New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 295713 | 207 (0.650) | 16 (0.060) | 13/244 | NT | 7.3% | intergenic (+60/+82) | PP_0241/PP_0242 | transporter/TetR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | = 295744 | 219 (0.770) | intergenic (+91/+51) | PP_0241/PP_0242 | transporter/TetR family transcriptional regulator |
Only 100 of 406 total aligned reads displayed.
ACCCGTTCCGTGCGGGAGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAACGGCGGCAGATACAACCCCAGATACGCTTCGAACACCCGCTTG > NC_002947/295564‑295861 | accCGTTCCGTGCGGGAGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAG < 1:6776550‑M1/150‑1 (MQ=255) accCGTTCCGTGCGGGAGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAG < 1:2725744‑M1/150‑1 (MQ=255) cccGTTCCGTGCGGGAGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGa < 1:5528178‑M1/150‑2 (MQ=255) cGTTCCGTGCGGGAGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTa > 1:3333173/1‑150 (MQ=255) tGCGGGAGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCaa < 2:2830628/150‑1 (MQ=255) gCGGGAGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAg > 2:2014808/1‑150 (MQ=255) ggAGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTc > 1:1821703/1‑150 (MQ=255) gCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAg > 2:2251855/1‑150 (MQ=255) cTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAgg < 1:6562142/150‑1 (MQ=255) cTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAgg > 1:2288283/1‑150 (MQ=255) tGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAggg > 2:7301486/1‑150 (MQ=255) ggAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGt < 1:6890238/150‑1 (MQ=255) cAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGcgcgcg < 1:2056171/150‑1 (MQ=255) 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cGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAACGGCGGCAGATACAACCCCAGATag > 2:4884189/1‑149 (MQ=255) cGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAACGGCGGCAGATACAACCCCAGATAc < 2:843761/150‑1 (MQ=255) ggCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAACGGCGGCAGATACAACCCCAGATACg > 2:6561526/1‑150 (MQ=255) aCGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAACGGCGGCAGATACAACCCCAGATACGCtt < 2:1207862/150‑1 (MQ=255) gCCCGCTCCCACAGagcccgcgcgcaccctggagcttgcgagtacctgtgggagcgggcgtgccggcgaagggctgcaaagcagccccaatatcgacccgccgcatcacagcttggcgatagacacttcggtcgacttcacaaaggcaat < 1:4189532‑M1/150‑137 (MQ=255) gCCCGCTCCCACAGagcccgcgcgcaccctggagcttgcgagtacctgtgggagcgggcgtgccggcgaagggctgcaaagcagccccaatatcgacccgccgcatcacagcttggcgatagacacttcggtcgacttcacaaaggcaat < 1:2515004‑M1/150‑137 (MQ=255) GCCCGCTCCCACTGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGGGGGAGCGGGCGTGCCCGCGCTGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCCGCGGGAACGCGGGGCCAGACACGGCGGCAGATACGCCCCCAGATCCGCGTCg < 2:6755781‑M1/150‑1 (MQ=255) GCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAACGGCGGCAGATACAACCCCAGATACGCTTCg < 2:2710557‑M1/150‑1 (MQ=255) cccGCTCCCACAGagcccgcgcgcaccctggagcttgcgagtacctgtgggagcgggcgtgccggcgaagggctgcaaagcagccccaatatcgacccgccgcatcacagcttggcgatagacacttcggtcgacttcacaaaggcaatc > 1:7301486‑M1/1‑13 (MQ=255) cccGCTCCCACAGagcccgcgcgcaccctggagcttgcgagtacctgtgggagcgggcgtgccggcgaagggctgcaaagcagccccaatatcgacccgccgcatcacagcttgg < 1:1009503‑M1/115‑103 (MQ=255) ccGCTCCCACAGagcccgcgcgcaccctggagcttgcgagtacctgtgggagcgggcgtgccggcgaagggctgcaaagcagccccaatatcgacccgccgcatcacagcttggcgatagacacttcggtcgacttcacaaaggcaatca > 2:6782540‑M1/1‑12 (MQ=255) ccGCTCCCACAGagcccgcgcgcaccctggagcttgcgagtacctgtgggagcgggcgtgccggcgaagggctgcaaagcagccccaatatcgacccgccgcatcacagcttggcgatagacacttcggtcgacttcacaaaggcaatca > 1:4477467‑M1/1‑12 (MQ=255) cGCTCCCACAGagcccgcgcgcaccctggagcttgcgagtacctgtgggagcgggcgtgccggcgaagggctgcaaagcagccccaatatcgacccgccgcatcacagcttggcgatagacacttcggtcgacttcacaaaggcaatcac < 1:3058007‑M1/150‑140 (MQ=255) cGCTCCCACAGagcccgcgcgcaccctggagcttgcgagtacctgtgggagcgggcgtgccggcgaagggctgcaaagcagccccaatatcgacccgccgcatcacagcttggcgatagacacttcggtcgacttcacaaaggcaatcac < 2:3355961‑M1/150‑140 (MQ=255) gCTCCCACAGagcccgcgcgcaccctggagcttgcgagtacctgtgggagcgggcgtgccggcgaagggctgcaaagcagccccaatatcgacccgccgcatcacagcttggcgatagacacttcggtcgacttcacaaaggcaatcact > 2:7151587‑M1/1‑10 (MQ=255) cTCCCACAGagcccgcgcgcaccctggagcttgcgagtacctgtgggagcgggcgtgccggcgaagggctgcaaagcagccccaatatcgacccgccgcatcacagcttggcgatagacacttcggtcgacttcacaaaggcaatcactt < 1:1448689‑M1/150‑142 (MQ=255) tCCCACAGagcccgcgcgcaccctggagcttgcgagtacctgtgggagcgggcgtgccggcgaagggctgcaaagcagccccaatatcgacccgccgcatcacagcttggcgatagacacttcggtcgacttcacaaaggcaatcacttc > 1:2316368‑M1/1‑8 (MQ=255) tCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTctgtgggagcgggctgccggcgaagggctgcaaagcagccccaatatcgacccgccgcatcacagcttggcgatagacacttcggtcgacttcacaaaggcaatcacttca < 2:3561561‑M2/150‑112 (MQ=255) TCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAACGGCGGCAGATACAACCCCAGATACGCTTCGAACAcc > 2:5924079‑M1/1‑150 (MQ=255) TCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAACGGCGGCAGATACAACCCCAGATACGCTTCGAACAcc > 2:1050763‑M1/1‑150 (MQ=255) ccACAGagcccgcgcgcaccctggagcttgcgagtacctgtgggagcgggcgtgccggcgaagggctgcaaagcagccccaatatcgacccgccgcatcacagcttggcgatagacacttcggtcgacttcacaaaggcaatcacttcac > 1:1912403‑M1/1‑6 (MQ=255) CCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAACGGCGGCAGATACAACCCCAGATACGCTTCGAACACCCg < 1:6438645‑M1/150‑1 (MQ=255) ACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAAcggc < 1:4557264‑M1/113‑1 (MQ=255) ACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAACGGCGGCAGATACAACCCCAGATACGCTTCGAACACCCGCt < 1:716447‑M1/150‑1 (MQ=255) ACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAACGGCGGCAGATACAACCCCAGATACGCTTCGAACACCCGCt < 1:1697029‑M1/150‑1 (MQ=255) agagcccgcgcgcaccctggagcttgcgagtacctgtgggagcgggcgtgccggcgaagggctgcaaagcagccccaatatcgacccgccgcatcacagcttggcgatagacacttcggtcgacttcacaaaggcaatcacttcactgcc > 1:1402140‑M1/1‑2 (MQ=255) | ACCCGTTCCGTGCGGGAGCTGGAGTTGCAGGTGGGCAGTGAAGTGATTGCCTTTGTGAAGTCGACCGAAGTGTCTATCGCCAAGCTGTGATGCGGCGGGTCGATATTGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTCGCCGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTCGCAAGCTCCAGGGTGCGCGCGGGCTCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCCAAGCGGCCCCAGATTTCTCAGCTGGAACGCTTGGCCAGAAACGGCGGCAGATACAACCCCAGATACGCTTCGAACACCCGCTTG > NC_002947/295564‑295861 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |