Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,673,491 | C→T | N117N (AAC→AAT) | prpD → | 2‑methylcitrate dehydratase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,673,491 | 0 | C | T | 99.7% | 1227.1 / NA | 330 | N117N (AAC→AAT) | prpD | 2‑methylcitrate dehydratase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (164/164); total (165/165) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 330 total aligned reads displayed.
ACGCTGGTCCCGAATGGTGCTCGCGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAACCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAGGGCGTGCTGGCGCTGGAAAACGCCTTCA > NC_002947/2673345‑2673636 | cGCTGGTCCCGAATGGTGCTCGCGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCtt > 1:3137907/1‑149 (MQ=255) cGCTGGTCCCGAATGGTGCTCGCGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCtt > 2:4193980/1‑149 (MQ=255) cGCTGGTCCCGAATGGTGCTCGCGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCtt > 1:2364993/1‑149 (MQ=255) gCTGGTCCCGAATGGTGCTCGCGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTg > 2:3202027/1‑149 (MQ=255) cTGGTCCCGAATGGTGCTCGCGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTgg < 2:574118/149‑1 (MQ=255) tGGTCCCGAATGGTGCTCGCGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTggc < 1:6485799/149‑1 (MQ=255) ggTCCCGAATGGTGCTCGCGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTggcg > 2:7892912/1‑149 (MQ=255) tCCCGAATGGTGCTCGCGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTggcggc > 2:3081528/1‑149 (MQ=255) tCCCGAATGGTGCTCGCGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTggcggc > 2:6762638/1‑149 (MQ=255) cGAATGGTGCTCGCGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATc > 1:288436/1‑149 (MQ=255) aaTGGTGCTCGCGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCt < 1:2239185/149‑1 (MQ=255) aTGGTGCTCGCGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTg > 2:4972711/1‑149 (MQ=255) tGCTCGCGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAg < 1:1703647/149‑1 (MQ=255) gCTCGCGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGt < 1:7688093/149‑1 (MQ=255) cTCGCGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTg < 1:3942949/149‑1 (MQ=255) tCGCGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTgg > 2:2195436/1‑149 (MQ=255) gcgTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCt > 2:453108/1‑149 (MQ=255) ccGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGaccac > 2:6222805/1‑149 (MQ=255) cGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGaccacc > 1:4250071/1‑149 (MQ=255) gCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTg < 2:6980061/149‑1 (MQ=255) tcctATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTcaca < 2:2934700/149‑1 (MQ=255) cctATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAg > 2:1733781/1‑149 (MQ=255) cctATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAg > 1:252681/1‑149 (MQ=255) cctATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAg < 1:4928940/149‑1 (MQ=255) aggcagCCTTGACCGGGTCGAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGa > 2:7647141/6‑149 (MQ=255) ggcagCCTTGACCGGGTCGAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGaa > 1:5376517/5‑149 (MQ=255) cagCCTTGACCGGGTCGAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAAc > 1:7592685/3‑149 (MQ=255) cGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACg < 2:87890/149‑1 (MQ=255) gCCTTGACCGGGTCGAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACgg > 2:2299391/1‑149 (MQ=255) ccTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACggg > 1:1229240/1‑149 (MQ=255) tCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGtt < 2:2135176/149‑1 (MQ=255) cccGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCcg > 2:2836038/1‑149 (MQ=255) cGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCcgcg < 1:1033009/149‑1 (MQ=255) cGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCcgcg > 2:5844305/1‑149 (MQ=255) gTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCggg < 2:5939700/149‑1 (MQ=255) cAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTg > 2:1304053/1‑149 (MQ=255) aGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGaa < 1:6660016/149‑1 (MQ=255) cTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAg > 2:3763348/1‑149 (MQ=255) ggACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCActgc < 2:7176832/149‑1 (MQ=255) ggACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCActgc > 1:2776348/1‑149 (MQ=255) ggACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCActgc > 1:934513/1‑149 (MQ=255) aCATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCActgctg < 2:4860927/149‑1 (MQ=255) cATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGa < 1:990700/149‑1 (MQ=255) cATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGa < 1:4834564/149‑1 (MQ=255) ttGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATg < 1:4677702/149‑1 (MQ=255) tGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGc < 1:5719755/149‑1 (MQ=255) tGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGc > 1:21351/1‑149 (MQ=255) tGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGc > 2:6339522/1‑149 (MQ=255) tGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGc > 2:5337219/1‑149 (MQ=255) ggCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCg < 1:8047689/149‑1 (MQ=255) ggCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCg < 1:5189358/149‑1 (MQ=255) gCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGt < 2:3137907/149‑1 (MQ=255) gCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGAt > 1:5860733/1‑149 (MQ=255) aCGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGAtgt < 2:4782348/149‑1 (MQ=255) cGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGAtgtg < 2:3910667/149‑1 (MQ=255) gTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCt < 1:7106588/149‑1 (MQ=255) gTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCt < 1:6937956/149‑1 (MQ=255) tGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTc > 2:2602103/1‑149 (MQ=255) 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tggctggACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGc > 2:3384487/1‑149 (MQ=255) ctggACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGAt > 2:8003807/1‑149 (MQ=255) ctggACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACCGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGag > 2:5979884/1‑148 (MQ=255) gACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGt < 2:2707557/149‑1 (MQ=255) cTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCa > 1:675390/1‑149 (MQ=255) 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tggctggcCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGAt > 1:3728596/1‑149 (MQ=255) tggcCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAg < 2:4303637/149‑1 (MQ=255) ggcCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAgg > 1:4601660/1‑149 (MQ=255) ccgccgAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAGGGc > 2:3956805/1‑149 (MQ=255) cgAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAGGGCGTGc > 2:7691160/1‑149 (MQ=255) cgAATGGGCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGGTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAGGGCGTGc > 2:6562076/1‑149 (MQ=255) ggCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAGGGCGTGCTGgcgc < 1:3181924/149‑1 (MQ=255) ggCTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAGGGCGTGCTGgcgc < 1:5013665/149‑1 (MQ=255) cTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAGGGCGTGCTGGCGCTg < 2:2364993/149‑1 (MQ=255) cTCATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAGGGCGTGCTGGCGCTg > 1:7416274/1‑149 (MQ=255) cATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAGGGCGTGCTGGCGCTGGa < 1:138891/149‑1 (MQ=255) cATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAGGGCGTGCTGGCGCTGGa > 1:7482358/1‑149 (MQ=255) cATCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAGGGCGTGCTGGCGCTGGa < 1:6002034/149‑1 (MQ=255) tCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAGGGCGTGCTGGCGCTGGaaa < 1:1768813/149‑1 (MQ=255) tCCCTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAGGGCGTGCTGGCGCTGGaaa > 2:354964/1‑149 (MQ=255) cccTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAGGGCGTGCTGGCGCTGGaaaa < 2:1395899/149‑1 (MQ=255) cTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAGGGCGTGCTGGCGCTGGAAAACg > 2:7144147/1‑149 (MQ=255) cTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAGGGCGTGCTGGCGCTGGAAAACg < 1:1257525/149‑1 (MQ=255) cTCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAGGGCGTGCTGGCGCTGGAAAACg < 2:1612502/149‑1 (MQ=255) tCGGACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAGGGCGTGCTGGCGCTGGAAAACGc > 1:1849824/1‑149 (MQ=255) gACAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAGGGCGTGCTGGCGCTGGAAAACGCCtt < 2:5196807/149‑1 (MQ=255) cAATCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAGGGCGTGCTGGCGCTGGAAAACGCCTTCa > 2:662472/1‑149 (MQ=255) | ACGCTGGTCCCGAATGGTGCTCGCGTCCCCGGCACCTCCTATCGCCTCGACCCGGTCAAGGCTGCCTGGGACATTGGCTGCACGGTGCGCTGGCTGGACTACAACGACACCTGGCTGGCCGCCGAATGGGCTCATCCCTCGGACAACCTTGGCGGCATCCTGGCAGTGGCTGACCACCTGTCACAGAAACGGGTTGCCGCGGGTGAAAAGCCACTGCTGATGCGTGATGTGCTCGAGGCGATGGTCATGGCGCATGAGATCCAGGGCGTGCTGGCGCTGGAAAACGCCTTCA > NC_002947/2673345‑2673636 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |