| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_002947 | 2,963,791 | G→C | 13.8% | intergenic (+65/+77) | PP_2589 → / ← PP_2590 | aldehyde dehydrogenase family protein/ferric siderophore receptor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,963,791 | 0 | G | C | 13.8% | 649.2 / 86.6 | 232 | intergenic (+65/+77) | PP_2589/PP_2590 | aldehyde dehydrogenase family protein/ferric siderophore receptor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (125/73); new base C (16/16); total (142/90) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.74e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.18e-01 | |||||||||||
Only 100 of 236 total aligned reads displayed.
GTCGGGGTTTGGCCGCGATCTGTCACTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGCGGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCACGCTAGCCGAAAGCTGATAGGTCCGCGGCGCCCCCAACCCCAGGGTCTGGGTCAGTGGCACA > NC_002947/2963642‑2963940 | gTCGGGGTTTGGCCGCGATCTGTCACTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGCGGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAg > 2:2205698/1‑150 (MQ=255) tCGGGGTTTGGCCGCGATCTGTCACTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGCGGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGt > 1:6663353/1‑150 (MQ=255) tCGGGGTTTGGCCGCGATCTGTCACTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGCGGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGt > 1:3485663/1‑150 (MQ=255) ggTTTGGCCGCGATCTGTCACTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGCGGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACACGTCTGa < 2:3407169/150‑1 (MQ=255) ggTTTGGCCGCGATCTGTCACTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGCGGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGa < 1:581419/150‑1 (MQ=255) ggTTTGGCCGCGATCTGTCACTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGCGGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGa < 1:2919430/150‑1 (MQ=255) gTTTGGCCGCGATCTGTCACTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGCGGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAg < 2:5256513/150‑1 (MQ=255) ccGCGATCTGTCACTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGCGGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTtgt < 2:2920846/150‑1 (MQ=255) cgcgATCTGTCACTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGCGGCTGAGGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACCAGTCTGAGGGTtgtg > 2:4176167/1‑150 (MQ=255) gcgATCTGTCACTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGCGGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGc < 1:5981970/150‑1 (MQ=255) cgATCTGTCACTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGCGGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCt < 2:2100377/150‑1 (MQ=255) cgATCTGTCACTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGCGGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCt > 1:3899685/1‑150 (MQ=255) cgATCTGTCACTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGCGGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCt < 1:2242331/150‑1 (MQ=255) aTCTGTCACTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGCGGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTCCAGCACAACCCTCAGACTTGTGCTga < 1:2804011/150‑2 (MQ=37) aTCTGTCACTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGCGGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTCCAGCACAACCCTCAGACTTGTGCTga < 2:2525883/150‑2 (MQ=38) tCTGTCACTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGCGGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGTCCAGCACAACCCTCAGACTTGTGCTgaa < 1:1449908/150‑3 (MQ=25) tCTGTCACTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGCGGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTCCAGCACAACCCTCAGACTTGTGCTgaa < 1:402334/150‑3 (MQ=38) tCTGTCACTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGCGGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTCCAGCACAACCCTCAGACTTGTGCTgaa < 1:5666438/150‑3 (MQ=38) tGTCACTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGCGGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGAcc > 2:689859/1‑150 (MQ=255) gTCACTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGCGGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCt < 1:1552773/150‑1 (MQ=255) tCACTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGCGGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCtg > 2:2554369/1‑150 (MQ=255) cACTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGCGGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCtgt < 1:3207222/150‑1 (MQ=255) aCTTCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTCGTACAAGATGCGCGGCTGAGGTCGTGATCATTGACCGCGTCGTCTTCTTCGCGGTCAAGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCAGAGGTGTGTGCTGGACCtgtg > 2:3469321/1‑150 (MQ=255) aCTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGCGGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTCCAGCACAACCCTCAGACTTGTGCTGAACCtgtg < 2:6529437/150‑1 (MQ=37) cTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGCGGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTgg > 2:553273/1‑150 (MQ=255) cTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGCGGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTgg < 1:5800200/150‑1 (MQ=255) tGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGCGGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTggg < 1:1669418/150‑1 (MQ=255) tGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGCGGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTggg > 1:2643165/1‑150 (MQ=255) gCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGCGGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGa < 1:5042894/150‑1 (MQ=255) gttcgACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGCGGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGgc > 2:5651607/1‑150 (MQ=255) gttcgACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGCGGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGgc > 1:6623967/1‑150 (MQ=255) gttcgACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGCGGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTCCAGCACAACCCTCAGACTTGTGCTg > 1:4449576/1‑133 (MQ=37) gttcgACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGCGGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTCCAGCACAACCCTCAGACTTGTGCTg < 2:4449576/133‑1 (MQ=37) aaGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGCGGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCcg > 1:262430/1‑150 (MQ=255) tttCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCTGTGGCGGGGCTGATGTATTGATCATTGACCGGGTCGTGTGCTTCGGGGGCAGGCCCGCTCCCACAGGTTCCGCACAAGTCTGAGGGTTGTGGTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGaa < 2:3992547/149‑1 (MQ=38) cGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGCGGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAagag > 1:4413300/1‑150 (MQ=255) gCAACTCACGACCACCTGGTACCAGTTGCGCGGCTGTTGTTTTGACCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCTGGCCCGCTCCCACAGGTACAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCGGGCCCGGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAgg < 1:1657833/150‑1 (MQ=37) gCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGCGGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAgg > 2:4910422/1‑150 (MQ=255) 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tCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCACGCTAg > 2:1259744/1‑150 (MQ=255) aTTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCACGCTAGcc > 1:3319174/1‑150 (MQ=255) cccGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCCCAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCACGCTAGCCGaaa < 2:6423770/149‑1 (MQ=255) cgcgTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCCCGAAGAGGCCGTATATTGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTACACGCTAGACGAAAGc > 1:1232381/1‑150 (MQ=38) gcgTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCACGCTAGCCGAAAGCt > 2:3682075/1‑150 (MQ=255) gcgTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTGGTGCTGGACCGGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCACGCTAGCCGAACGcg > 1:958372/1‑149 (MQ=255) tcTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCACGCTAGCCGAAAGCTGATAgg > 1:4295055/1‑150 (MQ=255) tcTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGGGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGACGTCCACGCTAGCCGAAAGCTGATggg > 2:329386/1‑150 (MQ=255) gCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGCGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGGTAGAAGTCCACGCTAGCCGAAAGCTGATAGGTcc > 1:5171636/1‑150 (MQ=255) tCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCACGCTAGCCGAAAGCTGATAGGTCcgcg < 2:3263017/150‑1 (MQ=255) 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ccACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCCGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCACGCTAGCCGAAAGCAGATAGGTCCGCGGCGCCCCCAACCCCAgtg > 2:5890848/1‑148 (MQ=255) cacaGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCACGCTAGCCGAAAGCTGATAGGTCCGCGGCGCCCCCAACCCCAGGGt > 1:6262658/1‑150 (MQ=255) cacaGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCACGCTAGCCGAAAGCTGATAGGTCCGCGGCGCCCCCAACCCCAGGGt > 2:3731272/1‑150 (MQ=255) cacaGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCACGCTAGCCGAAAGCTGATAGGTCCGCGGCGCCCCCAACCCCAGGGt > 1:2096258/1‑150 (MQ=255) cacaGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCACGCTAGCCGAAAGCTGATAGGTCCGCGGCGCCCCCAACCCCAGGGt > 1:1073430/1‑150 (MQ=255) acaGGTCCAGCACAACCCTCAGACTTGTGCTGAACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCACGCTAGCCGAAAGCTGATAGGTCCGCGGCGCCCCCAACCCCAGGGTc > 2:6229901/1‑150 (MQ=37) ccggTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCACGCTAGCCGAAAGCTGATAGGTCCGCGGCGCCCCCAACCCCAGGGTCt < 2:6298412/148‑1 (MQ=255) caGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCACGCTAGCCGAAAGCTGATAGGTCCGCGGCGCCCCCAACCCCAGGGTCt > 2:1069497/1‑150 (MQ=255) aGGTCCAGCACAACCCTCAGACTTGTGCTGAACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCACGCTAGCCGAAAGCTGATAGGTCCGCGGCGCCCCCAACCCCAGGGTCTg > 2:4348385/1‑150 (MQ=37) ggTTCAGCACATGTCTGTGGGTTGTGCTGGCCCGGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCACGCTAGCCGAAAGCTGATAGGTCCGCGGCGCCCCCAACCCCAGGGTCTgg < 1:2205698/150‑1 (MQ=255) ggTTCAGCACACGTGTGTGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCACGCTAGCCGAAAGCTGATAGGTCCGCGGCGCCCCCAACCCCAGGGTCTgg < 2:262460/150‑1 (MQ=255) ggTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCACGCTAGCCGAAAGCTGATAGGTCCGCGGCGCCCCCAACCCCAGGGTCTgg < 2:2079444/150‑1 (MQ=255) gTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCACGCTAGCCGAAAGCTGATAGGTCCGCGGCGCCCCCAACCCCAGGGTCTggg > 2:6654679/1‑150 (MQ=255) gTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCACGCTAGCCGAAAGCTGATAGGTCCGCGGCGCCCCCAACCCCAGGGTCTggg > 2:6654363/1‑150 (MQ=255) gTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCACGCTAGCCGAAAGCTGATAGGTCCGCGGCGCCCCCAACCCCAGGGTCTggg > 2:1455924/1‑150 (MQ=255) tccAGCACAACCCTCAGACTTGTGCTGAACCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGTGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCACGCTAGCCGAAAGCTGATAGGTCCGCGGCGCCCCCAACCCCAGGGTCTGGGt > 1:649630/3‑150 (MQ=25) tCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCACGCTAGCCGAAAGCTGATAGGTCCGCGGCGCCCCCAACCCCAGGGTCTGGGTc > 2:79710/1‑150 (MQ=255) tCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCACGCTAGCCGAAAGCTGATAGGTCCGCGGCGCCCCCAACCCCAGGGTCTGGGTc > 1:6787724/1‑150 (MQ=255) tCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCACGCTAGCCGAAAGCTGATAGGTCCGCGGCGCCCCCAACCCCAGGGTCTGGGTc > 2:1716193/1‑150 (MQ=255) tCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCACGCTAGCCGAAAGCTGATAGGTCCGCGGCGCCCCCAACCCCAGGGTCTGGGTc > 1:938033/1‑150 (MQ=255) caccacaAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCACGCTAGCCGAAAGCTGATAGGTCCGCGGCGCCCCCAGACCCTGGGGTTgggggc < 1:526931/147‑4 (MQ=39) cAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCACGCTAGCCGAAAGCTGATAGGTCCGCGGCGCCCCCAACCCCAGGGTCTGGGTCa > 2:5121444/1‑150 (MQ=255) cAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCACGCTAGCCGAAAGCTGATAGGTCCGCGGCGCCCCCAACCCCAGGGTCTGGGTCa < 2:1961008/150‑1 (MQ=255) cAGCACAACCCTCAGACTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCACGCTAGCCGAAAGCTGATAGGTCCGCGGCGCCCCCAACCCCAGGGTCTGGGTCa > 1:1467509/1‑150 (MQ=38) gCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCACGCTAGCCGAAAGCTGATAGGTCCGCGGCGCCCCCAACCCCAGGGTCTGGGTCAGt > 2:673310/1‑150 (MQ=255) cacaAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCACGCTAGCCGAAAGCTGATAGGTCCGCGGCGCCCCCAACCCCAGGGTCTGGGTCAGTg > 2:910482/1‑150 (MQ=255) cacaAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCACGCTAGCCGAAAGCTGATAGGTCCGCGGCGCCCCCAACCCCAGGGTCTGGGTCAGTg > 2:310900/1‑150 (MQ=255) aaGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCACGCTAGCCGAAAGCTGATAGGTCCGCGGCGCCCCCAACCCCAGGGTCTGGGTCAGTggta > 1:5854266/1‑148 (MQ=255) aaGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCACGCTAGCCGAAAGCTGATAGGTCCGCGGCGCCCCCAACCCCAGGGTCTGGGTCAGTGGca > 1:490450/1‑150 (MQ=255) gTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAg > 1:2688219/1‑81 (MQ=255) gTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAg < 2:2688219/81‑1 (MQ=255) gTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCACGCTAGCCGAAAGCTGATAGGTCCGCGGCGCCCCCAACCCCAGGGTCTGGGTCAGTGGcaca > 1:131779/1‑150 (MQ=255) | GTCGGGGTTTGGCCGCGATCTGTCACTGCATTCGTTCGACAAGTATTCGCAACTCAAGACCACCTGGTACCAGTTGCGCGGCTGATGTATTGATCATTGACCGCGTCGTCTGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTTCAGCACAAGTCTGAGGGTTGTGCTGGACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGTATCTGGCGCCGCGGCGGGACCCGGTTAGAAGTCCACGCTAGCCGAAAGCTGATAGGTCCGCGGCGCCCCCAACCCCAGGGTCTGGGTCAGTGGCACA > NC_002947/2963642‑2963940 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |