCCGACCACGTCATAGCCGGGGATATCGCAGACCAGTGCCCGCACCCCGGCGCGGATCAGCGAGTGGTCATCTACCAGCAGTAGTCTACAGGTCATGGTTGGTAATACTCCTGGCGCGTTGCTGGGTGCGCGGGGACCACGGGAACA > NC_002947/2430710‑2431005 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |