| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,866,172:1 | +A | 8.8% | intergenic (‑129/+108) | ligA ← / ← PP_4275 | DNA ligase/cell division protein ZipA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,866,172 | 1 | . | A | 8.8% | 1109.2 / 98.3 | 260 | intergenic (‑129/+108) | ligA/PP_4275 | DNA ligase/cell division protein ZipA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (147/90); new base A (7/16); total (154/106) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.43e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.42e-01 | |||||||||||
Only 100 of 268 total aligned reads displayed.
GATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGAC > NC_002947/4866023‑4866318 | gATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACACGCCCTAGGGc < 1:7072727/150‑1 (MQ=255) aTACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCAC‑CGCCCTAGGGcat < 1:1704752/150‑3 (MQ=255) cGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAAACCGCGCCCCCAAGGGCGTCACATGCCCAAGGGC‑gggg > 1:1031847/1‑148 (MQ=255) gggTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGa < 2:4867584/150‑1 (MQ=255) gggTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCGAGGGC‑GGGGa > 2:2747324/1‑150 (MQ=255) gggTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCCCTCCCACAAGGGCGTCACAATCCCAAGGGC‑GGTGa > 1:5959135/1‑150 (MQ=255) gTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATg < 1:4298392/150‑1 (MQ=255) gTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATg < 2:5517907/150‑1 (MQ=255) tttCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATTCCCTAGGGC‑GGTGATGt > 2:6294590/1‑150 (MQ=255) tttCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGt > 2:205704/1‑150 (MQ=255) tCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTAc < 1:969073/150‑1 (MQ=255) tCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTAc > 2:5756205/1‑150 (MQ=255) tCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTAc < 1:4000368/150‑1 (MQ=255) ggcggTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCt < 2:1421398/150‑1 (MQ=255) ggTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTa < 1:1494336/150‑1 (MQ=255) gTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAg < 1:7007279/150‑1 (MQ=255) gTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAg < 1:6584012/150‑1 (MQ=255) cATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGa < 1:3333289/150‑1 (MQ=255) cATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGa < 1:3610516/150‑1 (MQ=255) aTGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAg > 2:2375733/1‑150 (MQ=255) aTGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCCACAAGGGCGTCAAATTCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAg > 2:1870869/1‑150 (MQ=255) aTGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAAACCGCACCCACAAGGGCGTCACATGCCCAAGGGC‑GGTGGTGTACCAGTAGGAg > 1:6418128/1‑150 (MQ=255) tGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGc > 2:428701/1‑150 (MQ=255) gATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTACATCAC‑CGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGC‑ggg < 1:1146535/150‑1 (MQ=14) gATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTACATCAC‑CGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGC‑ggg < 1:4787146/150‑1 (MQ=14) gATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTACATCAC‑CGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGC‑ggg < 2:4443553/150‑1 (MQ=14) gATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTACATCAC‑CGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGC‑ggg < 1:6650193/150‑1 (MQ=14) gATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑ggg < 2:3069216/150‑1 (MQ=255) gATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑ggg < 2:5178975/150‑1 (MQ=255) aTTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTACATCAC‑CGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGC‑GGGt < 1:1669717/150‑1 (MQ=14) aTTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGGAGGAGC‑GGGt > 2:4801107/1‑150 (MQ=255) tttGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTACATCAC‑CGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGC‑GGGtt < 1:5216117/150‑1 (MQ=14) tcttctCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTAcc > 2:3592517/1‑150 (MQ=255) cttctCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAAACCCCGCCCACCAGGGCCTCACAAGCCCGAGGGC‑GGGGATGTACCGGTAGGAGC‑GGGTTTAacc > 1:5292847/1‑150 (MQ=255) ttctCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTACATCAC‑CGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGC‑GGGTTTACCcg < 1:5554980/150‑1 (MQ=14) ttctCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCcg < 1:2375733/150‑1 (MQ=255) ttctCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCAAGGGC‑GGTGATGTACCGGTAGGAGC‑GGGTTTACCcg > 1:4902387/1‑150 (MQ=255) tctcTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCcgc < 2:5304698/150‑1 (MQ=255) tctcTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCCCGCCCACAAGGGCCGCACAGGCCCGACGGC‑GGTGGTGTACCGGGAGGGGC‑GGGTTTACCcgc > 1:2247005/1‑150 (MQ=255) gcaaagcaaaAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACCAGGGCGTCACAAGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAagag > 2:3730663/1‑150 (MQ=255) gcaaaCGAGCTGCTTGGGGTGGTGGGTGGGGTTCCTGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACACGGGCGTCACATGCCCTTGGGG‑GGTGTTGTACGTGTTGGAGG‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCgg < 2:1080475/150‑1 (MQ=37) aaaaGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGca > 2:3875432/1‑150 (MQ=255) aaaaGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAAACCCCGCCCCCAAAGGCGGCACAAGCCCAACGGG‑GGTGGTGGACCGGGAGGGGC‑GGGGTTACCCGCGGAGAAGCCGGcc > 1:5718216/1‑149 (MQ=255) aaaGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGGGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGccc > 2:6374150/1‑148 (MQ=255) agagCAGGTTGGGGTGGGGGGGGGGGTCCCTGGTGTCTGTTGCCGGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCGCCCACACGGGCGTCACATGCCCTTGGGG‑GGTGATGTACCTGTAGGAGG‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAg < 2:5277816/150‑1 (MQ=25) gttGGGGTGGTGGGGGGGGTTCCCGGTGTCTGTTGATTGTGCCCGCCTCTGCGGGGGTAAACCCGCGCCCACCGGGGCGTCACAGGCCCTTGGGC‑GGTTTTGTACGTGTTGGCGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAacga < 2:2230924/149‑1 (MQ=25) ggggTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTGAACCCCCGCCCCCAACGGCGGCACCAGCCCCAAGGC‑GGGGGTGTAACGGTAGGAGCGGGGTTTACCC‑CGAACAGGCCGGCCCACGCcaccaccc > 1:1879935/1‑148 (MQ=255) gTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTTAACCCGCTCCCACAAGGGCGGCCCCTGCCCGAGGGG‑GGTGTTGTACCTGGTGGTGC‑GGGGTTACCCGCGACGAGGCCGGCACACGCAACGACGATACCCGAAcc > 1:7259492/1‑150 (MQ=255) gggTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCGAGGGC‑GGTGATGTACCGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCCACGACGCTACCCGAACCGGc > 2:4714206/1‑150 (MQ=255) ttCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCCCGGGTAAAACCCCACCCACAACTCCGTAACATGCCCGAGGCC‑CGTGATGTACATCTAGGACC‑CGGGTTACCCGCGCATAGGCCGCCACAGGCAACCACCATACACCAACCGccccc > 2:1938311/1‑148 (MQ=255) cAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAAACCCCTCCCACAAGGGCGTCACAAGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTGGGAGC‑GGGTTTACCCGCGGAGAGGCCGGCCCAGGCAACGACGAAACCCCAACCGGCCAGCAc > 2:3353106/1‑150 (MQ=37) tggTGTGTGTTGACTGTGCCCGCCTCTTCGGGGTTAACCCCGCTCCCACAGGGGCGTCACTTGCCCTTGGGG‑GTTGTTGTCCGTTTCGGTGG‑GGGTTAACCCGCGAAGCGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACg < 2:6339936/149‑1 (MQ=255) tgtCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCCCTCCCACAAGGGCGTCACAAGCCCGAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGGAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATAACCGAACCGGCCAGCACGccc > 2:71337/1‑150 (MQ=38) tCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTc > 2:6590951/1‑150 (MQ=255) cgggtgCCCGCCTCTGCGCGGGTAACCCCGCCCCCCCCCGGGCGTCACTTGCCCTCGGGC‑GGGGTTGTCCGTGTTGGCGG‑GGGTTAACCCGCGAAGTGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGgctgc < 2:2852356/147‑1 (MQ=255) tgtgCCAGCCTCTTCGCGGGTAAAACCCCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGGGATGTACCGGTTGGAGC‑GGGTTTACCCGCGCAGAGGCCGGCACCGGCACCGCCGATACCCGAACCGGCCACCACGCCCGCAGGCTGctc > 2:5692651/1‑150 (MQ=255) tgCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCCCTCCCACAAGGGCGTCCCATGCCCGAGGGC‑GGGGCGGTCCCGGTAGGAGC‑GGGTGTACCCGCGAAGAGGCCGGCACCGGCAACGCCGATACCCGAACCGGCCCGCACCCCCTCCGGCTGctcgt > 2:5938982/1‑148 (MQ=255) cccgCCTCTTCGGGGGTAAACCCGCTCCCACACGGGCGTCACATGCCCTTGGGC‑GGTGATGTACCTGTTGGAGG‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCGCAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCtttt < 2:3028847/147‑2 (MQ=38) ccTCTTCGCGGTTAACCCCGCCCCCACCCGGGCGCCAATTGCCCTTGGGG‑GTTTTTGTCCGTGTCGGCGG‑GGTTTTACCCGCGATGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCt < 2:166951/150‑1 (MQ=255) ctctTCGGGGGAAACCCCGCCCCCACACGGGGGGCACAGGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTg < 2:5874291/150‑1 (MQ=38) actccgcgGTAAACCCCGCCCCCCCAGGGGCGTCCCAGCCCCTCGGGG‑GGTGTTGCCCGGGTCGGCGG‑GGTTTAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTgg < 2:4997508/146‑1 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGAt > 2:7336640/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGAt > 2:5289807/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATACCCTAGGGC‑GGTGATGTACCGGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGCAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTGTCGTCTGGag > 2:4167501/1‑149 (MQ=255) cgcgGGAAACCCCGCCCCCACAGGGGCGCCACCGGCCCTTGGGG‑GGTGTTGTACCTTTAGGCGC‑GGTTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCt < 1:7410437/150‑1 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTg > 2:6780000/1‑150 (MQ=255) gggTAACCCCGCTCCCACACGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTc < 2:1131271/150‑1 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACAGGTACATCAC‑CGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTc > 2:3634070/1‑150 (MQ=14) ggTAAACCCGCTCCTACAGGTACATCAC‑CGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCa > 2:300628/1‑150 (MQ=14) ggTAAACCCGCTACTACAGGTACATCAC‑CGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCa > 2:4370010/1‑150 (MQ=14) tAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAgc > 1:6605232/1‑150 (MQ=255) tAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACAAGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAgc > 1:276808/1‑150 (MQ=255) aaCCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAgcgc > 2:516368/1‑150 (MQ=255) aCCCGCTCCTACAGGTACATCAC‑CGCCCTAGGGCATGTGACGCCCTTGTGGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCt > 1:7340888/1‑150 (MQ=14) aCCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCt > 2:2453194/1‑150 (MQ=255) aCCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCt > 1:5250920/1‑150 (MQ=255) aCCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCt > 2:4058033/1‑150 (MQ=255) aCCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGACACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCt > 1:29911/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCtt > 2:2361891/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCtt > 2:6469212/1‑150 (MQ=255) cccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCtt > 2:5361791/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCTGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTc > 1:5637918/1‑129 (MQ=255) ccGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTc > 1:4222071/1‑150 (MQ=255) ccACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGtt > 1:3204002/1‑150 (MQ=255) ccACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGtt > 1:6125149/1‑150 (MQ=255) acaAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAg > 1:1425537/1‑150 (MQ=255) acaAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAg > 1:3759033/1‑150 (MQ=255) acaAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAg > 1:5452531/1‑150 (MQ=255) acaAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAg > 2:4383834/1‑150 (MQ=255) acaAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAg > 1:5582922/1‑150 (MQ=255) acaTGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCt > 2:5556070/1‑150 (MQ=255) acaTGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCt > 1:1252258/1‑150 (MQ=255) caTGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCt > 2:6195709/1‑119 (MQ=255) aTGCCCTTGGGG‑GTTGTTTTACCTGTTGGTGG‑GGTTTTACCCGCGATGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCGGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCg < 2:1339413/150‑1 (MQ=255) aTGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCg > 1:1825338/1‑150 (MQ=255) tGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGa > 1:4109178/1‑150 (MQ=255) ggCCCTCGGGC‑GGTGTTGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGa < 2:4902387/149‑1 (MQ=255) cTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTc > 2:4610667/1‑150 (MQ=255) tAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTcg > 2:6918372/1‑150 (MQ=255) tAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTcg > 2:1567507/1‑150 (MQ=255) | GATACGGGTTTCGGCGGTCATGGGATTTGTCTTCTCTTGCAAAGCAAAAGAGCAGCTTGGGGTGGTGCGTGGGGTTCCAGGTGTCTGTTGACTGTGCCAGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAAGGGCGTCACATGCCCTAGGGC‑GGTGATGTACCTGTAGGAGC‑GGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGACGATACCCGAACCGGCCAGCACGCCCTCAGGCTGCTCTTTCGTCTGGATCTGTCAGCGCTTCTGGGTTAGCGCACGGCGCTCGAACTCGAC > NC_002947/4866023‑4866318 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |