| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 413997 = | 232 (0.730) | 35 (0.140) | 16/216 | NT | 22.9% | intergenic (+14/‑189) | glnE/waaF | glutamate‑ammonia‑ligase adenylyltransferase/ADP‑heptose:LPS heptosyltransferase II |
| ? | NC_002947 | 414083 = | 52 (0.210) | intergenic (+100/‑103) | glnE/waaF | glutamate‑ammonia‑ligase adenylyltransferase/ADP‑heptose:LPS heptosyltransferase II | |||||
Only 100 of 323 total aligned reads displayed.
TGAAGTGTACAAAGCGTTCCGCTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACA‑GGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATAGGCCATGTGAGTGGTACACTGTCCGCCACATAGCCTGAATATAAAGAGGGGAGGCCAGGCTG > NC_002947/413848‑414144 | catgtcgccgacccagctggggccaatgatcagtattctcatgcttagtccagaaacgctcggggaggctacaggctgcggtacagcctggcctcccctctttatattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggccTATTc > 1:4381978‑M1/146‑150 (MQ=255) tACAAAGCGTTCCGCTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTcgcg > 1:3342982/1‑150 (MQ=255) gtcgccgacccagctggggccaatgatcagtattctcatgcttagtccagaaacgctcggggaggctacaggctgcggtacagcctggcctcccctctttatattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggctTATTcgcg > 2:427333‑M1/143‑150 (MQ=255) gtcgccgacccagctggggccaatgatcagtattctcatgcttagtccagaaacgctcggggaggctacaggctgcggtacagcctggcctcccctctttatattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggccTATTcgcg > 2:5559559‑M1/143‑150 (MQ=255) aCAAAGCGTTCCGCTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCgg < 1:5442288/150‑1 (MQ=255) aaaGCGTTCCGCTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGc > 2:2703388/1‑150 (MQ=255) aaaGCGTTCCGCTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGc > 1:762443/1‑150 (MQ=255) aaaGCGTTCCGCTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGc > 2:3801376/1‑150 (MQ=255) aGCGTTCCGCTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCaa < 2:3667459/150‑1 (MQ=255) aGCGTTCCGCTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCaa < 1:3862270/150‑1 (MQ=255) cGTTCCGCTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGc < 1:6237616/150‑1 (MQ=255) cGTTCCGCTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGc < 2:4502570/150‑1 (MQ=255) acccagctggggccaatgatcagtattctcatgcttagtccagaaacgctcggggaggctacaggctgcggtacagcctggcctcccctctttatattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggccTATTCGCGGGCAAGc > 2:4117056‑M1/136‑150 (MQ=255) 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ccAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGcaca < 1:3896125/150‑1 (MQ=255) ccAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGcaca < 1:2803910/150‑1 (MQ=255) ccAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGcaca < 1:5913765/150‑1 (MQ=255) ggCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCATGccctgc < 2:1021493/130‑4 (MQ=255) ggCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCca > 1:2873672/1‑134 (MQ=255) ggCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCca < 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cGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACA‑GGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCggg < 1:4128589/150‑1 (MQ=255) tacaggctgcggtacagcctggcctcccctctttatattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggctTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACA‑GGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTgg > 1:1254513‑M1/77‑141 (MQ=255) tacaggctgcggtacagcctggcctcccctctttatattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggccTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACA‑GGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCtg > 2:2295975‑M1/77‑138 (MQ=255) tacaggctgcggtacagcctggcctcccctctttatattcaggctatgtggcggacagtgtaccactcacatggccTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGATTGCACA‑GGCCCTGAGCAGTGTGCAATcc > 2:4893713‑M1/77‑135 (MQ=255) cacaGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACA‑GGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCtt < 2:1135312/150‑1 (MQ=255) gTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTAGTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACGGCACA‑GGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGccc < 2:601624/150‑1 (MQ=255) aCGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACA‑GGCCCTGAGCAGTGTGCAAt < 1:3770632/116‑1 (MQ=255) aGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACA‑GGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATAGGCCATGTGAGTgg < 2:1417211/150‑1 (MQ=255) aTCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACA‑GGCCCTGAGGAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATAGGCCATGTGAGTGGTACACTGTcc < 2:4835843/150‑1 (MQ=255) cgtggggTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTTTCCGCGGGCACGCCCGCGCCCACCGGTACTGCACA‑GGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCGGTGGGCGCGGGCTTGCCCGCGAATAGGCCATGTGAGTGGTACACTGTCCGCCACATAGc < 1:6617665/146‑1 (MQ=255) ggTTTATGCTGATCCCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCCCCCACAGGTACTGCACA‑GGCCCTGAGCAGTGTGCAACCCCTGTGGGCGCGGGCTTGCCCGCGAATAGGCCATGTGAGTGGTACACTGTCCGCCACATAGCCTGaa < 1:5099567/150‑1 (MQ=39) ggTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACA‑GGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATAGGCCATGTGAGTGGTACACTGTCCGCCACATAGCCTGaa < 2:5050321/150‑1 (MQ=255) tttAAGCTGTTACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACA‑GGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGGGGGCTTGCCCGCGAATAGGCCATGTGAGTGGTACACTGTCCGCCACATAGCCTGAata < 1:4855142/150‑1 (MQ=255) tttAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACA‑GGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATAGGCCATGTGAGTGGTACACTGTCCGCCACATAGCCTGAata > 2:5457979/1‑150 (MQ=255) aGCTGATACCGTGTGGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACCGGTACTGCACA‑GGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATAGGCCATGTGAGTGGTACACTGTCCGCCACATAGCCTGAATATaaa < 1:1661495/150‑1 (MQ=255) tGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACA‑GGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCGGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATAGGCCATGTGAGTGGTACACTGTCCGCCACATAGCCTGAATATAAagag < 2:1926060/150‑1 (MQ=255) cGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACA‑GGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATAGGCCATGTGAGTGGTACACTGTCCGCCACATAGCCTGAATATAAAGAGGGGAgg > 1:4922820/1‑150 (MQ=255) tGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACA‑GGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATAGGCCATGTGAGTGGTACACTGTCCGCCACATAGCCTGAATATAAAGAGGGGAGGCCAgg < 2:1706630/150‑1 (MQ=255) tGGCTTATTCGCGGGCAAGCACGCTCCCACAGGTCCTGCAGA‑GGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATAGGCCATGTGAGTGGTTCACTGTCCGCCTCATAGCCTGAATATAAAGAGGGGAGGCCAgg < 2:5478180/150‑1 (MQ=39) cTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACA‑GGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATAGGCCATGTGAGTGGTACACTGTCCGCCACATAGCCTGAATATAAAGAGGGGAGGCCAGGCTg < 1:5550963/150‑1 (MQ=255) | TGAAGTGTACAAAGCGTTCCGCTCGGCCTCCCACCGCCAGGCCCTGCAGAAGGAGGCCGGGGTGATCGATGCGGCACAGTTTGCCGATGAACGCCGTGAAGTGCGGCGGATCTGGGGTGAGTTGGGTTTAAGCTGATACCGTGTTGGCTTATTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGTACTGCACA‑GGCCCTGAGCAGTGTGCAATCCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAATAGGCCATGTGAGTGGTACACTGTCCGCCACATAGCCTGAATATAAAGAGGGGAGGCCAGGCTG > NC_002947/413848‑414144 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |