| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 100443 = | 205 (0.650) | 13 (0.050) | 5/238 | NT | 6.1% | intergenic (‑35/+87) | PP_0094/PP_0095 | 5'‑nucleotidase/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 100525 = | 220 (0.790) | intergenic (‑117/+5) | PP_0094/PP_0095 | 5'‑nucleotidase/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 372 total aligned reads displayed.
GGTCCGGTTCGTCGATGCCCAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGC > NC_002947/100294‑100592 | agtggctacctgtacatgggcagtccggtgaaacaggcccggctgctgaacgacaaggagcgcgcatttttctcctacagcgccggcaactacgtgaagctcaaggaccagcacctggccgaaggctacgatcaacctgaatgaccgcat > 1:1106060‑M1/150‑150 (MQ=255) gTCCGGTTCGTCGATGCCCAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTT < 1:463324‑M1/150‑1 (MQ=255) gTCCGGTTCGTCGATGCCCAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTT < 1:4181154‑M1/150‑1 (MQ=255) tCCGGTTCGTCGATGCCCAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTC < 2:6948159‑M1/150‑1 (MQ=255) gtgcatgtacatgggcagtccggtgaaacaggcccggctgctgaacgacaaggagcgcgcatttttctcctacagcgccggcaactacgtgaagctcaaggaccagcacctggccgaaggctacgatcaacctgaatgaccgcaTTcgcg < 2:1800526‑M1/6‑1 (MQ=255) ggTTCGTCGATGCCCAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCG < 1:6288554‑M1/150‑1 (MQ=255) ggTTCGTCGATGCCCAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCG < 1:3510898‑M1/150‑1 (MQ=255) tacctgtacatgggcagtccggtgaaacaggcccggctgctgaacgacaaggagcgcgcatttttctcctacagcgccggcaactacgtgaagctcaaggaccagcacctggccgaaggctacgatcaacctgaatgaccgcaTTCGCgg > 1:7368303‑M1/144‑150 (MQ=255) 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acctgtacatgggcagtccggtgaaacaggcccggctgctgaacgacaaggagcgcgcatttttctcctacagcgccggcaactacgtgaagctcaaggaccagcacctggccgaaggctacgatcaacctgaatgaccgcaTTCGCggg > 2:3700940‑M1/143‑150 (MQ=255) acctgtacatgggcagtccggtgaaacaggcccggctgctgaacgacaaggagcgcgcatttttctcctacagcgccggcaactacgtgaagctcaaggaccagcacctggccgaaggctacgatcaacctgaatgaccgcaTTCGCggg > 2:2858172‑M1/143‑150 (MQ=255) ctgtacatgggcagtccggtgaaacaggcccggctgctgaacgacaaggagcgcgcatttttctcctacagcgccggcaactacgtgaagctcaaggaccagcacctggccgaaggctacgatcaacctgaatgaccgcaTTCGCGGGCa < 1:7022842‑M1/10‑1 (MQ=255) ctgtacatgggcagtccggtgaaacaggcccggctgctgaacgacaaggagcgcgcatttttctcctacagcgccggcaactacgtgaagctcaaggaccagcacctggccgaaggctacgatcaacctgaatgaccgcaTTCGCGGGCa > 1:1931062‑M1/141‑150 (MQ=255) gtcgATGCCCAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCAT < 1:133105‑M1/150‑1 (MQ=255) 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aCTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCt > 1:542564/1‑150 (MQ=255) aCTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCt > 1:7133510/1‑150 (MQ=255) tgcgTGCGGCGGGGCCTTCGGCGCGGGCAGGCCCGCGCCCCCAGGTAACGCGCCGGCCTGGCCGGGGCCACTCACCCTGCGGGGGCGGGCAGGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGa < 2:2685054/147‑1 (MQ=255) tgctgcGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCGTGAGCtt > 1:2854043/1‑150 (MQ=255) tgcGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCAc < 2:1351490/150‑1 (MQ=255) tgcGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCAc < 2:893421/150‑1 (MQ=255) gcGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGGTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACg > 1:3306636/1‑150 (MQ=255) gCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGtt > 2:4421913/1‑150 (MQ=255) ccTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTCGTTg > 2:7285382/1‑150 (MQ=255) cttcttCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGc > 2:6607595/1‑150 (MQ=255) ttcttcGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGcc > 1:5079854/1‑150 (MQ=255) ttcttcGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGcc > 2:816155/1‑150 (MQ=255) ttcttcGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGGTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGcc > 1:5743934/1‑150 (MQ=255) ttcttcGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGACCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGcc > 1:1735409/1‑150 (MQ=255) tcttcGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCg > 2:3022111/1‑150 (MQ=255) ttcGCGGGCATGCCCGCccccgcaggttgagtggccccttcaaggcctgcgctttacctgtgggagcgggcatgcccgcgaagaaggccacgcagcactcaagtggaaccctgtacatgcaccagcaaaacatcctcttcgacctcgacg < 1:2050495‑M1/150‑134 (MQ=255) | GGTCCGGTTCGTCGATGCCCAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGC > NC_002947/100294‑100592 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |