| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 2,589,975 | 0 | A | C | 7.8% | 798.0 / 2.5 | 297 | V171G (GTT→GGT) | folD‑II | bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (140/122); new base C (3/32); total (143/154) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.84e-07 | |||||||||||
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Only 100 of 302 total aligned reads displayed.
CCCACTCACCCTTGACCAGGCCCGGCTTGCCGGCAGCCACGACCACCAGGTCGGCACGCCCGACGTGGCCGGCCAGGTCCTTGGTGAAGCGGTGGCAGACGGTCACGGTGCAGCCGGCCAGCAGCAGTTCCATGGCCATCGGGCGGCCAACGATGTTGGACGCGCCGACGATCACCGCGTTCATGCCGTACAGGTCCTGGCCGGTGCTTTCCAGCAGGGTCATGATGCCTTTCGGTGTGCACGGGCGCAGCAGTGGAATACGCTGGGCCAGGCGGCCGATGTTGTACGGGTGGAAGCC > NC_002947/2589826‑2590123 | tCACCCTTGACCAGGCCCGGCTTGCCGGCAGCCACGACCACCAGGTCGGCACGCCCGACGTGGCCGGCCAGGTCCTTGGTGAAGCGGTGGCAGACGGTCACGGTGCAGCCGGCCAGCAGCAGTTCCATGGCCATCGGGCGGCCAACGATg > 1:1536198/1‑150 (MQ=255) tCACCCTTGACCAGGCCCGGCTTGCCGGCAGCCACGACCACCAGGTCGGCACGCCCGACGTGGCCGGCCAGGTCCTTGGTGAAGCGGTGGCAGACGGTCACGGTGCAGCCGGCCAGCAGCAGTTCCATGGCCATCGGGCGGCCAACGATg > 1:2280340/1‑150 (MQ=255) tCACCCTTGACCAGGCCCGGCTTGCCGGCAGCCACGACCACCAGGTCGGCACGCCCGACGTGGCCGGCCAGGTCCTTGGTGAAGCGGTGGCAGACGGTCACGGTGCAGCCGGCCAGCAGCAGTTCCATGGCCATCGGGCGGCCAACGATg > 2:4233353/1‑150 (MQ=255) 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ggCCAGCAGCTGTTCCATGGCCATCGGGCGGCAAACGATGTTGGACGCGCCGACGATCACCGCGTTCATGCCGTACAGGTCCTGGCCGGTGCTTTCCAGCAGGGTCATGATGCCTTTCGGTGTGCACGGGCGCAGCAGTGGAATACGCTg < 2:5615914/150‑1 (MQ=255) gCCCGCAGCTGTCCCAGGGCCCTCGGGCGGCCACCTATGTTGGACGCGCCGACGATCACCGCGTTCATGCCGTACAGGTCCTGGCCGGTGCTTTCCAGCAGGGTCATGATGCCTTTCGGTGTGCACGGGCGCAGCAGTGGAATACGCTgg < 1:2066528/150‑1 (MQ=255) gCCAGCAGCAGTTCCATGGCCATCGGGCGGCCAACGATGTTGGACGCGCCGACGATCACCGCGTTCATGCCGTACAGGTCCTGGCCGGTGCTTTCCAGCCGGGTCATGATGCCTTTCGGTGTGCACGGGCGCAGCAGTGGAATACGCTgg > 2:4427220/1‑150 (MQ=255) cagcagctgTTCCATGGCCTTGGGGCGGCCAACGTTGTTGGACGCGCCGACGATCACCGCGTTCATGCCGTACAGGTCCTGGCCGGTGCTTTCCAGCAGGGTCATGATGCCTTTCGGTGTGCACGGGCGCAGCAGTGGAATACGCTGGGc < 2:2723694/150‑1 (MQ=255) gTTCCATGGCCATCGGGCGGCCAACGATGTTGGACGCGCCGACGATCACCGCGTTCATGCCGTACAGGTCCTGGCCGGTGCTTTCCAGCAGGGTCATGATGCCTTTCGGTGTGCACGGGCGCAGCAGTGGAATACGCTGGGCCAggcggc > 2:675642/1‑150 (MQ=255) ttCCATGGCCATCGGGCGGCCAACGATGTTGGACGCGCCGACGATCACCGCGTTCATGCCGTACAGGTCCTGGCCGGTGCTTTCCAGCAGGGTCATGATGCCTTTCGGTGTGCACGGGCGCAGCAGTGGAATACGCTGGGCCAGGCGGcc > 2:4001402/1‑150 (MQ=255) ccatggccatggGGCGGCCACCGATGTTGGCCGCGCCGACGATCACCGCGTTCATGCCGTACAGGTCCTGGCCGGTGCTTTCCAGCAGGGTCATGATGCCTTTCGGTGTGCACGGGCGCAGCAGTGGAATACGCTGGGCCAGGCGGCCGa < 2:5930705/150‑1 (MQ=255) tGGCCATCGGGCGGCCAACGATGTTGGACGCGCCGACGATCACCGCGTTCATGCCGTACAGGTCCTGGCCGGTGCTTTCCAGCAGGGTCATGATGCCTTTCGGTGTGCACGGGCGCAGCAGTGGAATACGCTGGGCCAGGCGGCCGAtgt > 2:3612889/1‑150 (MQ=255) gcccgggggCGGCCACCGTTGTTGGACGCGCCGACGATCACCGCGTTCATGCCGTACAGGTCCTGGCCGGTGCTTTCCAGCAGGGTCATGATGCCTTTCGGTGTGCACGGGCGCAGCAGTGGAATACGCTGGGCCAGGCGGCCGAtgttg < 1:6665474/144‑1 (MQ=255) ggggCGCCCACCGTGGTGGGCCGCGCCGACGATCACCGCGTTCATGCCGTACAGGTCCTGGCCGGTGCTTTCCAGCAGGGTCATGATGCCTTTCGGTGTGCACGGGCGCAGCAGTGGAATACGCTGGGCCAGGCGGCCGATGTTGTACgg < 1:1808760/149‑1 (MQ=255) gggCGGCAAACGTTTTTGGACGCGCCGACGATCACCGCGTTCATGCCGTACAGGTCCTGGCCGGTGCTTTCCAGCAGGGTCATGATGCCTTTCGGTGTGCACGGGCGCAGCAGTGGAATACGCTGGGCCAGGCGGCCGATGTTGTACggg < 2:1536167/150‑1 (MQ=255) ggcggcCACCTATGTTGGACGCGCCGACGATCACCGCGTTCATGCCGTACAGGTCCTGGCCGGTGCTTTCCAGCAGGGTCATGATGCCTTTCGGTGTGCACGGGCGCAGCAGTGGAATACGCTGGGCCAGGCGGCCGATGTTGTACGGGt < 1:5752337/150‑1 (MQ=255) gcggcCAACGATGTTGGACGCGCCGACGATCACCGCGTTCATGCCGTACAGGTCCTGGCCGGTGCTTTCCAGCAGGGTCATGATGCCTTTCGGTGTGCACGGGCGCAGCAGTGGAATACGCTGGGCCAGGCGGCCGATGTTGTACGGGTg > 2:3055250/1‑150 (MQ=255) cggcCAACTTTTTTGGACGCGCCGACGATCACCGCGTTCATGCCGTACAGGTCCTGGCCGGTGCTTTCCAGCAGGGTCATGATGCCTTTCGGTGTGCACGGGCGCAGCAGTGGAATACGCTGGGCCAGGCGGCCGATGTTGTACGGGTgg < 1:726782/150‑1 (MQ=255) gcCACCGTTGTTGGCCGCGCCGACGATCACCGCGTTCATGCCGTACAGGTCCTGGCCGGTGCTTTCCAGCAGGGTCATGATGCCTTTCGGTGTGCACGGGCGCAGCAGTGGAATACGCTGGGCCAGGCGGCCGATGTTGTACGGGTGGaa < 2:5889309/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |