| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 356668 = | 333 (1.050) | 19 (0.090) +CAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCC |
6/176 | NT | 10.8% | coding (10/1377 nt) | tdcG‑I | L‑serine dehydratase |
| ? | NC_002947 | = 1131611 | 151 (0.480) | intergenic (‑111/+39) | tdcG‑II/gcvP‑I | L‑serine dehydratase/glycine dehydrogenase | |||||
CCGACGGTGTGGGAGCTGGAGGGCCCGACACCGATCTTGAACAGGTCGAACACGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/356723‑356668‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGG < NC_002947/1131611‑1131557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCG < 1:5237502/150‑1CCGACCGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCG < 1:5237201/150‑1 ccGTGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATT < 1:5209246/148‑1 TGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGC < 1:1885870/150‑1 TGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGC < 2:814285/150‑1 TGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGC < 2:2676330/150‑1 TGTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGC < 1:3322728/150‑1 GTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCG < 2:2710698/150‑1 GTGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCG < 2:1011704/150‑1 ttGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTTGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGAGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGG < 2:231646/148‑1 TGGGAGCTGGAGGGGCCGCTGCCGCTCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGG < 2:6320972/150‑1 TGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGG < 1:4167363/150‑1 TGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGG < 1:5444005/150‑1 TGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGG < 1:4167572/150‑1 TGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGG < 1:3022648/150‑1 TGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGTGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGG < 1:3022711/150‑1 TGGGAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGG < 1:1472201/150‑1 GAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGG < 1:976582/147‑1 GAGCTGGAGGGGCCGATGCCGATCTTGAACAGGTCGAAGACGCTCAGTGACATGTGGACCTCCTGCCAGGTTGTTGGGTGGACATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGG > 2:976582/1‑147 ATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCC < 2:2619554/54‑1 ATTGAGCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCC > 1:2619554/1‑54 GCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCA < 1:3127686/52‑1 GCCCTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCA > 2:3127686/1‑52 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CCGACGGTGTGGGAGCTGGAGGGCCCGACACCGATCTTGAACAGGTCGAACACGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/356723‑356668‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGATGGTGGCTATACCTCCGCATTCGCGG < NC_002947/1131611‑1131557 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |