| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,987,684 | C→G | 5.3% | G163R (GGT→CGT) | PP_2608 ← | shikimate dehydrogenase family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,987,684 | 0 | C | G | 5.3% | 904.7 / 28.6 | 266 | G163R (GGT→CGT) | PP_2608 | shikimate dehydrogenase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (131/121); new base G (10/4); total (141/125) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.79e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.67e-01 | |||||||||||
Only 100 of 273 total aligned reads displayed.
CAGGGCGGCGGACAACGGCAGCTCTGCGCGGGTGCCCATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTGCCCGTTTGCCCGCCGGCTCGAAGCCATGCTTGTGCGCAGCGCCGA > NC_002947/2987538‑2987833 | gggCGGCGGACAACGGCAGCTCTGCGCGGGTGCCCATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCAtgc < 1:3706611/150‑1 (MQ=255) gggCGGCGGACAACGGCAGCTCTGCGCGGGTGCCCATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCAtgc > 2:6087251/1‑150 (MQ=255) gggCGGCGGACAACGGCAGCTCTGCGCGGGTGCCCATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCAtgc > 2:2621290/1‑150 (MQ=255) gcggACAACGGCAGCTCTGCGCGGGTGCCCATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCAtgcgtgcg < 2:6289649/150‑1 (MQ=255) cggACAACGGCAGCTCTGCGCGGGTGCCCATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCgg < 1:3494377/150‑1 (MQ=255) cggACAACGGCAGCTCTGCGCGGGTGCCCATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCgg > 1:6659317/1‑150 (MQ=255) ggACAACGGCAGCTCTGCGCGGGTGCCCATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGt < 1:4987804/150‑1 (MQ=255) gACAACGGCAGCTCTGCGCGGGTGCCCATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGTCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTg > 2:2948223/1‑150 (MQ=255) gACAACGGCAGCTCTGCGCGGGTGCCCATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTg < 2:4840608/150‑1 (MQ=255) cAACGGCAGCTCTGCGCGGGTGCCCATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCt < 1:5123272/150‑1 (MQ=255) cAACGGCAGCTCTGCGCGGGTGCCCATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCt < 2:3110418/150‑1 (MQ=255) aCGGCAGCTCTGCGCGGGTGCCCATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTgg < 1:4311993/150‑1 (MQ=255) aCGGCAGCTCTGCGCGGGTGCCCATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTgg < 1:6471105/150‑1 (MQ=255) cGGCAGCTCTGCGCGGGTGCCCATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTggg < 2:6326389/150‑1 (MQ=255) cAGCTCTGCGCGGGTGCCCATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTc < 1:2590828/150‑1 (MQ=255) tctGCGCGGGTGCCCATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCag > 1:6797281/1‑150 (MQ=255) tctGCGCGGGTGCCCATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCag > 1:5708356/1‑150 (MQ=255) tctGCACGGGTGCCCATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCag > 2:4649495/1‑150 (MQ=255) ctGCGCGGGTGCCCATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCaga < 1:4665137/150‑1 (MQ=255) tGCGCGGGTGCCCATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCagag > 2:1983523/1‑150 (MQ=255) gcgcGGGTGCCCATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAgg < 1:1522906/150‑1 (MQ=255) gcgcGGGTGCCCATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAgg > 2:6554045/1‑150 (MQ=255) ggTGCCCATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTAt < 1:281454/150‑1 (MQ=255) ggTGCCCATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTAt < 2:3589410/150‑1 (MQ=255) aTGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCg > 2:836092/1‑150 (MQ=255) ccGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATc < 1:6790182/150‑1 (MQ=255) cGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATcc < 1:1619470/150‑1 (MQ=255) cGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATcc < 2:1180372/150‑1 (MQ=255) gACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATccc > 2:740793/1‑150 (MQ=255) gACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATccc < 2:5635930/150‑1 (MQ=255) gACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATccc > 1:5583292/1‑150 (MQ=255) cTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTg > 1:3462303/1‑150 (MQ=255) cTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTg > 1:3092433/1‑150 (MQ=255) tGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGc > 2:3529919/1‑150 (MQ=255) ggACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGACGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTc > 1:1841831/1‑150 (MQ=255) ttGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGt > 1:1947178/1‑150 (MQ=255) tGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTg < 1:4188297/150‑1 (MQ=255) gCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTACGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCa > 1:6141744/1‑150 (MQ=255) ccaccaGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCAt < 2:5736642/150‑1 (MQ=255) ccaccaGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCAt < 2:5603985/150‑1 (MQ=255) caccaGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATa > 2:2656492/1‑150 (MQ=255) caccaGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATa < 2:1257894/150‑1 (MQ=255) accaGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAg > 2:536237/1‑150 (MQ=255) accaGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAg < 1:536237/150‑1 (MQ=255) accaGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAg > 1:2462111/1‑150 (MQ=255) accaGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAg > 2:6186034/1‑150 (MQ=255) accaGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAg < 1:2670502/150‑1 (MQ=255) gTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAAt > 2:4093048/1‑150 (MQ=255) gAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGc < 1:2828460/150‑1 (MQ=255) gAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGc > 1:2138201/1‑150 (MQ=255) aGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCAc < 2:4332985/150‑1 (MQ=255) aGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCAc < 1:1352049/150‑1 (MQ=255) ttCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCCATGGCACTGcc > 2:5467426/1‑150 (MQ=255) ttCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCACTGcc > 1:6220996/1‑150 (MQ=255) ttCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCACTGcc > 2:4759348/1‑150 (MQ=255) ttCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCACTGcc > 1:954355/1‑150 (MQ=255) tcAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCACTGCCaa > 1:4749743/2‑150 (MQ=255) ccAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCACTGCCaa < 2:2204835/150‑1 (MQ=255) gCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCACTGCCAacac > 1:6068616/1‑150 (MQ=255) gCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCACTGCCAacac > 2:568500/1‑150 (MQ=255) cccACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCACTGCCAACAcc > 1:1031545/1‑150 (MQ=255) cccACTGAACAGAGTGCAGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCACTGCCAACAcc > 1:1459707/1‑150 (MQ=255) aCTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCACTGCCAACAccgcc < 2:276076/150‑1 (MQ=255) aCTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCACTGCCAACAccgcc > 2:6618254/1‑150 (MQ=255) aaCTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCACTGCCAACACCGCCGCaa < 2:5581518/150‑1 (MQ=255) aCTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCACTGCCAACACCGCCGCAAc < 2:6516662/150‑1 (MQ=255) tgtgtgCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCg < 2:1587285/150‑1 (MQ=255) tgtgtgCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCg > 1:4773420/1‑150 (MQ=255) tgtgtgCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCg > 2:6525199/1‑150 (MQ=255) gtgtgCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGa > 2:593392/1‑150 (MQ=255) tgCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCa > 1:6464926/1‑150 (MQ=255) tgCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCa > 1:4749262/1‑150 (MQ=255) tGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCa < 1:836092/150‑1 (MQ=255) ccGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTg < 2:4188493/150‑1 (MQ=255) tAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCACTGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTGccc > 2:5925120/1‑150 (MQ=255) cccGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTGCCCGttt > 2:2906226/1‑150 (MQ=255) aaGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTGCCCGTTTGCccgcc > 1:329778/1‑150 (MQ=255) cGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTGCCCGTTTGCCCGCCGGCTCGAAGc > 2:1951057/1‑150 (MQ=255) cGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTGCCCGTTTGCCCGCCGGCTCGAAGc < 1:3765318/150‑1 (MQ=255) cGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTGCCCGGTTGCCCGCCGGCTCGAAGc > 2:3375370/1‑150 (MQ=255) gAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATcc > 1:5949511/1‑65 (MQ=255) gAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATATGCAATGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTGCCCGTTTGCCCGCCGGCTCGAAGcc > 1:1770186/1‑150 (MQ=255) aGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTGCCCGTTTGCCCGCCGGCTCGAAGCCa < 2:4991225/150‑1 (MQ=255) aGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTGCCCGTTTGCCCGCCGGCTCGAAGCCa < 1:2259098/150‑1 (MQ=255) ttCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTGCCCGTTTGCCCGCCGGCTCGAAGCCATGCtt < 1:2395554/150‑1 (MQ=255) ttCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTGCCCGTTTGCCCGCCGGCTCGAAGCCATGCtt > 2:1859672/1‑150 (MQ=255) cGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTGCCCGTTTGCCCGCCGGCTCGAAGCCATGCTtgt < 1:2725958/150‑1 (MQ=255) gCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTGCCCGTTTGCCCGCCGGCTCGAAGCCATGCTtgtg > 1:5401041/1‑150 (MQ=255) gCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTGCCCGTTTGCCCGCCGGCTCGAAGCCATGCTtgtg < 1:4578475/150‑1 (MQ=255) cagcaCCGCACGCATGGGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTGCCCGTTTGCCCGCCGGCTCGAAGCCATGCTtgtg > 1:1037842/5‑150 (MQ=255) cagcaCCGCACGCATGGGTGCGGTACTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATg > 1:4494554/5‑82 (MQ=38) cagcaCCGCACGCATGGGTGCGGTACTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATg < 2:4494554/78‑1 (MQ=38) cATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTGCCCGTTTGCCCGCCGGCTCGAAGCCATGCTTGTgc > 1:6562/1‑150 (MQ=255) aTACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTGCCCGTTTGCCCGCCGGCTCGAAGCCATGCTTGTgcg > 1:629894/1‑150 (MQ=255) aCCGCACGCATGGGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTGCCCGTTTGCCCGCCGGCTCGAAGCCATGCTTGTGCGCa > 1:76233/1‑150 (MQ=255) aCCGCACGCATGGGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTGCCCGTTTGCCCGCCGGCTCGAAGCCATGCTTGTGCGCa > 1:2866846/1‑150 (MQ=255) cGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTGCCCGTTTGCCCGCCGGCTCGAAGCCATGCTTGTGCGCAgc > 1:4132103/1‑150 (MQ=255) cGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTGCCCGTTTGCCCGCCGGCTCGAAGCCATGCTTGTGCGCAgc > 2:3845201/1‑150 (MQ=255) gCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGTGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTGCCCGTTTGCCCGCCGGCTCGAAGCCATGCTTGTGCGCAgcg > 1:2972667/1‑150 (MQ=255) ccATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTGCCCGTTTGCCCGCCGGCTCGAAGCCATGCTTGTGCGCAGCGCCGa < 2:2827149/150‑1 (MQ=255) | CAGGGCGGCGGACAACGGCAGCTCTGCGCGGGTGCCCATGCCGACTGGGGACGCGTTGGCCACCAGGTCGAAGTCTTCCAGCCCACTGAACTGTGTGCTGACCGTAAGCCCGGGGAAGCCGTTGCCGAGCAGTTCGCATACCGCACCCATGCGTGCGGTGCTGGGGTCGCAGAGGGTTATGCTGGCGATCCCTGCCTCAGCCAGTGCATAGGCAATGGCACTGCCAACACCGCCGCAACCGATCACCAGTGCCCGTTTGCCCGCCGGCTCGAAGCCATGCTTGTGCGCAGCGCCGA > NC_002947/2987538‑2987833 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |