| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 3,029,302 | 0 | T | A | 5.5% | 992.1 / 29.7 | 292 | intergenic (+125/+29) | dapA‑II/PP_2640 | 4‑hydroxy‑tetrahydrodipicolinate synthase/GNAT family acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (138/138); new base A (11/5); total (149/143) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.99e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 304 total aligned reads displayed.
GTGCTGTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCTGGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGCTGATACACCAGCCCGGCAAACTCACCCACGTCGCCTGCCAGGGTGAAGCCGTAGCGTTGGTAGGCGGGTACAGAAGACAATGAT > NC_002947/3029154‑3029451 | gCTGTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCg > 2:1835953/1‑150 (MQ=255) gCTGTGTTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCg < 2:6289943/150‑1 (MQ=255) gtgtTCACTCGGCGCCTGAAGCGGCAACGGTTGATGGCGGGTTGACAAGCCGCCACACCCTTGGTTGGTTCGGGGTCGGCGGATGCCTCGCGAGCGGATTTCTGCCAGCAACGCGCTGAGACAGAGTATTGCCAGGGCCGCTTTGCGGcc > 2:1984394/1‑150 (MQ=255) 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2:2376564/97‑1 (MQ=255) ggCCGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCTGGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGCTGATACACCAGCCCGGCAAACTCACCCACGTCGCCTGCCAGGGTGAAGCCGTAGCGTTGGTAGGCGGGTACagaag > 1:537184/1‑150 (MQ=255) tccGCTTTGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCTGGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGCTGATACACCAGCCCGGCAAACTCACCCACGTCGCCTGCCAGGGTGAAGCCGTAGCGTTGGTAGGCGGGTACagaaga < 1:5530400/149‑1 (MQ=255) tttGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCTGGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGCTGATACACCAGCCCGGCAAACTCACCCACGTCGCCTGCCAGGGTGAAGCCGTAGCGTTGGTAGGCGGGTACAGAAGACAatg > 1:2531002/1‑150 (MQ=255) tttGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCTGGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGCTGATACACCAGCCCGGCAAACTCACCCACGTCGCCTGCCAGGGTGAAGCCGTAGCGTTGGTAGGCGGGTACAGAAGACAatg < 1:4962195/150‑1 (MQ=255) tttGCGGCCCTGTCGCGACCCCAGGTTGCTCCTACGCTGGCTGGGTCGGCAGGCGCTTTTCCATCGGCTGATACACCAGCCCGGCAAACTCACCCACGTCGCCTGCCAGGGTGAAGCCGTAGCGTTGGTAGGCGGGTACAGAAGACAatg < 1:6264562/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |