Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_002947 | 3,279,828 | T→A | 5.8% | H198Q (CAT→CAA) | eamA → | O‑acetylserine/cysteine export transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_002947 | 3,279,828 | 0 | T | A | 5.8% | 903.9 / 28.7 | 269 | H198Q (CAT→CAA) | eamA | O‑acetylserine/cysteine export transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (125/128); new base A (10/6); total (135/134) | |||||||||||
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Only 100 of 277 total aligned reads displayed.
GGCGGTGCGATGTGGGGCCTGGGCAACATCATTACCCGACGGTTCGGCTCGGTCGACCTGGTCGCGTTGGTGATCTGGGGTGGGCTGATACCGCCACTTCCATTCCTGGCACTGTCCTGGTGGCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGTTCGGTGCTGGCCCTGGCGTATTTGGCCTTTGTGGCCACCATGCTCGGCTACAGCCTGTGGAGCAAGTTGCTGTCGCGTCACCCGGCAGGCAAAGTGGCGCCGTTCTCGCTGCTGGTACCGGTGAT > NC_002947/3279679‑3279977 | ggCGGTGCGATGTGGGGCCTGGGCAACATCATTACCCGACGGTTCGGCTCGGTCGACCTGGTCGCGTTGGTGATCTGGGGTGGGCTGATACCGCCACTTCCATTCCTGGCACTGTCCTGGTGGCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCAt < 1:3950840/150‑1 (MQ=255) gggTGCGATGTGGGGCCTGGGCAACATCATTACCCGACGGTTCGGCTCGGTCGACCTGGTCGCGTTGGTGATCTGGGGTGGGCTGATACCGCCACTTCCATTCCTGGCACTGTCCTGGTGGCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGc < 1:5463123/149‑1 (MQ=255) gCGATGTGGGGCCTGGGCAACATCATTACCCGACGGTTCGGCTCGGTCGACCTGGTCGCGTTGGTGATCTGGGGTGGGCTGATACCGCCACTTCCATTCCTGGCACTGTCCTGGTGGCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTg < 1:4912415/150‑1 (MQ=255) 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2:1343555/1‑150 (MQ=255) gCCATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGTTCGGTGCTGGCCCTGGCGTATTTGGCCTTTGTGGCCACCATGCTCGGCTACAGCCTGTGGAGCAAGTTGCTGTCGCGTCACCCGGCAGGCAAAGTGGCGCCGTTCTCGCTGCTGGTACCgg > 1:1981246/1‑150 (MQ=255) gCCATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGTTCGGTGCTGGCCCTGGCGTATTTGGCCTTTGTGGCCACCATGCTCGGCTACAGCCTGTGGAGCAAGTTGCTGTCGCGTCACCCGGCAGGCAAAGTGGCGCCGTTCTCGCTGCTGGTACCgg > 1:5165119/1‑150 (MQ=255) ccATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGTTCGGTGCTGGCCCTGGCGTATTTGGCCTTTGTGGCCACCATGCTCGGCTACAGCCTGTGGAGCAAGTTGCTGTCGCGTCACCCGGCAGGCAAAGTGGCGCCGTTCTCGCTGCTGGTACCGGt < 2:1993375/150‑1 (MQ=255) cATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGTTCGGTGCTGGCCCTGGCGTATTTGGCCTTTGTGGCCACCATGCTCGGCTACAGCCTGTGGAGCAAGTTGCTGTCGCGTCACCCGGCAGGCAAAGTGGCGCCGTTCTCGCTGCTGGTCCCGGTg > 1:5796309/1‑150 (MQ=255) aTGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGTTCGGTGCTGGCCCTGGCGTATTTGGCCTTTGTGGCCACCATGCTCGGCTACAGCCTGTGGAGCACGTTGCTGTCGCGTCACCCGGCAGGCAAAGTGGCGCCGTTCTCGCTGCTGGTCCCGGTGa > 2:1022313/1‑150 (MQ=255) | GGCGGTGCGATGTGGGGCCTGGGCAACATCATTACCCGACGGTTCGGCTCGGTCGACCTGGTCGCGTTGGTGATCTGGGGTGGGCTGATACCGCCACTTCCATTCCTGGCACTGTCCTGGTGGCTGGAAGGCCCCGAGCGCATTGGCCATGCCTTGGCCAATATCAGTTGGAGTTCGGTGCTGGCCCTGGCGTATTTGGCCTTTGTGGCCACCATGCTCGGCTACAGCCTGTGGAGCAAGTTGCTGTCGCGTCACCCGGCAGGCAAAGTGGCGCCGTTCTCGCTGCTGGTACCGGTGAT > NC_002947/3279679‑3279977 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |