| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 4136103 | 314 (0.990) | 35 (0.120) | 10/252 | NT | 10.3% | intergenic (+22/+90) | PP_3634/PP_3635 | GNAT family acetyltransferase/sulfonate ABC transporter permease |
| ? | NC_002947 | = 4136165 | 319 (1.080) | intergenic (+84/+28) | PP_3634/PP_3635 | GNAT family acetyltransferase/sulfonate ABC transporter permease | |||||
TGCAGATTCACACCTATCTGCTTAACCAGCAGGGTGAGGATGCAATGATCGAAGCGGAGCAGATGCGCGATGAGCGGCTGGATGAGCTGACCGCTCAAGCCCAGGAATGTGTGCGCCAGCGCAAGAACGTGCATTGATCCGAT‑‑GGCCTGTTCGCGGGCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/4135945‑4136103‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttcgcgggctCGCCCGCTCCCACAGGTACATCACCGGCCTTGGGCCTTACGGTATTCCTGTGGGCGCGGGCAAGCCCGCGAACAGGCCATCGGATCAATGCACGTTCTTGCGCTGGCGCACACATTCCTGGGCTTGAGCGGTCAGCTCATCCAGCCGCT < NC_002947/4136165‑4136017 TGCAGATTCACACCTATCTGCTTAACCAGCAGGGTGAGGATGCAATGATCGAAGCGGAGCAGATGCGCGATGAGCGGCTGGATGAGCTGACCGCTCAAGCCCAGGAATGTGTGCGCCAGCGCAAGAACGTGCATTGATCCGAT‑‑GGCCTGT > 1:92856/1‑150TGCAGATTCACACCTATCTGCTTAACCAGCAGGGTGAGGATGCAATGATCGAAGCGGAGCAGATGCGCGATGAGCGGCTGGATGAGCTGACCGCTCAAGCCCAGGAATGTGTGCGCCAGCGCAAGAACGTGCATTGATCCGAT‑‑GGCCTGT > 2:2305084/1‑150TGCAGATTCACACCTATCTGCTTAACCAGCAGGGTGAGGATGCAATGATCGAAGCGGAGCAGATGCGCGATGAGCGGCTGGATGAGCTGACCGCTCAAGCCCAGGAATGTGTGCGCCAGCGCAAGAACGTGCATTGATCCGAT‑‑GGCCTGT > 1:3806064/1‑150TGCAGATTCACACCTATCTGCTTAACCAGCAGGGTGAGGATGCAATGATCGAAGCGGAGCAGATGCGCGATGAGCGGCTGGATGAGCTGACCGCTCAAGCCCAGGAATGTGTGCGCCAGCGCAAGAACGTGCATTGATCCGAT‑‑GGCCTGT > 2:7176872/1‑150TGCAGATTCACACCTATCTGCTTAACCAGCAGGGTGAGGATGCAATGATCGAAGCGGAGCAGATGCGCGATGAGCGGCTGGATGAGCTGACCGCTCAAGCCCAGGAATGTGTGCGCCAGCGCAAGAACGTGCATTGATCCGAT‑‑GGCCTGT > 1:88673/1‑150 GCAGATTCACACCTATCTGCTTAACCAGCAGGGTGAGGATGCAATGATCGAAGCGGAGCAGATGCGCGATGAGCGGCTGGATGAGCTGACCGCTCAAGCCCAGGAATGTGTGCGCCAGCGCAAGAACGTGCATTGATCCGAT‑‑GGCCTGTT > 2:4854928/1‑150 GCAGATTCACACCTATCTGCTTAACAAGCAGGGTGAGGATGCAATGATCGAAGAGGAGCAGATGCGCGATGAGCGGCTGGATGAGCTGAACGCTCAAGCCCAGGAATGTGTGCGCCAGCGCAAGAACGTGCATTGATCCGAT‑‑GGCGTGTT > 2:4782014/1‑150 CAGATTCACACCTATCTGCTTAACCAGCAGGGTGAGGATGCAATGATCGAAGCGGAGCAGATGCGCGATGAGCGGCTGGATGAGCTGACCGCTCAAGCCCAGGAATGTGTGCGCCAGCGCAAGAACGTGCATTGATCCGAT‑‑GGCCTGTTC < 1:2895801/150‑1 CAGATTCACACCTATCTGCTTAACCAGCAGGGTGAGGATGCAATGATCGAAGCGGAGCAGATGCGCGATGAGCGGCTGGATGAGCTGACCGCTCAAGCCCAGGAATGTGTGCGCCAGCGCAAGAACGTGCATTGATCCGAT‑‑GGCCTGTTC > 2:1222502/1‑150 CAGATTCACACCTATCTGCTTAACCAGCAGGGTGAGGATGCAATGATCGAAGCGGAGCAGATGCGCGATGAGCGGCTGGATGAGCTGACCGCTCAAGCCCAGGAATGTGTGCGCCAGCGCAAGAACGTGCATTGATCCGAT‑‑GGCCTGTTC > 2:2446329/1‑150 AGATTCACACCTATCTGCTTAACCAGCAGGGTGAGGATGCAATGATCGAAGCGGAGCAGATGCGCGATGAGCGGCTGGATGAGCTGACCGCTCAAGCCCAGGAATGTGTGCGCCAGCGCAAGAACGTGCATTGATCCGAT‑‑GGCCTGTTCG > 2:7352044/1‑150 AGATTCACACCTATCTGCTTAACCAGCAGGGTGAGGATGCAATGATCGAAGCGGAGCAGATGCGCGATGAGCGGCTGGATGAGCTGACCGCTCAAGCCCAGGAATGTGTGCGCCAGCGCAAGAACGTGCATTGATCCGAT‑‑GGCCTGTTCG > 1:3566269/1‑150 GATTCACACCTATCTGCTTAACCAGCAGGGTGAGGATGCAATGATCGAAGCGGAGCAGATGCGCGATGAGCGGCTGGATGAGCTGACCGCTCAAGCCCAGGAATGTGTGCGCCAGCGCAAGAACGTGCATTGATCCGAT‑‑GGCCTGTTCGC < 2:339742/150‑1 ATTCACACCTATCTGCTTAACCAGCAGGGTGAGGATGCAATGATCGAAGCGGAGCAGATGCGCGATGAGCGGCTGGATGAGCTGACCGCTCAAGCCCAGGAATGTGTGCGCCAGCGCAAGAACGTGCATTGATCCGAT‑‑GGCCTGTTCGCG > 2:4666925/1‑150 TTCACGCCTATCTGCTTAACCAGCAGGGTGAGGATGCAATGATCGAAGCGGAGCAGATGCGCGATGAGCGGCTGGATGAGCTGACCGCTCAAGCCCAGGAATGTGTGCGCCAGCGCAAGAACGTGCATTGATCCGAT‑‑GGCCTGTTCGCGG < 2:2198924/150‑1 TTCACACCTATCTGCTTAACCAGCAGTGTGAGGATTCAATGATCGAAGCGGAGCAGATGCGCGATGAGCGGCTGGATGAGCTGACCGCTCAAGCCCAGGAATGTGTGCGCCAGCGCAAGAACGTGCATTGATCCGAT‑‑TGCCTGTTCGCGG < 2:987107/150‑1 TTCACACCTATCTGCTTAACCAGCAGGGTGAGGATGCAATGATCGAAGCGGAGCAGATGCGCGATGAGCGGCTGGATGAGCTGACCGCTCAAGCCCAGGAATGTGTGCGCCAGCGCAAGAACGTGCATTGATCCGAT‑‑GGCCTGTTCGCGG < 1:743353/150‑1 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TCACACCTATCTGCTTAACCAGCAGGGTGAGGATGCAATGATCGAAGCGGAGCAGATGCGCGATGAGCGGCTGGATGAGCTGACCGCTCAAGCCCAGGAATGTGTGCGCCAGCGCAAGAACGTGCATTGATCCGAT‑‑GGCCTGTTCGCGGG > 1:1316862/1‑150 CACACCTATCTGCTTAACCAGCAGGGTGAGGATGCAATGATCGAAGCGGAGCAGATGCGCGATGAGCGGCTGGATGAGCTGACCGCTCAAGCCCAGGAATGTGTGCGCCAGCGCAAGAACGTGCATTGATCCGAT‑‑GGCCTGTTCGCGGGC > 2:1275290/1‑150 CACACCTATCTGCTTAACCAGCAGGGTGAGGATGCAATGATCGAAGCGGAGCAGATGCGCGATGAGCGGCTGGATGAGCTGACCGCTCAAGCCCAGGAATGTGTGCGCCAGCGCAAGAACGTGCATTGATCCGAT‑‑GGCCTGTTCGCGGGC > 2:1275291/1‑150 ACACCTATCTGCTTAACCAGCAGGGTGAGGATGCAATGATCGAAGCGGAGCAGATGCGCGATGAGCGGCTGGATGAGCTGACCGCTCAAGCCCAGGAATGTGTGCGCCAGCGCAAGAACGTGCATTGATCCGAT‑‑GGCCTGTTCGCGGGCT < 1:2453748/150‑1 ACACCTATCTGCTTAACCAGCAGGGTGAGGATGCAATGATCGAAGCGGAGCAGATGCGCGATGAGCGGCTGGATGAGCTGACCGCTCAAGCCCAGGAATGTGTGCGCCAGCGCAAGAACGTGCATTGATCCGAT‑‑GGCCTGTTCGCGGGCT > 1:5489755/1‑150 ACACCTATCTGCTTAACCAGCAGGGTGAGGATGCAATGATCGAAGCGGAGCAGATGCGCGATGAGCGGCTGGATGAGCTGACCGCTCAAGCCCAGGAATGTGTGCGCCAGCGCAAGAACGTGCATTGATCCGAT‑‑GGCCTGTTCGCGGCCT < 2:4775746/150‑1 TGCAATGATCGAAGCGGAGCAGATGCGCGATGAGCGGCTGGATGAGCTGACCGCTCAAGCCCAGGAATGTGTGCGCCAGCGCAAGAACGTGCATTGATCCGAT‑‑GGCCTGTTCGCGGGCTCGC > 1:4882057/1‑122 TGCAATGATCGAAGCGGAGCAGATGCGCGATGAGCGGCTGGATGAGCTGACCGCTCAAGCCCAGGAATGTGTGCGCCAGCGCAAGAACGTGCATTGATCCGAT‑‑GGCCTGTTCGCGGGCTCGC < 2:4882057/122‑1 CAATGATCGCCGCGGAGCAGATGCGCGATGCGCGGCTGGATGAGCTGACCGCTCAAGCCCAGGATTGTGGGCGCCAGCGCAAGAACGTGCATTGATCCTAT‑‑GGCCTGTTCGCGGGCTTGCCCGCGCCCACAGGTACATCACCGGCCTTGG < 1:4503598/150‑1 AGCAGATGCGCGATGAGCGGCTGGATGAGCTGACCGCTCAAGCCCAGGAATGTGTGCGCCAGCGCAAGAACGTGCATTGATCCGAT‑‑GGCTTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGTACATCACCGGCCTTGGGCCTTACGGTATTCC < 1:5860272/150‑1 GCAGATGCGCGATGAGCGGCTGGATGAGCTGACCGCTCAAGCCCATGAATGTGTGCGCCAGCGCAAGAACGTGCATTGATCCGAT‑‑GGCCTGTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGTACATCACCGGCCTTGGGCCTTACGGTATTCCT < 2:2706018/150‑1 GCAGATGCGCGATGAGCGGCTGGATGAGCTGACCGCTCAAGCCCAGGAATGTGTGCGCCAGCGCAAGAACGTGCATTGATCCGAT‑‑GGCTTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGTACATCACCGGCCTTGGGCCTTACGGTATTCCT < 2:261961/150‑1 GCAGATGCGCGATGAGCGGCTGGATGAGCTGACCGCTCAAGCCCAGGAATGTGTGCGCCAGCGCAAGAACGTGCATTGATCCGAT‑‑GGCCTGTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACATCACCGGCCTTGGGCCTTACGGTATTCCT < 2:678967/150‑1 GCAGATGCGCGATGAGCGGCTGGATGAGCTGACCGCTCAAGCCCAGGAATGTGTGCGCCAGCGCAAGAACGTGCATTGATCCGAT‑‑GGCCTGTTCGCGGGCTTGCCCGCGCCCACAGGTACATCACCGGCCTTGGGCCTTACGGTATTCCT < 2:7254362/150‑1 GCAGATGCGCGATGAGCGGCTGGATGAGCTGACCGCTCAAGCCCAGGAATGTGTGCGCCAGCGCAAGAACGTGCATTGATCCGAT‑‑GGCCTGTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGTACATCACCGGCCTTGGGCCTTACGGTATTCCT < 2:5478826/150‑1 GCAGATGCGCGATGAGCGGCTGGATGAGCTGACCGCTCAAGCCCAGGAATGTGTGCGCCAGCGCAAGAACGTGCATTGATCCGAT‑‑GGCCTGTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGTACATCACCGGCCTTGGGCCTTACGGTATTCCT < 2:1565240/150‑1 GCAGATGCGCGATGAGCGGCTGGATGAGCTGACCGCTCAAGCCCAGGAATGTGTGCGCCAGCGCAAGAACGTGCATTGATCCGAT‑‑GGCCTGTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGTACATCACCGGCCTTGGGCCTTACGGTATTCCT < 2:5478768/150‑1 GCAGATGCGCGATGAGCGGCTGGATGAGCTGACCGCTCAAGCCCAGGAATGTGTGCGCCAGCGCAAGAACGTGCATTGATCCGAT‑‑GGCCTGTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGTACATCACCGGCCTTGGGCCTTACGGTATTCCT < 2:5478644/150‑1 AGATGCGCGATGAGCGGCTGGATGAGCTGACCGCTCAAGCCCAGGAATGTGTGCGCCAGCGCAAGAACGTGCATTGATCCGAT‑‑GGCCTGTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGTACATCACCGGCCTTGGGCCTTACGGTATTCCTGT < 1:938263/150‑1 tgGCGCGATGAGCGGGTGTTTGAGCTGACCGCTCAAGCCCAGTATTGTGTGCGCCAGCGAAAGAACGTGATTTGTTCGGAG‑‑GGCCTGTTCGGGGGCTGGCCCGCGCCCACAGGTACATCACCGGCCTTGGGCCTTACGGTATTCCTGTGG < 1:144765/148‑1 ATGCGCGATGAGCGGCTGGATGAGCTGACCGCTCAAGCCCAGGAATGTGTGCGCCAGCGCAAGAACGTGCATTGATCCGAT‑‑GGCCTGTTCGCGGGCTTGCCCGCGCCCACAGGTACATCACCGGCCTTGGGCCTTACGGTATTCCTGTGG < 2:2572181/150‑1 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GATGAGCTGACCGCTCAAGCCCAGGAATGTGTGCGCCAGCGCAAGAACGTGCATTGATCCGAT‑‑GGCCTGTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGTACATCACCGGCCTTGGGCCTTACGGTATTCCTGTGGGCGCGGGCTTGCCCGCGc < 1:1026909/150‑2 GAGCTGACCGCTCAAGCCCAGGAATGTGTGCGCCAGCGCAAGAACGTGCATTGATCCGAG‑‑GGCCTGTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGTACATCACCGGCCTTGGGCCTTACGGTATTCCTGTGGGCGCGGGCAAGCCCGCGAACA < 2:6548603/150‑1 AGCTGACCGCTCAAGCCCAGGAATGTGTGCGCCAGCGCAAGAACGTGCATTGATCCGAT‑‑GGCTTCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGTACATCACCGGCCTTGGGCCTTACGGTATTCCTGTGGGCGCGGGCAAGCCCGCGAACAG < 1:3333747/150‑1 CAGGAATGTGTGCGCCAGCGCAAGAACGTGCATTGATCCGAT‑‑GGCCTGTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACATCACCGGCCTTGGGCCTTACGGTATTCCTGTGGGCGCGG > 1:515297/1‑117 CAGGAATGTGTGCGCCAGCGCAAGAACGTGCATTGATCCGAT‑‑GGCCTGTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGTACATCACCGGCCTTGGGCCTTACGGTATTCCTGTGGGCGCGG < 2:515297/117‑1 CCAGCGCAAGAACGTGCATTGATCCGAT‑‑GGCCTGTTCGCGGGCTTGCCCGCGCCCACAGGTACATCACCGGCCTTGGGCCTTACGGTATTCCTGTGGGCGCG < 2:4734547/102‑1 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NC_002947/4135945‑4136103‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttcgcgggctCGCCCGCTCCCACAGGTACATCACCGGCCTTGGGCCTTACGGTATTCCTGTGGGCGCGGGCAAGCCCGCGAACAGGCCATCGGATCAATGCACGTTCTTGCGCTGGCGCACACATTCCTGGGCTTGAGCGGTCAGCTCATCCAGCCGCT < NC_002947/4136165‑4136017 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |