New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | = 6005971 | 67 (0.270) | intergenic (+73/+36) | PP_5256/amaA | cyclic nucleotide‑binding protein/L‑pipecolate oxidase |
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
CTGTTTGCAGCAGCGTGGCGAAGTGCAGACGGCGTTGAGCAAATTGCAGCGGTTCCGGCGGCAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/6005760‑6005937 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcctcttcgcgggtaaacccgctcctacaGGTTCACCACAGCCCTCTCAGGCGGTGCACTACTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTCACTTGTGCAACCAACTCAGGAAGCCACCCTTCTTGATTGAAGCCGGCTTCTGCAACAACAACGACTCCCGGCTC < NC_002947/6005971‑6005823 TGTTTGCAGCAGCGTGGCGAAGTGCAGACGGCGTTGAGCAAATTGCAGCGGTTCCGGCGGCAGATCCTGTAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGC < 2:5129475/150‑1 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1:3492207/150‑1 cCCCGCTCCTACCGGTTCACCACAGCCCTCTCAGGCGGTGCACTCCTTGTTGGAGGGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTCACTTGTGCAACCAACTCAGGAAGCCACCCTTCTTGATTGAAGCCGGCTTCTGCAACAACAAC < 2:1353953/149‑1 ACCCGCTCCTACAGGTTCACCACAGCCCTCTCAGGCGGTGCACTACTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTCACTTGTGCAACCAACTCAGGAAGCCACCCTTCTTGATTGAAGCCGGCTTCTGCAACAACAAC > 2:2477671/1‑150 CCCGCTCCTACAGGTTCACCACAGCCCTCTCAGGCGGTGCACTACTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTCACTTGTGCAACCAACTCAGGAAGCCACCCTTCTTGATTGAAGCCGGCTTCTGCAACAACAACG > 2:6252848/1‑150 CCCGCTCCTACAGGTTCACCACAGCCCTCTCAGGCGGTGCACTACTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTCACTTGTGCAACCAACTCAGGAAGCCACCCTTCTTGATTGAAGCCGGCTTCTGCAACAACAACG > 1:5089498/1‑150 CCCGCTCCTACAGGTTCACCACAGCCCTCTCAGGCGGTGCACTACTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTCACTTGTGCAACCAACTCAGGAAGCCACCCTTCTTGATTGAAGCCGGCTTCTGCAACAACAACG > 1:628769/1‑150 CCGCTCCTACAGGTTCACCACAGCCCTCTCAGGCGGTGCACTACTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTCACTTGTGCAACCAACTCAGGAAGCCACCCTTCTTGATTGAAGCCGGCTTCTGCAACAACAACGA > 1:6015028/1‑150 CCGCTCCTACAGGTTCACCACAGCCCTCTCAGGCGGTGCACTACTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTCACTTGTGCAACCAACTCAGGAAGCCACCCTTCTTGATTGAAGCCGGCTTCTGCAACAACAACGA > 1:5792583/1‑150 CCGCTCCTACAGGTTCACCACAGCCCTCTCAGGCGGTGCACTACTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTCACTTGTGCAACCAACTCAGGAAGCCACCCTTCTTGATTGAAGCCGGCTTCTGCAACAACAACGA > 1:7112871/1‑150 GCTCCTACAGGTTCACCACAGCCCTCTCAGGCGGTGCACTACTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTCACTTGTGCAACCAACTCAGGAAGCCACCCTTCTTGATTGAAGCCGGCTTCTGCAACAACAACGACT > 1:2887937/1‑150 GCTCCTACAGGTTCACCACAGCCCTCTCAGGCGGTGCACTACTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTCACTTGTGCAACCAACTCAGGAAGCCACCCTTCTTGATTGAAGCCGGCTTCTGCAACAACAACGACT > 1:2887060/1‑150 GCTCCTACAGGTTCACCACAGCCCTCTCAGGCGGTGCACTACTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTCACTTGTGCAACCAACTCAGGAAGCCACCCTTCTTGATTGAAGCCGGCTTCTGCAACAACAACGACT > 2:2929383/1‑150 GCTCCTACAGGTTCACCACAGCCCTCTCAGGCGGTGCACTACTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTCACTTGTGCAACCAACTCAGGAAGCCACCCTTCTTGATTGAAGCCGGCTTCTGCAACAACAACGACT > 2:767718/1‑150 GCTCCTACAGGTTCACCACAGCCCTCTCAGGCGGTGCACTACTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTCACTTGTGCAAC < 2:5254116/95‑1 GCTCCTACAGGTTCACCACAGCCCTCTCAGGCGGTGCACTACTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTCACTTGTGCAAC > 1:5254116/1‑95 TCCTACAGGTTCACCACAGCCCTCTCAGGCGGTGCACTACTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTCACTTGTGCAACCAACTCAGGAAGCCACCCTTCTTGATTGAAGCCGGCTTCTGCAACAACAACGACTCC > 1:1943390/1‑150 TACAGGTTCACCACAGCCCTCTCAGGCGGTGCACTACTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTCACTTGTGCAACCAACTCAGGAAGCCACCCTTCTTGATTGAAGCCGGCTTCTGCAACAACAACGACTCCCGG > 2:6559040/1‑150 TACAGGTTCACCACAGCCCTCTCAGGCGGTGCACTACTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTCACTTGTGCAACCAACTCAGGAAGCCACCCTTCTTGATTGAAGCCGGCTTCTGCAACAACAACGACTCCCGG > 2:6955018/1‑150 TACAGGTTCACCACAGCCCTCTCAGGCGGTGCACTACTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTCACTTGTGCAACCAACTCAGGAAGCCACCCTTCTTGATTGAAGCCGGCTTCTGCAACAACAACGACTCCCGG > 1:1574138/1‑150 TACAGGTTCACCACAGCCCTCTCAGGCGGTGCACTACTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTCACTTGTGCAACCAACTCAGGAAGCCACCCTTCGTGATTGAAGCCGGCTTCTGCAACAACAACGACTCCCGG > 2:6286569/1‑150 TACAGGTTCACCACAGCCCTCTCAGGCGGTGCACTACTTGTAGGAGCGAGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTCACTTGTGCAACCAACTCAGGAAGCCACCCTGCTTGATTGAAGCCGGCTTCTGCAACAACAACGACTCCCGG > 2:4350468/1‑150 ACAGGTTCACCACAGCCCTCTCAGGCGGTGCACTACTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTCACTTGTGCAACCAACTCAGGAAGCCACCCTTCTTGATTGAAGCCGGCTTCTGCAACAACAACGACTCCCGGC > 2:6165876/1‑150 ACAGGTTCACCACAGCCCTCTCAGGCGGTGCACTACTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTCACTTGTGCAACCAACTCAGGAAGCCACCCTTCTTGATTGAAGCCGGCTTCTGCAACAACAACGACTCCCGGC > 2:7223719/1‑150 AGGTTCACCACAGCCCTCTCAGGCGGTGCACTTCTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTCACTTGTGCAACCAACTCAGGAAGCCACCCTTCTTGATTGAAGCCGGCTTCTGCAACAACAACGACTCCCGGCTC > 2:1885179/1‑150 CTGTTTGCAGCAGCGTGGCGAAGTGCAGACGGCGTTGAGCAAATTGCAGCGGTTCCGGCGGCAGAGCCGGGAGTCGTTGTTGTTGCAGAAGCCGGCTTCAATCAAGAAGGGTGGCTTCCTGAGTTGGTTGCACAAGTGAGCCTGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/6005760‑6005937 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcctcttcgcgggtaaacccgctcctacaGGTTCACCACAGCCCTCTCAGGCGGTGCACTACTTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCTCACTTGTGCAACCAACTCAGGAAGCCACCCTTCTTGATTGAAGCCGGCTTCTGCAACAACAACGACTCCCGGCTC < NC_002947/6005971‑6005823 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |